MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium canettii CIPT 140070008 complete genome

Total Repeats: 99472

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_019965	TGC	2	6	116072	116077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640232
2502	NC_019965	GCC	2	6	116095	116100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640232
2503	NC_019965	GTC	2	6	116113	116118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640232
2504	NC_019965	GGC	3	9	116165	116173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640232
2505	NC_019965	TCG	2	6	116195	116200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640232
2506	NC_019965	CCG	2	6	116264	116269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640232
2507	NC_019965	ACC	2	6	116290	116295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433640232
2508	NC_019965	CCG	2	6	116324	116329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640232
2509	NC_019965	TGC	2	6	116337	116342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640232
2510	NC_019965	CGG	2	6	116409	116414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640232
2511	NC_019965	GGC	2	6	116422	116427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640232
2512	NC_019965	TGC	3	9	116456	116464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640232
2513	NC_019965	GAT	2	6	116514	116519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433640232
2514	NC_019965	CTC	2	6	116606	116611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433640232
2515	NC_019965	GTTC	2	8	116612	116619	0 %	50 %	25 %	25 %	433640232
2516	NC_019965	CG	3	6	116650	116655	0 %	0 %	50 %	50 %	433640232
2517	NC_019965	GC	3	6	116708	116713	0 %	0 %	50 %	50 %	433640232
2518	NC_019965	TGA	2	6	116756	116761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433640232
2519	NC_019965	ACG	3	9	116768	116776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640232
2520	NC_019965	CGC	2	6	116830	116835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640232
2521	NC_019965	TGC	2	6	116915	116920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640232
2522	NC_019965	TGC	2	6	116924	116929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640232
2523	NC_019965	CCGA	3	12	116986	116997	25 %	0 %	25 %	50 %	433640232
2524	NC_019965	GCG	2	6	117016	117021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640232
2525	NC_019965	CAT	2	6	117075	117080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433640232
2526	NC_019965	CTG	2	6	117385	117390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640233
2527	NC_019965	GT	3	6	117392	117397	0 %	50 %	50 %	0 %	433640233
2528	NC_019965	GGT	2	6	117402	117407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433640233
2529	NC_019965	GC	3	6	117433	117438	0 %	0 %	50 %	50 %	433640233
2530	NC_019965	TTC	2	6	117502	117507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433640233
2531	NC_019965	GC	3	6	117539	117544	0 %	0 %	50 %	50 %	433640233
2532	NC_019965	CGC	2	6	117594	117599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640233
2533	NC_019965	CTG	2	6	117616	117621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640233
2534	NC_019965	TGG	2	6	117665	117670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433640233
2535	NC_019965	GCC	2	6	117679	117684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640233
2536	NC_019965	CTG	2	6	117712	117717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640233
2537	NC_019965	CGC	2	6	117744	117749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640233
2538	NC_019965	TTG	2	6	117773	117778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433640233
2539	NC_019965	GC	3	6	117788	117793	0 %	0 %	50 %	50 %	433640233
2540	NC_019965	TGG	2	6	117794	117799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433640233
2541	NC_019965	TGC	2	6	117845	117850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640233
2542	NC_019965	CGT	2	6	117870	117875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640233
2543	NC_019965	GCG	2	6	117988	117993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640233
2544	NC_019965	ACG	2	6	118003	118008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640233
2545	NC_019965	TGC	2	6	118073	118078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640233
2546	NC_019965	GTT	2	6	118164	118169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433640233
2547	NC_019965	CTG	2	6	118173	118178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640233
2548	NC_019965	GCC	2	6	118194	118199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640233
2549	NC_019965	CGC	2	6	118213	118218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640233
2550	NC_019965	GGT	2	6	118219	118224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433640233
2551	NC_019965	ATG	2	6	118246	118251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433640233
2552	NC_019965	GCC	2	6	118252	118257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640233
2553	NC_019965	CCGCG	2	10	118289	118298	0 %	0 %	40 %	60 %	433640233
2554	NC_019965	CCG	2	6	118357	118362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640233
2555	NC_019965	GCG	2	6	118441	118446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640233
2556	NC_019965	CGC	2	6	118452	118457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640233
2557	NC_019965	GCG	2	6	118461	118466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640233
2558	NC_019965	TGC	2	6	118664	118669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640233
2559	NC_019965	GCC	2	6	118689	118694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640233
2560	NC_019965	GCT	2	6	118719	118724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640233
2561	NC_019965	TGG	2	6	118871	118876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433640233
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2563	NC_019965	CTT	2	6	118983	118988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433640233
2564	NC_019965	TGA	2	6	119000	119005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433640233
2565	NC_019965	TGT	2	6	119009	119014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433640233
2566	NC_019965	CAT	2	6	119067	119072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433640233
2567	NC_019965	CGG	2	6	119088	119093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640233
2568	NC_019965	TCA	2	6	119126	119131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433640233
2569	NC_019965	GC	3	6	119161	119166	0 %	0 %	50 %	50 %	433640233
2570	NC_019965	CCG	2	6	119172	119177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640233
2571	NC_019965	CGA	3	9	119220	119228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640233
2572	NC_019965	GCG	2	6	119271	119276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640233
2573	NC_019965	ACG	2	6	119536	119541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640234
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2579	NC_019965	CGT	2	6	119804	119809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640234
2580	NC_019965	CTTG	2	8	119843	119850	0 %	50 %	25 %	25 %	433640234
2581	NC_019965	GCA	2	6	119885	119890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640234
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2583	NC_019965	CGG	3	9	119936	119944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640234
2584	NC_019965	CGG	2	6	120002	120007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640234
2585	NC_019965	GAC	2	6	120054	120059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640234
2586	NC_019965	CGAC	2	8	120065	120072	25 %	0 %	25 %	50 %	433640234
2587	NC_019965	GC	3	6	120111	120116	0 %	0 %	50 %	50 %	433640234
2588	NC_019965	CGT	2	6	120131	120136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640234
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2590	NC_019965	GCC	3	9	120274	120282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640234
2591	NC_019965	GCG	3	9	120310	120318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640234
2592	NC_019965	TCGC	2	8	120342	120349	0 %	25 %	25 %	50 %	433640234
2593	NC_019965	CAT	2	6	120510	120515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433640234
2594	NC_019965	CG	3	6	120585	120590	0 %	0 %	50 %	50 %	433640234
2595	NC_019965	ACC	2	6	120649	120654	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433640234
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2598	NC_019965	GCC	2	6	120823	120828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640234
2599	NC_019965	ATCG	2	8	120873	120880	25 %	25 %	25 %	25 %	433640234
2600	NC_019965	CTT	2	6	120951	120956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433640234
2601	NC_019965	TCGC	2	8	120961	120968	0 %	25 %	25 %	50 %	433640234
2602	NC_019965	GCA	3	9	120995	121003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640234
2603	NC_019965	GGC	2	6	121180	121185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640234
2604	NC_019965	GACG	2	8	121197	121204	25 %	0 %	50 %	25 %	433640234
2605	NC_019965	GGC	2	6	121221	121226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640234
2606	NC_019965	CCGA	2	8	121234	121241	25 %	0 %	25 %	50 %	433640234
2607	NC_019965	GTC	2	6	121261	121266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640234
2608	NC_019965	GC	3	6	121272	121277	0 %	0 %	50 %	50 %	433640234
2609	NC_019965	AAC	2	6	121390	121395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433640234
2610	NC_019965	CAGC	2	8	121406	121413	25 %	0 %	25 %	50 %	433640234
2611	NC_019965	AAC	2	6	121420	121425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433640234
2612	NC_019965	CCG	2	6	121427	121432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640234
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2616	NC_019965	GCG	2	6	121517	121522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640234
2617	NC_019965	ACC	2	6	121546	121551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433640234
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2619	NC_019965	CCG	2	6	121707	121712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640234
2620	NC_019965	CGC	2	6	121978	121983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640235
2621	NC_019965	CTG	2	6	121991	121996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640235
2622	NC_019965	ACGC	2	8	122003	122010	25 %	0 %	25 %	50 %	433640235
2623	NC_019965	TGC	2	6	122013	122018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640235
2624	NC_019965	CGA	2	6	122128	122133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640235
2625	NC_019965	TTC	2	6	122198	122203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433640235
2626	NC_019965	TCGTG	2	10	122242	122251	0 %	40 %	40 %	20 %	433640235
2627	NC_019965	CTC	2	6	122252	122257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433640235
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2631	NC_019965	TCG	2	6	122355	122360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640235
2632	NC_019965	TCA	2	6	122382	122387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433640235
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2654	NC_019965	CGC	2	6	123610	123615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640236
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2727	NC_019965	CGG	2	6	126708	126713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640238
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2729	NC_019965	CTA	2	6	126776	126781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433640238
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2731	NC_019965	GCGTGC	2	12	126830	126841	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	433640238
2732	NC_019965	CG	5	10	126868	126877	0 %	0 %	50 %	50 %	433640238
2733	NC_019965	GCA	2	6	126885	126890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640238
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2736	NC_019965	TGC	2	6	126945	126950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640238
2737	NC_019965	GC	3	6	126957	126962	0 %	0 %	50 %	50 %	433640238
2738	NC_019965	ACC	2	6	126965	126970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433640238
2739	NC_019965	GCGAG	2	10	127045	127054	20 %	0 %	60 %	20 %	433640238
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2982	NC_019965	CAG	2	6	137737	137742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640245
2983	NC_019965	TGA	2	6	137759	137764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433640245
2984	NC_019965	CAC	2	6	137854	137859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433640245
2985	NC_019965	GAC	2	6	137918	137923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640245
2986	NC_019965	CA	3	6	137987	137992	50 %	0 %	0 %	50 %	433640245
2987	NC_019965	CGC	2	6	137997	138002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640245
2988	NC_019965	TGC	2	6	138003	138008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640245
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2990	NC_019965	CGG	2	6	138170	138175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640246
2991	NC_019965	GAGAT	2	10	138277	138286	40 %	20 %	40 %	0 %	433640246
2992	NC_019965	TCGC	2	8	138293	138300	0 %	25 %	25 %	50 %	433640246
2993	NC_019965	TCGA	2	8	138327	138334	25 %	25 %	25 %	25 %	433640246
2994	NC_019965	TC	3	6	138345	138350	0 %	50 %	0 %	50 %	433640246
2995	NC_019965	GAA	2	6	138351	138356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433640246
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2999	NC_019965	TCG	2	6	138474	138479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640246
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