MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium canettii CIPT 140070017 complete genome

Total Repeats: 101347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_019952	GCTG	2	8	24487	24494	0 %	25 %	50 %	25 %	433633033
502	NC_019952	CGTAGT	2	12	24521	24532	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	433633033
503	NC_019952	CGGC	2	8	24535	24542	0 %	0 %	50 %	50 %	433633033
504	NC_019952	GAG	2	6	24566	24571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433633033
505	NC_019952	GCC	3	9	24618	24626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433633033
506	NC_019952	GCCG	2	8	24635	24642	0 %	0 %	50 %	50 %	433633033
507	NC_019952	CTC	2	6	24747	24752	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433633033
508	NC_019952	CCG	2	6	24787	24792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433633033
509	NC_019952	GCC	2	6	24804	24809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433633033
510	NC_019952	GCC	2	6	24828	24833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433633033
511	NC_019952	GCCGG	2	10	24880	24889	0 %	0 %	60 %	40 %	433633033
512	NC_019952	AGG	2	6	24897	24902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433633033
513	NC_019952	GCG	2	6	24917	24922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433633033
514	NC_019952	C	6	6	24928	24933	0 %	0 %	0 %	100 %	433633033
515	NC_019952	CCTGGT	2	12	24959	24970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433633033
516	NC_019952	GCC	2	6	25095	25100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433633033
517	NC_019952	C	6	6	25116	25121	0 %	0 %	0 %	100 %	433633033
518	NC_019952	CCA	2	6	25153	25158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433633033
519	NC_019952	GTC	2	6	25188	25193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433633033
520	NC_019952	TCG	2	6	25201	25206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433633033
521	NC_019952	GCCCCT	2	12	25211	25222	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	433633033
522	NC_019952	CGG	2	6	25317	25322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433633033
523	NC_019952	CGA	2	6	25383	25388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633033
524	NC_019952	GAC	2	6	25401	25406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633033
525	NC_019952	ATG	2	6	25528	25533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433633033
526	NC_019952	GCC	2	6	25585	25590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433633033
527	NC_019952	GCA	2	6	25598	25603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633033
528	NC_019952	GC	3	6	26194	26199	0 %	0 %	50 %	50 %	433633034
529	NC_019952	CGC	2	6	26217	26222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433633034
530	NC_019952	TTG	2	6	26223	26228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433633034
531	NC_019952	CGG	2	6	26249	26254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433633034
532	NC_019952	CGG	2	6	26291	26296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433633034
533	NC_019952	GCA	2	6	26323	26328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633034
534	NC_019952	CTT	2	6	26354	26359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433633034
535	NC_019952	GT	3	6	26428	26433	0 %	50 %	50 %	0 %	433633034
536	NC_019952	GTG	2	6	26473	26478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433633034
537	NC_019952	GTC	2	6	26487	26492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433633034
538	NC_019952	GCC	2	6	26500	26505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433633034
539	NC_019952	AGC	2	6	26506	26511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633034
540	NC_019952	CGG	2	6	26579	26584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433633034
541	NC_019952	CGG	2	6	26600	26605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433633034
542	NC_019952	CGG	2	6	26633	26638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433633034
543	NC_019952	CG	3	6	26662	26667	0 %	0 %	50 %	50 %	433633034
544	NC_019952	CGA	2	6	26678	26683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633034
545	NC_019952	CCA	2	6	26750	26755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433633034
546	NC_019952	GCTC	2	8	26779	26786	0 %	25 %	25 %	50 %	433633034
547	NC_019952	CGG	2	6	26828	26833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433633034
548	NC_019952	AGC	2	6	26914	26919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633034
549	NC_019952	TGA	2	6	26945	26950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433633034
550	NC_019952	GCG	2	6	26974	26979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433633034
551	NC_019952	CCAA	2	8	26996	27003	50 %	0 %	0 %	50 %	433633034
552	NC_019952	GCC	2	6	27018	27023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433633034
553	NC_019952	CAGC	2	8	27062	27069	25 %	0 %	25 %	50 %	433633034
554	NC_019952	CCG	2	6	27073	27078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433633034
555	NC_019952	CAC	2	6	27150	27155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433633034
556	NC_019952	CAC	2	6	27339	27344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433633035
557	NC_019952	CAG	2	6	27387	27392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633035
558	NC_019952	CGC	2	6	27428	27433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433633035
559	NC_019952	GCA	2	6	27446	27451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633035
560	NC_019952	CGT	2	6	27452	27457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433633035
561	NC_019952	GCC	2	6	27492	27497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433633035
562	NC_019952	GCT	2	6	27566	27571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433633035
563	NC_019952	GCG	2	6	27643	27648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433633035
564	NC_019952	CGT	2	6	27659	27664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433633035
565	NC_019952	CGGC	2	8	27882	27889	0 %	0 %	50 %	50 %	433633036
566	NC_019952	GGC	2	6	27940	27945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433633036
567	NC_019952	CA	3	6	28002	28007	50 %	0 %	0 %	50 %	433633036
568	NC_019952	GCC	2	6	28045	28050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433633036
569	NC_019952	CGC	2	6	28075	28080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433633036
570	NC_019952	CGC	2	6	28111	28116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433633036
571	NC_019952	CCG	2	6	28141	28146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433633036
572	NC_019952	GTC	2	6	28157	28162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433633036
573	NC_019952	CGA	2	6	28251	28256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633036
574	NC_019952	TC	3	6	28282	28287	0 %	50 %	0 %	50 %	433633036
575	NC_019952	GCC	2	6	28322	28327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433633036
576	NC_019952	CCGG	2	8	28368	28375	0 %	0 %	50 %	50 %	433633036
577	NC_019952	CG	3	6	28407	28412	0 %	0 %	50 %	50 %	433633036
578	NC_019952	GC	3	6	28413	28418	0 %	0 %	50 %	50 %	433633036
579	NC_019952	GTC	2	6	28474	28479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433633036
580	NC_019952	TCGGCG	2	12	28509	28520	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	433633036
581	NC_019952	CGA	2	6	28522	28527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633036
582	NC_019952	GC	3	6	28566	28571	0 %	0 %	50 %	50 %	433633036
583	NC_019952	TCG	2	6	28590	28595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433633036
584	NC_019952	ACG	2	6	28614	28619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633036
585	NC_019952	GCA	2	6	28630	28635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633036
586	NC_019952	TCA	2	6	28671	28676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433633037
587	NC_019952	CAC	2	6	28719	28724	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433633037
588	NC_019952	CTG	2	6	28738	28743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433633037
589	NC_019952	GGC	2	6	28812	28817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433633037
590	NC_019952	CTG	2	6	28826	28831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433633037
591	NC_019952	TCA	2	6	28859	28864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433633037
592	NC_019952	CGG	2	6	28894	28899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433633037
593	NC_019952	CGA	2	6	28917	28922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633037
594	NC_019952	GCTC	2	8	28924	28931	0 %	25 %	25 %	50 %	433633037
595	NC_019952	ACC	2	6	28936	28941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433633037
596	NC_019952	CGT	2	6	28984	28989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433633037
597	NC_019952	GC	4	8	29001	29008	0 %	0 %	50 %	50 %	433633037
598	NC_019952	CGA	2	6	29032	29037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633037
599	NC_019952	ACG	2	6	29043	29048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633037
600	NC_019952	GGC	2	6	29055	29060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433633037
601	NC_019952	TGCG	2	8	29063	29070	0 %	25 %	50 %	25 %	433633037
602	NC_019952	CGC	2	6	29160	29165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433633037
603	NC_019952	CAC	2	6	29277	29282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433633037
604	NC_019952	CCGG	2	8	29328	29335	0 %	0 %	50 %	50 %	433633037
605	NC_019952	CAA	2	6	29382	29387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433633037
606	NC_019952	GTC	2	6	29392	29397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433633037
607	NC_019952	CAA	2	6	29442	29447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433633037
608	NC_019952	GGCAA	2	10	29575	29584	40 %	0 %	40 %	20 %	433633038
609	NC_019952	ACG	2	6	29586	29591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633038
610	NC_019952	GC	3	6	29634	29639	0 %	0 %	50 %	50 %	433633038
611	NC_019952	CGTC	2	8	29659	29666	0 %	25 %	25 %	50 %	433633038
612	NC_019952	CG	3	6	29696	29701	0 %	0 %	50 %	50 %	433633038
613	NC_019952	GGATCA	2	12	29707	29718	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	433633038
614	NC_019952	AGC	2	6	29775	29780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633038
615	NC_019952	GTC	2	6	29795	29800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433633038
616	NC_019952	GCC	3	9	29801	29809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433633038
617	NC_019952	CACG	2	8	30019	30026	25 %	0 %	25 %	50 %	433633039
618	NC_019952	ACCG	2	8	30100	30107	25 %	0 %	25 %	50 %	433633039
619	NC_019952	GGT	2	6	30118	30123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433633039
620	NC_019952	CGC	2	6	30229	30234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433633039
621	NC_019952	AGC	2	6	30256	30261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633039
622	NC_019952	GTC	2	6	30305	30310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433633039
623	NC_019952	CGATC	2	10	30401	30410	20 %	20 %	20 %	40 %	433633039
624	NC_019952	CCGG	2	8	30419	30426	0 %	0 %	50 %	50 %	433633039
625	NC_019952	CG	3	6	30427	30432	0 %	0 %	50 %	50 %	433633039
626	NC_019952	GGT	2	6	30478	30483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433633039
627	NC_019952	GCC	2	6	30527	30532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433633039
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751	NC_019952	CGA	2	6	37014	37019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633047
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1000	NC_019952	CGT	2	6	48175	48180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433633056

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