MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium canettii CIPT 140060008 complete genome

Total Repeats: 100207

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_019950	GCC	2	6	47947	47952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625133
1002	NC_019950	GAG	2	6	48001	48006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433625133
1003	NC_019950	ACC	2	6	48028	48033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433625133
1004	NC_019950	GCC	2	6	48067	48072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625133
1005	NC_019950	TCG	2	6	48077	48082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625133
1006	NC_019950	GTG	3	9	48133	48141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625133
1007	NC_019950	GCC	2	6	48142	48147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625133
1008	NC_019950	CGA	2	6	48153	48158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625133
1009	NC_019950	GCC	2	6	48172	48177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625133
1010	NC_019950	CGA	2	6	48186	48191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625133
1011	NC_019950	GCCG	2	8	48244	48251	0 %	0 %	50 %	50 %	433625133
1012	NC_019950	TTGC	2	8	48408	48415	0 %	50 %	25 %	25 %	433625134
1013	NC_019950	AGC	2	6	48507	48512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625134
1014	NC_019950	CG	3	6	48524	48529	0 %	0 %	50 %	50 %	433625134
1015	NC_019950	CCGC	2	8	48556	48563	0 %	0 %	25 %	75 %	433625134
1016	NC_019950	GCG	2	6	48568	48573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625134
1017	NC_019950	CCGC	2	8	48589	48596	0 %	0 %	25 %	75 %	433625134
1018	NC_019950	TCT	2	6	48634	48639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433625134
1019	NC_019950	GCC	2	6	48643	48648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625134
1020	NC_019950	GGT	3	9	48659	48667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625134
1021	NC_019950	GGTC	2	8	48697	48704	0 %	25 %	50 %	25 %	433625134
1022	NC_019950	GCA	2	6	48799	48804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625134
1023	NC_019950	CGGTG	2	10	48860	48869	0 %	20 %	60 %	20 %	433625134
1024	NC_019950	ACA	2	6	48999	49004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433625134
1025	NC_019950	TCATG	2	10	49006	49015	20 %	40 %	20 %	20 %	433625134
1026	NC_019950	CGGG	2	8	49248	49255	0 %	0 %	75 %	25 %	433625135
1027	NC_019950	CGG	3	9	49265	49273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625135
1028	NC_019950	GCAG	2	8	49321	49328	25 %	0 %	50 %	25 %	433625135
1029	NC_019950	GCG	2	6	49361	49366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625135
1030	NC_019950	CGT	2	6	49392	49397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625135
1031	NC_019950	TGG	2	6	49458	49463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625135
1032	NC_019950	TCG	2	6	49487	49492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625135
1033	NC_019950	GGC	2	6	49606	49611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625135
1034	NC_019950	TGG	2	6	49668	49673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625135
1035	NC_019950	CGC	2	6	49698	49703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625135
1036	NC_019950	CGT	2	6	49728	49733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625135
1037	NC_019950	T	6	6	49892	49897	0 %	100 %	0 %	0 %	433625135
1038	NC_019950	CGC	2	6	50160	50165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625136
1039	NC_019950	CGG	2	6	50175	50180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625136
1040	NC_019950	GTGC	2	8	50221	50228	0 %	25 %	50 %	25 %	433625136
1041	NC_019950	CGG	2	6	50262	50267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625136
1042	NC_019950	CCG	4	12	50324	50335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625136
1043	NC_019950	CGG	3	9	50359	50367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625136
1044	NC_019950	GCAGC	2	10	50400	50409	20 %	0 %	40 %	40 %	433625136
1045	NC_019950	GTC	2	6	50416	50421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625136
1046	NC_019950	GGC	2	6	50424	50429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625136
1047	NC_019950	TCG	2	6	50459	50464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625136
1048	NC_019950	CCCGA	2	10	50483	50492	20 %	0 %	20 %	60 %	433625136
1049	NC_019950	GCCG	2	8	50505	50512	0 %	0 %	50 %	50 %	433625136
1050	NC_019950	AGC	2	6	50549	50554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625136
1051	NC_019950	AAG	2	6	50681	50686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433625136
1052	NC_019950	CGG	2	6	50729	50734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625136
1053	NC_019950	G	6	6	50760	50765	0 %	0 %	100 %	0 %	433625136
1054	NC_019950	TGC	2	6	50768	50773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625136
1055	NC_019950	GT	3	6	50850	50855	0 %	50 %	50 %	0 %	433625137
1056	NC_019950	GC	3	6	50885	50890	0 %	0 %	50 %	50 %	433625137
1057	NC_019950	CGA	2	6	50925	50930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625137
1058	NC_019950	CGG	2	6	50970	50975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625137
1059	NC_019950	CGA	2	6	50998	51003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625137
1060	NC_019950	GCC	2	6	51004	51009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625137
1061	NC_019950	CGT	2	6	51045	51050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625137
1062	NC_019950	CGG	2	6	51122	51127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625137
1063	NC_019950	CGC	2	6	51141	51146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625137
1064	NC_019950	GCT	2	6	51255	51260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625137
1065	NC_019950	CGG	2	6	51261	51266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625137
1066	NC_019950	CGA	2	6	51306	51311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625137
1067	NC_019950	GCG	2	6	51450	51455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625137
1068	NC_019950	TCC	2	6	51467	51472	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433625137
1069	NC_019950	CGA	2	6	51531	51536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625137
1070	NC_019950	CCG	3	9	51566	51574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625137
1071	NC_019950	GCC	2	6	51601	51606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625137
1072	NC_019950	CAGCG	2	10	51608	51617	20 %	0 %	40 %	40 %	433625137
1073	NC_019950	CAGC	2	8	51690	51697	25 %	0 %	25 %	50 %	433625137
1074	NC_019950	TCG	2	6	51725	51730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625137
1075	NC_019950	GAT	2	6	51829	51834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433625138
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1078	NC_019950	GCT	2	6	51873	51878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625138
1079	NC_019950	CGGG	2	8	51879	51886	0 %	0 %	75 %	25 %	433625138
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1082	NC_019950	GCC	2	6	51953	51958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625138
1083	NC_019950	GAT	2	6	51970	51975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433625138
1084	NC_019950	GCCG	2	8	51979	51986	0 %	0 %	50 %	50 %	433625138
1085	NC_019950	TCG	2	6	52082	52087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625138
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1089	NC_019950	GGTG	2	8	52302	52309	0 %	25 %	75 %	0 %	433625138
1090	NC_019950	TCG	2	6	52311	52316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625138
1091	NC_019950	TCA	2	6	52337	52342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433625138
1092	NC_019950	CGA	2	6	52344	52349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625138
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1094	NC_019950	TCC	2	6	52472	52477	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433625138
1095	NC_019950	CCT	2	6	52518	52523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433625138
1096	NC_019950	GAC	2	6	52534	52539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625138
1097	NC_019950	GTA	2	6	52579	52584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433625138
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1099	NC_019950	CTT	2	6	52705	52710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433625138
1100	NC_019950	CGC	2	6	52726	52731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625138
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1103	NC_019950	GCCGAC	2	12	52855	52866	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	433625138
1104	NC_019950	CTCA	2	8	52918	52925	25 %	25 %	0 %	50 %	433625138
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1107	NC_019950	CGCT	2	8	53057	53064	0 %	25 %	25 %	50 %	433625139
1108	NC_019950	CTG	2	6	53114	53119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625139
1109	NC_019950	GGC	2	6	53166	53171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625139
1110	NC_019950	GAA	2	6	53218	53223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433625139
1111	NC_019950	CGT	2	6	53244	53249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625139
1112	NC_019950	TG	3	6	53259	53264	0 %	50 %	50 %	0 %	433625139
1113	NC_019950	CCA	2	6	53277	53282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433625139
1114	NC_019950	CGT	2	6	53327	53332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625139
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1116	NC_019950	GGC	2	6	53359	53364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625139
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1119	NC_019950	ACAACG	3	18	53710	53727	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	433625140
1120	NC_019950	GTG	2	6	53736	53741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625140
1121	NC_019950	CGA	2	6	53758	53763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625140
1122	NC_019950	ATG	2	6	53823	53828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433625140
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1124	NC_019950	GGTA	2	8	53923	53930	25 %	25 %	50 %	0 %	433625140
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1248	NC_019950	TG	3	6	59294	59299	0 %	50 %	50 %	0 %	433625144
1249	NC_019950	CGA	2	6	59310	59315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625144
1250	NC_019950	GGC	2	6	59347	59352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625144
1251	NC_019950	CAC	2	6	59427	59432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433625144
1252	NC_019950	CGG	2	6	59445	59450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625144
1253	NC_019950	GGC	2	6	59460	59465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625144
1254	NC_019950	GTC	2	6	59557	59562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625144
1255	NC_019950	TCA	2	6	59582	59587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433625144
1256	NC_019950	CCG	3	9	59588	59596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625144
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1261	NC_019950	CGA	2	6	60041	60046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625145
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1265	NC_019950	GCC	2	6	60198	60203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625145
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1280	NC_019950	GGC	3	9	60859	60867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625146
1281	NC_019950	GCG	2	6	60947	60952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625147
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1289	NC_019950	TCG	2	6	61326	61331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625148
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1364	NC_019950	TCAGG	2	10	64258	64267	20 %	20 %	40 %	20 %	433625150
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1368	NC_019950	A	6	6	64373	64378	100 %	0 %	0 %	0 %	433625150
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1370	NC_019950	CGA	2	6	64443	64448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625150
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1372	NC_019950	CGT	2	6	64552	64557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625150
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1492	NC_019950	GCCG	2	8	70979	70986	0 %	0 %	50 %	50 %	433625158
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1495	NC_019950	CGG	2	6	71089	71094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625158
1496	NC_019950	TCA	2	6	71185	71190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433625159
1497	NC_019950	GGTGAC	2	12	71246	71257	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	433625159
1498	NC_019950	TGC	3	9	71301	71309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625159
1499	NC_019950	GAT	2	6	71315	71320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433625159
1500	NC_019950	CTG	2	6	72246	72251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625160

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