MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis 7199-99 complete genome

Total Repeats: 10296

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020089	CGAC	2	8	311	318	25 %	0 %	25 %	50 %	479053933
2	NC_020089	CGTT	2	8	527	534	0 %	50 %	25 %	25 %	479053933
3	NC_020089	CCCG	2	8	589	596	0 %	0 %	25 %	75 %	479053933
4	NC_020089	GGCA	2	8	660	667	25 %	0 %	50 %	25 %	479053933
5	NC_020089	CCCA	2	8	918	925	25 %	0 %	0 %	75 %	479053933
6	NC_020089	GTGG	2	8	2132	2139	0 %	25 %	75 %	0 %	479053934
7	NC_020089	GCCA	2	8	2150	2157	25 %	0 %	25 %	50 %	479053934
8	NC_020089	TCAG	2	8	2494	2501	25 %	25 %	25 %	25 %	479053934
9	NC_020089	CGTT	2	8	2720	2727	0 %	50 %	25 %	25 %	479053934
10	NC_020089	ACGG	2	8	3072	3079	25 %	0 %	50 %	25 %	479053934
11	NC_020089	GCCT	2	8	3134	3141	0 %	25 %	25 %	50 %	479053934
12	NC_020089	CGTC	2	8	3285	3292	0 %	25 %	25 %	50 %	479053935
13	NC_020089	GGTA	2	8	3465	3472	25 %	25 %	50 %	0 %	479053935
14	NC_020089	GGTT	2	8	3647	3654	0 %	50 %	50 %	0 %	479053935
15	NC_020089	CCGC	2	8	3875	3882	0 %	0 %	25 %	75 %	479053935
16	NC_020089	CCAC	2	8	5499	5506	25 %	0 %	0 %	75 %	479053937
17	NC_020089	ACCG	2	8	5518	5525	25 %	0 %	25 %	50 %	479053937
18	NC_020089	CAAG	2	8	5713	5720	50 %	0 %	25 %	25 %	479053937
19	NC_020089	CGCC	2	8	5809	5816	0 %	0 %	25 %	75 %	479053937
20	NC_020089	CGGC	2	8	6624	6631	0 %	0 %	50 %	50 %	479053937
21	NC_020089	GACA	2	8	7304	7311	50 %	0 %	25 %	25 %	479053938
22	NC_020089	CGGT	2	8	7524	7531	0 %	25 %	50 %	25 %	479053938
23	NC_020089	CGAG	2	8	8456	8463	25 %	0 %	50 %	25 %	479053938
24	NC_020089	CCAC	2	8	8986	8993	25 %	0 %	0 %	75 %	479053938
25	NC_020089	CGAC	2	8	9355	9362	25 %	0 %	25 %	50 %	479053938
26	NC_020089	GGTT	2	8	9583	9590	0 %	50 %	50 %	0 %	479053938
27	NC_020089	CCCG	2	8	10132	10139	0 %	0 %	25 %	75 %	479053939
28	NC_020089	GAGC	2	8	12092	12099	25 %	0 %	50 %	25 %	479053940
29	NC_020089	CTCA	2	8	12303	12310	25 %	25 %	0 %	50 %	479053940
30	NC_020089	AACC	2	8	13338	13345	50 %	0 %	0 %	50 %	479053942
31	NC_020089	CCCG	2	8	13447	13454	0 %	0 %	25 %	75 %	479053942
32	NC_020089	ACCC	2	8	14098	14105	25 %	0 %	0 %	75 %	479053944
33	NC_020089	TGAT	2	8	14135	14142	25 %	50 %	25 %	0 %	479053944
34	NC_020089	TGCT	2	8	14182	14189	0 %	50 %	25 %	25 %	479053944
35	NC_020089	GCCC	2	8	14669	14676	0 %	0 %	25 %	75 %	479053944
36	NC_020089	GGGC	2	8	15450	15457	0 %	0 %	75 %	25 %	479053945
37	NC_020089	CTGA	2	8	15905	15912	25 %	25 %	25 %	25 %	479053946
38	NC_020089	TGGC	2	8	16048	16055	0 %	25 %	50 %	25 %	479053946
39	NC_020089	GCTT	2	8	16107	16114	0 %	50 %	25 %	25 %	479053946
40	NC_020089	CAGT	2	8	16135	16142	25 %	25 %	25 %	25 %	479053946
41	NC_020089	CGGT	2	8	16506	16513	0 %	25 %	50 %	25 %	479053946
42	NC_020089	GCCG	2	8	16565	16572	0 %	0 %	50 %	50 %	479053946
43	NC_020089	CGGG	2	8	17800	17807	0 %	0 %	75 %	25 %	479053947
44	NC_020089	CTGG	2	8	17908	17915	0 %	25 %	50 %	25 %	479053947
45	NC_020089	GTGC	2	8	18408	18415	0 %	25 %	50 %	25 %	479053947
46	NC_020089	GCCG	2	8	18426	18433	0 %	0 %	50 %	50 %	479053947
47	NC_020089	CCGC	2	8	18791	18798	0 %	0 %	25 %	75 %	479053948
48	NC_020089	GCCG	2	8	20255	20262	0 %	0 %	50 %	50 %	479053949
49	NC_020089	CCAG	2	8	20743	20750	25 %	0 %	25 %	50 %	479053949
50	NC_020089	CACC	2	8	20926	20933	25 %	0 %	0 %	75 %	479053949
51	NC_020089	CGGG	2	8	21882	21889	0 %	0 %	75 %	25 %	479053950
52	NC_020089	GCCG	2	8	21973	21980	0 %	0 %	50 %	50 %	479053950
53	NC_020089	GCTG	2	8	22353	22360	0 %	25 %	50 %	25 %	479053950
54	NC_020089	CGGC	2	8	22373	22380	0 %	0 %	50 %	50 %	479053950
55	NC_020089	GCCG	2	8	23044	23051	0 %	0 %	50 %	50 %	479053950
56	NC_020089	CCCA	2	8	23056	23063	25 %	0 %	0 %	75 %	479053950
57	NC_020089	GCTG	2	8	24195	24202	0 %	25 %	50 %	25 %	479053952
58	NC_020089	CGGC	2	8	24243	24250	0 %	0 %	50 %	50 %	479053952
59	NC_020089	GCCG	2	8	24343	24350	0 %	0 %	50 %	50 %	479053952
60	NC_020089	CGGG	2	8	24418	24425	0 %	0 %	75 %	25 %	479053952
61	NC_020089	GCTC	2	8	26487	26494	0 %	25 %	25 %	50 %	479053953
62	NC_020089	CCAA	2	8	26704	26711	50 %	0 %	0 %	50 %	479053953
63	NC_020089	CAGC	2	8	26770	26777	25 %	0 %	25 %	50 %	479053953
64	NC_020089	CGGC	2	8	27590	27597	0 %	0 %	50 %	50 %	479053955
65	NC_020089	CCGG	2	8	28076	28083	0 %	0 %	50 %	50 %	479053955
66	NC_020089	GCTC	2	8	28632	28639	0 %	25 %	25 %	50 %	479053956
67	NC_020089	TGCG	2	8	28771	28778	0 %	25 %	50 %	25 %	479053956
68	NC_020089	CCGG	2	8	29036	29043	0 %	0 %	50 %	50 %	479053956
69	NC_020089	CGTC	2	8	29367	29374	0 %	25 %	25 %	50 %	479053957
70	NC_020089	CACG	2	8	29726	29733	25 %	0 %	25 %	50 %	479053958
71	NC_020089	ACCG	2	8	29807	29814	25 %	0 %	25 %	50 %	479053958
72	NC_020089	CCGG	2	8	30126	30133	0 %	0 %	50 %	50 %	479053958
73	NC_020089	GTCG	2	8	30302	30309	0 %	25 %	50 %	25 %	479053958
74	NC_020089	CGAG	2	8	31436	31443	25 %	0 %	50 %	25 %	479053959
75	NC_020089	CGAC	2	8	31733	31740	25 %	0 %	25 %	50 %	479053960
76	NC_020089	GCCG	2	8	32460	32467	0 %	0 %	50 %	50 %	479053961
77	NC_020089	CCGA	2	8	33449	33456	25 %	0 %	25 %	50 %	479053962
78	NC_020089	GGCC	2	8	34584	34591	0 %	0 %	50 %	50 %	479053964
79	NC_020089	ATCG	2	8	35077	35084	25 %	25 %	25 %	25 %	479053964
80	NC_020089	GATC	2	8	35415	35422	25 %	25 %	25 %	25 %	479053964
81	NC_020089	CCAC	2	8	36236	36243	25 %	0 %	0 %	75 %	479053964
82	NC_020089	ACCG	2	8	36629	36636	25 %	0 %	25 %	50 %	479053965
83	NC_020089	CTGG	2	8	36973	36980	0 %	25 %	50 %	25 %	479053966
84	NC_020089	GCAT	2	8	37368	37375	25 %	25 %	25 %	25 %	479053967
85	NC_020089	GCTG	2	8	37882	37889	0 %	25 %	50 %	25 %	479053967
86	NC_020089	AACG	2	8	38637	38644	50 %	0 %	25 %	25 %	479053967
87	NC_020089	CCGA	2	8	38698	38705	25 %	0 %	25 %	50 %	479053967
88	NC_020089	CCAC	2	8	38854	38861	25 %	0 %	0 %	75 %	479053967
89	NC_020089	CAGC	2	8	39081	39088	25 %	0 %	25 %	50 %	479053968
90	NC_020089	CCGG	2	8	39577	39584	0 %	0 %	50 %	50 %	479053968
91	NC_020089	GGCC	2	8	40108	40115	0 %	0 %	50 %	50 %	479053969
92	NC_020089	CGAT	2	8	40558	40565	25 %	25 %	25 %	25 %	479053969
93	NC_020089	GCCG	2	8	40858	40865	0 %	0 %	50 %	50 %	479053969
94	NC_020089	CACC	2	8	40883	40890	25 %	0 %	0 %	75 %	479053969
95	NC_020089	ACCG	2	8	41106	41113	25 %	0 %	25 %	50 %	479053969
96	NC_020089	GCGT	2	8	41132	41139	0 %	25 %	50 %	25 %	479053969
97	NC_020089	CCAC	2	8	41861	41868	25 %	0 %	0 %	75 %	479053970
98	NC_020089	CGAT	2	8	41870	41877	25 %	25 %	25 %	25 %	479053970
99	NC_020089	GGCC	2	8	42566	42573	0 %	0 %	50 %	50 %	479053972
100	NC_020089	CCCG	2	8	43157	43164	0 %	0 %	25 %	75 %	479053972
101	NC_020089	CGGG	2	8	43186	43193	0 %	0 %	75 %	25 %	479053972
102	NC_020089	CGAC	2	8	43825	43832	25 %	0 %	25 %	50 %	479053973
103	NC_020089	GAGC	2	8	44205	44212	25 %	0 %	50 %	25 %	479053973
104	NC_020089	GGGC	2	8	45364	45371	0 %	0 %	75 %	25 %	479053973
105	NC_020089	CGGC	2	8	45459	45466	0 %	0 %	50 %	50 %	479053973
106	NC_020089	GCCG	2	8	46422	46429	0 %	0 %	50 %	50 %	479053973
107	NC_020089	TTGC	2	8	46586	46593	0 %	50 %	25 %	25 %	479053974
108	NC_020089	CCGC	2	8	46734	46741	0 %	0 %	25 %	75 %	479053974
109	NC_020089	CCGC	2	8	46767	46774	0 %	0 %	25 %	75 %	479053974
110	NC_020089	GGTC	2	8	46875	46882	0 %	25 %	50 %	25 %	479053974
111	NC_020089	CGGG	2	8	47426	47433	0 %	0 %	75 %	25 %	479053975
112	NC_020089	GCAG	2	8	47499	47506	25 %	0 %	50 %	25 %	479053975
113	NC_020089	GTGC	2	8	48399	48406	0 %	25 %	50 %	25 %	479053976
114	NC_020089	GCCG	2	8	48683	48690	0 %	0 %	50 %	50 %	479053976
115	NC_020089	CAGC	2	8	49868	49875	25 %	0 %	25 %	50 %	479053977
116	NC_020089	CGGG	2	8	50057	50064	0 %	0 %	75 %	25 %	479053978
117	NC_020089	GCCG	2	8	50157	50164	0 %	0 %	50 %	50 %	479053978
118	NC_020089	GGTG	2	8	50480	50487	0 %	25 %	75 %	0 %	479053978
119	NC_020089	CTCA	2	8	51096	51103	25 %	25 %	0 %	50 %	479053978
120	NC_020089	CGCT	2	8	51235	51242	0 %	25 %	25 %	50 %	479053979
121	NC_020089	GGTA	2	8	52101	52108	25 %	25 %	50 %	0 %	479053980
122	NC_020089	ACCA	2	8	53721	53728	50 %	0 %	0 %	50 %	479053982
123	NC_020089	GTGC	2	8	54606	54613	0 %	25 %	50 %	25 %	479053982
124	NC_020089	ACCG	2	8	55484	55491	25 %	0 %	25 %	50 %	479053982
125	NC_020089	CCCG	2	8	55646	55653	0 %	0 %	25 %	75 %	479053982
126	NC_020089	GGCC	2	8	56320	56327	0 %	0 %	50 %	50 %	479053983
127	NC_020089	CGCT	2	8	57047	57054	0 %	25 %	25 %	50 %	479053983
128	NC_020089	GCGG	2	8	58804	58811	0 %	0 %	75 %	25 %	479053986
129	NC_020089	GTTC	2	8	59023	59030	0 %	50 %	25 %	25 %	479053986
130	NC_020089	AGCG	2	8	59228	59235	25 %	0 %	50 %	25 %	479053987
131	NC_020089	CGGC	2	8	59970	59977	0 %	0 %	50 %	50 %	479053989
132	NC_020089	GCGG	2	8	59982	59989	0 %	0 %	75 %	25 %	479053989
133	NC_020089	CAGC	2	8	61500	61507	25 %	0 %	25 %	50 %	479053990
134	NC_020089	TGGC	3	12	62128	62139	0 %	25 %	50 %	25 %	479053990
135	NC_020089	AAGG	2	8	63871	63878	50 %	0 %	50 %	0 %	479053991
136	NC_020089	AACC	2	8	64648	64655	50 %	0 %	0 %	50 %	479053992
137	NC_020089	CGGA	2	8	65012	65019	25 %	0 %	50 %	25 %	479053993
138	NC_020089	GCTG	2	8	66277	66284	0 %	25 %	50 %	25 %	479053994
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