MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium smegmatis JS623 plasmid pMYCSM01

Total Repeats: 8007

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_019957	CGCC	2	8	228309	228316	0 %	0 %	25 %	75 %	433644289
4502	NC_019957	CGA	2	6	228318	228323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644289
4503	NC_019957	TGA	2	6	228326	228331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433644289
4504	NC_019957	GCA	2	6	228351	228356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644289
4505	NC_019957	CGA	2	6	228375	228380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644289
4506	NC_019957	CGA	2	6	228393	228398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644289
4507	NC_019957	CGA	2	6	228417	228422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644289
4508	NC_019957	CCT	2	6	228431	228436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433644289
4509	NC_019957	CGA	2	6	228437	228442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644289
4510	NC_019957	GGC	2	6	228459	228464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644289
4511	NC_019957	CA	3	6	228526	228531	50 %	0 %	0 %	50 %	433644289
4512	NC_019957	GAC	2	6	228585	228590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644289
4513	NC_019957	CCT	2	6	230411	230416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433644290
4514	NC_019957	TCA	2	6	230471	230476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433644290
4515	NC_019957	CGT	2	6	230495	230500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644290
4516	NC_019957	CGT	2	6	230529	230534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644290
4517	NC_019957	GC	3	6	230537	230542	0 %	0 %	50 %	50 %	433644290
4518	NC_019957	CAG	2	6	230560	230565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644290
4519	NC_019957	GGGCCG	2	12	230623	230634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644290
4520	NC_019957	GCC	2	6	230646	230651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644290
4521	NC_019957	CGT	2	6	230688	230693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644290
4522	NC_019957	CCG	2	6	230709	230714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644290
4523	NC_019957	CG	3	6	230713	230718	0 %	0 %	50 %	50 %	433644290
4524	NC_019957	GCG	2	6	230813	230818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644290
4525	NC_019957	AAG	2	6	230830	230835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433644290
4526	NC_019957	GCT	2	6	230853	230858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644290
4527	NC_019957	CGA	2	6	230892	230897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644290
4528	NC_019957	CTG	2	6	231664	231669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644291
4529	NC_019957	GATCGC	2	12	231683	231694	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	433644291
4530	NC_019957	GGGTG	2	10	231704	231713	0 %	20 %	80 %	0 %	433644291
4531	NC_019957	CGC	2	6	231740	231745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644291
4532	NC_019957	CGA	2	6	231805	231810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644291
4533	NC_019957	AAC	2	6	231906	231911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433644291
4534	NC_019957	ACG	2	6	232024	232029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644291
4535	NC_019957	CGC	2	6	232085	232090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644291
4536	NC_019957	CCGA	2	8	232107	232114	25 %	0 %	25 %	50 %	433644291
4537	NC_019957	TGC	2	6	232210	232215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644291
4538	NC_019957	GAT	2	6	232298	232303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433644291
4539	NC_019957	GGT	2	6	232343	232348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433644291
4540	NC_019957	TCG	2	6	232420	232425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644291
4541	NC_019957	CAT	2	6	232452	232457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433644291
4542	NC_019957	AAG	2	6	232462	232467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433644291
4543	NC_019957	GAG	2	6	232528	232533	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433644292
4544	NC_019957	GAG	2	6	232549	232554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433644292
4545	NC_019957	CCG	2	6	232588	232593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644292
4546	NC_019957	CTGCGG	2	12	232672	232683	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	433644292
4547	NC_019957	GCG	2	6	232690	232695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644292
4548	NC_019957	TGGC	2	8	232714	232721	0 %	25 %	50 %	25 %	433644292
4549	NC_019957	CGC	2	6	232792	232797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644292
4550	NC_019957	CTG	2	6	232801	232806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644292
4551	NC_019957	CGT	2	6	232817	232822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644292
4552	NC_019957	GCT	2	6	232878	232883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644293
4553	NC_019957	CAGC	2	8	232888	232895	25 %	0 %	25 %	50 %	433644293
4554	NC_019957	CACC	2	8	232912	232919	25 %	0 %	0 %	75 %	433644293
4555	NC_019957	CGA	2	6	232968	232973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644293
4556	NC_019957	GCG	2	6	233009	233014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644293
4557	NC_019957	CGC	2	6	233038	233043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644293
4558	NC_019957	GC	3	6	233084	233089	0 %	0 %	50 %	50 %	433644293
4559	NC_019957	GCT	2	6	233149	233154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644293
4560	NC_019957	GC	3	6	233155	233160	0 %	0 %	50 %	50 %	433644293
4561	NC_019957	TCGG	2	8	233227	233234	0 %	25 %	50 %	25 %	433644293
4562	NC_019957	CTC	2	6	233248	233253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433644293
4563	NC_019957	CGC	2	6	233257	233262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644293
4564	NC_019957	GTCG	2	8	233290	233297	0 %	25 %	50 %	25 %	433644293
4565	NC_019957	CG	3	6	233302	233307	0 %	0 %	50 %	50 %	433644293
4566	NC_019957	GGC	2	6	233331	233336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644293
4567	NC_019957	CTCG	2	8	233454	233461	0 %	25 %	25 %	50 %	433644293
4568	NC_019957	ACC	2	6	233463	233468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433644293
4569	NC_019957	GCA	2	6	233490	233495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644293
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4571	NC_019957	GC	3	6	233519	233524	0 %	0 %	50 %	50 %	433644293
4572	NC_019957	CGTCGG	2	12	233537	233548	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	433644294
4573	NC_019957	CGG	2	6	233557	233562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644294
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4575	NC_019957	CGC	2	6	233599	233604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644294
4576	NC_019957	GCGCG	2	10	233630	233639	0 %	0 %	60 %	40 %	433644294
4577	NC_019957	GGC	2	6	233652	233657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644294
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4579	NC_019957	CG	3	6	233726	233731	0 %	0 %	50 %	50 %	433644294
4580	NC_019957	GCC	2	6	233743	233748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644294
4581	NC_019957	GCG	2	6	233773	233778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644294
4582	NC_019957	CG	3	6	233870	233875	0 %	0 %	50 %	50 %	433644294
4583	NC_019957	CGG	2	6	233938	233943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644294
4584	NC_019957	TCG	2	6	233962	233967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644294
4585	NC_019957	TTTG	2	8	233976	233983	0 %	75 %	25 %	0 %	433644294
4586	NC_019957	GCG	2	6	234025	234030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644294
4587	NC_019957	GCC	2	6	234047	234052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644294
4588	NC_019957	T	7	7	234086	234092	0 %	100 %	0 %	0 %	433644294
4589	NC_019957	CTGC	2	8	234222	234229	0 %	25 %	25 %	50 %	433644294
4590	NC_019957	GC	3	6	234277	234282	0 %	0 %	50 %	50 %	433644294
4591	NC_019957	TGG	2	6	234329	234334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433644294
4592	NC_019957	GC	4	8	234373	234380	0 %	0 %	50 %	50 %	433644294
4593	NC_019957	CGC	2	6	234465	234470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644294
4594	NC_019957	CGT	2	6	234493	234498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644294
4595	NC_019957	GCCC	2	8	234499	234506	0 %	0 %	25 %	75 %	433644294
4596	NC_019957	CAG	2	6	234511	234516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644294
4597	NC_019957	GTCG	2	8	234563	234570	0 %	25 %	50 %	25 %	433644294
4598	NC_019957	GC	3	6	234578	234583	0 %	0 %	50 %	50 %	433644294
4599	NC_019957	CG	3	6	234585	234590	0 %	0 %	50 %	50 %	433644294
4600	NC_019957	CGGTG	2	10	234603	234612	0 %	20 %	60 %	20 %	433644294
4601	NC_019957	GCCGC	2	10	234621	234630	0 %	0 %	40 %	60 %	433644294
4602	NC_019957	AC	3	6	235417	235422	50 %	0 %	0 %	50 %	433644295
4603	NC_019957	GTCGC	2	10	235438	235447	0 %	20 %	40 %	40 %	433644295
4604	NC_019957	CGA	2	6	235459	235464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644295
4605	NC_019957	CTG	2	6	235518	235523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644295
4606	NC_019957	GC	3	6	235542	235547	0 %	0 %	50 %	50 %	433644295
4607	NC_019957	ACC	2	6	235631	235636	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433644295
4608	NC_019957	CAT	2	6	235668	235673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433644295
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4610	NC_019957	CGGT	2	8	235727	235734	0 %	25 %	50 %	25 %	433644295
4611	NC_019957	ACCC	2	8	235786	235793	25 %	0 %	0 %	75 %	433644295
4612	NC_019957	CTG	2	6	235822	235827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644295
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4617	NC_019957	GTC	2	6	236017	236022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644295
4618	NC_019957	CG	3	6	236025	236030	0 %	0 %	50 %	50 %	433644295
4619	NC_019957	TGCG	2	8	236056	236063	0 %	25 %	50 %	25 %	433644295
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4621	NC_019957	CGT	2	6	236122	236127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644295
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4853	NC_019957	GC	3	6	247126	247131	0 %	0 %	50 %	50 %	433644305
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4858	NC_019957	AATTG	2	10	247362	247371	40 %	40 %	20 %	0 %	433644306
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4987	NC_019957	CTG	2	6	252897	252902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644313
4988	NC_019957	ACCGG	2	10	252903	252912	20 %	0 %	40 %	40 %	433644313
4989	NC_019957	GGT	3	9	252914	252922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433644313
4990	NC_019957	GC	3	6	252923	252928	0 %	0 %	50 %	50 %	433644313
4991	NC_019957	ACGCGC	2	12	252991	253002	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	433644313
4992	NC_019957	GCC	3	9	253004	253012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644313
4993	NC_019957	CGC	2	6	253021	253026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644313
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4995	NC_019957	GGTT	2	8	253143	253150	0 %	50 %	50 %	0 %	433644313
4996	NC_019957	CGA	2	6	253163	253168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644313
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4999	NC_019957	CGGT	2	8	253222	253229	0 %	25 %	50 %	25 %	433644313
5000	NC_019957	CGC	2	6	253252	253257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644313

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