MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium canettii CIPT 140060008 complete genome

Total Repeats: 100207

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_019950	ACA	2	6	230251	230256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433625293
5003	NC_019950	ACG	2	6	230260	230265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625293
5004	NC_019950	AGC	2	6	230388	230393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625294
5005	NC_019950	CGG	2	6	230394	230399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625294
5006	NC_019950	CAC	2	6	230411	230416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433625294
5007	NC_019950	GGC	2	6	230444	230449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625294
5008	NC_019950	CGCAG	2	10	230503	230512	20 %	0 %	40 %	40 %	433625294
5009	NC_019950	GC	3	6	230552	230557	0 %	0 %	50 %	50 %	433625294
5010	NC_019950	CGG	2	6	230599	230604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625294
5011	NC_019950	GGTCTT	2	12	230608	230619	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	433625294
5012	NC_019950	CGGG	2	8	230690	230697	0 %	0 %	75 %	25 %	433625294
5013	NC_019950	GCT	2	6	230698	230703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625294
5014	NC_019950	AGCC	2	8	230715	230722	25 %	0 %	25 %	50 %	433625294
5015	NC_019950	CTG	2	6	230746	230751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625294
5016	NC_019950	GC	3	6	230771	230776	0 %	0 %	50 %	50 %	433625294
5017	NC_019950	GAA	2	6	230867	230872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433625294
5018	NC_019950	CTC	2	6	230873	230878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433625294
5019	NC_019950	GCC	2	6	230952	230957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625294
5020	NC_019950	CG	3	6	230976	230981	0 %	0 %	50 %	50 %	433625294
5021	NC_019950	TTC	2	6	231033	231038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433625294
5022	NC_019950	GAG	2	6	231044	231049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433625294
5023	NC_019950	GCG	3	9	231069	231077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625294
5024	NC_019950	TAA	2	6	231088	231093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433625294
5025	NC_019950	GCT	2	6	231097	231102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625294
5026	NC_019950	TCG	2	6	231111	231116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625294
5027	NC_019950	GCTC	2	8	231136	231143	0 %	25 %	25 %	50 %	433625294
5028	NC_019950	ATG	2	6	231219	231224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433625294
5029	NC_019950	GCG	2	6	231279	231284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625294
5030	NC_019950	GGT	2	6	231334	231339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625294
5031	NC_019950	GTG	2	6	231393	231398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625294
5032	NC_019950	CGC	2	6	231522	231527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625294
5033	NC_019950	TCG	2	6	231549	231554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625294
5034	NC_019950	GCA	2	6	231577	231582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625294
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5039	NC_019950	CCG	2	6	231709	231714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625294
5040	NC_019950	CGC	2	6	231738	231743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625294
5041	NC_019950	TGAA	2	8	231759	231766	50 %	25 %	25 %	0 %	433625294
5042	NC_019950	TCG	2	6	231795	231800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625294
5043	NC_019950	GTC	2	6	231824	231829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625294
5044	NC_019950	CGA	2	6	231835	231840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625294
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5050	NC_019950	CGG	2	6	232093	232098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625294
5051	NC_019950	GGT	2	6	232145	232150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625294
5052	NC_019950	TGG	2	6	232517	232522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625296
5053	NC_019950	CTG	2	6	232559	232564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625296
5054	NC_019950	GCG	2	6	232577	232582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625296
5055	NC_019950	GAC	2	6	232637	232642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625296
5056	NC_019950	CGC	3	9	232693	232701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625296
5057	NC_019950	ACGT	2	8	232721	232728	25 %	25 %	25 %	25 %	433625296
5058	NC_019950	TAC	2	6	232736	232741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433625296
5059	NC_019950	ACA	2	6	232819	232824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433625296
5060	NC_019950	AGC	2	6	232835	232840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625296
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5064	NC_019950	TGC	2	6	232989	232994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625296
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5068	NC_019950	GTC	2	6	233090	233095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625296
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5070	NC_019950	GTC	2	6	233120	233125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625296
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5081	NC_019950	CCGG	2	8	233572	233579	0 %	0 %	50 %	50 %	433625296
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5120	NC_019950	CGG	2	6	234933	234938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625296
5121	NC_019950	TCAC	2	8	234993	235000	25 %	25 %	0 %	50 %	433625296
5122	NC_019950	GAC	2	6	235004	235009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625296
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5237	NC_019950	CGC	2	6	240060	240065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625299
5238	NC_019950	CTGCG	2	10	240162	240171	0 %	20 %	40 %	40 %	433625300
5239	NC_019950	CGG	2	6	240260	240265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625300
5240	NC_019950	CGG	2	6	240288	240293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625300
5241	NC_019950	GAA	2	6	240341	240346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433625300
5242	NC_019950	CAG	2	6	240416	240421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625300
5243	NC_019950	GCCC	2	8	240433	240440	0 %	0 %	25 %	75 %	433625300
5244	NC_019950	GAG	2	6	240484	240489	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433625300
5245	NC_019950	CGA	2	6	240502	240507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625300
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5273	NC_019950	GTA	2	6	241643	241648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433625300
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5279	NC_019950	TCG	2	6	241866	241871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625300
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5284	NC_019950	CAGC	3	12	242032	242043	25 %	0 %	25 %	50 %	433625300
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5324	NC_019950	CGCT	2	8	243513	243520	0 %	25 %	25 %	50 %	433625302
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5331	NC_019950	CCG	2	6	243942	243947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625303
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5333	NC_019950	GTT	2	6	243980	243985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433625303
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5340	NC_019950	GCC	2	6	244174	244179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625304
5341	NC_019950	AGT	2	6	244195	244200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433625304
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5344	NC_019950	AGCGT	2	10	244318	244327	20 %	20 %	40 %	20 %	433625304
5345	NC_019950	GTC	2	6	244380	244385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625304
5346	NC_019950	GCT	2	6	244394	244399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625304
5347	NC_019950	CCG	2	6	244400	244405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625304
5348	NC_019950	CG	3	6	244418	244423	0 %	0 %	50 %	50 %	433625304
5349	NC_019950	C	7	7	244435	244441	0 %	0 %	0 %	100 %	433625304
5350	NC_019950	GGT	2	6	244451	244456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625304
5351	NC_019950	GCC	2	6	244665	244670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625304
5352	NC_019950	CGC	2	6	244709	244714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625304
5353	NC_019950	ACG	2	6	244737	244742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625304
5354	NC_019950	CGGT	2	8	244766	244773	0 %	25 %	50 %	25 %	433625304
5355	NC_019950	CGAC	2	8	244780	244787	25 %	0 %	25 %	50 %	433625304
5356	NC_019950	GCCA	2	8	244800	244807	25 %	0 %	25 %	50 %	433625304
5357	NC_019950	ACC	2	6	244816	244821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433625304
5358	NC_019950	ACCAGC	2	12	244857	244868	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	433625304
5359	NC_019950	ACG	2	6	244872	244877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625304
5360	NC_019950	CACGC	2	10	244905	244914	20 %	0 %	20 %	60 %	433625304
5361	NC_019950	GCGAAC	2	12	244941	244952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625304
5362	NC_019950	CGTG	2	8	244994	245001	0 %	25 %	50 %	25 %	433625304
5363	NC_019950	TCGA	2	8	245145	245152	25 %	25 %	25 %	25 %	433625304
5364	NC_019950	GGC	3	9	245219	245227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625304
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5372	NC_019950	ACG	2	6	245544	245549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625304
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5375	NC_019950	GC	3	6	245656	245661	0 %	0 %	50 %	50 %	433625304
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5382	NC_019950	GCCG	2	8	245868	245875	0 %	0 %	50 %	50 %	433625304
5383	NC_019950	GCC	2	6	245907	245912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625304
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5390	NC_019950	TGA	2	6	246271	246276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433625304
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5392	NC_019950	GCC	2	6	246405	246410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625304
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5395	NC_019950	TGGG	2	8	246597	246604	0 %	25 %	75 %	0 %	433625304
5396	NC_019950	TAGC	2	8	246681	246688	25 %	25 %	25 %	25 %	433625304
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5468	NC_019950	GTG	3	9	249812	249820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625307
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5470	NC_019950	CGGT	2	8	249858	249865	0 %	25 %	50 %	25 %	433625307
5471	NC_019950	GTG	2	6	249950	249955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625307
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5475	NC_019950	TTC	2	6	250087	250092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433625307
5476	NC_019950	TCACC	2	10	250096	250105	20 %	20 %	0 %	60 %	433625307
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5479	NC_019950	GCT	2	6	250209	250214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625308
5480	NC_019950	GTC	2	6	250231	250236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625308
5481	NC_019950	CGC	2	6	250309	250314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625308
5482	NC_019950	CGGGGT	2	12	250357	250368	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	433625308
5483	NC_019950	TGG	2	6	250369	250374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625308
5484	NC_019950	GACC	2	8	250400	250407	25 %	0 %	25 %	50 %	433625308
5485	NC_019950	CGG	2	6	250429	250434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625308
5486	NC_019950	CGA	2	6	250441	250446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625308
5487	NC_019950	GTG	2	6	250463	250468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625308
5488	NC_019950	GCC	2	6	250484	250489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625308
5489	NC_019950	GCTG	2	8	250531	250538	0 %	25 %	50 %	25 %	433625308
5490	NC_019950	GCG	2	6	250610	250615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625308
5491	NC_019950	CG	3	6	250614	250619	0 %	0 %	50 %	50 %	433625308
5492	NC_019950	CCAGC	2	10	250626	250635	20 %	0 %	20 %	60 %	433625308
5493	NC_019950	GGA	2	6	250643	250648	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433625308
5494	NC_019950	TCG	2	6	250685	250690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625308
5495	NC_019950	CAG	2	6	250754	250759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625308
5496	NC_019950	AGC	2	6	250769	250774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625308
5497	NC_019950	TCA	2	6	250776	250781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433625308
5498	NC_019950	CAC	2	6	250804	250809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433625308
5499	NC_019950	CAG	3	9	250819	250827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625308
5500	NC_019950	CGC	2	6	250828	250833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625308

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