MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Mycoplasma bovis HB0801 chromosome

Total Repeats: 480

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018077	ATTTTT	2	12	3353	3364	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	392429598
2	NC_018077	ACCTTT	2	12	4371	4382	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	392429598
3	NC_018077	AATTAG	2	12	7562	7573	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	392429601
4	NC_018077	AACTTC	2	12	10979	10990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392429604
5	NC_018077	TTCCTT	2	12	11432	11443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392429605
6	NC_018077	CCAATA	2	12	11926	11937	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	392429605
7	NC_018077	TTTTCA	2	12	12062	12073	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	392429606
8	NC_018077	AATCAA	2	12	13398	13409	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	392429608
9	NC_018077	TTAAAA	2	12	13999	14010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392429609
10	NC_018077	CAAAAT	2	12	18815	18826	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	392429613
11	NC_018077	CCACTA	2	12	18984	18995	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	392429613
12	NC_018077	ATGAAG	2	12	21895	21906	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	392429616
13	NC_018077	AATATT	2	12	23681	23692	50 %	50 %	0 %	0 %	392429618
14	NC_018077	CCATTT	2	12	23781	23792	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	392429618
15	NC_018077	TTTACA	2	12	28030	28041	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	392429622
16	NC_018077	AGTTAA	2	12	29055	29066	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	392429622
17	NC_018077	AATTTC	2	12	30572	30583	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	392429623
18	NC_018077	AAAATA	2	12	31668	31679	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	392429625
19	NC_018077	TTGACT	2	12	32770	32781	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	392429626
20	NC_018077	CTTTTC	2	12	33140	33151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392429627
21	NC_018077	ACCAGA	2	12	34079	34090	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	392429627
22	NC_018077	ATTCAT	2	12	35922	35933	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	392429628
23	NC_018077	TTCTCT	2	12	36897	36908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392429629
24	NC_018077	ACCTTT	2	12	41297	41308	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	392429632
25	NC_018077	AGCTCT	2	12	41645	41656	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	392429632
26	NC_018077	TTAGTT	2	12	45765	45776	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	392429632
27	NC_018077	AGTTTA	2	12	49266	49277	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	392429632
28	NC_018077	GAAAAT	2	12	53360	53371	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	392429634
29	NC_018077	TAAGTA	2	12	54936	54947	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	392429636
30	NC_018077	AAATGA	2	12	58367	58378	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	392429640
31	NC_018077	ATGAAC	2	12	58714	58725	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	392429640
32	NC_018077	TAAGTG	2	12	59420	59431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392429641
33	NC_018077	CCAATT	2	12	66418	66429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392429647
34	NC_018077	TCAGTT	2	12	67981	67992	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	392429649
35	NC_018077	GAAAAT	2	12	70057	70068	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	392429652
36	NC_018077	TAAGAA	2	12	70163	70174	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	392429652
37	NC_018077	AGCTCT	2	12	72257	72268	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	392429654
38	NC_018077	TCAAAA	2	12	72737	72748	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	392429654
39	NC_018077	TAATTT	2	12	73522	73533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392429655
40	NC_018077	TTTTGA	2	12	75708	75719	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	392429658
41	NC_018077	GACAAA	2	12	75736	75747	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	392429658
42	NC_018077	ATGCAA	2	12	77503	77514	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	392429659
43	NC_018077	TGAAAA	2	12	78005	78016	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	392429659
44	NC_018077	AGTTAA	2	12	82017	82028	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	392429663
45	NC_018077	GCTTCA	2	12	86953	86964	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	392429664
46	NC_018077	AATTGA	2	12	97585	97596	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	392429674
47	NC_018077	TTATCT	2	12	97882	97893	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	392429675
48	NC_018077	TAAATA	2	12	99415	99426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392429677
49	NC_018077	TGTTCG	2	12	101004	101015	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	392429679
50	NC_018077	CCTGTT	2	12	101134	101145	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	392429679
51	NC_018077	CTTTGA	2	12	101783	101794	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	392429680
52	NC_018077	AACTCC	2	12	101894	101905	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	392429680
53	NC_018077	AGAATT	2	12	103755	103766	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	392429682
54	NC_018077	TGAAAA	2	12	106056	106067	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	392429685
55	NC_018077	TGTTTT	2	12	110269	110280	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	392429691
56	NC_018077	TTGATG	2	12	111821	111832	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	392429693
57	NC_018077	GAAAAA	2	12	112603	112614	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	392429693
58	NC_018077	TTAGCT	2	12	116429	116440	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	392429697
59	NC_018077	CACCCA	2	12	116483	116494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392429697
60	NC_018077	GAATCT	2	12	118860	118871	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	392429700
61	NC_018077	TTAGAA	2	12	120702	120713	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	392429702
62	NC_018077	TGTATT	2	12	123897	123908	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	392429703
63	NC_018077	AATTAA	2	12	125828	125839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392429704
64	NC_018077	TCTGGT	2	12	126086	126097	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	392429705
65	NC_018077	TTTAAA	2	12	126307	126318	50 %	50 %	0 %	0 %	392429705
66	NC_018077	TGAAGT	2	12	128660	128671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392429706
67	NC_018077	GAATAT	2	12	130374	130385	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	392429707
68	NC_018077	ATATTT	2	12	130684	130695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392429708
69	NC_018077	ATATAG	2	12	133784	133795	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	392429710
70	NC_018077	GTTCCT	2	12	146016	146027	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	392429722
71	NC_018077	AAGCAA	2	12	147346	147357	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	392429722
72	NC_018077	GAAAAT	2	12	147995	148006	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	392429723
73	NC_018077	AAATCA	2	12	148255	148266	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	392429723
74	NC_018077	GACATT	2	12	152185	152196	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	392429725
75	NC_018077	CACTGA	2	12	155349	155360	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	392429728
76	NC_018077	TAATGG	2	12	155373	155384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392429728
77	NC_018077	GACAAA	2	12	155710	155721	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	392429728
78	NC_018077	GAAAAT	2	12	156585	156596	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	392429729
79	NC_018077	AAATCA	2	12	156845	156856	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	392429729
80	NC_018077	ACAAAA	2	12	158490	158501	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	392429731
81	NC_018077	TGATAA	2	12	159085	159096	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	392429731
82	NC_018077	AAAATT	2	12	165158	165169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392429736
83	NC_018077	ACAAGC	2	12	165954	165965	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	392429736
84	NC_018077	ACTTTG	2	12	167043	167054	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	392429736
85	NC_018077	CTTTTT	2	12	168987	168998	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	392429737
86	NC_018077	CAAAAA	2	12	171134	171145	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	392429739
87	NC_018077	GGAAAT	2	12	172168	172179	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	392429740
88	NC_018077	TGGTTA	2	12	173893	173904	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	392429742
89	NC_018077	TAATGC	2	12	175099	175110	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	392429743
90	NC_018077	TGTAAA	2	12	178886	178897	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	392429746
91	NC_018077	AATGGC	2	12	179336	179347	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	392429746
92	NC_018077	TAAGAT	2	12	179552	179563	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	392429746
93	NC_018077	TAGCAC	2	12	180779	180790	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	392429747
94	NC_018077	CATATG	2	12	186314	186325	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	392429752
95	NC_018077	GTTTTG	2	12	191429	191440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392429753
96	NC_018077	TTAAAT	2	12	192697	192708	50 %	50 %	0 %	0 %	392429755
97	NC_018077	ATTTTT	2	12	193038	193049	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	392429755
98	NC_018077	TTTATA	2	12	193898	193909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392429756
99	NC_018077	TTTTCT	2	12	196305	196316	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	392429758
100	NC_018077	ATCAAA	2	12	196338	196349	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	392429758
101	NC_018077	AATTTT	2	12	196803	196814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392429758
102	NC_018077	TCAAAT	2	12	197998	198009	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	392429759
103	NC_018077	GACAAA	2	12	199378	199389	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	392429759
104	NC_018077	TTGGTG	2	12	199397	199408	0 %	50 %	50 %	0 %	392429759
105	NC_018077	TTATGG	2	12	199575	199586	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	392429759
106	NC_018077	AAAATA	2	12	199833	199844	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	392429759
107	NC_018077	AATATC	3	18	203469	203486	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	392429761
108	NC_018077	AAATTG	2	12	206565	206576	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	392429763
109	NC_018077	AAATAC	2	12	211689	211700	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	392429767
110	NC_018077	ATTTAT	2	12	217587	217598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392429771
111	NC_018077	AAATTG	2	12	217992	218003	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	392429772
112	NC_018077	CAGAAA	2	12	218234	218245	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	392429772
113	NC_018077	GTGTTT	2	12	222537	222548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392429775
114	NC_018077	TTTCAT	2	12	223727	223738	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	392429776
115	NC_018077	TATATT	2	12	226081	226092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392429778
116	NC_018077	AATTTA	2	12	226370	226381	50 %	50 %	0 %	0 %	392429778
117	NC_018077	GTAATA	2	12	227160	227171	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	392429778
118	NC_018077	GCTTTA	2	12	227784	227795	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	392429779
119	NC_018077	CAACTG	2	12	228662	228673	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	392429780
120	NC_018077	TGAGCC	2	12	228711	228722	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	392429780
121	NC_018077	CATATT	2	12	229346	229357	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	392429781
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127	NC_018077	GTTCAT	2	12	238305	238316	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	392429787
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235	NC_018077	TAATTG	2	12	466178	466189	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	392429972
236	NC_018077	TAAAAC	2	12	466557	466568	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	392429972
237	NC_018077	AAGTTG	2	12	467207	467218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392429972
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