MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium smegmatis JS623 plasmid pMYCSM03

Total Repeats: 119

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019959	GCGCG	2	10	368	377	0 %	0 %	60 %	40 %	433644686
2	NC_019959	GCCGC	2	10	1333	1342	0 %	0 %	40 %	60 %	433644687
3	NC_019959	CCCGC	2	10	1814	1823	0 %	0 %	20 %	80 %	433644689
4	NC_019959	CGACC	2	10	4577	4586	20 %	0 %	20 %	60 %	433644693
5	NC_019959	CCGGC	2	10	6001	6010	0 %	0 %	40 %	60 %	433644695
6	NC_019959	GCAGA	2	10	6126	6135	40 %	0 %	40 %	20 %	433644695
7	NC_019959	GCGCC	2	10	6314	6323	0 %	0 %	40 %	60 %	433644697
8	NC_019959	CGCAC	2	10	8613	8622	20 %	0 %	20 %	60 %	433644699
9	NC_019959	GACGC	2	10	9187	9196	20 %	0 %	40 %	40 %	433644700
10	NC_019959	CCGCG	2	10	9197	9206	0 %	0 %	40 %	60 %	433644700
11	NC_019959	CCGAT	2	10	9274	9283	20 %	20 %	20 %	40 %	433644700
12	NC_019959	CGCGG	2	10	10037	10046	0 %	0 %	60 %	40 %	433644701
13	NC_019959	TGCCC	2	10	10810	10819	0 %	20 %	20 %	60 %	433644701
14	NC_019959	GGTGG	2	10	12266	12275	0 %	20 %	80 %	0 %	433644701
15	NC_019959	CGCGG	2	10	13017	13026	0 %	0 %	60 %	40 %	433644702
16	NC_019959	ACCGA	2	10	14178	14187	40 %	0 %	20 %	40 %	433644702
17	NC_019959	CGGAA	2	10	14803	14812	40 %	0 %	40 %	20 %	433644702
18	NC_019959	CGCGA	2	10	14827	14836	20 %	0 %	40 %	40 %	433644702
19	NC_019959	CCGCG	2	10	15701	15710	0 %	0 %	40 %	60 %	433644703
20	NC_019959	GCCTG	2	10	15802	15811	0 %	20 %	40 %	40 %	433644703
21	NC_019959	CACCG	2	10	15957	15966	20 %	0 %	20 %	60 %	433644703
22	NC_019959	CGGTG	2	10	19730	19739	0 %	20 %	60 %	20 %	433644705
23	NC_019959	CGCTG	2	10	19838	19847	0 %	20 %	40 %	40 %	433644705
24	NC_019959	GCCCC	2	10	22785	22794	0 %	0 %	20 %	80 %	433644708
25	NC_019959	TTCAC	2	10	26583	26592	20 %	40 %	0 %	40 %	433644712
26	NC_019959	CACGA	2	10	27021	27030	40 %	0 %	20 %	40 %	433644713
27	NC_019959	CCGAT	2	10	27974	27983	20 %	20 %	20 %	40 %	433644714
28	NC_019959	CAACC	2	10	32267	32276	40 %	0 %	0 %	60 %	433644723
29	NC_019959	ATTCG	2	10	34227	34236	20 %	40 %	20 %	20 %	433644728
30	NC_019959	GCCGC	2	10	34581	34590	0 %	0 %	40 %	60 %	433644728
31	NC_019959	CCGCC	2	10	34923	34932	0 %	0 %	20 %	80 %	433644729
32	NC_019959	CAGCG	2	10	36823	36832	20 %	0 %	40 %	40 %	433644729
33	NC_019959	AGTTG	2	10	40140	40149	20 %	40 %	40 %	0 %	433644734
34	NC_019959	TCGAG	2	10	40866	40875	20 %	20 %	40 %	20 %	433644734
35	NC_019959	CGGCG	2	10	43830	43839	0 %	0 %	60 %	40 %	433644739
36	NC_019959	TCGCG	2	10	46621	46630	0 %	20 %	40 %	40 %	433644744
37	NC_019959	GGCGA	2	10	47511	47520	20 %	0 %	60 %	20 %	433644745
38	NC_019959	GCGCT	2	10	48107	48116	0 %	20 %	40 %	40 %	433644746
39	NC_019959	GAGTC	2	10	50200	50209	20 %	20 %	40 %	20 %	433644748
40	NC_019959	GGGGT	2	10	50699	50708	0 %	20 %	80 %	0 %	433644748
41	NC_019959	CGGAT	2	10	51599	51608	20 %	20 %	40 %	20 %	433644749
42	NC_019959	CGGCC	2	10	53025	53034	0 %	0 %	40 %	60 %	433644750
43	NC_019959	CGGGC	2	10	56878	56887	0 %	0 %	60 %	40 %	433644756
44	NC_019959	CGACC	2	10	58606	58615	20 %	0 %	20 %	60 %	433644758
45	NC_019959	CGCAA	2	10	58641	58650	40 %	0 %	20 %	40 %	433644758
46	NC_019959	CGATC	2	10	61982	61991	20 %	20 %	20 %	40 %	433644761
47	NC_019959	GGATG	2	10	63466	63475	20 %	20 %	60 %	0 %	433644763
48	NC_019959	CTGGC	2	10	65181	65190	0 %	20 %	40 %	40 %	433644764
49	NC_019959	CCCCG	2	10	65651	65660	0 %	0 %	20 %	80 %	433644764
50	NC_019959	ACCCG	2	10	66436	66445	20 %	0 %	20 %	60 %	433644765
51	NC_019959	GCATC	2	10	66688	66697	20 %	20 %	20 %	40 %	433644765
52	NC_019959	GCCGC	2	10	66974	66983	0 %	0 %	40 %	60 %	433644766
53	NC_019959	CGGCG	2	10	68810	68819	0 %	0 %	60 %	40 %	433644767
54	NC_019959	CGGCG	2	10	71524	71533	0 %	0 %	60 %	40 %	433644770
55	NC_019959	TGCCG	2	10	71857	71866	0 %	20 %	40 %	40 %	433644770
56	NC_019959	CGACC	2	10	72311	72320	20 %	0 %	20 %	60 %	433644771
57	NC_019959	CCAAG	2	10	77382	77391	40 %	0 %	20 %	40 %	433644776
58	NC_019959	TGCCC	2	10	78478	78487	0 %	20 %	20 %	60 %	433644777
59	NC_019959	AGCCA	2	10	79175	79184	40 %	0 %	20 %	40 %	433644778
60	NC_019959	CCGAC	2	10	79357	79366	20 %	0 %	20 %	60 %	433644778
61	NC_019959	CGCGG	2	10	80534	80543	0 %	0 %	60 %	40 %	433644779
62	NC_019959	CGCAG	2	10	80579	80588	20 %	0 %	40 %	40 %	433644779
63	NC_019959	AGCGC	2	10	81191	81200	20 %	0 %	40 %	40 %	433644779
64	NC_019959	GACCC	2	10	83148	83157	20 %	0 %	20 %	60 %	433644780
65	NC_019959	CCGCG	2	10	86041	86050	0 %	0 %	40 %	60 %	433644780
66	NC_019959	CTCGC	2	10	86126	86135	0 %	20 %	20 %	60 %	433644780
67	NC_019959	AGCGC	2	10	92235	92244	20 %	0 %	40 %	40 %	433644787
68	NC_019959	GGCTG	2	10	95337	95346	0 %	20 %	60 %	20 %	433644789
69	NC_019959	CGGCG	2	10	98812	98821	0 %	0 %	60 %	40 %	433644792
70	NC_019959	ACCGA	2	10	98834	98843	40 %	0 %	20 %	40 %	433644792
71	NC_019959	CCAGC	2	10	99220	99229	20 %	0 %	20 %	60 %	433644792
72	NC_019959	GCGGT	2	10	100044	100053	0 %	20 %	60 %	20 %	433644793
73	NC_019959	CCGCC	2	10	100243	100252	0 %	0 %	20 %	80 %	433644793
74	NC_019959	GGCAC	2	10	101259	101268	20 %	0 %	40 %	40 %	433644795
75	NC_019959	CCGAG	2	10	101632	101641	20 %	0 %	40 %	40 %	433644795
76	NC_019959	CGCGG	2	10	101782	101791	0 %	0 %	60 %	40 %	433644795
77	NC_019959	GCGCC	2	10	102421	102430	0 %	0 %	40 %	60 %	433644797
78	NC_019959	CGCGC	2	10	105019	105028	0 %	0 %	40 %	60 %	433644799
79	NC_019959	CCCCG	2	10	106736	106745	0 %	0 %	20 %	80 %	433644800
80	NC_019959	CGCGA	2	10	107919	107928	20 %	0 %	40 %	40 %	433644800
81	NC_019959	GCCTG	2	10	108201	108210	0 %	20 %	40 %	40 %	433644800
82	NC_019959	GGCCG	2	10	109953	109962	0 %	0 %	60 %	40 %	433644803
83	NC_019959	CCCGA	2	10	110075	110084	20 %	0 %	20 %	60 %	433644803
84	NC_019959	GCTCA	2	10	110987	110996	20 %	20 %	20 %	40 %	433644805
85	NC_019959	GCCAG	2	10	112565	112574	20 %	0 %	40 %	40 %	433644807
86	NC_019959	ACGTG	2	10	113802	113811	20 %	20 %	40 %	20 %	433644809
87	NC_019959	TCGAC	2	10	113996	114005	20 %	20 %	20 %	40 %	433644809
88	NC_019959	GCGGG	2	10	117599	117608	0 %	0 %	80 %	20 %	433644812
89	NC_019959	TGGCC	2	10	118231	118240	0 %	20 %	40 %	40 %	433644813
90	NC_019959	CGTGG	2	10	122464	122473	0 %	20 %	60 %	20 %	433644818
91	NC_019959	GCAGC	2	10	122667	122676	20 %	0 %	40 %	40 %	433644818
92	NC_019959	GCGCC	2	10	123429	123438	0 %	0 %	40 %	60 %	433644819
93	NC_019959	GTGCT	2	10	123646	123655	0 %	40 %	40 %	20 %	433644819
94	NC_019959	GTGCG	2	10	123680	123689	0 %	20 %	60 %	20 %	433644819
95	NC_019959	GTGAC	2	10	123698	123707	20 %	20 %	40 %	20 %	433644819
96	NC_019959	CGTGA	2	10	124223	124232	20 %	20 %	40 %	20 %	433644821
97	NC_019959	CCCCG	2	10	125173	125182	0 %	0 %	20 %	80 %	433644821
98	NC_019959	GGCCA	2	10	126012	126021	20 %	0 %	40 %	40 %	433644822
99	NC_019959	CGGTG	2	10	128711	128720	0 %	20 %	60 %	20 %	433644825
100	NC_019959	ACGCG	2	10	130633	130642	20 %	0 %	40 %	40 %	433644826
101	NC_019959	CGGCG	2	10	131476	131485	0 %	0 %	60 %	40 %	433644826
102	NC_019959	CAGCG	2	10	137099	137108	20 %	0 %	40 %	40 %	433644831
103	NC_019959	GCCCG	2	10	137235	137244	0 %	0 %	40 %	60 %	433644831
104	NC_019959	CTGTG	2	10	139142	139151	0 %	40 %	40 %	20 %	433644833
105	NC_019959	CCGGG	2	10	140885	140894	0 %	0 %	60 %	40 %	433644837
106	NC_019959	ATCCG	2	10	142686	142695	20 %	20 %	20 %	40 %	433644840
107	NC_019959	CGGCG	2	10	147433	147442	0 %	0 %	60 %	40 %	433644850
108	NC_019959	GCGGT	2	10	148281	148290	0 %	20 %	60 %	20 %	433644850
109	NC_019959	CGGCG	2	10	152806	152815	0 %	0 %	60 %	40 %	433644856
110	NC_019959	GCGCC	2	10	153375	153384	0 %	0 %	40 %	60 %	433644857
111	NC_019959	ACCAC	2	10	154588	154597	40 %	0 %	0 %	60 %	433644859
112	NC_019959	CTGGG	2	10	154712	154721	0 %	20 %	60 %	20 %	433644860
113	NC_019959	GCTGG	2	10	155122	155131	0 %	20 %	60 %	20 %	433644860
114	NC_019959	GATCG	2	10	155966	155975	20 %	20 %	40 %	20 %	433644862
115	NC_019959	CTGTG	2	10	156702	156711	0 %	40 %	40 %	20 %	433644862
116	NC_019959	CGCAG	2	10	161074	161083	20 %	0 %	40 %	40 %	433644867
117	NC_019959	CCAGC	2	10	161827	161836	20 %	0 %	20 %	60 %	433644868
118	NC_019959	GTGCG	2	10	162705	162714	0 %	20 %	60 %	20 %	433644868
119	NC_019959	GATCG	2	10	163790	163799	20 %	20 %	40 %	20 %	433644870

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.