MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Melissococcus plutonius DAT561 plasmid 1

Total Repeats: 213

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018265	TC	3	6	855	860	0 %	50 %	0 %	50 %	399140226
2	NC_018265	CT	3	6	1160	1165	0 %	50 %	0 %	50 %	399140227
3	NC_018265	AT	3	6	4045	4050	50 %	50 %	0 %	0 %	399140228
4	NC_018265	TA	3	6	4952	4957	50 %	50 %	0 %	0 %	399140229
5	NC_018265	TA	3	6	5547	5552	50 %	50 %	0 %	0 %	399140230
6	NC_018265	TC	3	6	5991	5996	0 %	50 %	0 %	50 %	399140230
7	NC_018265	TA	3	6	6661	6666	50 %	50 %	0 %	0 %	399140231
8	NC_018265	TA	3	6	7297	7302	50 %	50 %	0 %	0 %	399140232
9	NC_018265	TA	3	6	7751	7756	50 %	50 %	0 %	0 %	399140233
10	NC_018265	TA	4	8	10527	10534	50 %	50 %	0 %	0 %	399140238
11	NC_018265	TA	3	6	10955	10960	50 %	50 %	0 %	0 %	399140238
12	NC_018265	TA	3	6	11188	11193	50 %	50 %	0 %	0 %	399140238
13	NC_018265	GA	3	6	11924	11929	50 %	0 %	50 %	0 %	399140238
14	NC_018265	AT	5	10	11951	11960	50 %	50 %	0 %	0 %	399140238
15	NC_018265	TA	3	6	12149	12154	50 %	50 %	0 %	0 %	399140238
16	NC_018265	AG	3	6	14134	14139	50 %	0 %	50 %	0 %	399140241
17	NC_018265	AT	3	6	15060	15065	50 %	50 %	0 %	0 %	399140243
18	NC_018265	AG	4	8	15101	15108	50 %	0 %	50 %	0 %	399140243
19	NC_018265	TC	4	8	15272	15279	0 %	50 %	0 %	50 %	399140243
20	NC_018265	AT	3	6	16079	16084	50 %	50 %	0 %	0 %	399140244
21	NC_018265	AT	3	6	16192	16197	50 %	50 %	0 %	0 %	399140244
22	NC_018265	TA	3	6	16205	16210	50 %	50 %	0 %	0 %	399140244
23	NC_018265	TA	3	6	16441	16446	50 %	50 %	0 %	0 %	399140244
24	NC_018265	AT	3	6	16807	16812	50 %	50 %	0 %	0 %	399140244
25	NC_018265	AT	3	6	20952	20957	50 %	50 %	0 %	0 %	399140247
26	NC_018265	AT	3	6	21122	21127	50 %	50 %	0 %	0 %	399140247
27	NC_018265	AT	3	6	21412	21417	50 %	50 %	0 %	0 %	399140247
28	NC_018265	TA	3	6	22606	22611	50 %	50 %	0 %	0 %	399140248
29	NC_018265	TA	3	6	22957	22962	50 %	50 %	0 %	0 %	399140248
30	NC_018265	AT	3	6	25545	25550	50 %	50 %	0 %	0 %	399140249
31	NC_018265	TA	3	6	25588	25593	50 %	50 %	0 %	0 %	399140249
32	NC_018265	AT	3	6	27122	27127	50 %	50 %	0 %	0 %	399140251
33	NC_018265	AT	3	6	27135	27140	50 %	50 %	0 %	0 %	399140251
34	NC_018265	GA	3	6	27588	27593	50 %	0 %	50 %	0 %	399140251
35	NC_018265	TA	3	6	28020	28025	50 %	50 %	0 %	0 %	399140252
36	NC_018265	GA	3	6	28108	28113	50 %	0 %	50 %	0 %	399140252
37	NC_018265	AT	3	6	30781	30786	50 %	50 %	0 %	0 %	399140254
38	NC_018265	AT	3	6	31540	31545	50 %	50 %	0 %	0 %	399140255
39	NC_018265	TA	3	6	31731	31736	50 %	50 %	0 %	0 %	399140255
40	NC_018265	AT	3	6	32393	32398	50 %	50 %	0 %	0 %	399140256
41	NC_018265	AT	3	6	32446	32451	50 %	50 %	0 %	0 %	399140256
42	NC_018265	AT	3	6	32566	32571	50 %	50 %	0 %	0 %	399140256
43	NC_018265	TA	3	6	33321	33326	50 %	50 %	0 %	0 %	399140257
44	NC_018265	AT	3	6	37860	37865	50 %	50 %	0 %	0 %	399140258
45	NC_018265	CT	3	6	38273	38278	0 %	50 %	0 %	50 %	399140259
46	NC_018265	TA	4	8	38525	38532	50 %	50 %	0 %	0 %	399140259
47	NC_018265	CT	3	6	38615	38620	0 %	50 %	0 %	50 %	399140259
48	NC_018265	TA	3	6	38718	38723	50 %	50 %	0 %	0 %	399140259
49	NC_018265	CA	3	6	40150	40155	50 %	0 %	0 %	50 %	399140260
50	NC_018265	AT	3	6	40315	40320	50 %	50 %	0 %	0 %	399140260
51	NC_018265	AT	3	6	41642	41647	50 %	50 %	0 %	0 %	399140262
52	NC_018265	AT	3	6	42329	42334	50 %	50 %	0 %	0 %	399140263
53	NC_018265	AG	3	6	42375	42380	50 %	0 %	50 %	0 %	399140263
54	NC_018265	AG	3	6	42399	42404	50 %	0 %	50 %	0 %	399140263
55	NC_018265	TA	3	6	42703	42708	50 %	50 %	0 %	0 %	399140264
56	NC_018265	TA	3	6	44422	44427	50 %	50 %	0 %	0 %	399140266
57	NC_018265	TA	3	6	48299	48304	50 %	50 %	0 %	0 %	399140268
58	NC_018265	TA	4	8	48329	48336	50 %	50 %	0 %	0 %	399140268
59	NC_018265	TA	3	6	49891	49896	50 %	50 %	0 %	0 %	399140269
60	NC_018265	AG	3	6	50034	50039	50 %	0 %	50 %	0 %	399140269
61	NC_018265	AT	3	6	50868	50873	50 %	50 %	0 %	0 %	399140269
62	NC_018265	CA	3	6	51389	51394	50 %	0 %	0 %	50 %	399140270
63	NC_018265	TA	3	6	52180	52185	50 %	50 %	0 %	0 %	399140271
64	NC_018265	TG	3	6	52773	52778	0 %	50 %	50 %	0 %	399140272
65	NC_018265	AT	3	6	53021	53026	50 %	50 %	0 %	0 %	399140272
66	NC_018265	TA	3	6	53996	54001	50 %	50 %	0 %	0 %	399140273
67	NC_018265	AT	3	6	55216	55221	50 %	50 %	0 %	0 %	399140274
68	NC_018265	TC	3	6	55823	55828	0 %	50 %	0 %	50 %	399140274
69	NC_018265	AT	3	6	56097	56102	50 %	50 %	0 %	0 %	399140274
70	NC_018265	TC	3	6	59081	59086	0 %	50 %	0 %	50 %	399140277
71	NC_018265	TG	3	6	59829	59834	0 %	50 %	50 %	0 %	399140277
72	NC_018265	TA	3	6	61788	61793	50 %	50 %	0 %	0 %	399140279
73	NC_018265	AT	3	6	62473	62478	50 %	50 %	0 %	0 %	399140279
74	NC_018265	AT	3	6	63135	63140	50 %	50 %	0 %	0 %	399140279
75	NC_018265	TC	4	8	65458	65465	0 %	50 %	0 %	50 %	399140280
76	NC_018265	GT	3	6	65582	65587	0 %	50 %	50 %	0 %	399140280
77	NC_018265	TA	3	6	67014	67019	50 %	50 %	0 %	0 %	399140281
78	NC_018265	TA	3	6	71155	71160	50 %	50 %	0 %	0 %	399140285
79	NC_018265	CT	3	6	71183	71188	0 %	50 %	0 %	50 %	399140285
80	NC_018265	CA	3	6	74634	74639	50 %	0 %	0 %	50 %	399140288
81	NC_018265	AG	3	6	74748	74753	50 %	0 %	50 %	0 %	399140288
82	NC_018265	TG	3	6	80081	80086	0 %	50 %	50 %	0 %	399140292
83	NC_018265	GA	3	6	81037	81042	50 %	0 %	50 %	0 %	399140292
84	NC_018265	GA	3	6	83293	83298	50 %	0 %	50 %	0 %	399140293
85	NC_018265	AC	3	6	83751	83756	50 %	0 %	0 %	50 %	399140293
86	NC_018265	TA	4	8	86256	86263	50 %	50 %	0 %	0 %	399140294
87	NC_018265	AT	3	6	86283	86288	50 %	50 %	0 %	0 %	399140294
88	NC_018265	AT	3	6	87973	87978	50 %	50 %	0 %	0 %	399140295
89	NC_018265	GT	3	6	88704	88709	0 %	50 %	50 %	0 %	399140296
90	NC_018265	CT	3	6	88905	88910	0 %	50 %	0 %	50 %	399140296
91	NC_018265	TG	3	6	90505	90510	0 %	50 %	50 %	0 %	399140298
92	NC_018265	CT	3	6	90740	90745	0 %	50 %	0 %	50 %	399140298
93	NC_018265	TG	3	6	91092	91097	0 %	50 %	50 %	0 %	399140298
94	NC_018265	AC	3	6	91160	91165	50 %	0 %	0 %	50 %	399140298
95	NC_018265	AT	3	6	91662	91667	50 %	50 %	0 %	0 %	399140298
96	NC_018265	TC	3	6	92729	92734	0 %	50 %	0 %	50 %	399140300
97	NC_018265	GA	3	6	92902	92907	50 %	0 %	50 %	0 %	399140300
98	NC_018265	TC	3	6	93842	93847	0 %	50 %	0 %	50 %	399140300
99	NC_018265	TC	3	6	94031	94036	0 %	50 %	0 %	50 %	399140300
100	NC_018265	TA	3	6	95028	95033	50 %	50 %	0 %	0 %	399140301
101	NC_018265	AT	3	6	95120	95125	50 %	50 %	0 %	0 %	399140301
102	NC_018265	TA	3	6	96676	96681	50 %	50 %	0 %	0 %	399140303
103	NC_018265	TA	3	6	96985	96990	50 %	50 %	0 %	0 %	399140303
104	NC_018265	TA	3	6	102009	102014	50 %	50 %	0 %	0 %	399140305
105	NC_018265	CT	3	6	102755	102760	0 %	50 %	0 %	50 %	399140306
106	NC_018265	TC	3	6	102794	102799	0 %	50 %	0 %	50 %	399140306
107	NC_018265	TC	3	6	102955	102960	0 %	50 %	0 %	50 %	399140306
108	NC_018265	AG	3	6	103447	103452	50 %	0 %	50 %	0 %	399140307
109	NC_018265	AT	3	6	103803	103808	50 %	50 %	0 %	0 %	399140307
110	NC_018265	AT	3	6	104990	104995	50 %	50 %	0 %	0 %	399140308
111	NC_018265	GT	3	6	105194	105199	0 %	50 %	50 %	0 %	399140309
112	NC_018265	AT	4	8	105427	105434	50 %	50 %	0 %	0 %	399140309
113	NC_018265	AT	3	6	106282	106287	50 %	50 %	0 %	0 %	399140309
114	NC_018265	AT	3	6	106899	106904	50 %	50 %	0 %	0 %	399140309
115	NC_018265	AT	3	6	106977	106982	50 %	50 %	0 %	0 %	399140309
116	NC_018265	TA	3	6	108399	108404	50 %	50 %	0 %	0 %	399140312
117	NC_018265	TA	3	6	108651	108656	50 %	50 %	0 %	0 %	399140312
118	NC_018265	TA	3	6	108961	108966	50 %	50 %	0 %	0 %	399140312
119	NC_018265	GA	3	6	109207	109212	50 %	0 %	50 %	0 %	399140313
120	NC_018265	AG	3	6	109543	109548	50 %	0 %	50 %	0 %	399140313
121	NC_018265	AT	3	6	109636	109641	50 %	50 %	0 %	0 %	399140313
122	NC_018265	AT	3	6	109755	109760	50 %	50 %	0 %	0 %	399140313
123	NC_018265	AT	3	6	111627	111632	50 %	50 %	0 %	0 %	399140314
124	NC_018265	TA	3	6	111950	111955	50 %	50 %	0 %	0 %	399140314
125	NC_018265	TA	3	6	113510	113515	50 %	50 %	0 %	0 %	399140315
126	NC_018265	TA	3	6	114025	114030	50 %	50 %	0 %	0 %	399140315
127	NC_018265	TA	3	6	118589	118594	50 %	50 %	0 %	0 %	399140317
128	NC_018265	TC	3	6	119634	119639	0 %	50 %	0 %	50 %	399140318
129	NC_018265	GT	3	6	119677	119682	0 %	50 %	50 %	0 %	399140318
130	NC_018265	TA	3	6	121821	121826	50 %	50 %	0 %	0 %	399140320
131	NC_018265	GA	3	6	122670	122675	50 %	0 %	50 %	0 %	399140320
132	NC_018265	TG	3	6	122898	122903	0 %	50 %	50 %	0 %	399140321
133	NC_018265	TA	3	6	126830	126835	50 %	50 %	0 %	0 %	399140324
134	NC_018265	AG	3	6	127536	127541	50 %	0 %	50 %	0 %	399140325
135	NC_018265	AT	3	6	127610	127615	50 %	50 %	0 %	0 %	399140325
136	NC_018265	TA	3	6	127796	127801	50 %	50 %	0 %	0 %	399140325
137	NC_018265	TA	3	6	128492	128497	50 %	50 %	0 %	0 %	399140325
138	NC_018265	GA	3	6	128721	128726	50 %	0 %	50 %	0 %	399140325
139	NC_018265	TA	3	6	130327	130332	50 %	50 %	0 %	0 %	399140326
140	NC_018265	AT	3	6	130805	130810	50 %	50 %	0 %	0 %	399140327
141	NC_018265	AC	3	6	131776	131781	50 %	0 %	0 %	50 %	399140328
142	NC_018265	CA	3	6	131847	131852	50 %	0 %	0 %	50 %	399140328
143	NC_018265	AT	3	6	132239	132244	50 %	50 %	0 %	0 %	399140329
144	NC_018265	AT	3	6	133376	133381	50 %	50 %	0 %	0 %	399140330
145	NC_018265	AT	3	6	138766	138771	50 %	50 %	0 %	0 %	399140333
146	NC_018265	CT	3	6	138815	138820	0 %	50 %	0 %	50 %	399140333
147	NC_018265	AT	3	6	139903	139908	50 %	50 %	0 %	0 %	399140334
148	NC_018265	TG	3	6	140295	140300	0 %	50 %	50 %	0 %	399140335
149	NC_018265	GT	3	6	140366	140371	0 %	50 %	50 %	0 %	399140335
150	NC_018265	AT	3	6	141337	141342	50 %	50 %	0 %	0 %	399140336
151	NC_018265	TA	3	6	141815	141820	50 %	50 %	0 %	0 %	399140337
152	NC_018265	TC	3	6	143421	143426	0 %	50 %	0 %	50 %	399140338
153	NC_018265	AT	3	6	144345	144350	50 %	50 %	0 %	0 %	399140338
154	NC_018265	AT	3	6	144532	144537	50 %	50 %	0 %	0 %	399140338
155	NC_018265	CT	3	6	144606	144611	0 %	50 %	0 %	50 %	399140338
156	NC_018265	TA	3	6	145312	145317	50 %	50 %	0 %	0 %	399140339
157	NC_018265	CA	3	6	149244	149249	50 %	0 %	0 %	50 %	399140342
158	NC_018265	TC	3	6	149472	149477	0 %	50 %	0 %	50 %	399140343
159	NC_018265	AT	3	6	150320	150325	50 %	50 %	0 %	0 %	399140343
160	NC_018265	AT	4	8	152027	152034	50 %	50 %	0 %	0 %	399140345
161	NC_018265	TA	3	6	152750	152755	50 %	50 %	0 %	0 %	399140346
162	NC_018265	GT	3	6	152859	152864	0 %	50 %	50 %	0 %	399140346
163	NC_018265	TA	3	6	152940	152945	50 %	50 %	0 %	0 %	399140346
164	NC_018265	CT	3	6	153534	153539	0 %	50 %	0 %	50 %	399140346
165	NC_018265	GA	3	6	153864	153869	50 %	0 %	50 %	0 %	399140347
166	NC_018265	TA	3	6	153911	153916	50 %	50 %	0 %	0 %	399140347
167	NC_018265	AT	3	6	155172	155177	50 %	50 %	0 %	0 %	399140349
168	NC_018265	AT	3	6	155268	155273	50 %	50 %	0 %	0 %	399140349
169	NC_018265	CT	3	6	157350	157355	0 %	50 %	0 %	50 %	399140350
170	NC_018265	TC	3	6	157415	157420	0 %	50 %	0 %	50 %	399140350
171	NC_018265	TG	3	6	157912	157917	0 %	50 %	50 %	0 %	399140350
172	NC_018265	TC	3	6	158121	158126	0 %	50 %	0 %	50 %	399140350
173	NC_018265	TC	3	6	158588	158593	0 %	50 %	0 %	50 %	399140350
174	NC_018265	TA	3	6	158621	158626	50 %	50 %	0 %	0 %	399140350
175	NC_018265	TG	3	6	158977	158982	0 %	50 %	50 %	0 %	399140350
176	NC_018265	CT	3	6	160164	160169	0 %	50 %	0 %	50 %	399140351
177	NC_018265	AG	3	6	163724	163729	50 %	0 %	50 %	0 %	399140353
178	NC_018265	TA	3	6	164799	164804	50 %	50 %	0 %	0 %	399140354
179	NC_018265	TA	3	6	165170	165175	50 %	50 %	0 %	0 %	399140354
180	NC_018265	TA	3	6	166636	166641	50 %	50 %	0 %	0 %	399140355
181	NC_018265	GT	3	6	166895	166900	0 %	50 %	50 %	0 %	399140356
182	NC_018265	CA	3	6	169850	169855	50 %	0 %	0 %	50 %	399140359
183	NC_018265	GA	3	6	170007	170012	50 %	0 %	50 %	0 %	399140359
184	NC_018265	AT	3	6	170393	170398	50 %	50 %	0 %	0 %	399140360
185	NC_018265	TA	3	6	171611	171616	50 %	50 %	0 %	0 %	399140361
186	NC_018265	TA	3	6	173383	173388	50 %	50 %	0 %	0 %	399140362
187	NC_018265	AC	3	6	173617	173622	50 %	0 %	0 %	50 %	399140362
188	NC_018265	TC	3	6	173904	173909	0 %	50 %	0 %	50 %	399140363
189	NC_018265	TA	3	6	173957	173962	50 %	50 %	0 %	0 %	399140363
190	NC_018265	GA	3	6	174297	174302	50 %	0 %	50 %	0 %	399140363
191	NC_018265	TA	3	6	174426	174431	50 %	50 %	0 %	0 %	399140363
192	NC_018265	AT	3	6	175057	175062	50 %	50 %	0 %	0 %	399140364
193	NC_018265	AT	3	6	175075	175080	50 %	50 %	0 %	0 %	399140364
194	NC_018265	AT	3	6	178397	178402	50 %	50 %	0 %	0 %	399140367
195	NC_018265	AT	3	6	179012	179017	50 %	50 %	0 %	0 %	399140367
196	NC_018265	AT	3	6	179942	179947	50 %	50 %	0 %	0 %	399140368
197	NC_018265	AT	3	6	180555	180560	50 %	50 %	0 %	0 %	399140369
198	NC_018265	AT	3	6	182716	182721	50 %	50 %	0 %	0 %	399140371
199	NC_018265	GA	3	6	183845	183850	50 %	0 %	50 %	0 %	399140372
200	NC_018265	CA	3	6	184095	184100	50 %	0 %	0 %	50 %	399140373
201	NC_018265	TC	3	6	184276	184281	0 %	50 %	0 %	50 %	399140374
202	NC_018265	CA	3	6	186461	186466	50 %	0 %	0 %	50 %	399140375
203	NC_018265	CT	4	8	187418	187425	0 %	50 %	0 %	50 %	399140376
204	NC_018265	TG	3	6	187793	187798	0 %	50 %	50 %	0 %	399140376
205	NC_018265	TC	3	6	188847	188852	0 %	50 %	0 %	50 %	399140376
206	NC_018265	TC	3	6	189380	189385	0 %	50 %	0 %	50 %	399140376
207	NC_018265	TA	3	6	191979	191984	50 %	50 %	0 %	0 %	399140378
208	NC_018265	AG	3	6	193278	193283	50 %	0 %	50 %	0 %	399140379
209	NC_018265	AT	3	6	193441	193446	50 %	50 %	0 %	0 %	399140379
210	NC_018265	TA	3	6	194270	194275	50 %	50 %	0 %	0 %	399140379
211	NC_018265	GT	3	6	198255	198260	0 %	50 %	50 %	0 %	399140381
212	NC_018265	AT	3	6	198566	198571	50 %	50 %	0 %	0 %	399140381
213	NC_018265	GT	3	6	198816	198821	0 %	50 %	50 %	0 %	399140381

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.