MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Microcoleus sp. PCC 7113 plasmid pMIC7113.05

Total Repeats: 83

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019741	GGTA	2	8	277	284	25 %	25 %	50 %	0 %	428314671
2	NC_019741	GGGA	2	8	382	389	25 %	0 %	75 %	0 %	428314671
3	NC_019741	TTCC	2	8	856	863	0 %	50 %	0 %	50 %	428314672
4	NC_019741	TCGC	2	8	968	975	0 %	25 %	25 %	50 %	428314672
5	NC_019741	CTGC	2	8	1029	1036	0 %	25 %	25 %	50 %	428314672
6	NC_019741	CATC	2	8	1714	1721	25 %	25 %	0 %	50 %	428314672
7	NC_019741	GATA	2	8	1816	1823	50 %	25 %	25 %	0 %	428314672
8	NC_019741	AGGA	2	8	2040	2047	50 %	0 %	50 %	0 %	428314672
9	NC_019741	GCGG	2	8	2117	2124	0 %	0 %	75 %	25 %	428314672
10	NC_019741	CTAG	2	8	3012	3019	25 %	25 %	25 %	25 %	428314672
11	NC_019741	AGTG	2	8	3041	3048	25 %	25 %	50 %	0 %	428314672
12	NC_019741	TGTT	2	8	3317	3324	0 %	75 %	25 %	0 %	428314673
13	NC_019741	GCCA	2	8	3561	3568	25 %	0 %	25 %	50 %	428314673
14	NC_019741	TGAG	2	8	3771	3778	25 %	25 %	50 %	0 %	428314673
15	NC_019741	ACAT	2	8	6141	6148	50 %	25 %	0 %	25 %	428314675
16	NC_019741	ATCT	2	8	6490	6497	25 %	50 %	0 %	25 %	428314676
17	NC_019741	GTTG	2	8	7036	7043	0 %	50 %	50 %	0 %	428314676
18	NC_019741	TGAT	2	8	7049	7056	25 %	50 %	25 %	0 %	428314676
19	NC_019741	CCAG	2	8	7827	7834	25 %	0 %	25 %	50 %	428314676
20	NC_019741	TGCT	2	8	8216	8223	0 %	50 %	25 %	25 %	428314677
21	NC_019741	TGAC	2	8	8813	8820	25 %	25 %	25 %	25 %	428314678
22	NC_019741	TGGG	2	8	9080	9087	0 %	25 %	75 %	0 %	428314678
23	NC_019741	TTAG	2	8	9163	9170	25 %	50 %	25 %	0 %	428314678
24	NC_019741	CTGT	2	8	9752	9759	0 %	50 %	25 %	25 %	428314679
25	NC_019741	GATG	2	8	10550	10557	25 %	25 %	50 %	0 %	428314679
26	NC_019741	TGGG	2	8	10765	10772	0 %	25 %	75 %	0 %	428314680
27	NC_019741	CTTG	2	8	11513	11520	0 %	50 %	25 %	25 %	428314680
28	NC_019741	CTGA	2	8	12541	12548	25 %	25 %	25 %	25 %	428314681
29	NC_019741	GGAA	2	8	12627	12634	50 %	0 %	50 %	0 %	428314681
30	NC_019741	GGAG	2	8	13917	13924	25 %	0 %	75 %	0 %	428314683
31	NC_019741	ATCG	2	8	13939	13946	25 %	25 %	25 %	25 %	428314683
32	NC_019741	CGAC	2	8	14556	14563	25 %	0 %	25 %	50 %	428314684
33	NC_019741	GCTC	2	8	14595	14602	0 %	25 %	25 %	50 %	428314684
34	NC_019741	CTTC	2	8	15072	15079	0 %	50 %	0 %	50 %	428314684
35	NC_019741	CAGT	2	8	16274	16281	25 %	25 %	25 %	25 %	428314684
36	NC_019741	CGCT	2	8	16379	16386	0 %	25 %	25 %	50 %	428314684
37	NC_019741	CTGG	2	8	16447	16454	0 %	25 %	50 %	25 %	428314684
38	NC_019741	ACCA	2	8	16888	16895	50 %	0 %	0 %	50 %	428314684
39	NC_019741	CCAA	2	8	16896	16903	50 %	0 %	0 %	50 %	428314684
40	NC_019741	CTTT	2	8	17027	17034	0 %	75 %	0 %	25 %	428314684
41	NC_019741	CATC	2	8	17150	17157	25 %	25 %	0 %	50 %	428314684
42	NC_019741	TGTT	2	8	17501	17508	0 %	75 %	25 %	0 %	428314684
43	NC_019741	GGCA	2	8	18558	18565	25 %	0 %	50 %	25 %	428314686
44	NC_019741	TCAG	2	8	18858	18865	25 %	25 %	25 %	25 %	428314686
45	NC_019741	ATCA	2	8	18905	18912	50 %	25 %	0 %	25 %	428314686
46	NC_019741	TGAT	2	8	18979	18986	25 %	50 %	25 %	0 %	428314686
47	NC_019741	CGAG	2	8	19019	19026	25 %	0 %	50 %	25 %	428314686
48	NC_019741	TTGA	2	8	19508	19515	25 %	50 %	25 %	0 %	428314687
49	NC_019741	CAAC	2	8	19701	19708	50 %	0 %	0 %	50 %	428314687
50	NC_019741	CGAG	2	8	20217	20224	25 %	0 %	50 %	25 %	428314689
51	NC_019741	ATGG	2	8	21313	21320	25 %	25 %	50 %	0 %	428314693
52	NC_019741	CGAG	2	8	21494	21501	25 %	0 %	50 %	25 %	428314694
53	NC_019741	AAAG	2	8	21883	21890	75 %	0 %	25 %	0 %	428314695
54	NC_019741	AAAG	2	8	22176	22183	75 %	0 %	25 %	0 %	428314696
55	NC_019741	ATGA	2	8	22641	22648	50 %	25 %	25 %	0 %	428314696
56	NC_019741	GTGA	2	8	23479	23486	25 %	25 %	50 %	0 %	428314697
57	NC_019741	AAAC	2	8	24019	24026	75 %	0 %	0 %	25 %	428314697
58	NC_019741	TCCT	2	8	25607	25614	0 %	50 %	0 %	50 %	428314698
59	NC_019741	CCTC	2	8	27337	27344	0 %	25 %	0 %	75 %	428314701
60	NC_019741	TTCT	2	8	27594	27601	0 %	75 %	0 %	25 %	428314701
61	NC_019741	GCCA	2	8	28063	28070	25 %	0 %	25 %	50 %	428314702
62	NC_019741	GAAG	2	8	28549	28556	50 %	0 %	50 %	0 %	428314702
63	NC_019741	ACGG	2	8	29049	29056	25 %	0 %	50 %	25 %	428314702
64	NC_019741	TTGA	2	8	29123	29130	25 %	50 %	25 %	0 %	428314702
65	NC_019741	TTAT	2	8	29252	29259	25 %	75 %	0 %	0 %	428314702
66	NC_019741	ATTC	2	8	29697	29704	25 %	50 %	0 %	25 %	428314703
67	NC_019741	TGAT	2	8	29747	29754	25 %	50 %	25 %	0 %	428314703
68	NC_019741	CCTT	2	8	30099	30106	0 %	50 %	0 %	50 %	428314704
69	NC_019741	AGAT	2	8	30472	30479	50 %	25 %	25 %	0 %	428314705
70	NC_019741	ATTT	2	8	30504	30511	25 %	75 %	0 %	0 %	428314705
71	NC_019741	GATG	2	8	30524	30531	25 %	25 %	50 %	0 %	428314705
72	NC_019741	AGTA	2	8	32558	32565	50 %	25 %	25 %	0 %	428314707
73	NC_019741	CCAA	2	8	32961	32968	50 %	0 %	0 %	50 %	428314708
74	NC_019741	TACC	2	8	33073	33080	25 %	25 %	0 %	50 %	428314708
75	NC_019741	TCAC	2	8	34344	34351	25 %	25 %	0 %	50 %	428314708
76	NC_019741	ATCG	2	8	34394	34401	25 %	25 %	25 %	25 %	428314708
77	NC_019741	CACT	2	8	35121	35128	25 %	25 %	0 %	50 %	428314708
78	NC_019741	CCAA	2	8	35328	35335	50 %	0 %	0 %	50 %	428314708
79	NC_019741	TGAT	2	8	35502	35509	25 %	50 %	25 %	0 %	428314708
80	NC_019741	ATAG	2	8	36714	36721	50 %	25 %	25 %	0 %	428314709
81	NC_019741	AATA	2	8	36979	36986	75 %	25 %	0 %	0 %	428314709
82	NC_019741	TTGA	2	8	37664	37671	25 %	50 %	25 %	0 %	428314709
83	NC_019741	TCGG	2	8	37793	37800	0 %	25 %	50 %	25 %	428314709

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.