MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium smegmatis JS623 plasmid pMYCSM03

Total Repeats: 3978

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_019959	GCA	2	6	20256	20261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644705
502	NC_019959	GT	3	6	20384	20389	0 %	50 %	50 %	0 %	433644705
503	NC_019959	CGG	2	6	20392	20397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644705
504	NC_019959	CCGCGG	2	12	20412	20423	0 %	0 %	50 %	50 %	433644705
505	NC_019959	GTGA	2	8	20443	20450	25 %	25 %	50 %	0 %	433644705
506	NC_019959	CGC	2	6	20506	20511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644705
507	NC_019959	CCGC	2	8	20540	20547	0 %	0 %	25 %	75 %	433644705
508	NC_019959	TGC	2	6	20591	20596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644705
509	NC_019959	CCG	2	6	20600	20605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644705
510	NC_019959	CGG	2	6	20622	20627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644705
511	NC_019959	CGC	2	6	20659	20664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644705
512	NC_019959	ACC	2	6	20684	20689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433644705
513	NC_019959	GCG	2	6	20703	20708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644705
514	NC_019959	CGG	2	6	20730	20735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644705
515	NC_019959	CGG	3	9	20794	20802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644705
516	NC_019959	CCG	2	6	20820	20825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644705
517	NC_019959	CGA	2	6	20920	20925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644705
518	NC_019959	TCT	2	6	20940	20945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433644705
519	NC_019959	ACC	2	6	21035	21040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433644705
520	NC_019959	AGC	2	6	21071	21076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644705
521	NC_019959	CTC	2	6	21100	21105	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433644705
522	NC_019959	CG	3	6	21137	21142	0 %	0 %	50 %	50 %	433644705
523	NC_019959	CGG	2	6	21198	21203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644705
524	NC_019959	GCG	2	6	21219	21224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644705
525	NC_019959	CA	3	6	21225	21230	50 %	0 %	0 %	50 %	433644705
526	NC_019959	CG	3	6	21239	21244	0 %	0 %	50 %	50 %	433644705
527	NC_019959	GC	3	6	21290	21295	0 %	0 %	50 %	50 %	433644705
528	NC_019959	TGC	2	6	21296	21301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644705
529	NC_019959	GCT	2	6	21393	21398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644705
530	NC_019959	GGT	2	6	21419	21424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433644706
531	NC_019959	TCC	2	6	21426	21431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433644706
532	NC_019959	CGC	2	6	21455	21460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644706
533	NC_019959	GCC	2	6	21510	21515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644706
534	NC_019959	CCA	2	6	21556	21561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433644706
535	NC_019959	CTC	2	6	21626	21631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433644706
536	NC_019959	GCG	2	6	21639	21644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644706
537	NC_019959	CG	3	6	21652	21657	0 %	0 %	50 %	50 %	433644706
538	NC_019959	TCC	2	6	21660	21665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433644706
539	NC_019959	GC	4	8	21702	21709	0 %	0 %	50 %	50 %	433644706
540	NC_019959	CGAA	2	8	21716	21723	50 %	0 %	25 %	25 %	433644706
541	NC_019959	GC	3	6	21797	21802	0 %	0 %	50 %	50 %	433644706
542	NC_019959	CGT	2	6	21814	21819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644706
543	NC_019959	CGCCAT	2	12	21821	21832	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	433644706
544	NC_019959	ACG	2	6	22008	22013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644707
545	NC_019959	CGTGCA	2	12	22027	22038	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	433644707
546	NC_019959	CCA	2	6	22089	22094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433644707
547	NC_019959	CTG	3	9	22175	22183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644707
548	NC_019959	CCA	2	6	22185	22190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433644707
549	NC_019959	CCA	2	6	22204	22209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433644707
550	NC_019959	GCT	2	6	22216	22221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644707
551	NC_019959	GCG	2	6	22224	22229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644707
552	NC_019959	TCA	2	6	22236	22241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433644707
553	NC_019959	ACG	2	6	22248	22253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644707
554	NC_019959	CGA	2	6	22279	22284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644707
555	NC_019959	CACC	2	8	22291	22298	25 %	0 %	0 %	75 %	433644707
556	NC_019959	CGA	2	6	22357	22362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644707
557	NC_019959	CCG	3	9	22369	22377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644707
558	NC_019959	CT	3	6	22378	22383	0 %	50 %	0 %	50 %	433644707
559	NC_019959	GCC	2	6	22397	22402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644707
560	NC_019959	ACCG	2	8	22406	22413	25 %	0 %	25 %	50 %	433644707
561	NC_019959	CCG	2	6	22519	22524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644708
562	NC_019959	GGC	2	6	22535	22540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644708
563	NC_019959	CGC	2	6	22550	22555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644708
564	NC_019959	GCG	2	6	22580	22585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644708
565	NC_019959	GCT	2	6	22640	22645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644708
566	NC_019959	CGC	2	6	22662	22667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644708
567	NC_019959	CGA	2	6	22688	22693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644708
568	NC_019959	CG	3	6	22704	22709	0 %	0 %	50 %	50 %	433644708
569	NC_019959	GTG	2	6	22710	22715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433644708
570	NC_019959	CCT	2	6	22717	22722	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433644708
571	NC_019959	GGC	2	6	22734	22739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644708
572	NC_019959	GCCCC	2	10	22785	22794	0 %	0 %	20 %	80 %	433644708
573	NC_019959	ACCG	2	8	22827	22834	25 %	0 %	25 %	50 %	433644708
574	NC_019959	ACCG	2	8	22863	22870	25 %	0 %	25 %	50 %	433644708
575	NC_019959	CGG	2	6	22895	22900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644708
576	NC_019959	CGA	2	6	22934	22939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644709
577	NC_019959	CGA	2	6	22951	22956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644709
578	NC_019959	TCA	2	6	22971	22976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433644709
579	NC_019959	TCA	2	6	22993	22998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433644709
580	NC_019959	ACC	2	6	23049	23054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433644709
581	NC_019959	ATG	2	6	23072	23077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433644709
582	NC_019959	GCC	2	6	23085	23090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644709
583	NC_019959	GCC	2	6	23093	23098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644709
584	NC_019959	CGA	2	6	23113	23118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644709
585	NC_019959	CGC	2	6	23146	23151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644709
586	NC_019959	CGC	2	6	23195	23200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644709
587	NC_019959	CGC	2	6	23207	23212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644709
588	NC_019959	GGC	2	6	23313	23318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644710
589	NC_019959	GAA	2	6	23377	23382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433644710
590	NC_019959	CGAC	2	8	23428	23435	25 %	0 %	25 %	50 %	433644710
591	NC_019959	CG	3	6	23488	23493	0 %	0 %	50 %	50 %	433644710
592	NC_019959	ATC	2	6	23506	23511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433644710
593	NC_019959	GCT	2	6	23532	23537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644710
594	NC_019959	CTG	2	6	23563	23568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644710
595	NC_019959	CGC	2	6	23638	23643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644711
596	NC_019959	GCT	2	6	23675	23680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644711
597	NC_019959	GCT	2	6	23684	23689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644711
598	NC_019959	CGC	2	6	23719	23724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644711
599	NC_019959	ACC	2	6	23731	23736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433644711
600	NC_019959	TCA	2	6	23750	23755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433644711
601	NC_019959	CGG	2	6	23778	23783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644711
602	NC_019959	CCG	2	6	23849	23854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644711
603	NC_019959	GC	3	6	23914	23919	0 %	0 %	50 %	50 %	433644711
604	NC_019959	GTCA	2	8	23931	23938	25 %	25 %	25 %	25 %	433644711
605	NC_019959	GCCG	2	8	23983	23990	0 %	0 %	50 %	50 %	433644711
606	NC_019959	CGC	2	6	24024	24029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644711
607	NC_019959	CCGC	2	8	24095	24102	0 %	0 %	25 %	75 %	433644711
608	NC_019959	GGCC	2	8	24189	24196	0 %	0 %	50 %	50 %	433644711
609	NC_019959	GCG	2	6	24232	24237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644711
610	NC_019959	CAG	2	6	24294	24299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644711
611	NC_019959	CGGC	2	8	24311	24318	0 %	0 %	50 %	50 %	433644711
612	NC_019959	GGT	2	6	24336	24341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433644711
613	NC_019959	CG	3	6	24472	24477	0 %	0 %	50 %	50 %	433644711
614	NC_019959	AGC	2	6	24526	24531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644711
615	NC_019959	CG	3	6	24605	24610	0 %	0 %	50 %	50 %	433644711
616	NC_019959	CCT	2	6	24662	24667	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433644711
617	NC_019959	GCG	2	6	24672	24677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644711
618	NC_019959	CG	3	6	24708	24713	0 %	0 %	50 %	50 %	433644711
619	NC_019959	GAA	2	6	24714	24719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433644711
620	NC_019959	AGTC	2	8	24806	24813	25 %	25 %	25 %	25 %	433644711
621	NC_019959	CAC	2	6	24825	24830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433644711
622	NC_019959	GC	3	6	24871	24876	0 %	0 %	50 %	50 %	433644711
623	NC_019959	TGA	2	6	24911	24916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433644711
624	NC_019959	TCG	3	9	24931	24939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644711
625	NC_019959	GCCG	2	8	24967	24974	0 %	0 %	50 %	50 %	433644711
626	NC_019959	AAC	2	6	25051	25056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433644711
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628	NC_019959	CGC	2	6	25269	25274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644711
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1000	NC_019959	CCA	2	6	40942	40947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433644734

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