MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium indicus pranii MTCC 9506 chromosome

Total Repeats: 12976

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018612	AAGG	2	8	814	821	50 %	0 %	50 %	0 %	406028181
2	NC_018612	GTGG	2	8	2119	2126	0 %	25 %	75 %	0 %	406028182
3	NC_018612	CGGG	2	8	2503	2510	0 %	0 %	75 %	25 %	406028182
4	NC_018612	GCCG	2	8	2833	2840	0 %	0 %	50 %	50 %	406028182
5	NC_018612	CGAT	2	8	3006	3013	25 %	25 %	25 %	25 %	406028182
6	NC_018612	CCGA	2	8	3191	3198	25 %	0 %	25 %	50 %	406028182
7	NC_018612	GGGC	2	8	3506	3513	0 %	0 %	75 %	25 %	406028183
8	NC_018612	CGGC	2	8	3668	3675	0 %	0 %	50 %	50 %	406028183
9	NC_018612	GTGC	2	8	3686	3693	0 %	25 %	50 %	25 %	406028183
10	NC_018612	GGTC	2	8	4054	4061	0 %	25 %	50 %	25 %	406028183
11	NC_018612	GCCA	2	8	4115	4122	25 %	0 %	25 %	50 %	406028183
12	NC_018612	GCCG	2	8	4519	4526	0 %	0 %	50 %	50 %	406028184
13	NC_018612	GCCG	2	8	4884	4891	0 %	0 %	50 %	50 %	406028184
14	NC_018612	GGGC	2	8	6524	6531	0 %	0 %	75 %	25 %	406033432
15	NC_018612	CGGC	2	8	6604	6611	0 %	0 %	50 %	50 %	406033432
16	NC_018612	GATG	2	8	7064	7071	25 %	25 %	50 %	0 %	406033432
17	NC_018612	TGAC	2	8	7300	7307	25 %	25 %	25 %	25 %	406028185
18	NC_018612	CGGT	2	8	7524	7531	0 %	25 %	50 %	25 %	406028185
19	NC_018612	CCCA	2	8	7986	7993	25 %	0 %	0 %	75 %	406028185
20	NC_018612	TCGC	2	8	8833	8840	0 %	25 %	25 %	50 %	406028185
21	NC_018612	CGAC	2	8	9355	9362	25 %	0 %	25 %	50 %	406028185
22	NC_018612	ACCT	2	8	9462	9469	25 %	25 %	0 %	50 %	406028185
23	NC_018612	CCGA	2	8	10157	10164	25 %	0 %	25 %	50 %	406028186
24	NC_018612	CCGG	2	8	10181	10188	0 %	0 %	50 %	50 %	406028186
25	NC_018612	GCCG	2	8	10406	10413	0 %	0 %	50 %	50 %	406028186
26	NC_018612	GATC	2	8	11470	11477	25 %	25 %	25 %	25 %	406028187
27	NC_018612	GCGA	2	8	11722	11729	25 %	0 %	50 %	25 %	406028187
28	NC_018612	ACCA	2	8	11789	11796	50 %	0 %	0 %	50 %	406028187
29	NC_018612	TGCG	2	8	12084	12091	0 %	25 %	50 %	25 %	406028188
30	NC_018612	CGCC	2	8	12555	12562	0 %	0 %	25 %	75 %	406028188
31	NC_018612	AACA	2	8	12696	12703	75 %	0 %	0 %	25 %	406028188
32	NC_018612	CGGC	2	8	12738	12745	0 %	0 %	50 %	50 %	406028188
33	NC_018612	GCCG	2	8	12934	12941	0 %	0 %	50 %	50 %	406028188
34	NC_018612	CGAA	2	8	13002	13009	50 %	0 %	25 %	25 %	406028188
35	NC_018612	GGGC	2	8	13252	13259	0 %	0 %	75 %	25 %	406028189
36	NC_018612	GACC	2	8	14270	14277	25 %	0 %	25 %	50 %	406028190
37	NC_018612	GGTC	2	8	14460	14467	0 %	25 %	50 %	25 %	406028191
38	NC_018612	CACG	2	8	15470	15477	25 %	0 %	25 %	50 %	406028193
39	NC_018612	CTGG	2	8	16741	16748	0 %	25 %	50 %	25 %	406028194
40	NC_018612	GCCG	2	8	16893	16900	0 %	0 %	50 %	50 %	406028195
41	NC_018612	CGTC	2	8	17006	17013	0 %	25 %	25 %	50 %	406028195
42	NC_018612	GGCC	2	8	17133	17140	0 %	0 %	50 %	50 %	406028195
43	NC_018612	CGAC	3	12	17734	17745	25 %	0 %	25 %	50 %	406028195
44	NC_018612	GGGC	2	8	17805	17812	0 %	0 %	75 %	25 %	406028195
45	NC_018612	TCGG	2	8	17847	17854	0 %	25 %	50 %	25 %	406028195
46	NC_018612	CGCC	2	8	18381	18388	0 %	0 %	25 %	75 %	406028195
47	NC_018612	GTAG	2	8	18563	18570	25 %	25 %	50 %	0 %	406028195
48	NC_018612	TGCC	2	8	18805	18812	0 %	25 %	25 %	50 %	406028196
49	NC_018612	GGGC	2	8	19010	19017	0 %	0 %	75 %	25 %	406028196
50	NC_018612	CTGG	2	8	19139	19146	0 %	25 %	50 %	25 %	406028196
51	NC_018612	GCCG	2	8	19657	19664	0 %	0 %	50 %	50 %	406028196
52	NC_018612	CGGG	2	8	20805	20812	0 %	0 %	75 %	25 %	406028197
53	NC_018612	CCGC	2	8	21293	21300	0 %	0 %	25 %	75 %	406028197
54	NC_018612	GTCG	2	8	21847	21854	0 %	25 %	50 %	25 %	406028198
55	NC_018612	CCCA	2	8	22064	22071	25 %	0 %	0 %	75 %	406028198
56	NC_018612	CCGA	2	8	22163	22170	25 %	0 %	25 %	50 %	406028198
57	NC_018612	TGGG	2	8	22997	23004	0 %	25 %	75 %	0 %	406028199
58	NC_018612	GCCC	2	8	23575	23582	0 %	0 %	25 %	75 %	406028199
59	NC_018612	GCCG	2	8	24249	24256	0 %	0 %	50 %	50 %	406028199
60	NC_018612	GCGG	2	8	25800	25807	0 %	0 %	75 %	25 %	406028201
61	NC_018612	AGCC	2	8	25915	25922	25 %	0 %	25 %	50 %	406028201
62	NC_018612	GTCA	2	8	26189	26196	25 %	25 %	25 %	25 %	406028201
63	NC_018612	CGGG	2	8	26264	26271	0 %	0 %	75 %	25 %	406028201
64	NC_018612	GGCA	2	8	27257	27264	25 %	0 %	50 %	25 %	406028202
65	NC_018612	CGAG	2	8	28114	28121	25 %	0 %	50 %	25 %	406028204
66	NC_018612	CGCC	2	8	29050	29057	0 %	0 %	25 %	75 %	406028206
67	NC_018612	ACCG	2	8	29146	29153	25 %	0 %	25 %	50 %	406028206
68	NC_018612	TGGC	2	8	29183	29190	0 %	25 %	50 %	25 %	406028206
69	NC_018612	CTGT	2	8	29345	29352	0 %	50 %	25 %	25 %	406028206
70	NC_018612	CGGA	2	8	29954	29961	25 %	0 %	50 %	25 %	406028206
71	NC_018612	CGGT	2	8	30193	30200	0 %	25 %	50 %	25 %	406028206
72	NC_018612	GCCG	2	8	30221	30228	0 %	0 %	50 %	50 %	406028206
73	NC_018612	TGGA	2	8	30270	30277	25 %	25 %	50 %	0 %	406028206
74	NC_018612	CGGT	2	8	30300	30307	0 %	25 %	50 %	25 %	406028206
75	NC_018612	CGAG	2	8	31110	31117	25 %	0 %	50 %	25 %	406028207
76	NC_018612	AGCA	2	8	31584	31591	50 %	0 %	25 %	25 %	406028208
77	NC_018612	GGCG	2	8	32563	32570	0 %	0 %	75 %	25 %	406028208
78	NC_018612	GCAC	2	8	32770	32777	25 %	0 %	25 %	50 %	406028208
79	NC_018612	GCCG	2	8	32815	32822	0 %	0 %	50 %	50 %	406028208
80	NC_018612	CGCC	2	8	34023	34030	0 %	0 %	25 %	75 %	406028209
81	NC_018612	GGGC	2	8	34244	34251	0 %	0 %	75 %	25 %	406028210
82	NC_018612	AGCG	2	8	35005	35012	25 %	0 %	50 %	25 %	406028210
83	NC_018612	CGGC	2	8	35138	35145	0 %	0 %	50 %	50 %	406028210
84	NC_018612	TGCG	2	8	36552	36559	0 %	25 %	50 %	25 %	406028211
85	NC_018612	CGGC	2	8	37277	37284	0 %	0 %	50 %	50 %	406028213
86	NC_018612	ATCG	2	8	37630	37637	25 %	25 %	25 %	25 %	406028213
87	NC_018612	TCTG	2	8	37677	37684	0 %	50 %	25 %	25 %	406028213
88	NC_018612	CCGG	2	8	37763	37770	0 %	0 %	50 %	50 %	406028213
89	NC_018612	AGCA	2	8	39109	39116	50 %	0 %	25 %	25 %	406028215
90	NC_018612	GTCC	2	8	39447	39454	0 %	25 %	25 %	50 %	406028216
91	NC_018612	CCGA	2	8	39499	39506	25 %	0 %	25 %	50 %	406028216
92	NC_018612	GCCG	2	8	40016	40023	0 %	0 %	50 %	50 %	406028216
93	NC_018612	GTCG	2	8	40128	40135	0 %	25 %	50 %	25 %	406028216
94	NC_018612	CGGC	2	8	40843	40850	0 %	0 %	50 %	50 %	406028216
95	NC_018612	GCCG	2	8	41076	41083	0 %	0 %	50 %	50 %	406028217
96	NC_018612	GCGG	2	8	42038	42045	0 %	0 %	75 %	25 %	406028220
97	NC_018612	GACC	2	8	42050	42057	25 %	0 %	25 %	50 %	406028220
98	NC_018612	CCCG	2	8	42295	42302	0 %	0 %	25 %	75 %	406028220
99	NC_018612	GGCG	2	8	42359	42366	0 %	0 %	75 %	25 %	406028220
100	NC_018612	CCAC	2	8	42376	42383	25 %	0 %	0 %	75 %	406028220
101	NC_018612	GCCG	2	8	42605	42612	0 %	0 %	50 %	50 %	406028220
102	NC_018612	GCCG	2	8	42689	42696	0 %	0 %	50 %	50 %	406028220
103	NC_018612	GCCG	2	8	42794	42801	0 %	0 %	50 %	50 %	406028220
104	NC_018612	GCCG	2	8	42827	42834	0 %	0 %	50 %	50 %	406028220
105	NC_018612	CCAG	2	8	44223	44230	25 %	0 %	25 %	50 %	406028222
106	NC_018612	CGGT	2	8	44477	44484	0 %	25 %	50 %	25 %	406028222
107	NC_018612	CGGC	2	8	44603	44610	0 %	0 %	50 %	50 %	406028222
108	NC_018612	CGGT	2	8	44795	44802	0 %	25 %	50 %	25 %	406028222
109	NC_018612	GGCC	2	8	45056	45063	0 %	0 %	50 %	50 %	406028223
110	NC_018612	CATC	2	8	45212	45219	25 %	25 %	0 %	50 %	406028223
111	NC_018612	CAGC	2	8	45600	45607	25 %	0 %	25 %	50 %	406028223
112	NC_018612	ACCG	2	8	45819	45826	25 %	0 %	25 %	50 %	406028223
113	NC_018612	CGCC	2	8	45956	45963	0 %	0 %	25 %	75 %	406028223
114	NC_018612	ACCC	2	8	47011	47018	25 %	0 %	0 %	75 %	406028224
115	NC_018612	TGGG	2	8	47272	47279	0 %	25 %	75 %	0 %	406028225
116	NC_018612	GTCG	2	8	47838	47845	0 %	25 %	50 %	25 %	406028226
117	NC_018612	CGAG	2	8	47888	47895	25 %	0 %	50 %	25 %	406028226
118	NC_018612	GCGG	2	8	48213	48220	0 %	0 %	75 %	25 %	406028226
119	NC_018612	GACG	2	8	49110	49117	25 %	0 %	50 %	25 %	406028227
120	NC_018612	CACC	2	8	49218	49225	25 %	0 %	0 %	75 %	406028227
121	NC_018612	CGGG	2	8	49458	49465	0 %	0 %	75 %	25 %	406028227
122	NC_018612	CCGC	2	8	50318	50325	0 %	0 %	25 %	75 %	406028227
123	NC_018612	CGCC	2	8	50385	50392	0 %	0 %	25 %	75 %	406028227
124	NC_018612	GACG	2	8	50434	50441	25 %	0 %	50 %	25 %	406028227
125	NC_018612	CGGC	2	8	50737	50744	0 %	0 %	50 %	50 %	406028227
126	NC_018612	ACCA	2	8	51367	51374	50 %	0 %	0 %	50 %	406028227
127	NC_018612	CGGC	2	8	51708	51715	0 %	0 %	50 %	50 %	406028227
128	NC_018612	ACCG	2	8	51743	51750	25 %	0 %	25 %	50 %	406028228
129	NC_018612	GCCG	2	8	51751	51758	0 %	0 %	50 %	50 %	406028228
130	NC_018612	CGGC	2	8	52318	52325	0 %	0 %	50 %	50 %	406028228
131	NC_018612	GCGT	2	8	52336	52343	0 %	25 %	50 %	25 %	406028228
132	NC_018612	GGCG	3	12	52482	52493	0 %	0 %	75 %	25 %	406028229
133	NC_018612	GCCG	2	8	52498	52505	0 %	0 %	50 %	50 %	406028229
134	NC_018612	GCTG	2	8	52587	52594	0 %	25 %	50 %	25 %	406028229
135	NC_018612	CCGC	2	8	52677	52684	0 %	0 %	25 %	75 %	406028229
136	NC_018612	CGGG	2	8	53103	53110	0 %	0 %	75 %	25 %	406028230
137	NC_018612	ATTG	2	8	54059	54066	25 %	50 %	25 %	0 %	406028231
138	NC_018612	CAGC	2	8	54372	54379	25 %	0 %	25 %	50 %	406028231
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