MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Microcoleus sp. PCC 7113 plasmid pMIC7113.04

Total Repeats: 99

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019761	CTGG	2	8	2492	2499	0 %	25 %	50 %	25 %	428314545
2	NC_019761	TTTC	2	8	3361	3368	0 %	75 %	0 %	25 %	428314547
3	NC_019761	TCAT	2	8	3685	3692	25 %	50 %	0 %	25 %	428314547
4	NC_019761	ATTG	2	8	4252	4259	25 %	50 %	25 %	0 %	428314548
5	NC_019761	TAAA	2	8	4410	4417	75 %	25 %	0 %	0 %	428314548
6	NC_019761	AGCA	2	8	4956	4963	50 %	0 %	25 %	25 %	428314549
7	NC_019761	CGAG	2	8	5271	5278	25 %	0 %	50 %	25 %	428314549
8	NC_019761	TAGT	2	8	5635	5642	25 %	50 %	25 %	0 %	428314550
9	NC_019761	AATT	2	8	5876	5883	50 %	50 %	0 %	0 %	428314550
10	NC_019761	AATT	2	8	6896	6903	50 %	50 %	0 %	0 %	428314552
11	NC_019761	TTGT	3	12	6959	6970	0 %	75 %	25 %	0 %	428314552
12	NC_019761	TCCT	2	8	7171	7178	0 %	50 %	0 %	50 %	428314553
13	NC_019761	GATA	2	8	8216	8223	50 %	25 %	25 %	0 %	428314555
14	NC_019761	CGAA	2	8	8806	8813	50 %	0 %	25 %	25 %	428314556
15	NC_019761	GCTT	2	8	8928	8935	0 %	50 %	25 %	25 %	428314557
16	NC_019761	ATCG	2	8	9506	9513	25 %	25 %	25 %	25 %	428314557
17	NC_019761	ACTG	2	8	9602	9609	25 %	25 %	25 %	25 %	428314557
18	NC_019761	CGGA	2	8	10101	10108	25 %	0 %	50 %	25 %	428314558
19	NC_019761	GAAA	2	8	10397	10404	75 %	0 %	25 %	0 %	428314558
20	NC_019761	CTTT	2	8	10621	10628	0 %	75 %	0 %	25 %	428314558
21	NC_019761	TGAA	2	8	10746	10753	50 %	25 %	25 %	0 %	428314558
22	NC_019761	TGGA	2	8	11312	11319	25 %	25 %	50 %	0 %	428314558
23	NC_019761	TTGG	2	8	12590	12597	0 %	50 %	50 %	0 %	428314560
24	NC_019761	AAGC	2	8	12823	12830	50 %	0 %	25 %	25 %	428314560
25	NC_019761	TGAT	2	8	13948	13955	25 %	50 %	25 %	0 %	428314562
26	NC_019761	GACT	2	8	14129	14136	25 %	25 %	25 %	25 %	428314562
27	NC_019761	CCAT	2	8	14273	14280	25 %	25 %	0 %	50 %	428314562
28	NC_019761	CCTC	2	8	16111	16118	0 %	25 %	0 %	75 %	428314564
29	NC_019761	CTAT	2	8	16394	16401	25 %	50 %	0 %	25 %	428314564
30	NC_019761	GCCA	2	8	16462	16469	25 %	0 %	25 %	50 %	428314564
31	NC_019761	TGTT	2	8	16550	16557	0 %	75 %	25 %	0 %	428314564
32	NC_019761	TTAT	2	8	16665	16672	25 %	75 %	0 %	0 %	428314564
33	NC_019761	CACT	2	8	16809	16816	25 %	25 %	0 %	50 %	428314564
34	NC_019761	AGAT	2	8	17889	17896	50 %	25 %	25 %	0 %	428314564
35	NC_019761	CTGT	2	8	18146	18153	0 %	50 %	25 %	25 %	428314565
36	NC_019761	TTCC	2	8	18159	18166	0 %	50 %	0 %	50 %	428314565
37	NC_019761	TGAT	2	8	19352	19359	25 %	50 %	25 %	0 %	428314566
38	NC_019761	GAGT	2	8	19689	19696	25 %	25 %	50 %	0 %	428314566
39	NC_019761	TTTC	2	8	20103	20110	0 %	75 %	0 %	25 %	428314566
40	NC_019761	CGAT	2	8	20877	20884	25 %	25 %	25 %	25 %	428314568
41	NC_019761	TGTT	2	8	21198	21205	0 %	75 %	25 %	0 %	428314568
42	NC_019761	TCCT	2	8	21309	21316	0 %	50 %	0 %	50 %	428314568
43	NC_019761	GCTA	2	8	21748	21755	25 %	25 %	25 %	25 %	428314569
44	NC_019761	GGGA	2	8	23020	23027	25 %	0 %	75 %	0 %	428314572
45	NC_019761	GGAC	2	8	23731	23738	25 %	0 %	50 %	25 %	428314573
46	NC_019761	GGTT	2	8	23818	23825	0 %	50 %	50 %	0 %	428314573
47	NC_019761	AGAA	2	8	24391	24398	75 %	0 %	25 %	0 %	428314573
48	NC_019761	AGCA	2	8	24471	24478	50 %	0 %	25 %	25 %	428314573
49	NC_019761	GAAG	2	8	24503	24510	50 %	0 %	50 %	0 %	428314573
50	NC_019761	AGAA	2	8	25005	25012	75 %	0 %	25 %	0 %	428314573
51	NC_019761	ACAA	2	8	25083	25090	75 %	0 %	0 %	25 %	428314573
52	NC_019761	TCAA	2	8	25302	25309	50 %	25 %	0 %	25 %	428314573
53	NC_019761	TTTA	2	8	25720	25727	25 %	75 %	0 %	0 %	428314573
54	NC_019761	ATTG	2	8	26416	26423	25 %	50 %	25 %	0 %	428314575
55	NC_019761	CTGA	2	8	27801	27808	25 %	25 %	25 %	25 %	428314576
56	NC_019761	GGCT	2	8	28244	28251	0 %	25 %	50 %	25 %	428314576
57	NC_019761	CGTT	2	8	29164	29171	0 %	50 %	25 %	25 %	428314576
58	NC_019761	TGAG	2	8	29755	29762	25 %	25 %	50 %	0 %	428314576
59	NC_019761	CACG	2	8	30703	30710	25 %	0 %	25 %	50 %	428314576
60	NC_019761	CCAG	2	8	31376	31383	25 %	0 %	25 %	50 %	428314577
61	NC_019761	CTGC	2	8	31653	31660	0 %	25 %	25 %	50 %	428314577
62	NC_019761	ATCC	2	8	32860	32867	25 %	25 %	0 %	50 %	428314580
63	NC_019761	AAAT	2	8	33298	33305	75 %	25 %	0 %	0 %	428314580
64	NC_019761	AGTT	2	8	33757	33764	25 %	50 %	25 %	0 %	428314580
65	NC_019761	CTAA	2	8	34333	34340	50 %	25 %	0 %	25 %	428314580
66	NC_019761	TGGG	2	8	34892	34899	0 %	25 %	75 %	0 %	428314581
67	NC_019761	CCAA	2	8	35653	35660	50 %	0 %	0 %	50 %	428314583
68	NC_019761	TTGA	2	8	35754	35761	25 %	50 %	25 %	0 %	428314583
69	NC_019761	ATTT	2	8	35914	35921	25 %	75 %	0 %	0 %	428314583
70	NC_019761	TTCA	2	8	36293	36300	25 %	50 %	0 %	25 %	428314583
71	NC_019761	TTGC	2	8	36398	36405	0 %	50 %	25 %	25 %	428314583
72	NC_019761	AATC	2	8	36418	36425	50 %	25 %	0 %	25 %	428314583
73	NC_019761	ATTC	2	8	36505	36512	25 %	50 %	0 %	25 %	428314583
74	NC_019761	CTAA	2	8	37629	37636	50 %	25 %	0 %	25 %	428314583
75	NC_019761	CCTC	2	8	37935	37942	0 %	25 %	0 %	75 %	428314583
76	NC_019761	GTCT	2	8	38474	38481	0 %	50 %	25 %	25 %	428314583
77	NC_019761	GCTT	2	8	38520	38527	0 %	50 %	25 %	25 %	428314583
78	NC_019761	GTGA	2	8	39355	39362	25 %	25 %	50 %	0 %	428314583
79	NC_019761	CAGC	2	8	40321	40328	25 %	0 %	25 %	50 %	428314584
80	NC_019761	TCCG	2	8	40462	40469	0 %	25 %	25 %	50 %	428314584
81	NC_019761	GCTT	2	8	40646	40653	0 %	50 %	25 %	25 %	428314584
82	NC_019761	TTGT	2	8	40846	40853	0 %	75 %	25 %	0 %	428314584
83	NC_019761	CACG	2	8	42135	42142	25 %	0 %	25 %	50 %	428314584
84	NC_019761	CTGT	2	8	43283	43290	0 %	50 %	25 %	25 %	428314585
85	NC_019761	CAAC	2	8	43985	43992	50 %	0 %	0 %	50 %	428314586
86	NC_019761	AGGG	2	8	44275	44282	25 %	0 %	75 %	0 %	428314586
87	NC_019761	GTCA	2	8	44607	44614	25 %	25 %	25 %	25 %	428314586
88	NC_019761	ACCG	2	8	45100	45107	25 %	0 %	25 %	50 %	428314587
89	NC_019761	ACAA	2	8	45281	45288	75 %	0 %	0 %	25 %	428314587
90	NC_019761	CAGC	2	8	45798	45805	25 %	0 %	25 %	50 %	428314587
91	NC_019761	ATAA	2	8	46144	46151	75 %	25 %	0 %	0 %	428314587
92	NC_019761	TCAC	2	8	46506	46513	25 %	25 %	0 %	50 %	428314588
93	NC_019761	TAAA	2	8	46688	46695	75 %	25 %	0 %	0 %	428314588
94	NC_019761	GACT	2	8	48362	48369	25 %	25 %	25 %	25 %	428314589
95	NC_019761	TCCT	2	8	48521	48528	0 %	50 %	0 %	50 %	428314589
96	NC_019761	GGTG	2	8	48601	48608	0 %	25 %	75 %	0 %	428314590
97	NC_019761	CAAT	2	8	48924	48931	50 %	25 %	0 %	25 %	428314591
98	NC_019761	GGCA	2	8	49119	49126	25 %	0 %	50 %	25 %	428314591
99	NC_019761	CTCA	2	8	50272	50279	25 %	25 %	0 %	50 %	428314592

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.