MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium canettii CIPT 140070008 complete genome

Total Repeats: 99472

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_019965	TCG	2	6	138528	138533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640246
3002	NC_019965	GGT	2	6	138597	138602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433640246
3003	NC_019965	CGC	2	6	138617	138622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640246
3004	NC_019965	CGG	2	6	138629	138634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640246
3005	NC_019965	GTG	2	6	138672	138677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433640246
3006	NC_019965	ACG	2	6	138692	138697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640246
3007	NC_019965	CTT	2	6	138726	138731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433640246
3008	NC_019965	CGG	2	6	138740	138745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640246
3009	NC_019965	GTC	2	6	138758	138763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640246
3010	NC_019965	CAA	2	6	138780	138785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433640246
3011	NC_019965	GTC	2	6	138792	138797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640246
3012	NC_019965	GACGCG	2	12	138804	138815	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	433640246
3013	NC_019965	CACT	2	8	138824	138831	25 %	25 %	0 %	50 %	433640246
3014	NC_019965	TCT	2	6	138863	138868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433640246
3015	NC_019965	GTG	2	6	138870	138875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433640246
3016	NC_019965	ATG	2	6	139041	139046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433640246
3017	NC_019965	CGCA	2	8	139076	139083	25 %	0 %	25 %	50 %	433640246
3018	NC_019965	GGA	2	6	139101	139106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433640246
3019	NC_019965	ACC	2	6	139576	139581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433640247
3020	NC_019965	TGT	2	6	139596	139601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433640247
3021	NC_019965	CGA	2	6	139622	139627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640247
3022	NC_019965	GGGC	2	8	139630	139637	0 %	0 %	75 %	25 %	433640247
3023	NC_019965	GCT	2	6	139644	139649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640247
3024	NC_019965	ACC	2	6	139891	139896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433640248
3025	NC_019965	GACC	2	8	139998	140005	25 %	0 %	25 %	50 %	433640248
3026	NC_019965	CGC	2	6	140027	140032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640248
3027	NC_019965	GGC	2	6	140168	140173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640248
3028	NC_019965	ACG	2	6	140186	140191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640248
3029	NC_019965	GGA	2	6	140204	140209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433640248
3030	NC_019965	CTG	2	6	140221	140226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640248
3031	NC_019965	CACC	2	8	140306	140313	25 %	0 %	0 %	75 %	433640248
3032	NC_019965	CACC	2	8	140349	140356	25 %	0 %	0 %	75 %	433640248
3033	NC_019965	CGGCG	2	10	140432	140441	0 %	0 %	60 %	40 %	433640248
3034	NC_019965	GTG	2	6	140455	140460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433640248
3035	NC_019965	CAC	3	9	140466	140474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433640248
3036	NC_019965	CAC	2	6	140490	140495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433640248
3037	NC_019965	CGG	2	6	140555	140560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640248
3038	NC_019965	CTGA	2	8	140569	140576	25 %	25 %	25 %	25 %	433640248
3039	NC_019965	GATA	2	8	140614	140621	50 %	25 %	25 %	0 %	433640248
3040	NC_019965	TCG	2	6	140842	140847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640249
3041	NC_019965	TGG	2	6	141007	141012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433640249
3042	NC_019965	TGCGG	2	10	141065	141074	0 %	20 %	60 %	20 %	433640249
3043	NC_019965	ACG	2	6	141123	141128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640249
3044	NC_019965	GGCT	2	8	141193	141200	0 %	25 %	50 %	25 %	433640249
3045	NC_019965	TGA	2	6	141275	141280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433640249
3046	NC_019965	GAG	2	6	141303	141308	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433640249
3047	NC_019965	TGT	2	6	141319	141324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433640249
3048	NC_019965	CGG	2	6	141328	141333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640249
3049	NC_019965	TGC	2	6	141337	141342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640249
3050	NC_019965	CGC	2	6	141434	141439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640249
3051	NC_019965	GTG	2	6	141583	141588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433640249
3052	NC_019965	CG	3	6	141594	141599	0 %	0 %	50 %	50 %	433640249
3053	NC_019965	TCA	2	6	141685	141690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433640249
3054	NC_019965	GC	3	6	141694	141699	0 %	0 %	50 %	50 %	433640249
3055	NC_019965	GGCGCT	2	12	141701	141712	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	433640249
3056	NC_019965	CGC	2	6	141753	141758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640249
3057	NC_019965	CGCTG	2	10	141772	141781	0 %	20 %	40 %	40 %	433640250
3058	NC_019965	GCC	2	6	141925	141930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640250
3059	NC_019965	CGTG	2	8	141956	141963	0 %	25 %	50 %	25 %	433640250
3060	NC_019965	GGC	2	6	142006	142011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640250
3061	NC_019965	TCG	2	6	142031	142036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640250
3062	NC_019965	CGC	2	6	142047	142052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640250
3063	NC_019965	GTT	2	6	142054	142059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433640250
3064	NC_019965	GAC	2	6	142066	142071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640250
3065	NC_019965	CGG	2	6	142173	142178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640250
3066	NC_019965	GAT	2	6	142258	142263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433640250
3067	NC_019965	GTTGC	2	10	142318	142327	0 %	40 %	40 %	20 %	433640250
3068	NC_019965	GAT	3	9	142371	142379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433640250
3069	NC_019965	CCG	2	6	142390	142395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640250
3070	NC_019965	CGC	2	6	142447	142452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640250
3071	NC_019965	GAG	2	6	142486	142491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433640250
3072	NC_019965	GCG	2	6	142605	142610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640250
3073	NC_019965	TAG	2	6	142624	142629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433640250
3074	NC_019965	CAG	2	6	142651	142656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640250
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3080	NC_019965	AGT	2	6	142895	142900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433640250
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3086	NC_019965	CCGAT	2	10	143066	143075	20 %	20 %	20 %	40 %	433640250
3087	NC_019965	CGC	2	6	143077	143082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640250
3088	NC_019965	GCG	2	6	143099	143104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640250
3089	NC_019965	CGC	2	6	143130	143135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640250
3090	NC_019965	CGGC	2	8	143152	143159	0 %	0 %	50 %	50 %	433640250
3091	NC_019965	ATC	2	6	143180	143185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433640250
3092	NC_019965	GTG	2	6	143198	143203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433640250
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3101	NC_019965	TCG	2	6	143742	143747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640251
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3103	NC_019965	GGCC	2	8	143806	143813	0 %	0 %	50 %	50 %	433640251
3104	NC_019965	CTG	2	6	143831	143836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640251
3105	NC_019965	GCA	2	6	143865	143870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640251
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3116	NC_019965	GAC	2	6	144196	144201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640251
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3118	NC_019965	CAT	2	6	144259	144264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433640251
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3120	NC_019965	CGG	2	6	144364	144369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640251
3121	NC_019965	GAC	2	6	144419	144424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640251
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3123	NC_019965	CGA	2	6	144462	144467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640251
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3230	NC_019965	GCT	2	6	149462	149467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640256
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3360	NC_019965	CGA	2	6	153354	153359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640258
3361	NC_019965	GCC	2	6	153477	153482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640258
3362	NC_019965	GCT	2	6	153549	153554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640258
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3364	NC_019965	GCA	2	6	153744	153749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640258
3365	NC_019965	CTG	2	6	153820	153825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640258
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3369	NC_019965	GTC	2	6	154182	154187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640259
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3400	NC_019965	GAC	2	6	155662	155667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640260
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3442	NC_019965	AGCC	2	8	157374	157381	25 %	0 %	25 %	50 %	433640261
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3451	NC_019965	GCCA	2	8	158188	158195	25 %	0 %	25 %	50 %	433640263
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3453	NC_019965	CGG	2	6	158275	158280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640263
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3470	NC_019965	CGT	2	6	158762	158767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640263
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3472	NC_019965	TCT	2	6	158876	158881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433640263
3473	NC_019965	CGTA	2	8	158882	158889	25 %	25 %	25 %	25 %	433640263
3474	NC_019965	ACG	2	6	158927	158932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640263
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3480	NC_019965	AGC	2	6	159085	159090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640263
3481	NC_019965	TCG	2	6	159115	159120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640263
3482	NC_019965	GAT	2	6	159204	159209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433640263
3483	NC_019965	AGC	2	6	159217	159222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640263
3484	NC_019965	TGACC	2	10	159230	159239	20 %	20 %	20 %	40 %	433640263
3485	NC_019965	CCG	2	6	159250	159255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640263
3486	NC_019965	CGGCG	2	10	159476	159485	0 %	0 %	60 %	40 %	433640263
3487	NC_019965	GTC	2	6	159593	159598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640264
3488	NC_019965	GCACC	2	10	159646	159655	20 %	0 %	20 %	60 %	433640264
3489	NC_019965	ACCG	2	8	159677	159684	25 %	0 %	25 %	50 %	433640264
3490	NC_019965	CGG	2	6	159721	159726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640264
3491	NC_019965	CGG	2	6	159766	159771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640264
3492	NC_019965	CGG	2	6	159787	159792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640264
3493	NC_019965	GGC	2	6	159797	159802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640264
3494	NC_019965	GTC	2	6	159809	159814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640264
3495	NC_019965	CGA	2	6	159817	159822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640264
3496	NC_019965	AGC	2	6	159900	159905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640264
3497	NC_019965	CGT	2	6	159910	159915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640264
3498	NC_019965	CGGC	2	8	159954	159961	0 %	0 %	50 %	50 %	433640264
3499	NC_019965	CGG	3	9	160001	160009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640264
3500	NC_019965	TCG	2	6	160038	160043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640264

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