MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium smegmatis JS623 plasmid pMYCSM02

Total Repeats: 3135

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019958	GCT	2	6	634	639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644439
2	NC_019958	ATC	2	6	722	727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433644439
3	NC_019958	AAG	2	6	810	815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433644439
4	NC_019958	TGC	2	6	972	977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644439
5	NC_019958	CTC	2	6	1591	1596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433644440
6	NC_019958	CGG	2	6	1619	1624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644440
7	NC_019958	CCG	2	6	1631	1636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644440
8	NC_019958	GGT	2	6	1696	1701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433644440
9	NC_019958	GTC	2	6	1987	1992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644441
10	NC_019958	TCG	2	6	2057	2062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644441
11	NC_019958	AGT	2	6	2169	2174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433644442
12	NC_019958	CGC	2	6	2220	2225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644442
13	NC_019958	GCT	2	6	2256	2261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644442
14	NC_019958	ACG	2	6	2290	2295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644442
15	NC_019958	TGA	2	6	2314	2319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433644442
16	NC_019958	CGG	2	6	2472	2477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644443
17	NC_019958	GCG	2	6	2544	2549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644443
18	NC_019958	GAC	2	6	2651	2656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644443
19	NC_019958	ACC	2	6	2689	2694	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433644443
20	NC_019958	GGT	2	6	2778	2783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433644443
21	NC_019958	CGA	2	6	2920	2925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644443
22	NC_019958	TGC	3	9	2942	2950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644443
23	NC_019958	TCG	2	6	3043	3048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644444
24	NC_019958	CGG	3	9	3350	3358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644445
25	NC_019958	GCT	2	6	3383	3388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644445
26	NC_019958	CCG	2	6	3460	3465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644445
27	NC_019958	GCC	2	6	3503	3508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644445
28	NC_019958	CGA	2	6	4129	4134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644446
29	NC_019958	CTG	2	6	4198	4203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644446
30	NC_019958	CGA	2	6	4327	4332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644446
31	NC_019958	CGC	3	9	4484	4492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644446
32	NC_019958	GTC	2	6	4526	4531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644446
33	NC_019958	TGC	2	6	4571	4576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644446
34	NC_019958	CGG	2	6	4627	4632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644446
35	NC_019958	GGT	2	6	4643	4648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433644446
36	NC_019958	GGC	2	6	4687	4692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644446
37	NC_019958	GTC	2	6	4800	4805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644446
38	NC_019958	GTT	2	6	4832	4837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433644446
39	NC_019958	CGA	2	6	4948	4953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644447
40	NC_019958	GGC	2	6	4965	4970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644447
41	NC_019958	TCA	2	6	4981	4986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433644447
42	NC_019958	TTG	2	6	5001	5006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433644447
43	NC_019958	CCG	2	6	5014	5019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644447
44	NC_019958	GCG	2	6	5345	5350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644448
45	NC_019958	GGC	2	6	5367	5372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644448
46	NC_019958	CAC	2	6	5373	5378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433644448
47	NC_019958	GTT	2	6	5381	5386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433644448
48	NC_019958	TCG	2	6	5441	5446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644448
49	NC_019958	GGC	2	6	5454	5459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644448
50	NC_019958	TGG	2	6	5493	5498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433644448
51	NC_019958	GCG	3	9	5529	5537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644448
52	NC_019958	GGC	2	6	5547	5552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644448
53	NC_019958	CCG	2	6	5589	5594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644448
54	NC_019958	CGT	2	6	5722	5727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644448
55	NC_019958	GTT	2	6	5762	5767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433644448
56	NC_019958	TGC	2	6	5848	5853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644448
57	NC_019958	CGG	2	6	5868	5873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644448
58	NC_019958	GGC	2	6	5875	5880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644448
59	NC_019958	CGT	2	6	5893	5898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644448
60	NC_019958	GCT	2	6	5906	5911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644448
61	NC_019958	TCG	2	6	5957	5962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644448
62	NC_019958	TGG	2	6	6087	6092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433644448
63	NC_019958	GTG	2	6	6113	6118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433644448
64	NC_019958	GAC	2	6	6148	6153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644448
65	NC_019958	TTG	2	6	6164	6169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433644448
66	NC_019958	GCT	2	6	6221	6226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644448
67	NC_019958	CAC	2	6	6253	6258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433644448
68	NC_019958	CCG	2	6	6282	6287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644448
69	NC_019958	TGC	2	6	6345	6350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644448
70	NC_019958	TGC	2	6	6450	6455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644448
71	NC_019958	CCG	2	6	6491	6496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644448
72	NC_019958	CGA	2	6	6561	6566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644448
73	NC_019958	CGG	2	6	6600	6605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644448
74	NC_019958	TGA	2	6	6618	6623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433644448
75	NC_019958	CGC	2	6	6829	6834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644448
76	NC_019958	ACG	2	6	6848	6853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644448
77	NC_019958	AGC	2	6	6905	6910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644448
78	NC_019958	GGT	2	6	6925	6930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433644448
79	NC_019958	GTT	2	6	6964	6969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433644448
80	NC_019958	GGA	2	6	6991	6996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433644448
81	NC_019958	CGA	2	6	7008	7013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644448
82	NC_019958	CGG	2	6	7038	7043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644448
83	NC_019958	CGA	2	6	7128	7133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644448
84	NC_019958	GCG	2	6	7190	7195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644448
85	NC_019958	CCA	2	6	7686	7691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433644449
86	NC_019958	GCG	2	6	7704	7709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644449
87	NC_019958	CGC	2	6	7712	7717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644449
88	NC_019958	GGC	2	6	7752	7757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644449
89	NC_019958	CTG	2	6	8010	8015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644449
90	NC_019958	GAA	2	6	8084	8089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433644450
91	NC_019958	TCG	2	6	8133	8138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644450
92	NC_019958	CGG	2	6	8164	8169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644450
93	NC_019958	GTG	2	6	8172	8177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433644450
94	NC_019958	GAC	2	6	8183	8188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644450
95	NC_019958	CCG	2	6	8193	8198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644450
96	NC_019958	CGA	2	6	8209	8214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644450
97	NC_019958	ACC	2	6	8217	8222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433644450
98	NC_019958	TCG	2	6	8227	8232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644450
99	NC_019958	GTT	2	6	8285	8290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433644450
100	NC_019958	TGT	2	6	8524	8529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433644451
101	NC_019958	CGA	2	6	8665	8670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644451
102	NC_019958	CGA	2	6	8800	8805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644451
103	NC_019958	GTT	2	6	8827	8832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433644451
104	NC_019958	CGT	2	6	8849	8854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644451
105	NC_019958	GAG	2	6	9244	9249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433644452
106	NC_019958	GTC	2	6	9261	9266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644452
107	NC_019958	CCT	2	6	9278	9283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433644452
108	NC_019958	CTG	2	6	9325	9330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644452
109	NC_019958	CTG	2	6	9346	9351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644452
110	NC_019958	GGC	2	6	9525	9530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644453
111	NC_019958	GCC	2	6	9597	9602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644453
112	NC_019958	CGG	2	6	9614	9619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644453
113	NC_019958	CGG	2	6	9631	9636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644453
114	NC_019958	TCG	2	6	9667	9672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644453
115	NC_019958	GTC	2	6	9696	9701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644453
116	NC_019958	GTA	2	6	9765	9770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433644453
117	NC_019958	GAG	2	6	10045	10050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433644454
118	NC_019958	CAG	2	6	10088	10093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644454
119	NC_019958	GGC	2	6	10183	10188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644454
120	NC_019958	GTG	2	6	10656	10661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433644455
121	NC_019958	GTG	2	6	10691	10696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433644455
122	NC_019958	CGG	2	6	10718	10723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644455
123	NC_019958	GGC	2	6	10922	10927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644455
124	NC_019958	ACG	2	6	10981	10986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644455
125	NC_019958	GGC	2	6	11100	11105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644455
126	NC_019958	GTT	2	6	11148	11153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433644455
127	NC_019958	TGG	2	6	11184	11189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433644456
128	NC_019958	CGC	2	6	11194	11199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644456
129	NC_019958	TGA	2	6	11301	11306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433644456
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134	NC_019958	CGT	2	6	11626	11631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644457
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150	NC_019958	GTT	2	6	12499	12504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433644457
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152	NC_019958	GAT	2	6	12551	12556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433644457
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248	NC_019958	CGG	2	6	19201	19206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644465
249	NC_019958	CAC	2	6	19280	19285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433644465
250	NC_019958	TGG	2	6	19381	19386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433644465
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252	NC_019958	CCA	2	6	19516	19521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433644465
253	NC_019958	TGT	2	6	19541	19546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433644465
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498	NC_019958	ACC	2	6	38376	38381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433644496
499	NC_019958	CAG	2	6	38408	38413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644496
500	NC_019958	CGA	2	6	38455	38460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644496

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