MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium smegmatis JS623 plasmid pMYCSM01

Total Repeats: 5946

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019957	CGG	2	6	153	158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644116
2	NC_019957	ACC	2	6	423	428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433644117
3	NC_019957	ACG	2	6	467	472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644117
4	NC_019957	TTC	2	6	645	650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433644117
5	NC_019957	GCG	2	6	690	695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644117
6	NC_019957	CGG	2	6	948	953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644117
7	NC_019957	GAA	2	6	1115	1120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433644117
8	NC_019957	CCA	2	6	1135	1140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433644117
9	NC_019957	CCA	2	6	1329	1334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433644118
10	NC_019957	CAG	2	6	1343	1348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644118
11	NC_019957	TCG	2	6	1352	1357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644118
12	NC_019957	TCG	2	6	1427	1432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644118
13	NC_019957	TCC	2	6	1499	1504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433644118
14	NC_019957	CTA	2	6	1534	1539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433644118
15	NC_019957	GAT	2	6	1615	1620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433644118
16	NC_019957	CAC	2	6	1645	1650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433644118
17	NC_019957	AAC	2	6	1704	1709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433644118
18	NC_019957	ATC	2	6	1714	1719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433644118
19	NC_019957	CGG	2	6	1813	1818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644118
20	NC_019957	TCG	2	6	1851	1856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644118
21	NC_019957	CGG	2	6	1857	1862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644118
22	NC_019957	GTC	2	6	1973	1978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644118
23	NC_019957	GGC	2	6	2201	2206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644118
24	NC_019957	TCT	2	6	2285	2290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433644118
25	NC_019957	ACG	2	6	2330	2335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644118
26	NC_019957	CCA	2	6	2390	2395	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433644118
27	NC_019957	GTA	2	6	2519	2524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433644118
28	NC_019957	ACG	2	6	2538	2543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644118
29	NC_019957	CGA	2	6	2629	2634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644118
30	NC_019957	CGT	2	6	2719	2724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644118
31	NC_019957	CGA	2	6	2725	2730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644118
32	NC_019957	GTG	2	6	3037	3042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433644119
33	NC_019957	GTC	3	9	3062	3070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644119
34	NC_019957	TTC	2	6	3080	3085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433644119
35	NC_019957	TGT	2	6	3133	3138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433644119
36	NC_019957	TGC	2	6	3225	3230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644119
37	NC_019957	GGC	2	6	3250	3255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644119
38	NC_019957	CCG	2	6	3297	3302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644119
39	NC_019957	GAT	2	6	3437	3442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433644119
40	NC_019957	CGG	2	6	3577	3582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644119
41	NC_019957	CAA	2	6	3586	3591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433644119
42	NC_019957	GCC	2	6	3594	3599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644119
43	NC_019957	CAA	2	6	3727	3732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433644119
44	NC_019957	ACT	2	6	3743	3748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433644119
45	NC_019957	TGG	2	6	3757	3762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433644119
46	NC_019957	TTC	2	6	3878	3883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433644119
47	NC_019957	TCG	2	6	3924	3929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644119
48	NC_019957	GCG	2	6	4057	4062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644119
49	NC_019957	GCG	2	6	4114	4119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644119
50	NC_019957	GCC	2	6	4171	4176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644119
51	NC_019957	GAT	2	6	4383	4388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433644120
52	NC_019957	TGG	2	6	4445	4450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433644120
53	NC_019957	GCG	2	6	4574	4579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644120
54	NC_019957	CGA	2	6	4602	4607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644120
55	NC_019957	TCA	2	6	4619	4624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433644120
56	NC_019957	GCG	2	6	4717	4722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644120
57	NC_019957	ACT	2	6	4724	4729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433644120
58	NC_019957	GTC	2	6	4824	4829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644120
59	NC_019957	TTG	2	6	4886	4891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433644120
60	NC_019957	TGG	2	6	5069	5074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433644120
61	NC_019957	CAT	2	6	5133	5138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433644120
62	NC_019957	TCG	2	6	5151	5156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644120
63	NC_019957	GGT	2	6	5200	5205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433644120
64	NC_019957	CGC	2	6	5210	5215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644120
65	NC_019957	GAC	2	6	5690	5695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644121
66	NC_019957	CTA	2	6	5721	5726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433644121
67	NC_019957	TGG	2	6	5734	5739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433644121
68	NC_019957	CTT	2	6	5798	5803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433644121
69	NC_019957	CTG	2	6	5880	5885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644121
70	NC_019957	CGG	2	6	5887	5892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644121
71	NC_019957	TCT	2	6	5954	5959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433644121
72	NC_019957	CCA	2	6	6001	6006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433644121
73	NC_019957	CGC	2	6	6020	6025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644121
74	NC_019957	GCG	2	6	6040	6045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644121
75	NC_019957	ATC	2	6	6108	6113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433644121
76	NC_019957	CGG	2	6	6169	6174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644121
77	NC_019957	GCA	2	6	6198	6203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644121
78	NC_019957	CAC	2	6	6274	6279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433644121
79	NC_019957	CAC	2	6	6312	6317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433644121
80	NC_019957	TCG	2	6	6364	6369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644121
81	NC_019957	ACC	2	6	6393	6398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433644121
82	NC_019957	TCT	2	6	6403	6408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433644121
83	NC_019957	TGG	2	6	6421	6426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433644121
84	NC_019957	GAA	2	6	6506	6511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433644121
85	NC_019957	CTG	2	6	6591	6596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644121
86	NC_019957	CAT	2	6	6650	6655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433644121
87	NC_019957	TCT	2	6	6730	6735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433644121
88	NC_019957	CGT	2	6	6764	6769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644121
89	NC_019957	GTC	2	6	6771	6776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644121
90	NC_019957	TGC	2	6	6869	6874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644121
91	NC_019957	GTC	2	6	6992	6997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644122
92	NC_019957	GGT	2	6	7000	7005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433644122
93	NC_019957	GAG	2	6	7031	7036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433644122
94	NC_019957	CGG	2	6	7146	7151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644122
95	NC_019957	GTC	2	6	7181	7186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644122
96	NC_019957	GTG	2	6	7191	7196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433644122
97	NC_019957	CGG	2	6	7218	7223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644122
98	NC_019957	GGT	2	6	7234	7239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433644122
99	NC_019957	AGG	2	6	7377	7382	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433644122
100	NC_019957	TCA	2	6	7539	7544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433644122
101	NC_019957	TCT	2	6	7596	7601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433644122
102	NC_019957	TGG	2	6	7683	7688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433644122
103	NC_019957	CGA	2	6	7711	7716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644122
104	NC_019957	GAT	2	6	8267	8272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433644123
105	NC_019957	ACG	2	6	8280	8285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644123
106	NC_019957	CGG	2	6	8438	8443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644123
107	NC_019957	GGC	2	6	8565	8570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644123
108	NC_019957	TTG	2	6	8573	8578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433644123
109	NC_019957	GCT	3	9	8671	8679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644123
110	NC_019957	CGA	2	6	8737	8742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644123
111	NC_019957	GGT	2	6	8876	8881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433644123
112	NC_019957	GGA	2	6	8905	8910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433644123
113	NC_019957	GCC	2	6	8961	8966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644123
114	NC_019957	GCC	2	6	8984	8989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644123
115	NC_019957	CGA	3	9	9055	9063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644123
116	NC_019957	GGT	2	6	9103	9108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433644123
117	NC_019957	GCC	2	6	9164	9169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644123
118	NC_019957	GGC	2	6	9193	9198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644123
119	NC_019957	CCT	2	6	9475	9480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433644124
120	NC_019957	GGT	2	6	9514	9519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433644124
121	NC_019957	CGG	2	6	9547	9552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644124
122	NC_019957	GGT	2	6	9597	9602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433644124
123	NC_019957	CCG	2	6	9616	9621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644124
124	NC_019957	ACC	2	6	9729	9734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433644124
125	NC_019957	GCT	2	6	9753	9758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644124
126	NC_019957	CTC	2	6	9768	9773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433644124
127	NC_019957	TGA	2	6	9901	9906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433644124
128	NC_019957	CCA	3	9	9972	9980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433644124
129	NC_019957	TCA	2	6	10150	10155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433644124
130	NC_019957	CGT	2	6	10247	10252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644124
131	NC_019957	GCG	2	6	10303	10308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644124
132	NC_019957	CCA	2	6	10309	10314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433644124
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134	NC_019957	CGA	2	6	10420	10425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644124
135	NC_019957	TCG	2	6	10435	10440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644124
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253	NC_019957	ACG	2	6	24049	24054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644132
254	NC_019957	CAT	2	6	24058	24063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433644132
255	NC_019957	GTC	2	6	24257	24262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644132
256	NC_019957	TGA	2	6	24370	24375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433644132
257	NC_019957	ACG	2	6	24386	24391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644132
258	NC_019957	CGA	2	6	24466	24471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644132
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283	NC_019957	CGC	2	6	27006	27011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644134
284	NC_019957	CGA	2	6	27035	27040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644134
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340	NC_019957	TCG	2	6	30323	30328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644136
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343	NC_019957	ACG	2	6	30527	30532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644136
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351	NC_019957	TGC	2	6	31021	31026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644137
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359	NC_019957	GCC	2	6	31765	31770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644138
360	NC_019957	TCA	2	6	31781	31786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433644138
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368	NC_019957	ACG	2	6	32265	32270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644138
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370	NC_019957	TTC	2	6	32410	32415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433644138
371	NC_019957	CAG	2	6	32466	32471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644138
372	NC_019957	CCG	2	6	32525	32530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644138
373	NC_019957	GCC	2	6	32554	32559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644138
374	NC_019957	AGA	2	6	32579	32584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433644138
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499	NC_019957	GCC	2	6	42011	42016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644144
500	NC_019957	CAG	2	6	42110	42115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644144

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