MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium canettii CIPT 140070008 complete genome

Total Repeats: 99472

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_019965	GCG	2	6	248165	248170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640340
5502	NC_019965	GCA	2	6	248172	248177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640340
5503	NC_019965	CAC	2	6	248178	248183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433640340
5504	NC_019965	TGG	2	6	248214	248219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433640340
5505	NC_019965	GGC	2	6	248232	248237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640340
5506	NC_019965	TGG	2	6	248243	248248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433640340
5507	NC_019965	GAA	2	6	248272	248277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433640340
5508	NC_019965	GCA	2	6	248319	248324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640340
5509	NC_019965	AGC	2	6	248393	248398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640340
5510	NC_019965	AGCC	2	8	248401	248408	25 %	0 %	25 %	50 %	433640340
5511	NC_019965	TCGCCA	2	12	248457	248468	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	433640340
5512	NC_019965	ACC	2	6	248504	248509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433640340
5513	NC_019965	CG	3	6	248553	248558	0 %	0 %	50 %	50 %	433640340
5514	NC_019965	AGG	2	6	248576	248581	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433640340
5515	NC_019965	CCG	2	6	248638	248643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640340
5516	NC_019965	GT	3	6	248685	248690	0 %	50 %	50 %	0 %	433640340
5517	NC_019965	GCAT	2	8	248717	248724	25 %	25 %	25 %	25 %	433640340
5518	NC_019965	TGG	2	6	248732	248737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433640340
5519	NC_019965	TCG	2	6	248899	248904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640341
5520	NC_019965	CCA	2	6	248923	248928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433640341
5521	NC_019965	CCG	2	6	248932	248937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640341
5522	NC_019965	GCC	2	6	248967	248972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640341
5523	NC_019965	GGGT	2	8	249007	249014	0 %	25 %	75 %	0 %	433640341
5524	NC_019965	GC	4	8	249027	249034	0 %	0 %	50 %	50 %	433640341
5525	NC_019965	TCG	2	6	249054	249059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640341
5526	NC_019965	GTC	2	6	249111	249116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640341
5527	NC_019965	CGC	2	6	249161	249166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640341
5528	NC_019965	GGT	2	6	249179	249184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433640341
5529	NC_019965	GGCC	2	8	249209	249216	0 %	0 %	50 %	50 %	433640341
5530	NC_019965	GC	3	6	249259	249264	0 %	0 %	50 %	50 %	433640341
5531	NC_019965	CGA	2	6	249329	249334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640341
5532	NC_019965	TGA	2	6	249338	249343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433640341
5533	NC_019965	GCC	2	6	249372	249377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640341
5534	NC_019965	GGC	2	6	249425	249430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640341
5535	NC_019965	CGGTTG	2	12	249456	249467	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	433640341
5536	NC_019965	GGCCG	2	10	249517	249526	0 %	0 %	60 %	40 %	433640341
5537	NC_019965	CCG	3	9	249604	249612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640341
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5539	NC_019965	CGG	2	6	249689	249694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640341
5540	NC_019965	CGA	3	9	249716	249724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640341
5541	NC_019965	GGC	2	6	249743	249748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640341
5542	NC_019965	GCC	2	6	249804	249809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640341
5543	NC_019965	GCGGT	2	10	249822	249831	0 %	20 %	60 %	20 %	433640341
5544	NC_019965	GCGGA	2	10	249874	249883	20 %	0 %	60 %	20 %	433640341
5545	NC_019965	CG	3	6	249962	249967	0 %	0 %	50 %	50 %	433640342
5546	NC_019965	TGA	2	6	249973	249978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433640342
5547	NC_019965	CCGG	2	8	249980	249987	0 %	0 %	50 %	50 %	433640342
5548	NC_019965	TGG	2	6	249999	250004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433640342
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5551	NC_019965	GGT	2	6	250060	250065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433640342
5552	NC_019965	TGGC	2	8	250082	250089	0 %	25 %	50 %	25 %	433640342
5553	NC_019965	GC	3	6	250105	250110	0 %	0 %	50 %	50 %	433640342
5554	NC_019965	TCG	2	6	250143	250148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640342
5555	NC_019965	GTG	2	6	250187	250192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433640342
5556	NC_019965	GTT	2	6	250196	250201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433640342
5557	NC_019965	CCG	2	6	250248	250253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640342
5558	NC_019965	GGT	2	6	250270	250275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433640342
5559	NC_019965	CG	5	10	250348	250357	0 %	0 %	50 %	50 %	433640342
5560	NC_019965	GCC	2	6	250391	250396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640342
5561	NC_019965	GAC	2	6	250424	250429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640342
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5563	NC_019965	CG	3	6	250471	250476	0 %	0 %	50 %	50 %	433640342
5564	NC_019965	TGCG	2	8	250488	250495	0 %	25 %	50 %	25 %	433640342
5565	NC_019965	CG	3	6	250519	250524	0 %	0 %	50 %	50 %	433640342
5566	NC_019965	CGG	2	6	250556	250561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640342
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5568	NC_019965	GC	4	8	250645	250652	0 %	0 %	50 %	50 %	433640342
5569	NC_019965	TGC	2	6	250707	250712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640342
5570	NC_019965	CG	3	6	250779	250784	0 %	0 %	50 %	50 %	433640342
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5589	NC_019965	GTGC	2	8	251384	251391	0 %	25 %	50 %	25 %	433640342
5590	NC_019965	CGA	2	6	251655	251660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640343
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5593	NC_019965	TCA	2	6	251790	251795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433640343
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5595	NC_019965	CG	3	6	251854	251859	0 %	0 %	50 %	50 %	433640343
5596	NC_019965	CAA	2	6	251914	251919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433640343
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5598	NC_019965	CAT	2	6	251947	251952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433640343
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5602	NC_019965	TCGG	2	8	252161	252168	0 %	25 %	50 %	25 %	433640343
5603	NC_019965	CGC	2	6	252171	252176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640343
5604	NC_019965	TGGCC	2	10	252198	252207	0 %	20 %	40 %	40 %	433640343
5605	NC_019965	CGG	2	6	252277	252282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640343
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5609	NC_019965	TAC	2	6	252404	252409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433640343
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5619	NC_019965	GC	3	6	252908	252913	0 %	0 %	50 %	50 %	433640343
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5863	NC_019965	TAC	2	6	263960	263965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433640353
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5982	NC_019965	GAT	2	6	268991	268996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433640357
5983	NC_019965	TCGGC	2	10	269000	269009	0 %	20 %	40 %	40 %	433640357
5984	NC_019965	GTCGA	2	10	269016	269025	20 %	20 %	40 %	20 %	433640357
5985	NC_019965	TGT	2	6	269026	269031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433640357
5986	NC_019965	AGCG	2	8	269112	269119	25 %	0 %	50 %	25 %	433640357
5987	NC_019965	CGA	2	6	269144	269149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640357
5988	NC_019965	CGC	2	6	269188	269193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640357
5989	NC_019965	GTG	3	9	269196	269204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433640357
5990	NC_019965	TCG	2	6	269296	269301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640357
5991	NC_019965	TGG	2	6	269310	269315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433640357
5992	NC_019965	CGA	2	6	269384	269389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640357
5993	NC_019965	TGC	2	6	269407	269412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640357
5994	NC_019965	TTG	2	6	269430	269435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433640357
5995	NC_019965	GGC	2	6	269474	269479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640357
5996	NC_019965	CCA	2	6	269494	269499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433640357
5997	NC_019965	TCC	2	6	269511	269516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433640357
5998	NC_019965	GGT	2	6	269517	269522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433640357
5999	NC_019965	TCG	2	6	269536	269541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640357
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