MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Microcoleus sp. PCC 7113 plasmid pMIC7113.08

Total Repeats: 223

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019743	CGA	2	6	463	468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314711
2	NC_019743	GAG	2	6	529	534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428314711
3	NC_019743	CGC	2	6	551	556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428314711
4	NC_019743	CAT	2	6	874	879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314712
5	NC_019743	TGA	2	6	1368	1373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314713
6	NC_019743	ATT	2	6	1474	1479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428314713
7	NC_019743	GAG	2	6	1544	1549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428314713
8	NC_019743	CGG	3	9	1784	1792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428314714
9	NC_019743	TTC	2	6	1830	1835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314714
10	NC_019743	TGA	2	6	1869	1874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314714
11	NC_019743	AGG	2	6	1892	1897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428314714
12	NC_019743	GAA	2	6	1966	1971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314714
13	NC_019743	GAA	2	6	2095	2100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314714
14	NC_019743	TGT	2	6	2180	2185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314714
15	NC_019743	ATT	2	6	2268	2273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428314714
16	NC_019743	TGA	2	6	2334	2339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314714
17	NC_019743	ACA	2	6	2619	2624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314715
18	NC_019743	CGC	2	6	2727	2732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428314715
19	NC_019743	CTC	2	6	2816	2821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428314715
20	NC_019743	TCA	2	6	2828	2833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314715
21	NC_019743	GAT	2	6	2850	2855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314715
22	NC_019743	CGG	2	6	3081	3086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428314715
23	NC_019743	TGC	2	6	3215	3220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314715
24	NC_019743	GGC	2	6	3670	3675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428314716
25	NC_019743	ACC	2	6	3688	3693	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428314716
26	NC_019743	TGG	2	6	3918	3923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428314716
27	NC_019743	ATC	2	6	4230	4235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314717
28	NC_019743	TGG	2	6	4240	4245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428314717
29	NC_019743	GCG	2	6	4495	4500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428314717
30	NC_019743	GTG	2	6	4519	4524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428314717
31	NC_019743	GCA	2	6	4676	4681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314717
32	NC_019743	CAC	2	6	4783	4788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428314717
33	NC_019743	ACT	2	6	4935	4940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314717
34	NC_019743	TAA	2	6	5063	5068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428314717
35	NC_019743	GTG	2	6	5106	5111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428314717
36	NC_019743	ACA	2	6	5191	5196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314717
37	NC_019743	TTG	2	6	5242	5247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314717
38	NC_019743	GCT	2	6	5304	5309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314717
39	NC_019743	CTA	2	6	5374	5379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314717
40	NC_019743	TCC	2	6	5488	5493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428314718
41	NC_019743	CCT	2	6	5552	5557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428314718
42	NC_019743	AAC	2	6	5571	5576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314718
43	NC_019743	AGC	2	6	5674	5679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314719
44	NC_019743	TGA	2	6	5684	5689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314719
45	NC_019743	GAG	2	6	5706	5711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428314719
46	NC_019743	GCG	2	6	5827	5832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428314719
47	NC_019743	ATT	2	6	6109	6114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428314719
48	NC_019743	TCC	2	6	6155	6160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428314719
49	NC_019743	ACG	2	6	6252	6257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314719
50	NC_019743	ACT	2	6	6306	6311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314719
51	NC_019743	TCC	2	6	6362	6367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428314719
52	NC_019743	GCC	2	6	6472	6477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428314719
53	NC_019743	GAA	2	6	6666	6671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314719
54	NC_019743	TCC	2	6	6713	6718	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428314719
55	NC_019743	AGA	2	6	6733	6738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314719
56	NC_019743	AAG	2	6	6741	6746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314719
57	NC_019743	TGT	2	6	6759	6764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314719
58	NC_019743	TAA	2	6	6767	6772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428314719
59	NC_019743	TCC	2	6	6811	6816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428314719
60	NC_019743	TCT	2	6	7017	7022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314719
61	NC_019743	ATT	2	6	7079	7084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428314719
62	NC_019743	AAG	2	6	7162	7167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314719
63	NC_019743	GTT	2	6	7221	7226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314719
64	NC_019743	TCC	2	6	7261	7266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428314719
65	NC_019743	CAT	2	6	7370	7375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314719
66	NC_019743	AGA	2	6	7478	7483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314719
67	NC_019743	GAG	2	6	7499	7504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428314719
68	NC_019743	CGA	2	6	7526	7531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314719
69	NC_019743	CAA	2	6	7661	7666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314720
70	NC_019743	ACG	2	6	7793	7798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314720
71	NC_019743	GAA	2	6	7816	7821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314720
72	NC_019743	TGC	2	6	7938	7943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314721
73	NC_019743	TGA	2	6	7973	7978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314721
74	NC_019743	GAT	2	6	8200	8205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314721
75	NC_019743	GGA	2	6	8260	8265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428314721
76	NC_019743	GGC	3	9	8343	8351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428314721
77	NC_019743	AGG	2	6	8381	8386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428314721
78	NC_019743	GGC	2	6	8403	8408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428314721
79	NC_019743	TCA	2	6	8435	8440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314721
80	NC_019743	GAA	2	6	8451	8456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314721
81	NC_019743	TCC	2	6	8516	8521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428314721
82	NC_019743	GGA	2	6	8535	8540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428314721
83	NC_019743	AAG	2	6	8548	8553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314721
84	NC_019743	GAG	2	6	8599	8604	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428314721
85	NC_019743	GAG	2	6	8647	8652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428314721
86	NC_019743	AGA	2	6	8658	8663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314721
87	NC_019743	ACA	2	6	8693	8698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314721
88	NC_019743	GCT	2	6	8725	8730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314721
89	NC_019743	GAT	2	6	8736	8741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314721
90	NC_019743	TCG	2	6	8742	8747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314721
91	NC_019743	ATG	2	6	8886	8891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314722
92	NC_019743	CTA	2	6	8915	8920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314722
93	NC_019743	ATT	2	6	9129	9134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428314722
94	NC_019743	AGA	2	6	9166	9171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314722
95	NC_019743	CTT	2	6	9215	9220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314722
96	NC_019743	AAT	2	6	9230	9235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428314722
97	NC_019743	TGA	2	6	9277	9282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314722
98	NC_019743	TTC	2	6	9324	9329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314722
99	NC_019743	GAA	2	6	9653	9658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314722
100	NC_019743	AAT	2	6	9770	9775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428314722
101	NC_019743	TCC	2	6	9805	9810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428314722
102	NC_019743	CAG	2	6	10132	10137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314723
103	NC_019743	TAA	2	6	10175	10180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428314723
104	NC_019743	GTT	2	6	10185	10190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314723
105	NC_019743	TGC	2	6	10283	10288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314723
106	NC_019743	GCG	2	6	10343	10348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428314723
107	NC_019743	CGA	2	6	10363	10368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314723
108	NC_019743	ATT	2	6	10408	10413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428314723
109	NC_019743	CTA	2	6	10417	10422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314723
110	NC_019743	GAC	2	6	10444	10449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314723
111	NC_019743	GGC	2	6	10451	10456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428314723
112	NC_019743	AGA	2	6	10472	10477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314723
113	NC_019743	ACG	2	6	10481	10486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314723
114	NC_019743	CCG	2	6	10521	10526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428314723
115	NC_019743	GGC	2	6	10558	10563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428314723
116	NC_019743	AAC	2	6	10598	10603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314723
117	NC_019743	CAG	2	6	10777	10782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314724
118	NC_019743	TGA	2	6	10896	10901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314724
119	NC_019743	GAA	2	6	10918	10923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314724
120	NC_019743	GCT	2	6	10974	10979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314725
121	NC_019743	ATT	2	6	11029	11034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428314725
122	NC_019743	GAA	2	6	11049	11054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314725
123	NC_019743	GGC	2	6	11067	11072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428314725
124	NC_019743	CGT	2	6	11256	11261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314725
125	NC_019743	TGC	2	6	11288	11293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314725
126	NC_019743	GCA	2	6	11306	11311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314725
127	NC_019743	AAT	2	6	11345	11350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428314725
128	NC_019743	CTG	2	6	11459	11464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314726
129	NC_019743	GAT	2	6	11486	11491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314726
130	NC_019743	GAA	2	6	11837	11842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314726
131	NC_019743	CGC	2	6	11932	11937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428314726
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133	NC_019743	CGG	3	9	12330	12338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428314726
134	NC_019743	GGC	2	6	12381	12386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428314726
135	NC_019743	CAT	2	6	12496	12501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314726
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223	NC_019743	CCA	2	6	20782	20787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428314739

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.