MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium smegmatis JS623

Total Repeats: 109833

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019966	TCG	2	6	565	570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644872
2	NC_019966	AAC	2	6	579	584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433644872
3	NC_019966	CTG	2	6	720	725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644872
4	NC_019966	ATC	2	6	780	785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433644872
5	NC_019966	GTC	2	6	796	801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644872
6	NC_019966	CGC	3	9	881	889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644872
7	NC_019966	GCC	2	6	891	896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644872
8	NC_019966	CGA	2	6	908	913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644872
9	NC_019966	CGA	2	6	917	922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644872
10	NC_019966	CCG	2	6	994	999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644872
11	NC_019966	CCG	2	6	1025	1030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644872
12	NC_019966	CGC	2	6	1079	1084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644872
13	NC_019966	GTT	2	6	1127	1132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433644872
14	NC_019966	CGC	2	6	1175	1180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644872
15	NC_019966	TCA	2	6	1255	1260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433644872
16	NC_019966	CGA	2	6	1271	1276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644872
17	NC_019966	CGT	2	6	1285	1290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644872
18	NC_019966	CGA	2	6	1328	1333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644872
19	NC_019966	AGG	2	6	1366	1371	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433644872
20	NC_019966	TTC	2	6	1374	1379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433644872
21	NC_019966	TCC	2	6	1425	1430	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433644872
22	NC_019966	GCC	2	6	1436	1441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644872
23	NC_019966	GCC	2	6	1511	1516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644872
24	NC_019966	AAG	2	6	1548	1553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433644872
25	NC_019966	CAG	2	6	1604	1609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644872
26	NC_019966	GCC	2	6	1770	1775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644872
27	NC_019966	CCG	2	6	1777	1782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644872
28	NC_019966	ACC	2	6	1794	1799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433644872
29	NC_019966	GAG	2	6	1803	1808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433644872
30	NC_019966	AGA	2	6	1951	1956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433644872
31	NC_019966	CAC	2	6	2009	2014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433644872
32	NC_019966	CGA	2	6	2614	2619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644873
33	NC_019966	GAC	2	6	2754	2759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644873
34	NC_019966	TGT	2	6	2857	2862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433644873
35	NC_019966	CGA	2	6	3002	3007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644873
36	NC_019966	GTT	2	6	3029	3034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433644873
37	NC_019966	GGT	2	6	3128	3133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433644873
38	NC_019966	GGC	2	6	3137	3142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644873
39	NC_019966	GGC	2	6	3242	3247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644873
40	NC_019966	AGC	2	6	3296	3301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644873
41	NC_019966	GCA	2	6	3346	3351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644873
42	NC_019966	CCG	2	6	3400	3405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644873
43	NC_019966	GAT	2	6	3510	3515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433644873
44	NC_019966	CCG	2	6	3529	3534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644873
45	NC_019966	TGA	2	6	3539	3544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433644873
46	NC_019966	GAA	2	6	3558	3563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433644873
47	NC_019966	ACG	2	6	3672	3677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644873
48	NC_019966	GTC	2	6	3682	3687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644873
49	NC_019966	GAT	2	6	3714	3719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433644873
50	NC_019966	TCG	2	6	3848	3853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644874
51	NC_019966	GGC	2	6	3898	3903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644874
52	NC_019966	CGC	2	6	3957	3962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644874
53	NC_019966	GGT	2	6	3990	3995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433644874
54	NC_019966	CGG	2	6	4083	4088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644874
55	NC_019966	GAC	2	6	4132	4137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644874
56	NC_019966	TGG	2	6	4208	4213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433644874
57	NC_019966	TGA	2	6	4361	4366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433644874
58	NC_019966	GCC	2	6	4396	4401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644874
59	NC_019966	GTG	2	6	4456	4461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433644874
60	NC_019966	GCA	2	6	4473	4478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644874
61	NC_019966	GCT	2	6	4479	4484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644874
62	NC_019966	GGA	2	6	4566	4571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433644874
63	NC_019966	CGC	2	6	4605	4610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644874
64	NC_019966	TCG	2	6	4864	4869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644875
65	NC_019966	GTG	2	6	4933	4938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433644875
66	NC_019966	CGA	2	6	4940	4945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644875
67	NC_019966	CGG	2	6	4991	4996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644875
68	NC_019966	CAA	2	6	5004	5009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433644875
69	NC_019966	GCG	2	6	5105	5110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644875
70	NC_019966	TGC	2	6	5198	5203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644875
71	NC_019966	TGC	2	6	5211	5216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644875
72	NC_019966	GCT	2	6	5217	5222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644875
73	NC_019966	CGG	2	6	5228	5233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644875
74	NC_019966	GCG	2	6	5299	5304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644875
75	NC_019966	GCG	2	6	5323	5328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644875
76	NC_019966	CGC	2	6	5403	5408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644875
77	NC_019966	GCG	2	6	5423	5428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644875
78	NC_019966	GCC	2	6	5449	5454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644875
79	NC_019966	GCG	2	6	5534	5539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644875
80	NC_019966	TCG	2	6	5546	5551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644875
81	NC_019966	CGA	2	6	5562	5567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644875
82	NC_019966	CGC	2	6	5652	5657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644875
83	NC_019966	TGC	2	6	5666	5671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644875
84	NC_019966	CTG	2	6	5695	5700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644875
85	NC_019966	CGA	2	6	5703	5708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644875
86	NC_019966	GCG	2	6	5788	5793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644875
87	NC_019966	ACG	2	6	5798	5803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644875
88	NC_019966	CGG	2	6	5827	5832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644875
89	NC_019966	CGA	2	6	5850	5855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644875
90	NC_019966	GAC	2	6	5901	5906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644876
91	NC_019966	CGA	2	6	5912	5917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644876
92	NC_019966	GCG	2	6	5972	5977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644876
93	NC_019966	GAA	2	6	5985	5990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433644876
94	NC_019966	CGA	2	6	6054	6059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644876
95	NC_019966	CGC	2	6	6078	6083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644876
96	NC_019966	CTG	2	6	6120	6125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644876
97	NC_019966	TGG	2	6	6211	6216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433644876
98	NC_019966	GTG	2	6	6363	6368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433644876
99	NC_019966	TCG	2	6	6382	6387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644876
100	NC_019966	CGT	2	6	6400	6405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644876
101	NC_019966	GCT	2	6	6697	6702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644877
102	NC_019966	GAA	3	9	6705	6713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433644877
103	NC_019966	CGA	2	6	6855	6860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644877
104	NC_019966	CGA	2	6	6903	6908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644877
105	NC_019966	GGC	2	6	6910	6915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644877
106	NC_019966	CGT	2	6	6984	6989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644877
107	NC_019966	GGC	2	6	7009	7014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644877
108	NC_019966	CGG	2	6	7044	7049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644877
109	NC_019966	GTC	2	6	7072	7077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644877
110	NC_019966	GAA	2	6	7185	7190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433644877
111	NC_019966	CAC	2	6	7197	7202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433644877
112	NC_019966	ACC	2	6	7237	7242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433644877
113	NC_019966	CAA	2	6	7293	7298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433644877
114	NC_019966	CCG	2	6	7334	7339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644877
115	NC_019966	CGA	2	6	7350	7355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644877
116	NC_019966	GTC	2	6	7357	7362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644877
117	NC_019966	CCG	2	6	7370	7375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644877
118	NC_019966	GAG	2	6	7393	7398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433644877
119	NC_019966	GCC	2	6	7402	7407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644877
120	NC_019966	CGG	2	6	7455	7460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644877
121	NC_019966	CCA	2	6	7506	7511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433644877
122	NC_019966	TCG	2	6	7517	7522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644877
123	NC_019966	GGC	2	6	7630	7635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644877
124	NC_019966	TGC	2	6	7656	7661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644877
125	NC_019966	ACC	2	6	7666	7671	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433644877
126	NC_019966	GTG	2	6	7672	7677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433644877
127	NC_019966	AAG	2	6	7696	7701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433644877
128	NC_019966	CTC	2	6	7702	7707	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433644877
129	NC_019966	AGA	2	6	7847	7852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433644877
130	NC_019966	TCG	2	6	7927	7932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644877
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