MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Microcoleus sp. PCC 7113 plasmid pMIC7113.06

Total Repeats: 53

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019742	GATA	2	8	372	379	50 %	25 %	25 %	0 %	428314512
2	NC_019742	TCAA	2	8	609	616	50 %	25 %	0 %	25 %	428314513
3	NC_019742	AAAT	2	8	1109	1116	75 %	25 %	0 %	0 %	428314514
4	NC_019742	CTTT	2	8	1360	1367	0 %	75 %	0 %	25 %	428314514
5	NC_019742	CACT	2	8	1475	1482	25 %	25 %	0 %	50 %	428314514
6	NC_019742	AATA	2	8	1528	1535	75 %	25 %	0 %	0 %	428314514
7	NC_019742	ACTC	2	8	1946	1953	25 %	25 %	0 %	50 %	428314515
8	NC_019742	AACA	2	8	2400	2407	75 %	0 %	0 %	25 %	428314515
9	NC_019742	CTTA	2	8	4767	4774	25 %	50 %	0 %	25 %	428314515
10	NC_019742	TTTA	2	8	5403	5410	25 %	75 %	0 %	0 %	428314516
11	NC_019742	CCAC	2	8	5678	5685	25 %	0 %	0 %	75 %	428314516
12	NC_019742	TTCC	2	8	6905	6912	0 %	50 %	0 %	50 %	428314519
13	NC_019742	GTTT	2	8	7557	7564	0 %	75 %	25 %	0 %	428314519
14	NC_019742	TCAC	2	8	8097	8104	25 %	25 %	0 %	50 %	428314519
15	NC_019742	AACC	2	8	9158	9165	50 %	0 %	0 %	50 %	428314520
16	NC_019742	GAAA	2	8	9228	9235	75 %	0 %	25 %	0 %	428314520
17	NC_019742	GCCT	2	8	10053	10060	0 %	25 %	25 %	50 %	428314522
18	NC_019742	ACCC	2	8	10150	10157	25 %	0 %	0 %	75 %	428314523
19	NC_019742	GCCA	2	8	11116	11123	25 %	0 %	25 %	50 %	428314526
20	NC_019742	GATA	2	8	11593	11600	50 %	25 %	25 %	0 %	428314527
21	NC_019742	GCAG	2	8	11886	11893	25 %	0 %	50 %	25 %	428314527
22	NC_019742	GAAT	2	8	12854	12861	50 %	25 %	25 %	0 %	428314528
23	NC_019742	ACAA	2	8	13478	13485	75 %	0 %	0 %	25 %	428314530
24	NC_019742	CAAG	2	8	13506	13513	50 %	0 %	25 %	25 %	428314530
25	NC_019742	CCAG	2	8	13600	13607	25 %	0 %	25 %	50 %	428314530
26	NC_019742	GATC	2	8	13761	13768	25 %	25 %	25 %	25 %	428314530
27	NC_019742	CGGA	2	8	13806	13813	25 %	0 %	50 %	25 %	428314530
28	NC_019742	GATG	2	8	14025	14032	25 %	25 %	50 %	0 %	428314530
29	NC_019742	CAAT	2	8	14241	14248	50 %	25 %	0 %	25 %	428314531
30	NC_019742	TCAG	2	8	14371	14378	25 %	25 %	25 %	25 %	428314531
31	NC_019742	CCTG	2	8	14627	14634	0 %	25 %	25 %	50 %	428314531
32	NC_019742	GATG	2	8	14940	14947	25 %	25 %	50 %	0 %	428314531
33	NC_019742	GGTT	2	8	15438	15445	0 %	50 %	50 %	0 %	428314531
34	NC_019742	GATG	2	8	16516	16523	25 %	25 %	50 %	0 %	428314531
35	NC_019742	GATG	2	8	16525	16532	25 %	25 %	50 %	0 %	428314531
36	NC_019742	AATC	2	8	17078	17085	50 %	25 %	0 %	25 %	428314531
37	NC_019742	CAAC	2	8	17232	17239	50 %	0 %	0 %	50 %	428314531
38	NC_019742	TCCT	2	8	17879	17886	0 %	50 %	0 %	50 %	428314533
39	NC_019742	AATT	2	8	18440	18447	50 %	50 %	0 %	0 %	428314533
40	NC_019742	TCAG	2	8	20616	20623	25 %	25 %	25 %	25 %	428314537
41	NC_019742	GCAA	2	8	21065	21072	50 %	0 %	25 %	25 %	428314538
42	NC_019742	GAAC	2	8	22606	22613	50 %	0 %	25 %	25 %	428314538
43	NC_019742	GATT	2	8	22725	22732	25 %	50 %	25 %	0 %	428314538
44	NC_019742	TCTA	2	8	23500	23507	25 %	50 %	0 %	25 %	428314538
45	NC_019742	CTGA	2	8	25255	25262	25 %	25 %	25 %	25 %	428314541
46	NC_019742	GATG	2	8	25542	25549	25 %	25 %	50 %	0 %	428314542
47	NC_019742	TAAA	2	8	26006	26013	75 %	25 %	0 %	0 %	428314542
48	NC_019742	AATT	2	8	26414	26421	50 %	50 %	0 %	0 %	428314542
49	NC_019742	TAGA	2	8	26609	26616	50 %	25 %	25 %	0 %	428314542
50	NC_019742	GCAC	2	8	26688	26695	25 %	0 %	25 %	50 %	428314542
51	NC_019742	ATTT	2	8	26699	26706	25 %	75 %	0 %	0 %	428314542
52	NC_019742	CTCA	2	8	26810	26817	25 %	25 %	0 %	50 %	428314542
53	NC_019742	ATTT	2	8	28526	28533	25 %	75 %	0 %	0 %	428314543

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.