MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Mycoplasma gallisepticum VA94_7994-1-7P chromosome

Total Repeats: 455

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018406	AACTAA	2	12	4203	4214	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	401765856
2	NC_018406	GCAATC	2	12	5891	5902	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	401765858
3	NC_018406	GATCTT	2	12	6134	6145	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	401765859
4	NC_018406	AGAAAA	2	12	8483	8494	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	401765862
5	NC_018406	AATCTT	2	12	9862	9873	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	401765864
6	NC_018406	CTGATA	2	12	13994	14005	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	401765868
7	NC_018406	ACCTGA	2	12	19972	19983	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	401765872
8	NC_018406	TAAGAA	2	12	21362	21373	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	401765874
9	NC_018406	CATTAG	2	12	22255	22266	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	401765875
10	NC_018406	TCAAGA	2	12	25311	25322	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	401765876
11	NC_018406	TTAATG	2	12	25792	25803	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	401765876
12	NC_018406	CAAAGA	2	12	27039	27050	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	401765876
13	NC_018406	TGATCT	2	12	27998	28009	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	401765876
14	NC_018406	ATTATC	2	12	32727	32738	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	401765882
15	NC_018406	GCTAAA	2	12	33523	33534	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	401765882
16	NC_018406	AACTAA	2	12	34505	34516	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	401765882
17	NC_018406	AAGCAA	2	12	35619	35630	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	401765884
18	NC_018406	AGCTAA	2	12	37601	37612	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	401765886
19	NC_018406	AATAAC	2	12	41080	41091	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	401765887
20	NC_018406	CATTAG	2	12	44937	44948	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	401765890
21	NC_018406	TTAAGA	2	12	47550	47561	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	401765892
22	NC_018406	AATCTT	2	12	47941	47952	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	401765892
23	NC_018406	CTAAAG	2	12	52406	52417	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	401765894
24	NC_018406	AATCGT	2	12	56532	56543	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	401765897
25	NC_018406	TTGAGC	2	12	57678	57689	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	401765899
26	NC_018406	ACCTAA	2	12	58242	58253	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	401765899
27	NC_018406	AAACCA	2	12	60411	60422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	401765901
28	NC_018406	AAAATC	2	12	65968	65979	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	401765905
29	NC_018406	AAGAAA	2	12	68579	68590	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	401765910
30	NC_018406	TTTATG	2	12	69819	69830	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	401765912
31	NC_018406	AACAAA	2	12	70786	70797	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	401765913
32	NC_018406	AGGTAA	2	12	71102	71113	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	401765914
33	NC_018406	AGTTAA	2	12	72643	72654	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	401765918
34	NC_018406	TAAAGG	2	12	74385	74396	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	401765922
35	NC_018406	CTATTT	2	12	85135	85146	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	401765930
36	NC_018406	AATATT	2	12	85818	85829	50 %	50 %	0 %	0 %	401765930
37	NC_018406	AATAAA	2	12	87317	87328	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	401765931
38	NC_018406	ATTTAG	2	12	87360	87371	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	401765931
39	NC_018406	AATGTT	2	12	89462	89473	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	401765932
40	NC_018406	AATCTT	2	12	91545	91556	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	401765934
41	NC_018406	TCACGA	2	12	91608	91619	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	401765934
42	NC_018406	AAGAAA	2	12	98308	98319	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	401765940
43	NC_018406	CTTGAT	2	12	100817	100828	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	401765942
44	NC_018406	TATATC	2	12	102102	102113	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	401765942
45	NC_018406	GTGCAA	2	12	104261	104272	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	401765943
46	NC_018406	AAAACA	2	12	106869	106880	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	401765945
47	NC_018406	CAAAAG	2	12	109538	109549	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	401765948
48	NC_018406	GTTTTA	2	12	110458	110469	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	401765949
49	NC_018406	TTAAAG	2	12	114561	114572	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	401765950
50	NC_018406	TAGAAG	2	12	117336	117347	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	401765951
51	NC_018406	TTTTCT	2	12	119200	119211	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	401765952
52	NC_018406	ATCCAT	2	12	119757	119768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	401765952
53	NC_018406	ATTAAT	2	12	124022	124033	50 %	50 %	0 %	0 %	401765954
54	NC_018406	CTTTAA	2	12	127226	127237	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	401765960
55	NC_018406	ATAAAT	2	12	129436	129447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	401765962
56	NC_018406	AATTAC	2	12	138738	138749	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	401765971
57	NC_018406	CTCGAT	3	18	140892	140909	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	401765972
58	NC_018406	GAACAA	2	12	142938	142949	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	401765973
59	NC_018406	AAAAAG	2	12	143101	143112	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	401765973
60	NC_018406	GACAAA	2	12	143265	143276	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	401765973
61	NC_018406	AAAACA	2	12	144782	144793	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	401765975
62	NC_018406	TAATAT	2	12	144917	144928	50 %	50 %	0 %	0 %	401765975
63	NC_018406	TGTTAA	2	12	150957	150968	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	401765982
64	NC_018406	TTTGAT	2	12	152366	152377	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	401765984
65	NC_018406	TAAATC	2	12	154503	154514	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	401765985
66	NC_018406	TTAGAT	2	12	156703	156714	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	401765986
67	NC_018406	TGGTGA	2	12	158189	158200	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	401765987
68	NC_018406	AATCTA	2	12	162913	162924	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	401765993
69	NC_018406	TTAAAG	2	12	163489	163500	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	401765994
70	NC_018406	AAAGCT	2	12	165174	165185	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	401765994
71	NC_018406	ATTGGT	2	12	170680	170691	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	401765999
72	NC_018406	ACATTC	2	12	171142	171153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	401765999
73	NC_018406	ATTCTT	2	12	171498	171509	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	401765999
74	NC_018406	CAGGTG	2	12	175433	175444	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	401766002
75	NC_018406	GAAAAA	2	12	175591	175602	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	401766002
76	NC_018406	TTACTA	2	12	179903	179914	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	401766010
77	NC_018406	GGTTTA	2	12	180930	180941	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	401766012
78	NC_018406	ATAATC	2	12	181061	181072	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	401766012
79	NC_018406	ATTTAA	2	12	181317	181328	50 %	50 %	0 %	0 %	401766014
80	NC_018406	GATTTT	2	12	183640	183651	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	401766016
81	NC_018406	CTTTAA	2	12	183665	183676	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	401766016
82	NC_018406	CTTTAT	2	12	185597	185608	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	401766018
83	NC_018406	TTTTGT	2	12	186780	186791	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	401766019
84	NC_018406	TTTATT	2	12	190957	190968	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	401766024
85	NC_018406	AGAAAA	2	12	191946	191957	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	401766024
86	NC_018406	TTTTGT	2	12	192144	192155	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	401766025
87	NC_018406	TTTATT	2	12	196321	196332	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	401766030
88	NC_018406	AGAAAA	2	12	197310	197321	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	401766030
89	NC_018406	TTTTGT	2	12	197508	197519	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	401766031
90	NC_018406	TTTATT	2	12	201685	201696	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	401766036
91	NC_018406	AGAAAA	2	12	202674	202685	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	401766036
92	NC_018406	TTTTGT	2	12	202872	202883	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	401766037
93	NC_018406	TTTATT	2	12	207049	207060	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	401766042
94	NC_018406	AGAAAA	2	12	208038	208049	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	401766042
95	NC_018406	TTTTGT	2	12	208236	208247	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	401766043
96	NC_018406	TTTATT	2	12	212413	212424	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	401766048
97	NC_018406	AGAAAA	2	12	213402	213413	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	401766048
98	NC_018406	TTTTGT	2	12	213600	213611	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	401766049
99	NC_018406	ACTTAA	2	12	214185	214196	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	401766049
100	NC_018406	CTTGGG	2	12	215505	215516	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	401766050
101	NC_018406	ATCTTA	2	12	215612	215623	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	401766050
102	NC_018406	TATCAT	2	12	216799	216810	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	401766051
103	NC_018406	TACTGA	2	12	217386	217397	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	401766052
104	NC_018406	AAATGA	2	12	221267	221278	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	401766054
105	NC_018406	CAAAAA	2	12	221995	222006	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	401766054
106	NC_018406	AAACAA	2	12	222786	222797	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	401766055
107	NC_018406	TTTATT	2	12	223323	223334	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	401766055
108	NC_018406	AAAAGA	2	12	230011	230022	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	401766060
109	NC_018406	ATCAAA	2	12	230124	230135	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	401766060
110	NC_018406	AAATTA	2	12	233320	233331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	401766063
111	NC_018406	GGGTTT	2	12	234678	234689	0 %	50 %	50 %	0 %	401766065
112	NC_018406	TAAATT	2	12	238382	238393	50 %	50 %	0 %	0 %	401766067
113	NC_018406	TATGAT	2	12	239820	239831	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	401766067
114	NC_018406	CAAGTT	2	12	240422	240433	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	401766068
115	NC_018406	GGGATT	2	12	241200	241211	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	401766069
116	NC_018406	TCAAGA	2	12	242457	242468	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	401766070
117	NC_018406	CTACTT	2	12	242744	242755	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	401766070
118	NC_018406	CCTAAA	2	12	242797	242808	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	401766070
119	NC_018406	AGATTA	2	12	244870	244881	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	401766070
120	NC_018406	GGTATT	2	12	245095	245106	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	401766070
121	NC_018406	AATAAA	2	12	248606	248617	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	401766071
122	NC_018406	ATGCTA	2	12	248977	248988	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	401766072
123	NC_018406	TCAAAA	2	12	255759	255770	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	401766075
124	NC_018406	CCAAAT	2	12	257065	257076	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	401766075
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126	NC_018406	CTTTGT	2	12	263473	263484	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	401766078
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130	NC_018406	AATCCT	2	12	272118	272129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	401766086
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233	NC_018406	TAAGAA	2	12	465667	465678	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	401766229
234	NC_018406	TCAACT	2	12	470879	470890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	401766235
235	NC_018406	TCTTAA	2	12	471171	471182	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	401766235
236	NC_018406	TGTTGA	2	12	474818	474829	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	401766237
237	NC_018406	GTTTTA	2	12	480710	480721	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	401766244
238	NC_018406	TAATGC	2	12	481613	481624	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	401766245
239	NC_018406	TTCGAT	2	12	484025	484036	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	401766246
240	NC_018406	TAGTTA	2	12	484598	484609	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	401766246
241	NC_018406	GATAAT	2	12	484677	484688	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	401766246
242	NC_018406	AATTTA	2	12	485190	485201	50 %	50 %	0 %	0 %	401766246
243	NC_018406	TACCAG	2	12	493656	493667	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	401766255
244	NC_018406	TTGGTG	2	12	494437	494448	0 %	50 %	50 %	0 %	401766256
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248	NC_018406	TAAAAA	2	12	500032	500043	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	401766261
249	NC_018406	CTTCAG	2	12	503001	503012	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	401766264
250	NC_018406	CTGTTT	2	12	503724	503735	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	401766264
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253	NC_018406	AGCATG	2	12	508684	508695	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	401766268
254	NC_018406	TAACAA	2	12	511484	511495	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	401766271
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258	NC_018406	GTAGCA	2	12	524002	524013	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	401766283
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261	NC_018406	TGCTCA	2	12	527275	527286	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	401766285
262	NC_018406	ACAAAA	2	12	527312	527323	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	401766285
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264	NC_018406	AACTAA	2	12	536153	536164	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	401766294
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333	NC_018406	AGCTTT	2	12	681389	681400	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	401766401
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336	NC_018406	TCATGA	2	12	687235	687246	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	401766402
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339	NC_018406	TTCGAT	2	12	693837	693848	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	401766408
340	NC_018406	GACCAC	2	12	697008	697019	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	401766412
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342	NC_018406	TTCAAC	2	12	698233	698244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	401766412
343	NC_018406	CGTGAC	2	12	699702	699713	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	401766415
344	NC_018406	AATCTA	2	12	705696	705707	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	401766422
345	NC_018406	ATTTGA	2	12	706456	706467	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	401766422
346	NC_018406	TGCTTC	2	12	707674	707685	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	401766423
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348	NC_018406	TTTATA	2	12	716799	716810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	401766431
349	NC_018406	TGGTGA	2	12	718587	718598	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	401766432
350	NC_018406	CGATCG	2	12	719164	719175	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	401766433
351	NC_018406	TTTTGT	2	12	719560	719571	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	401766433
352	NC_018406	TAGCTC	2	12	720207	720218	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	401766434
353	NC_018406	TGCTTC	2	12	721811	721822	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	401766435
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