MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium canettii CIPT 140070008 complete genome

Total Repeats: 99472

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_019965	GCCG	2	8	24421	24428	0 %	0 %	50 %	50 %	433640148
502	NC_019965	CGGG	2	8	24496	24503	0 %	0 %	75 %	25 %	433640148
503	NC_019965	CTC	2	6	24533	24538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433640148
504	NC_019965	CCG	2	6	24573	24578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640148
505	NC_019965	GCC	2	6	24590	24595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640148
506	NC_019965	GCC	2	6	24614	24619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640148
507	NC_019965	GCCGG	2	10	24666	24675	0 %	0 %	60 %	40 %	433640148
508	NC_019965	AGG	2	6	24683	24688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433640148
509	NC_019965	GCG	2	6	24703	24708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640148
510	NC_019965	C	6	6	24714	24719	0 %	0 %	0 %	100 %	433640148
511	NC_019965	CCTGGT	2	12	24745	24756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640148
512	NC_019965	GCC	2	6	24881	24886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640148
513	NC_019965	C	6	6	24902	24907	0 %	0 %	0 %	100 %	433640148
514	NC_019965	CCA	2	6	24939	24944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433640148
515	NC_019965	GTC	2	6	24974	24979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640148
516	NC_019965	TCG	2	6	24987	24992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640148
517	NC_019965	GCCCCT	2	12	24997	25008	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	433640148
518	NC_019965	CGG	2	6	25103	25108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640148
519	NC_019965	CGA	2	6	25169	25174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640148
520	NC_019965	GAC	2	6	25187	25192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640148
521	NC_019965	ATG	2	6	25314	25319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433640148
522	NC_019965	GCC	2	6	25371	25376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640148
523	NC_019965	GCA	2	6	25384	25389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640148
524	NC_019965	GC	3	6	25980	25985	0 %	0 %	50 %	50 %	433640149
525	NC_019965	CGC	2	6	26003	26008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640149
526	NC_019965	TTG	2	6	26009	26014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433640149
527	NC_019965	CGG	2	6	26035	26040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640149
528	NC_019965	CGG	2	6	26077	26082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640149
529	NC_019965	GCA	2	6	26109	26114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640149
530	NC_019965	CTT	2	6	26140	26145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433640149
531	NC_019965	GT	3	6	26214	26219	0 %	50 %	50 %	0 %	433640149
532	NC_019965	GTG	2	6	26259	26264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433640149
533	NC_019965	GTC	2	6	26273	26278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640149
534	NC_019965	GCC	2	6	26286	26291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640149
535	NC_019965	AGC	2	6	26292	26297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640149
536	NC_019965	CGG	2	6	26365	26370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640149
537	NC_019965	CGG	2	6	26386	26391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640149
538	NC_019965	CGG	2	6	26419	26424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640149
539	NC_019965	CGA	2	6	26464	26469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640149
540	NC_019965	CCA	2	6	26536	26541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433640149
541	NC_019965	GCTC	2	8	26565	26572	0 %	25 %	25 %	50 %	433640149
542	NC_019965	CGG	2	6	26614	26619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640149
543	NC_019965	AGC	2	6	26700	26705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640149
544	NC_019965	TGA	2	6	26731	26736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433640149
545	NC_019965	GCG	2	6	26760	26765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640149
546	NC_019965	CCAA	2	8	26782	26789	50 %	0 %	0 %	50 %	433640149
547	NC_019965	GCC	2	6	26804	26809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640149
548	NC_019965	CAGC	2	8	26848	26855	25 %	0 %	25 %	50 %	433640149
549	NC_019965	CCG	2	6	26859	26864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640149
550	NC_019965	CAC	2	6	26936	26941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433640149
551	NC_019965	CAC	2	6	27125	27130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433640150
552	NC_019965	CAG	2	6	27173	27178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640150
553	NC_019965	CGC	2	6	27214	27219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640150
554	NC_019965	GCA	2	6	27232	27237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640150
555	NC_019965	CGT	2	6	27238	27243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640150
556	NC_019965	GCC	2	6	27278	27283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640150
557	NC_019965	GCT	2	6	27352	27357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640150
558	NC_019965	GCG	2	6	27429	27434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640150
559	NC_019965	CGT	2	6	27445	27450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640150
560	NC_019965	CGGC	2	8	27668	27675	0 %	0 %	50 %	50 %	433640151
561	NC_019965	GGC	2	6	27726	27731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640151
562	NC_019965	CA	3	6	27788	27793	50 %	0 %	0 %	50 %	433640151
563	NC_019965	GCC	2	6	27831	27836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640151
564	NC_019965	CGC	2	6	27861	27866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640151
565	NC_019965	CGC	2	6	27897	27902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640151
566	NC_019965	CCG	2	6	27927	27932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640151
567	NC_019965	GTC	2	6	27943	27948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640151
568	NC_019965	CGA	2	6	28037	28042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640151
569	NC_019965	TC	3	6	28068	28073	0 %	50 %	0 %	50 %	433640151
570	NC_019965	GCC	2	6	28108	28113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640151
571	NC_019965	CCGG	2	8	28154	28161	0 %	0 %	50 %	50 %	433640151
572	NC_019965	CG	3	6	28193	28198	0 %	0 %	50 %	50 %	433640151
573	NC_019965	GC	3	6	28199	28204	0 %	0 %	50 %	50 %	433640151
574	NC_019965	GTC	2	6	28260	28265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640151
575	NC_019965	TCGGCG	2	12	28295	28306	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	433640151
576	NC_019965	CGA	2	6	28308	28313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640151
577	NC_019965	GC	3	6	28352	28357	0 %	0 %	50 %	50 %	433640151
578	NC_019965	TCG	2	6	28376	28381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640151
579	NC_019965	ACG	2	6	28400	28405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640151
580	NC_019965	GCA	2	6	28416	28421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640151
581	NC_019965	TCA	2	6	28457	28462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433640152
582	NC_019965	CAC	2	6	28505	28510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433640152
583	NC_019965	CTG	2	6	28524	28529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640152
584	NC_019965	GGC	2	6	28598	28603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640152
585	NC_019965	CTG	2	6	28612	28617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640152
586	NC_019965	TCA	2	6	28645	28650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433640152
587	NC_019965	CGG	2	6	28680	28685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640152
588	NC_019965	CGA	2	6	28703	28708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640152
589	NC_019965	GCTC	2	8	28710	28717	0 %	25 %	25 %	50 %	433640152
590	NC_019965	ACC	2	6	28722	28727	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433640152
591	NC_019965	CGT	2	6	28770	28775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640152
592	NC_019965	GC	4	8	28787	28794	0 %	0 %	50 %	50 %	433640152
593	NC_019965	CGA	2	6	28818	28823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640152
594	NC_019965	ACG	2	6	28829	28834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640152
595	NC_019965	GGC	2	6	28841	28846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640152
596	NC_019965	TGCG	2	8	28849	28856	0 %	25 %	50 %	25 %	433640152
597	NC_019965	CGC	2	6	28946	28951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640152
598	NC_019965	CAC	2	6	29063	29068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433640152
599	NC_019965	CCGG	2	8	29114	29121	0 %	0 %	50 %	50 %	433640152
600	NC_019965	CAA	2	6	29168	29173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433640152
601	NC_019965	GTC	2	6	29178	29183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640152
602	NC_019965	CAA	2	6	29228	29233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433640152
603	NC_019965	GGCAA	2	10	29361	29370	40 %	0 %	40 %	20 %	433640153
604	NC_019965	GC	3	6	29420	29425	0 %	0 %	50 %	50 %	433640153
605	NC_019965	CGTC	2	8	29445	29452	0 %	25 %	25 %	50 %	433640153
606	NC_019965	CG	3	6	29482	29487	0 %	0 %	50 %	50 %	433640153
607	NC_019965	GGATCA	2	12	29493	29504	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	433640153
608	NC_019965	AGC	2	6	29561	29566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640153
609	NC_019965	GTC	2	6	29581	29586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640153
610	NC_019965	GCC	3	9	29587	29595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640153
611	NC_019965	CACG	2	8	29805	29812	25 %	0 %	25 %	50 %	433640154
612	NC_019965	ACCG	2	8	29886	29893	25 %	0 %	25 %	50 %	433640154
613	NC_019965	GGT	2	6	29904	29909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433640154
614	NC_019965	CGC	2	6	30015	30020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640154
615	NC_019965	AGC	2	6	30042	30047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640154
616	NC_019965	GTC	2	6	30091	30096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640154
617	NC_019965	CGATC	2	10	30187	30196	20 %	20 %	20 %	40 %	433640154
618	NC_019965	CCGG	2	8	30205	30212	0 %	0 %	50 %	50 %	433640154
619	NC_019965	CG	3	6	30213	30218	0 %	0 %	50 %	50 %	433640154
620	NC_019965	GGT	2	6	30264	30269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433640154
621	NC_019965	GCC	2	6	30313	30318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640154
622	NC_019965	GTCG	2	8	30381	30388	0 %	25 %	50 %	25 %	433640154
623	NC_019965	GCG	2	6	30395	30400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640154
624	NC_019965	CAG	2	6	30421	30426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640154
625	NC_019965	CCT	2	6	30459	30464	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433640154
626	NC_019965	GCT	3	9	30471	30479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640154
627	NC_019965	CGT	2	6	30548	30553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640154
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629	NC_019965	CTG	2	6	30661	30666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640154
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