MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Microcoleus sp. PCC 7113 plasmid pMIC7113.05

Total Repeats: 434

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019741	AGT	2	6	241	246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314671
2	NC_019741	CAA	2	6	311	316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314671
3	NC_019741	GGT	2	6	367	372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428314671
4	NC_019741	GTT	2	6	874	879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314672
5	NC_019741	CTC	2	6	1044	1049	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428314672
6	NC_019741	TCT	2	6	1065	1070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314672
7	NC_019741	GTG	2	6	1194	1199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428314672
8	NC_019741	AGT	2	6	1333	1338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314672
9	NC_019741	CAA	2	6	1339	1344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314672
10	NC_019741	CCA	2	6	1363	1368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428314672
11	NC_019741	TGA	2	6	1379	1384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314672
12	NC_019741	CCA	2	6	1390	1395	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428314672
13	NC_019741	GAC	2	6	1397	1402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314672
14	NC_019741	TCA	2	6	1420	1425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314672
15	NC_019741	ACC	2	6	1485	1490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428314672
16	NC_019741	GCG	2	6	1588	1593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428314672
17	NC_019741	CAA	2	6	1654	1659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314672
18	NC_019741	GCA	2	6	1747	1752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314672
19	NC_019741	CGG	2	6	1780	1785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428314672
20	NC_019741	TGC	3	9	1806	1814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314672
21	NC_019741	CGA	2	6	1915	1920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314672
22	NC_019741	TGG	2	6	1930	1935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428314672
23	NC_019741	CAG	2	6	1952	1957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314672
24	NC_019741	GCG	2	6	2142	2147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428314672
25	NC_019741	CTG	2	6	2357	2362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314672
26	NC_019741	TTG	2	6	2363	2368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314672
27	NC_019741	TGC	2	6	2434	2439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314672
28	NC_019741	TCA	2	6	2470	2475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314672
29	NC_019741	CCT	2	6	2500	2505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428314672
30	NC_019741	GAG	2	6	2647	2652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428314672
31	NC_019741	TCA	2	6	2709	2714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314672
32	NC_019741	ATG	2	6	2715	2720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314672
33	NC_019741	AAC	2	6	2811	2816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314672
34	NC_019741	TTC	2	6	2915	2920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314672
35	NC_019741	ATA	2	6	3311	3316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428314673
36	NC_019741	ATT	2	6	3380	3385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428314673
37	NC_019741	ATA	2	6	3413	3418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428314673
38	NC_019741	TGT	2	6	3603	3608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314673
39	NC_019741	CTG	2	6	3685	3690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314673
40	NC_019741	TCG	2	6	3747	3752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314673
41	NC_019741	AGC	2	6	3813	3818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314673
42	NC_019741	AGC	2	6	3863	3868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314673
43	NC_019741	CAA	2	6	3907	3912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314673
44	NC_019741	TCA	2	6	3969	3974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314673
45	NC_019741	TGC	2	6	3976	3981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314673
46	NC_019741	TCC	2	6	4010	4015	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428314673
47	NC_019741	GGC	2	6	4470	4475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428314674
48	NC_019741	CCG	2	6	4615	4620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428314674
49	NC_019741	CAA	2	6	4666	4671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314674
50	NC_019741	TGC	2	6	5016	5021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314674
51	NC_019741	AGC	2	6	5545	5550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314675
52	NC_019741	AGA	2	6	5576	5581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314675
53	NC_019741	CTT	2	6	5632	5637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314675
54	NC_019741	CTT	2	6	5759	5764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314675
55	NC_019741	TGT	2	6	5836	5841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314675
56	NC_019741	GCG	2	6	5861	5866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428314675
57	NC_019741	GCT	2	6	5926	5931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314675
58	NC_019741	ACT	2	6	5965	5970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314675
59	NC_019741	AAG	2	6	6022	6027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314675
60	NC_019741	ATC	2	6	6092	6097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314675
61	NC_019741	ATT	2	6	6211	6216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428314675
62	NC_019741	ATT	2	6	6223	6228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428314675
63	NC_019741	CAG	2	6	6237	6242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314675
64	NC_019741	GTA	2	6	6476	6481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314676
65	NC_019741	ACC	2	6	6579	6584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428314676
66	NC_019741	ATG	2	6	6629	6634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314676
67	NC_019741	CTG	2	6	6640	6645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314676
68	NC_019741	GTC	2	6	6691	6696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314676
69	NC_019741	CGC	2	6	6772	6777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428314676
70	NC_019741	ATC	2	6	6805	6810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314676
71	NC_019741	GGC	2	6	6814	6819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428314676
72	NC_019741	GCC	2	6	6919	6924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428314676
73	NC_019741	TGA	2	6	6936	6941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314676
74	NC_019741	CCG	2	6	6969	6974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428314676
75	NC_019741	CGC	2	6	6995	7000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428314676
76	NC_019741	CTA	2	6	7071	7076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314676
77	NC_019741	CGG	2	6	7077	7082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428314676
78	NC_019741	ACT	2	6	7133	7138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314676
79	NC_019741	GGC	2	6	7166	7171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428314676
80	NC_019741	CGA	2	6	7347	7352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314676
81	NC_019741	CTG	2	6	7411	7416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314676
82	NC_019741	CGA	2	6	7431	7436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314676
83	NC_019741	CGA	2	6	7469	7474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314676
84	NC_019741	GAG	2	6	7549	7554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428314676
85	NC_019741	GCG	2	6	7878	7883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428314676
86	NC_019741	GTG	2	6	7899	7904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428314676
87	NC_019741	TCT	2	6	7910	7915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314676
88	NC_019741	TCG	2	6	7923	7928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314676
89	NC_019741	ATC	2	6	7976	7981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314676
90	NC_019741	CCG	2	6	8027	8032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428314676
91	NC_019741	CTT	2	6	8242	8247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314677
92	NC_019741	CTG	2	6	8321	8326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314677
93	NC_019741	TTG	2	6	8373	8378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314677
94	NC_019741	TTG	2	6	8381	8386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314677
95	NC_019741	TTG	2	6	8421	8426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314677
96	NC_019741	TTG	2	6	8429	8434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314677
97	NC_019741	TTG	2	6	8469	8474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314677
98	NC_019741	TTG	2	6	8477	8482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314677
99	NC_019741	TTG	2	6	8517	8522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314677
100	NC_019741	TTG	2	6	8525	8530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314677
101	NC_019741	TTG	2	6	8581	8586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314677
102	NC_019741	TCA	2	6	8592	8597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314677
103	NC_019741	CCA	2	6	8747	8752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428314678
104	NC_019741	GTG	2	6	8772	8777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428314678
105	NC_019741	ATG	2	6	8890	8895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314678
106	NC_019741	TCG	2	6	8912	8917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314678
107	NC_019741	CAG	2	6	8979	8984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314678
108	NC_019741	CCG	3	9	9041	9049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428314678
109	NC_019741	CAG	2	6	9066	9071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314678
110	NC_019741	GCG	3	9	9763	9771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428314679
111	NC_019741	CAT	2	6	9804	9809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314679
112	NC_019741	GAA	2	6	9924	9929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314679
113	NC_019741	CTT	2	6	9985	9990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314679
114	NC_019741	GTT	2	6	10010	10015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314679
115	NC_019741	GAA	2	6	10317	10322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314679
116	NC_019741	GAT	2	6	10506	10511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314679
117	NC_019741	GGA	2	6	10562	10567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428314679
118	NC_019741	GCC	2	6	10588	10593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428314679
119	NC_019741	TTG	2	6	10633	10638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314680
120	NC_019741	AAC	2	6	10660	10665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314680
121	NC_019741	CAA	2	6	10752	10757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314680
122	NC_019741	TCG	2	6	10951	10956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314680
123	NC_019741	CAT	2	6	11072	11077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314680
124	NC_019741	CTG	2	6	11115	11120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314680
125	NC_019741	CAT	2	6	11121	11126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314680
126	NC_019741	CTT	2	6	11150	11155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314680
127	NC_019741	TCA	2	6	11267	11272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314680
128	NC_019741	CGT	2	6	11275	11280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314680
129	NC_019741	GGC	2	6	11430	11435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428314680
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162	NC_019741	AAG	2	6	14790	14795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314684
163	NC_019741	CTT	2	6	14805	14810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314684
164	NC_019741	CTT	2	6	14832	14837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314684
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378	NC_019741	GAC	2	6	33764	33769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314708
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410	NC_019741	ACA	2	6	36067	36072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314709
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434	NC_019741	GCT	2	6	38313	38318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314709

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.