MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium canettii CIPT 140070008 complete genome

Total Repeats: 99472

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_019965	GCG	2	6	227311	227316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640326
5003	NC_019965	GTC	2	6	227332	227337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640326
5004	NC_019965	AGG	2	6	227351	227356	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433640326
5005	NC_019965	CG	3	6	227389	227394	0 %	0 %	50 %	50 %	433640326
5006	NC_019965	GCT	2	6	227445	227450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640326
5007	NC_019965	CGG	2	6	227493	227498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640326
5008	NC_019965	ATGG	2	8	227499	227506	25 %	25 %	50 %	0 %	433640326
5009	NC_019965	GCA	2	6	227516	227521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640326
5010	NC_019965	TTG	2	6	227537	227542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433640326
5011	NC_019965	GCCT	2	8	227551	227558	0 %	25 %	25 %	50 %	433640326
5012	NC_019965	GCA	2	6	227610	227615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640326
5013	NC_019965	GCGG	2	8	227619	227626	0 %	0 %	75 %	25 %	433640326
5014	NC_019965	CCGA	2	8	227658	227665	25 %	0 %	25 %	50 %	433640326
5015	NC_019965	CCGG	2	8	227784	227791	0 %	0 %	50 %	50 %	433640326
5016	NC_019965	GGT	2	6	227805	227810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433640326
5017	NC_019965	GC	3	6	227813	227818	0 %	0 %	50 %	50 %	433640326
5018	NC_019965	ACC	2	6	227833	227838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433640326
5019	NC_019965	ACG	2	6	227864	227869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640326
5020	NC_019965	CA	3	6	227871	227876	50 %	0 %	0 %	50 %	433640326
5021	NC_019965	GGT	2	6	227893	227898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433640326
5022	NC_019965	GCC	2	6	228005	228010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640326
5023	NC_019965	CGG	2	6	228038	228043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640326
5024	NC_019965	GCG	2	6	228049	228054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640326
5025	NC_019965	GAG	2	6	228061	228066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433640326
5026	NC_019965	GC	3	6	228109	228114	0 %	0 %	50 %	50 %	433640326
5027	NC_019965	CGG	2	6	228129	228134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640326
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5030	NC_019965	GAC	2	6	228196	228201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640326
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5032	NC_019965	TGC	2	6	228248	228253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640326
5033	NC_019965	CGC	2	6	228292	228297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640326
5034	NC_019965	CGA	2	6	228369	228374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640326
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5036	NC_019965	GCA	2	6	228501	228506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640326
5037	NC_019965	CCCG	2	8	228540	228547	0 %	0 %	25 %	75 %	433640326
5038	NC_019965	CGC	2	6	228562	228567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640326
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5040	NC_019965	CTG	2	6	228604	228609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640326
5041	NC_019965	TGG	2	6	228611	228616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433640326
5042	NC_019965	CTG	2	6	228637	228642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640326
5043	NC_019965	CGC	2	6	228682	228687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640326
5044	NC_019965	TGG	2	6	228706	228711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433640326
5045	NC_019965	GCCTGG	2	12	228842	228853	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	433640326
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5050	NC_019965	TGG	2	6	228983	228988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433640326
5051	NC_019965	GCT	2	6	228990	228995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640326
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5053	NC_019965	CGG	2	6	229093	229098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640326
5054	NC_019965	CGG	2	6	229145	229150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640326
5055	NC_019965	TCAC	2	8	229205	229212	25 %	25 %	0 %	50 %	433640326
5056	NC_019965	GAC	2	6	229216	229221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640326
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5058	NC_019965	TAC	2	6	229264	229269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433640326
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5060	NC_019965	TCGG	2	8	229351	229358	0 %	25 %	50 %	25 %	433640326
5061	NC_019965	ACCT	2	8	229369	229376	25 %	25 %	0 %	50 %	433640326
5062	NC_019965	TGT	2	6	229391	229396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433640326
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5099	NC_019965	CGCA	2	8	231327	231334	25 %	0 %	25 %	50 %	433640327
5100	NC_019965	TGCGC	2	10	231347	231356	0 %	20 %	40 %	40 %	433640327
5101	NC_019965	TGAT	2	8	231369	231376	25 %	50 %	25 %	0 %	433640327
5102	NC_019965	TGG	2	6	231506	231511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433640328
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5111	NC_019965	GGCG	2	8	231798	231805	0 %	0 %	75 %	25 %	433640328
5112	NC_019965	CG	3	6	231840	231845	0 %	0 %	50 %	50 %	433640328
5113	NC_019965	GCG	2	6	231850	231855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640328
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5119	NC_019965	TCG	2	6	232126	232131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640329
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5121	NC_019965	CAA	2	6	232205	232210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433640329
5122	NC_019965	AAC	2	6	232236	232241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433640329
5123	NC_019965	GCC	2	6	232267	232272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640329
5124	NC_019965	GAG	2	6	232290	232295	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433640329
5125	NC_019965	CGG	2	6	232358	232363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640329
5126	NC_019965	TCT	2	6	232372	232377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433640329
5127	NC_019965	CGG	4	12	232382	232393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640329
5128	NC_019965	CGG	2	6	232409	232414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640329
5129	NC_019965	GCG	2	6	232423	232428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640329
5130	NC_019965	CGG	2	6	232517	232522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640329
5131	NC_019965	CG	3	6	232528	232533	0 %	0 %	50 %	50 %	433640329
5132	NC_019965	TCG	2	6	232564	232569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640329
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5134	NC_019965	GAT	2	6	232649	232654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433640329
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5136	NC_019965	CGT	2	6	232667	232672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640329
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5152	NC_019965	TCG	2	6	233275	233280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640329
5153	NC_019965	TGC	2	6	233320	233325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640329
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5166	NC_019965	CGG	2	6	234076	234081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640329
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5188	NC_019965	TGG	2	6	234931	234936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433640330
5189	NC_019965	TGC	2	6	234946	234951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640330
5190	NC_019965	GTA	2	6	234982	234987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433640330
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5192	NC_019965	GTC	2	6	235102	235107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640330
5193	NC_019965	AGT	2	6	235128	235133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433640330
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5200	NC_019965	CGG	2	6	235294	235299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640330
5201	NC_019965	CCA	2	6	235350	235355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433640330
5202	NC_019965	GCT	2	6	235386	235391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640330
5203	NC_019965	TCC	2	6	235427	235432	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433640330
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5207	NC_019965	GTA	2	6	235855	235860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433640330
5208	NC_019965	TCG	2	6	235865	235870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640330
5209	NC_019965	GCC	3	9	235951	235959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640330
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5213	NC_019965	TCG	2	6	236078	236083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640330
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5216	NC_019965	GAT	2	6	236155	236160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433640330
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5218	NC_019965	CAGC	3	12	236244	236255	25 %	0 %	25 %	50 %	433640330
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5220	NC_019965	AAG	2	6	236423	236428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433640331
5221	NC_019965	GAC	3	9	236434	236442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640331
5222	NC_019965	GCCGAA	2	12	236473	236484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640331
5223	NC_019965	ACT	2	6	236529	236534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433640331
5224	NC_019965	CGC	2	6	236550	236555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640331
5225	NC_019965	GAT	2	6	236571	236576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433640331
5226	NC_019965	TACC	2	8	236610	236617	25 %	25 %	0 %	50 %	433640331
5227	NC_019965	GCC	2	6	236635	236640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640331
5228	NC_019965	ACA	2	6	236678	236683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433640331
5229	NC_019965	ACG	2	6	236708	236713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640331
5230	NC_019965	CGGT	2	8	236717	236724	0 %	25 %	50 %	25 %	433640331
5231	NC_019965	GGT	2	6	236769	236774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433640331
5232	NC_019965	CAG	2	6	236793	236798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640331
5233	NC_019965	CGAT	2	8	236819	236826	25 %	25 %	25 %	25 %	433640331
5234	NC_019965	GCC	2	6	236860	236865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640331
5235	NC_019965	TGC	2	6	236918	236923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640331
5236	NC_019965	TGA	2	6	237017	237022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433640331
5237	NC_019965	TCGAT	2	10	237037	237046	20 %	40 %	20 %	20 %	433640331
5238	NC_019965	GGC	2	6	237058	237063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640332
5239	NC_019965	TGG	2	6	237064	237069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433640332
5240	NC_019965	CGC	2	6	237101	237106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640332
5241	NC_019965	TGG	2	6	237144	237149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433640332
5242	NC_019965	TGC	2	6	237172	237177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640332
5243	NC_019965	TGG	2	6	237178	237183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433640332
5244	NC_019965	CGT	2	6	237216	237221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640332
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5332	NC_019965	TAGC	2	8	240893	240900	25 %	25 %	25 %	25 %	433640334
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5359	NC_019965	GGC	3	9	242175	242183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640336
5360	NC_019965	ACCG	2	8	242202	242209	25 %	0 %	25 %	50 %	433640336
5361	NC_019965	CGG	2	6	242222	242227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640336
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5484	NC_019965	CCA	2	6	247140	247145	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433640338
5485	NC_019965	TCC	2	6	247338	247343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433640339
5486	NC_019965	CGA	2	6	247348	247353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640339
5487	NC_019965	CCA	3	9	247477	247485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433640339
5488	NC_019965	GCG	2	6	247488	247493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640339
5489	NC_019965	TCG	2	6	247512	247517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640339
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5491	NC_019965	ACC	2	6	247620	247625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433640339
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5499	NC_019965	GCCG	2	8	248122	248129	0 %	0 %	50 %	50 %	433640340
5500	NC_019965	GGTC	2	8	248157	248164	0 %	25 %	50 %	25 %	433640340

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