MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium canettii CIPT 140060008 complete genome

Total Repeats: 100207

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_019950	CGA	3	9	24179	24187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625109
502	NC_019950	GCC	3	9	24204	24212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625109
503	NC_019950	CAG	2	6	24321	24326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625109
504	NC_019950	CCT	2	6	24428	24433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433625109
505	NC_019950	TCG	2	6	24451	24456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625109
506	NC_019950	GTC	2	6	24477	24482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625109
507	NC_019950	GCA	2	6	24512	24517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625109
508	NC_019950	CG	3	6	24524	24529	0 %	0 %	50 %	50 %	433625109
509	NC_019950	GC	3	6	24649	24654	0 %	0 %	50 %	50 %	433625109
510	NC_019950	CAG	2	6	24675	24680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625109
511	NC_019950	TCG	2	6	24694	24699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625109
512	NC_019950	GCCG	2	8	24747	24754	0 %	0 %	50 %	50 %	433625109
513	NC_019950	CCCA	2	8	24759	24766	25 %	0 %	0 %	75 %	433625109
514	NC_019950	GTT	2	6	24816	24821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433625109
515	NC_019950	GC	3	6	24846	24851	0 %	0 %	50 %	50 %	433625109
516	NC_019950	GTC	2	6	25040	25045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625110
517	NC_019950	GTC	2	6	25147	25152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625110
518	NC_019950	GTC	2	6	25171	25176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625110
519	NC_019950	GC	3	6	25178	25183	0 %	0 %	50 %	50 %	433625110
520	NC_019950	CG	3	6	25217	25222	0 %	0 %	50 %	50 %	433625110
521	NC_019950	CAC	2	6	25243	25248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433625110
522	NC_019950	CG	3	6	25277	25282	0 %	0 %	50 %	50 %	433625110
523	NC_019950	CAT	2	6	25318	25323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433625110
524	NC_019950	CAA	2	6	25390	25395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433625110
525	NC_019950	GAT	2	6	25579	25584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433625111
526	NC_019950	ATCAC	2	10	25604	25613	40 %	20 %	0 %	40 %	433625111
527	NC_019950	GTG	2	6	25655	25660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625111
528	NC_019950	TGG	2	6	25665	25670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625111
529	NC_019950	AC	3	6	25731	25736	50 %	0 %	0 %	50 %	433625111
530	NC_019950	GAT	2	6	25777	25782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433625111
531	NC_019950	CGT	2	6	25821	25826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625111
532	NC_019950	CGG	2	6	25851	25856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625111
533	NC_019950	GCC	2	6	25864	25869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625111
534	NC_019950	GCTG	2	8	25898	25905	0 %	25 %	50 %	25 %	433625111
535	NC_019950	CGTAGT	2	12	25932	25943	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	433625111
536	NC_019950	CGGC	2	8	25946	25953	0 %	0 %	50 %	50 %	433625111
537	NC_019950	GAG	2	6	25977	25982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433625111
538	NC_019950	GCC	3	9	26029	26037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625111
539	NC_019950	GCCG	2	8	26046	26053	0 %	0 %	50 %	50 %	433625111
540	NC_019950	CGGG	2	8	26121	26128	0 %	0 %	75 %	25 %	433625111
541	NC_019950	CTC	2	6	26158	26163	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433625111
542	NC_019950	CCG	2	6	26198	26203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625111
543	NC_019950	GCC	2	6	26215	26220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625111
544	NC_019950	GCC	2	6	26239	26244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625111
545	NC_019950	GCCGG	2	10	26291	26300	0 %	0 %	60 %	40 %	433625111
546	NC_019950	AGG	2	6	26308	26313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433625111
547	NC_019950	GCG	2	6	26328	26333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625111
548	NC_019950	C	6	6	26339	26344	0 %	0 %	0 %	100 %	433625111
549	NC_019950	CCTGGT	2	12	26370	26381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625111
550	NC_019950	GCC	2	6	26506	26511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625111
551	NC_019950	C	6	6	26527	26532	0 %	0 %	0 %	100 %	433625111
552	NC_019950	CCA	2	6	26564	26569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433625111
553	NC_019950	GTC	2	6	26599	26604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625111
554	NC_019950	TCG	2	6	26612	26617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625111
555	NC_019950	GCCCCT	2	12	26622	26633	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	433625111
556	NC_019950	CGG	2	6	26728	26733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625111
557	NC_019950	CGA	2	6	26794	26799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625111
558	NC_019950	GAC	2	6	26812	26817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625111
559	NC_019950	ATG	2	6	26939	26944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433625111
560	NC_019950	GCC	2	6	26996	27001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625111
561	NC_019950	GCA	2	6	27009	27014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625111
562	NC_019950	GC	3	6	27605	27610	0 %	0 %	50 %	50 %	433625112
563	NC_019950	CGC	2	6	27628	27633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625112
564	NC_019950	TTG	2	6	27634	27639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433625112
565	NC_019950	CGG	2	6	27660	27665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625112
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570	NC_019950	GTG	2	6	27884	27889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625112
571	NC_019950	GTC	2	6	27898	27903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625112
572	NC_019950	CGC	2	6	27910	27915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625112
573	NC_019950	CAG	2	6	27916	27921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625112
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578	NC_019950	CGA	2	6	28089	28094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625112
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581	NC_019950	CGG	2	6	28239	28244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625112
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589	NC_019950	CAC	2	6	28561	28566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433625112
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591	NC_019950	CAG	2	6	28798	28803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625113
592	NC_019950	CGC	2	6	28839	28844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625113
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596	NC_019950	GCT	2	6	28977	28982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625113
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598	NC_019950	CGT	2	6	29070	29075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625113
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607	NC_019950	CGA	2	6	29662	29667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625114
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609	NC_019950	TG	3	6	29712	29717	0 %	50 %	50 %	0 %	433625114
610	NC_019950	GCC	2	6	29733	29738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625114
611	NC_019950	CCGG	2	8	29779	29786	0 %	0 %	50 %	50 %	433625114
612	NC_019950	CG	3	6	29818	29823	0 %	0 %	50 %	50 %	433625114
613	NC_019950	GTC	2	6	29885	29890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625114
614	NC_019950	TCGGCG	2	12	29920	29931	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	433625114
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616	NC_019950	GC	3	6	29977	29982	0 %	0 %	50 %	50 %	433625114
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626	NC_019950	GTC	2	6	30266	30271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625115
627	NC_019950	CGG	2	6	30305	30310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625115
628	NC_019950	CGA	2	6	30328	30333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625115
629	NC_019950	GCTC	2	8	30335	30342	0 %	25 %	25 %	50 %	433625115
630	NC_019950	CCG	2	6	30348	30353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625115
631	NC_019950	CGT	2	6	30395	30400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625115
632	NC_019950	TGCG	2	8	30411	30418	0 %	25 %	50 %	25 %	433625115
633	NC_019950	CGA	2	6	30443	30448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625115
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636	NC_019950	TGCG	2	8	30474	30481	0 %	25 %	50 %	25 %	433625115
637	NC_019950	CGC	2	6	30571	30576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625115
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642	NC_019950	CAA	2	6	30853	30858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433625115
643	NC_019950	GGCAA	2	10	30986	30995	40 %	0 %	40 %	20 %	433625116
644	NC_019950	ACG	2	6	30997	31002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625116
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647	NC_019950	CG	3	6	31107	31112	0 %	0 %	50 %	50 %	433625116
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651	NC_019950	GCC	2	6	31212	31217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625116
652	NC_019950	CACG	2	8	31430	31437	25 %	0 %	25 %	50 %	433625117
653	NC_019950	ACCG	2	8	31511	31518	25 %	0 %	25 %	50 %	433625117
654	NC_019950	GGT	2	6	31529	31534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625117
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658	NC_019950	CGATC	2	10	31812	31821	20 %	20 %	20 %	40 %	433625117
659	NC_019950	CCGG	2	8	31830	31837	0 %	0 %	50 %	50 %	433625117
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661	NC_019950	GGT	2	6	31889	31894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625117
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663	NC_019950	GTCG	2	8	32006	32013	0 %	25 %	50 %	25 %	433625117
664	NC_019950	GCG	2	6	32020	32025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625117
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746	NC_019950	TCGAGG	2	12	36540	36551	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	433625124
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749	NC_019950	GCG	2	6	36659	36664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625124
750	NC_019950	GTT	2	6	36700	36705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433625124
751	NC_019950	CTT	2	6	36730	36735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433625124
752	NC_019950	ATCG	2	8	36785	36792	25 %	25 %	25 %	25 %	433625124
753	NC_019950	GCG	2	6	36830	36835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625124
754	NC_019950	ATG	3	9	37001	37009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433625124
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757	NC_019950	GATC	2	8	37123	37130	25 %	25 %	25 %	25 %	433625124
758	NC_019950	CGG	2	6	37159	37164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625124
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