MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium canettii CIPT 140070008 complete genome

Total Repeats: 99472

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_019965	GTC	2	6	48615	48620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640173
1003	NC_019965	GGC	2	6	48623	48628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640173
1004	NC_019965	TCG	2	6	48658	48663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640173
1005	NC_019965	CCCGA	2	10	48682	48691	20 %	0 %	20 %	60 %	433640173
1006	NC_019965	GCCG	2	8	48704	48711	0 %	0 %	50 %	50 %	433640173
1007	NC_019965	AGC	2	6	48748	48753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640173
1008	NC_019965	AAG	2	6	48880	48885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433640173
1009	NC_019965	CGG	2	6	48928	48933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640173
1010	NC_019965	G	6	6	48959	48964	0 %	0 %	100 %	0 %	433640173
1011	NC_019965	TGC	2	6	48967	48972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640173
1012	NC_019965	GT	3	6	49049	49054	0 %	50 %	50 %	0 %	433640174
1013	NC_019965	GC	3	6	49084	49089	0 %	0 %	50 %	50 %	433640174
1014	NC_019965	CGA	2	6	49124	49129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640174
1015	NC_019965	CGG	2	6	49169	49174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640174
1016	NC_019965	CGA	2	6	49197	49202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640174
1017	NC_019965	GCC	2	6	49203	49208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640174
1018	NC_019965	CGT	2	6	49244	49249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640174
1019	NC_019965	CGG	2	6	49321	49326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640174
1020	NC_019965	CGC	2	6	49340	49345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640174
1021	NC_019965	GCT	2	6	49454	49459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640174
1022	NC_019965	CGG	2	6	49460	49465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640174
1023	NC_019965	CGA	2	6	49505	49510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640174
1024	NC_019965	GCG	2	6	49649	49654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640174
1025	NC_019965	TCC	2	6	49666	49671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433640174
1026	NC_019965	CGA	2	6	49730	49735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640174
1027	NC_019965	CCG	3	9	49765	49773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640174
1028	NC_019965	GCC	2	6	49800	49805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640174
1029	NC_019965	CAGCG	2	10	49807	49816	20 %	0 %	40 %	40 %	433640174
1030	NC_019965	CAGC	2	8	49889	49896	25 %	0 %	25 %	50 %	433640174
1031	NC_019965	TCG	2	6	49924	49929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640174
1032	NC_019965	GAT	2	6	50028	50033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433640175
1033	NC_019965	GC	5	10	50048	50057	0 %	0 %	50 %	50 %	433640175
1034	NC_019965	GTC	2	6	50061	50066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640175
1035	NC_019965	GCT	2	6	50072	50077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640175
1036	NC_019965	CGGG	2	8	50078	50085	0 %	0 %	75 %	25 %	433640175
1037	NC_019965	TCA	2	6	50090	50095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433640175
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1039	NC_019965	GCC	2	6	50152	50157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640175
1040	NC_019965	GAT	2	6	50169	50174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433640175
1041	NC_019965	GCCG	2	8	50178	50185	0 %	0 %	50 %	50 %	433640175
1042	NC_019965	TCG	2	6	50281	50286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640175
1043	NC_019965	TCT	2	6	50378	50383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433640175
1044	NC_019965	GCC	2	6	50430	50435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640175
1045	NC_019965	CGC	2	6	50468	50473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640175
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1047	NC_019965	TCG	2	6	50510	50515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640175
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1051	NC_019965	TCC	2	6	50671	50676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433640175
1052	NC_019965	CCT	2	6	50717	50722	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433640175
1053	NC_019965	GAC	2	6	50733	50738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640175
1054	NC_019965	GTA	2	6	50778	50783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433640175
1055	NC_019965	GTT	2	6	50859	50864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433640175
1056	NC_019965	CTT	2	6	50904	50909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433640175
1057	NC_019965	CGC	2	6	50925	50930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640175
1058	NC_019965	GTC	2	6	51000	51005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640175
1059	NC_019965	GTA	3	9	51012	51020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433640175
1060	NC_019965	GCCGAC	2	12	51054	51065	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	433640175
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1063	NC_019965	CGCT	2	8	51256	51263	0 %	25 %	25 %	50 %	433640176
1064	NC_019965	CTG	2	6	51313	51318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640176
1065	NC_019965	GGC	2	6	51365	51370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640176
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1069	NC_019965	CCA	2	6	51476	51481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433640176
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1087	NC_019965	CCA	2	6	52503	52508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433640177
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1106	NC_019965	CG	3	6	53921	53926	0 %	0 %	50 %	50 %	433640179
1107	NC_019965	AAC	2	6	53937	53942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433640179
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1111	NC_019965	CGA	2	6	54067	54072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640179
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1120	NC_019965	CT	3	6	54328	54333	0 %	50 %	0 %	50 %	433640179
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1229	NC_019965	GCGG	2	8	58831	58838	0 %	0 %	75 %	25 %	433640183
1230	NC_019965	AGC	2	6	58843	58848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640183
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1232	NC_019965	CGAGGT	2	12	58889	58900	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	433640183
1233	NC_019965	CTTCG	2	10	58915	58924	0 %	40 %	20 %	40 %	433640183
1234	NC_019965	CAA	2	6	58943	58948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433640183
1235	NC_019965	GCG	2	6	58960	58965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640183
1236	NC_019965	CCGGCG	2	12	58986	58997	0 %	0 %	50 %	50 %	433640183
1237	NC_019965	CAG	2	6	59003	59008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640183
1238	NC_019965	GTTC	2	8	59050	59057	0 %	50 %	25 %	25 %	433640183
1239	NC_019965	GGC	3	9	59058	59066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640183
1240	NC_019965	GCG	2	6	59146	59151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640184
1241	NC_019965	GAA	2	6	59200	59205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433640184
1242	NC_019965	AGCG	2	8	59255	59262	25 %	0 %	50 %	25 %	433640184
1243	NC_019965	CG	4	8	59273	59280	0 %	0 %	50 %	50 %	433640184
1244	NC_019965	GCA	2	6	59302	59307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640184
1245	NC_019965	GAA	2	6	59332	59337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433640184
1246	NC_019965	GCT	2	6	59353	59358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640184
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1248	NC_019965	TCG	2	6	59525	59530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640185
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1497	NC_019965	CCG	2	6	72201	72206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640197
1498	NC_019965	GTA	2	6	72229	72234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433640197
1499	NC_019965	GCC	2	6	72235	72240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640197
1500	NC_019965	GCT	2	6	72339	72344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640197

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