MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanoregula formicicum SMSP

Total Repeats: 47281

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019943	GAA	2	6	34	39	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	432329453
2	NC_019943	CGA	2	6	58	63	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	432329453
3	NC_019943	GCT	2	6	73	78	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	432329453
4	NC_019943	CAT	2	6	184	189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	432329453
5	NC_019943	ATG	2	6	252	257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	432329453
6	NC_019943	AGT	2	6	298	303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	432329453
7	NC_019943	AGG	2	6	346	351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432329453
8	NC_019943	CT	3	6	428	433	0 %	50 %	0 %	50 %	432329453
9	NC_019943	A	6	6	443	448	100 %	0 %	0 %	0 %	432329453
10	NC_019943	CCG	2	6	451	456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	432329453
11	NC_019943	TA	3	6	481	486	50 %	50 %	0 %	0 %	432329453
12	NC_019943	GA	3	6	533	538	50 %	0 %	50 %	0 %	432329453
13	NC_019943	T	6	6	568	573	0 %	100 %	0 %	0 %	432329453
14	NC_019943	AAGC	2	8	574	581	50 %	0 %	25 %	25 %	432329453
15	NC_019943	TAC	2	6	632	637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	432329453
16	NC_019943	GGA	2	6	639	644	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432329453
17	NC_019943	TGG	2	6	710	715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	432329453
18	NC_019943	GAG	2	6	800	805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432329453
19	NC_019943	CT	3	6	809	814	0 %	50 %	0 %	50 %	432329453
20	NC_019943	ACT	2	6	838	843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	432329453
21	NC_019943	GGAT	2	8	870	877	25 %	25 %	50 %	0 %	432329453
22	NC_019943	TCA	2	6	897	902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	432329453
23	NC_019943	GAG	2	6	914	919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432329453
24	NC_019943	GGA	2	6	993	998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432329453
25	NC_019943	AAC	2	6	1199	1204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	432329453
26	NC_019943	AGA	2	6	1287	1292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	432329453
27	NC_019943	TCA	2	6	1431	1436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	432329453
28	NC_019943	ATCGAT	2	12	1475	1486	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	432329453
29	NC_019943	G	6	6	1490	1495	0 %	0 %	100 %	0 %	432329453
30	NC_019943	CCT	2	6	1513	1518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	432329453
31	NC_019943	ATA	2	6	1599	1604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	432329453
32	NC_019943	GAAAA	2	10	1661	1670	80 %	0 %	20 %	0 %	432329453
33	NC_019943	TGA	2	6	1914	1919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	432329454
34	NC_019943	GTA	2	6	1942	1947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	432329454
35	NC_019943	CAG	2	6	1958	1963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	432329454
36	NC_019943	GCAC	2	8	1989	1996	25 %	0 %	25 %	50 %	432329454
37	NC_019943	GCG	2	6	2019	2024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	432329454
38	NC_019943	T	6	6	2110	2115	0 %	100 %	0 %	0 %	432329454
39	NC_019943	GC	3	6	2139	2144	0 %	0 %	50 %	50 %	432329454
40	NC_019943	T	6	6	2148	2153	0 %	100 %	0 %	0 %	432329454
41	NC_019943	GCTGC	2	10	2154	2163	0 %	20 %	40 %	40 %	432329454
42	NC_019943	GCTC	2	8	2245	2252	0 %	25 %	25 %	50 %	432329455
43	NC_019943	CCT	3	9	2260	2268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	432329455
44	NC_019943	TTC	2	6	2288	2293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	432329455
45	NC_019943	CCG	2	6	2300	2305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	432329455
46	NC_019943	ATC	2	6	2340	2345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	432329455
47	NC_019943	CGGG	2	8	2390	2397	0 %	0 %	75 %	25 %	432329455
48	NC_019943	GAA	2	6	2426	2431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	432329455
49	NC_019943	GAGGAC	2	12	2465	2476	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	432329455
50	NC_019943	AGG	2	6	2570	2575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432329456
51	NC_019943	TCGA	2	8	2596	2603	25 %	25 %	25 %	25 %	432329456
52	NC_019943	GCCGT	2	10	2609	2618	0 %	20 %	40 %	40 %	432329456
53	NC_019943	CCG	2	6	2676	2681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	432329456
54	NC_019943	ATCC	2	8	2706	2713	25 %	25 %	0 %	50 %	432329456
55	NC_019943	GCT	2	6	2810	2815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	432329457
56	NC_019943	TTG	2	6	2841	2846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	432329457
57	NC_019943	GAT	2	6	2879	2884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	432329457
58	NC_019943	CTT	2	6	3045	3050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	432329458
59	NC_019943	AGG	2	6	3073	3078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432329458
60	NC_019943	CTT	2	6	3087	3092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	432329458
61	NC_019943	CTT	2	6	3240	3245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	432329458
62	NC_019943	TGC	2	6	3253	3258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	432329458
63	NC_019943	GGA	2	6	3260	3265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432329458
64	NC_019943	GAT	2	6	3336	3341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	432329458
65	NC_019943	GAC	2	6	3348	3353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	432329458
66	NC_019943	TGA	2	6	3398	3403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	432329458
67	NC_019943	CTG	2	6	3511	3516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	432329459
68	NC_019943	TCT	2	6	3517	3522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	432329459
69	NC_019943	CGC	2	6	3524	3529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	432329459
70	NC_019943	CGG	2	6	3643	3648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	432329459
71	NC_019943	G	7	7	3672	3678	0 %	0 %	100 %	0 %	432329459
72	NC_019943	TCT	2	6	3729	3734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	432329459
73	NC_019943	GCA	2	6	3864	3869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	432329459
74	NC_019943	CGCC	2	8	3878	3885	0 %	0 %	25 %	75 %	432329459
75	NC_019943	GAAC	2	8	4120	4127	50 %	0 %	25 %	25 %	432329460
76	NC_019943	TGG	3	9	4128	4136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	432329460
77	NC_019943	AGGC	2	8	4146	4153	25 %	0 %	50 %	25 %	432329460
78	NC_019943	CGG	2	6	4162	4167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	432329460
79	NC_019943	TCGC	2	8	4169	4176	0 %	25 %	25 %	50 %	432329460
80	NC_019943	CGC	2	6	4180	4185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	432329460
81	NC_019943	TTC	2	6	4229	4234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	432329460
82	NC_019943	TCA	2	6	4287	4292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	432329460
83	NC_019943	GGCC	2	8	4294	4301	0 %	0 %	50 %	50 %	432329460
84	NC_019943	CACG	2	8	4336	4343	25 %	0 %	25 %	50 %	432329460
85	NC_019943	ATC	2	6	4346	4351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	432329460
86	NC_019943	CCA	2	6	4366	4371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	432329460
87	NC_019943	ACG	2	6	4413	4418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	432329460
88	NC_019943	ACG	2	6	4452	4457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	432329460
89	NC_019943	GAG	2	6	4472	4477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432329460
90	NC_019943	AGG	2	6	4485	4490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432329460
91	NC_019943	CCA	2	6	4515	4520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	432329460
92	NC_019943	GAA	2	6	4552	4557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	432329460
93	NC_019943	TCC	2	6	4572	4577	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	432329460
94	NC_019943	CCG	2	6	4581	4586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	432329460
95	NC_019943	CAA	2	6	4666	4671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	432329460
96	NC_019943	CAA	2	6	4728	4733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	432329460
97	NC_019943	GGC	3	9	4754	4762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	432329460
98	NC_019943	TCC	2	6	4779	4784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	432329460
99	NC_019943	TGA	2	6	4794	4799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	432329460
100	NC_019943	CCGG	2	8	4840	4847	0 %	0 %	50 %	50 %	432329460
101	NC_019943	G	7	7	4852	4858	0 %	0 %	100 %	0 %	432329460
102	NC_019943	GCC	2	6	4964	4969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	432329460
103	NC_019943	AAG	2	6	5029	5034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	432329461
104	NC_019943	TC	3	6	5103	5108	0 %	50 %	0 %	50 %	432329461
105	NC_019943	GGA	2	6	5136	5141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432329461
106	NC_019943	TCC	2	6	5233	5238	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	432329461
107	NC_019943	ATC	2	6	5239	5244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	432329461
108	NC_019943	CGC	2	6	5292	5297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	432329461
109	NC_019943	G	7	7	5305	5311	0 %	0 %	100 %	0 %	432329461
110	NC_019943	CTT	2	6	5355	5360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	432329461
111	NC_019943	CGG	2	6	5364	5369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	432329461
112	NC_019943	G	8	8	5511	5518	0 %	0 %	100 %	0 %	432329461
113	NC_019943	TTG	2	6	5540	5545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	432329461
114	NC_019943	CAT	2	6	5550	5555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	432329461
115	NC_019943	GGGC	2	8	5560	5567	0 %	0 %	75 %	25 %	432329461
116	NC_019943	AAC	2	6	5772	5777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	432329462
117	NC_019943	GAG	2	6	5864	5869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432329462
118	NC_019943	GCG	2	6	5886	5891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	432329462
119	NC_019943	AC	3	6	5894	5899	50 %	0 %	0 %	50 %	432329462
120	NC_019943	ACTGCA	2	12	5925	5936	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	432329462
121	NC_019943	ACG	2	6	6009	6014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	432329462
122	NC_019943	CAG	2	6	6025	6030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	432329462
123	NC_019943	AGC	2	6	6075	6080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	432329462
124	NC_019943	GCA	2	6	6166	6171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	432329463
125	NC_019943	GCG	2	6	6188	6193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	432329463
126	NC_019943	CGA	2	6	6243	6248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	432329463
127	NC_019943	CCT	2	6	6312	6317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	432329463
128	NC_019943	GCA	2	6	6333	6338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	432329463
129	NC_019943	TCC	2	6	6347	6352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	432329463
130	NC_019943	TCA	2	6	6362	6367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	432329463
131	NC_019943	TCA	2	6	6374	6379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	432329463
132	NC_019943	CCG	2	6	6380	6385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	432329463
133	NC_019943	CCG	2	6	6390	6395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	432329463
134	NC_019943	CAT	2	6	6426	6431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	432329463
135	NC_019943	GCA	2	6	6437	6442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	432329463
136	NC_019943	GGA	2	6	6453	6458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432329463
137	NC_019943	CAT	2	6	6477	6482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	432329463
138	NC_019943	GCT	2	6	6510	6515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	432329463
139	NC_019943	GGAG	2	8	6570	6577	25 %	0 %	75 %	0 %	432329463
140	NC_019943	TCC	2	6	6638	6643	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	432329463
141	NC_019943	CCGG	2	8	6689	6696	0 %	0 %	50 %	50 %	432329463
142	NC_019943	TTC	2	6	6703	6708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	432329463
143	NC_019943	CTA	2	6	6768	6773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	432329463
144	NC_019943	GTGG	2	8	6852	6859	0 %	25 %	75 %	0 %	432329463
145	NC_019943	GCCG	2	8	6915	6922	0 %	0 %	50 %	50 %	432329463
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148	NC_019943	GAG	2	6	7259	7264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432329464
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152	NC_019943	AGC	2	6	7600	7605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	432329465
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159	NC_019943	CTG	2	6	8198	8203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	432329465
160	NC_019943	CGA	2	6	8206	8211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	432329465
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162	NC_019943	CGGC	2	8	8314	8321	0 %	0 %	50 %	50 %	432329465
163	NC_019943	AGG	3	9	8355	8363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432329465
164	NC_019943	GCG	2	6	8379	8384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	432329465
165	NC_019943	CCT	2	6	8391	8396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	432329465
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169	NC_019943	CAA	2	6	8752	8757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	432329465
170	NC_019943	G	7	7	8813	8819	0 %	0 %	100 %	0 %	432329465
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173	NC_019943	GCA	2	6	9126	9131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	432329466
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178	NC_019943	TCG	2	6	9694	9699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	432329467
179	NC_019943	ACC	2	6	9723	9728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	432329467
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234	NC_019943	AGGG	2	8	13183	13190	25 %	0 %	75 %	0 %	432329469
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238	NC_019943	GGAGCC	2	12	13392	13403	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	432329469
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243	NC_019943	GGCC	2	8	13853	13860	0 %	0 %	50 %	50 %	432329470
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249	NC_019943	AG	4	8	14144	14151	50 %	0 %	50 %	0 %	432329470
250	NC_019943	CCG	2	6	14194	14199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	432329470
251	NC_019943	TGA	2	6	14215	14220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	432329470
252	NC_019943	T	6	6	14428	14433	0 %	100 %	0 %	0 %	432329470
253	NC_019943	CTTT	2	8	14492	14499	0 %	75 %	0 %	25 %	432329470
254	NC_019943	GCA	3	9	14503	14511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	432329470
255	NC_019943	CTC	2	6	14556	14561	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	432329470
256	NC_019943	CT	3	6	14567	14572	0 %	50 %	0 %	50 %	432329470
257	NC_019943	AGA	2	6	14591	14596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	432329470
258	NC_019943	AGG	2	6	14623	14628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432329470
259	NC_019943	ATA	2	6	14652	14657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	432329470
260	NC_019943	ATCC	2	8	14709	14716	25 %	25 %	0 %	50 %	432329470
261	NC_019943	CTG	2	6	14750	14755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	432329470
262	NC_019943	CCA	2	6	14958	14963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	432329471
263	NC_019943	GAG	2	6	14987	14992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432329471
264	NC_019943	TGCC	2	8	15037	15044	0 %	25 %	25 %	50 %	432329471
265	NC_019943	GGAT	2	8	15045	15052	25 %	25 %	50 %	0 %	432329471
266	NC_019943	CTG	2	6	15160	15165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	432329471
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382	NC_019943	ATC	2	6	22464	22469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	432329479
383	NC_019943	CTT	2	6	22500	22505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	432329479
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390	NC_019943	GTA	2	6	23733	23738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	432329480
391	NC_019943	AAGA	2	8	23759	23766	75 %	0 %	25 %	0 %	432329480
392	NC_019943	CGC	2	6	23816	23821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	432329480
393	NC_019943	CGG	2	6	23827	23832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	432329480
394	NC_019943	CGG	2	6	23841	23846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	432329480
395	NC_019943	AG	3	6	23863	23868	50 %	0 %	50 %	0 %	432329480
396	NC_019943	AT	3	6	24075	24080	50 %	50 %	0 %	0 %	432329481
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400	NC_019943	ATG	2	6	24244	24249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	432329481
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406	NC_019943	CCGT	2	8	24478	24485	0 %	25 %	25 %	50 %	432329481
407	NC_019943	GGT	2	6	24500	24505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	432329481
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432	NC_019943	CCGG	2	8	25730	25737	0 %	0 %	50 %	50 %	432329482
433	NC_019943	TTC	2	6	25779	25784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	432329482
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497	NC_019943	T	8	8	30001	30008	0 %	100 %	0 %	0 %	432329484
498	NC_019943	ATT	2	6	30045	30050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	432329484
499	NC_019943	TCAC	2	8	30060	30067	25 %	25 %	0 %	50 %	432329484
500	NC_019943	CAA	2	6	30119	30124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	432329484

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