MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Microcoleus sp. PCC 7113 plasmid pMIC7113.07

Total Repeats: 257

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019762	TAT	2	6	314	319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428314809
2	NC_019762	GGA	2	6	369	374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428314809
3	NC_019762	ACG	2	6	420	425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314809
4	NC_019762	GAT	2	6	431	436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314809
5	NC_019762	GAC	2	6	477	482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314809
6	NC_019762	AGT	2	6	545	550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314809
7	NC_019762	CAA	2	6	858	863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314810
8	NC_019762	GCA	3	9	917	925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314810
9	NC_019762	TGC	2	6	952	957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314810
10	NC_019762	TGC	2	6	1156	1161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314810
11	NC_019762	ACT	2	6	1242	1247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314810
12	NC_019762	GCA	2	6	1269	1274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314810
13	NC_019762	TTA	2	6	1435	1440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428314810
14	NC_019762	GAA	2	6	1499	1504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314810
15	NC_019762	ACA	2	6	1539	1544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314810
16	NC_019762	GAT	2	6	1653	1658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314810
17	NC_019762	ATG	2	6	1762	1767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314810
18	NC_019762	AGA	2	6	1901	1906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314810
19	NC_019762	AGG	2	6	1952	1957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428314810
20	NC_019762	TTG	2	6	1990	1995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314810
21	NC_019762	TGA	2	6	2054	2059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314810
22	NC_019762	AGG	2	6	2081	2086	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428314810
23	NC_019762	ATT	2	6	2220	2225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428314810
24	NC_019762	TCC	2	6	2429	2434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428314810
25	NC_019762	GAA	2	6	3306	3311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314811
26	NC_019762	GTT	2	6	3348	3353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314811
27	NC_019762	TAC	2	6	3412	3417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314811
28	NC_019762	ATG	2	6	3424	3429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314811
29	NC_019762	GTC	2	6	3586	3591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314811
30	NC_019762	AGG	2	6	3605	3610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428314811
31	NC_019762	TTC	2	6	3634	3639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314811
32	NC_019762	TGG	2	6	3678	3683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428314811
33	NC_019762	AGT	2	6	3734	3739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314811
34	NC_019762	AAC	2	6	3836	3841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314812
35	NC_019762	TGA	2	6	3900	3905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314812
36	NC_019762	TGA	2	6	3961	3966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314812
37	NC_019762	AAT	2	6	4127	4132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428314812
38	NC_019762	GCT	3	9	4210	4218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314812
39	NC_019762	TAC	2	6	4266	4271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314812
40	NC_019762	CTG	2	6	4322	4327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314812
41	NC_019762	CTT	2	6	4413	4418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314812
42	NC_019762	TTG	2	6	4536	4541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314812
43	NC_019762	AAG	2	6	4621	4626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314812
44	NC_019762	ACG	2	6	4671	4676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314812
45	NC_019762	CAT	2	6	4823	4828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314812
46	NC_019762	TGA	2	6	4924	4929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314812
47	NC_019762	ACT	2	6	4948	4953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314812
48	NC_019762	CAA	2	6	5113	5118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314813
49	NC_019762	TGT	2	6	5150	5155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314813
50	NC_019762	ATA	2	6	5169	5174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428314813
51	NC_019762	CTC	2	6	5203	5208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428314813
52	NC_019762	CTC	3	9	5276	5284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428314813
53	NC_019762	ACA	2	6	5337	5342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314813
54	NC_019762	TTC	2	6	5381	5386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314813
55	NC_019762	TGT	2	6	5429	5434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314813
56	NC_019762	TGC	2	6	5447	5452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314813
57	NC_019762	CTT	2	6	5477	5482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314813
58	NC_019762	ATG	2	6	5504	5509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314813
59	NC_019762	TTG	2	6	5586	5591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314813
60	NC_019762	TTC	2	6	5720	5725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314813
61	NC_019762	GAA	2	6	5881	5886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314813
62	NC_019762	GAG	2	6	6074	6079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428314813
63	NC_019762	TGC	2	6	6380	6385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314814
64	NC_019762	TCA	2	6	6427	6432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314814
65	NC_019762	ATG	2	6	6604	6609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314815
66	NC_019762	ATA	2	6	6718	6723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428314815
67	NC_019762	AGA	2	6	6768	6773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314815
68	NC_019762	AGA	2	6	6789	6794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314815
69	NC_019762	CTC	2	6	6859	6864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428314815
70	NC_019762	ATG	2	6	6893	6898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314815
71	NC_019762	CGC	2	6	6949	6954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428314815
72	NC_019762	GCA	2	6	7131	7136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314815
73	NC_019762	CTG	2	6	7228	7233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314815
74	NC_019762	ATC	2	6	7279	7284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314815
75	NC_019762	CTG	2	6	7616	7621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314815
76	NC_019762	CAG	2	6	7623	7628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314815
77	NC_019762	CCA	2	6	7678	7683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428314815
78	NC_019762	CAC	2	6	7698	7703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428314815
79	NC_019762	TGC	2	6	7709	7714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314815
80	NC_019762	GGT	2	6	7718	7723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428314815
81	NC_019762	TTC	2	6	7747	7752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314815
82	NC_019762	CCA	2	6	7777	7782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428314815
83	NC_019762	CGA	2	6	7812	7817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314815
84	NC_019762	ACA	2	6	7887	7892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314815
85	NC_019762	ATG	2	6	7907	7912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314815
86	NC_019762	CTG	2	6	8485	8490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314815
87	NC_019762	CAT	2	6	8496	8501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314815
88	NC_019762	CTA	2	6	8507	8512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314815
89	NC_019762	ACG	3	9	8531	8539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314815
90	NC_019762	GCA	2	6	8559	8564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314815
91	NC_019762	TAT	2	6	8683	8688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428314815
92	NC_019762	CTC	2	6	8701	8706	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428314815
93	NC_019762	GCA	2	6	8757	8762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314815
94	NC_019762	TGA	2	6	8787	8792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314815
95	NC_019762	ACG	2	6	8811	8816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314815
96	NC_019762	CAG	2	6	8838	8843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314815
97	NC_019762	CAG	2	6	8869	8874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314815
98	NC_019762	GAT	2	6	9004	9009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314815
99	NC_019762	CAA	2	6	9033	9038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314815
100	NC_019762	CGC	2	6	9202	9207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428314815
101	NC_019762	AGC	2	6	9368	9373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314815
102	NC_019762	CTA	2	6	9768	9773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314815
103	NC_019762	TGC	2	6	9848	9853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314815
104	NC_019762	TGA	2	6	9855	9860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314815
105	NC_019762	GAG	2	6	10036	10041	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428314815
106	NC_019762	CAT	2	6	10173	10178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314815
107	NC_019762	AAT	2	6	10264	10269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428314815
108	NC_019762	TAG	2	6	10271	10276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314815
109	NC_019762	ACC	2	6	10304	10309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428314815
110	NC_019762	AAC	2	6	10437	10442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314815
111	NC_019762	ACC	2	6	10455	10460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428314815
112	NC_019762	GGA	2	6	10488	10493	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428314815
113	NC_019762	ACT	2	6	10535	10540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314815
114	NC_019762	ACA	2	6	10547	10552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314815
115	NC_019762	CAA	2	6	10574	10579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314815
116	NC_019762	TGA	2	6	10611	10616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314815
117	NC_019762	TGG	2	6	10771	10776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428314815
118	NC_019762	TGA	2	6	10803	10808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314815
119	NC_019762	AGA	2	6	10809	10814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314815
120	NC_019762	AGC	2	6	10844	10849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314815
121	NC_019762	TTG	2	6	10928	10933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314815
122	NC_019762	TGC	2	6	11051	11056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314815
123	NC_019762	CAA	2	6	11147	11152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314815
124	NC_019762	GGA	2	6	11229	11234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428314815
125	NC_019762	TGG	2	6	11450	11455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428314815
126	NC_019762	CAG	2	6	11464	11469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314815
127	NC_019762	AAC	2	6	11833	11838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314816
128	NC_019762	GGA	2	6	11936	11941	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428314816
129	NC_019762	GAA	3	9	11949	11957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314816
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252	NC_019762	AGC	2	6	25559	25564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314826
253	NC_019762	AGG	2	6	25598	25603	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428314826
254	NC_019762	CTT	2	6	25651	25656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314826
255	NC_019762	ACG	2	6	25683	25688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314826
256	NC_019762	GCT	2	6	25722	25727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314826
257	NC_019762	TGT	2	6	25738	25743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314826

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.