MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium chubuense NBB4 chromosome

Total Repeats: 143386

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_018027	TCG	3	9	113120	113128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414021
3002	NC_018027	GAG	2	6	113182	113187	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392414021
3003	NC_018027	GTG	2	6	113233	113238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392414021
3004	NC_018027	CG	3	6	113240	113245	0 %	0 %	50 %	50 %	392414021
3005	NC_018027	TCG	2	6	113261	113266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414021
3006	NC_018027	TGC	2	6	113270	113275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414021
3007	NC_018027	TCA	2	6	113288	113293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392414021
3008	NC_018027	CGG	2	6	113307	113312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414021
3009	NC_018027	TCA	2	6	113408	113413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392414021
3010	NC_018027	GAC	2	6	113466	113471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414021
3011	NC_018027	CGT	2	6	113550	113555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414021
3012	NC_018027	GAC	2	6	113559	113564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414021
3013	NC_018027	CCG	2	6	113604	113609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414022
3014	NC_018027	GC	3	6	113617	113622	0 %	0 %	50 %	50 %	392414022
3015	NC_018027	GCC	2	6	113639	113644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414022
3016	NC_018027	CG	3	6	113671	113676	0 %	0 %	50 %	50 %	392414022
3017	NC_018027	TCG	2	6	113709	113714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414022
3018	NC_018027	CTA	2	6	113749	113754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392414022
3019	NC_018027	TGC	2	6	113766	113771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414022
3020	NC_018027	GTC	2	6	113813	113818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414022
3021	NC_018027	GGC	2	6	113819	113824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414022
3022	NC_018027	TCG	2	6	113835	113840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414022
3023	NC_018027	TGG	2	6	113868	113873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392414022
3024	NC_018027	CTT	2	6	113926	113931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392414022
3025	NC_018027	CGC	2	6	113956	113961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414022
3026	NC_018027	CGT	2	6	113965	113970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414022
3027	NC_018027	GAG	2	6	114041	114046	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392414022
3028	NC_018027	ATC	2	6	114125	114130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392414022
3029	NC_018027	ATC	2	6	114149	114154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392414022
3030	NC_018027	CAC	3	9	114178	114186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392414022
3031	NC_018027	ACT	2	6	114222	114227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392414022
3032	NC_018027	GAC	2	6	114248	114253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414022
3033	NC_018027	TCGT	2	8	114263	114270	0 %	50 %	25 %	25 %	392414022
3034	NC_018027	TCA	2	6	114279	114284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392414022
3035	NC_018027	ATC	2	6	114290	114295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392414022
3036	NC_018027	CTA	2	6	114313	114318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392414022
3037	NC_018027	GCG	2	6	114333	114338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414022
3038	NC_018027	GC	3	6	114376	114381	0 %	0 %	50 %	50 %	392414022
3039	NC_018027	GTC	2	6	114404	114409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414022
3040	NC_018027	GCG	2	6	114466	114471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414022
3041	NC_018027	GCC	2	6	114501	114506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414023
3042	NC_018027	TCG	2	6	114545	114550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414023
3043	NC_018027	GAT	2	6	114609	114614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392414023
3044	NC_018027	GCC	2	6	114616	114621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414023
3045	NC_018027	CGGTC	2	10	114622	114631	0 %	20 %	40 %	40 %	392414023
3046	NC_018027	CGA	2	6	114714	114719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414023
3047	NC_018027	ATC	2	6	114733	114738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392414023
3048	NC_018027	CGT	2	6	114780	114785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414023
3049	NC_018027	CCA	2	6	114800	114805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392414023
3050	NC_018027	CAA	2	6	114816	114821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392414023
3051	NC_018027	CGA	2	6	114851	114856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414023
3052	NC_018027	ACGTC	2	10	114887	114896	20 %	20 %	20 %	40 %	392414023
3053	NC_018027	GTG	2	6	114931	114936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392414023
3054	NC_018027	GCCA	2	8	114943	114950	25 %	0 %	25 %	50 %	392414023
3055	NC_018027	GCT	2	6	115101	115106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414023
3056	NC_018027	ACC	2	6	115174	115179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392414023
3057	NC_018027	AGC	2	6	115196	115201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414023
3058	NC_018027	CGG	2	6	115251	115256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414023
3059	NC_018027	GCG	2	6	115271	115276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414023
3060	NC_018027	ACG	2	6	115373	115378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414023
3061	NC_018027	TCG	2	6	115396	115401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414023
3062	NC_018027	CGG	2	6	115404	115409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414023
3063	NC_018027	GGC	2	6	115501	115506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414023
3064	NC_018027	GCT	2	6	115523	115528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414023
3065	NC_018027	TCT	2	6	115714	115719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392414024
3066	NC_018027	CTG	2	6	115731	115736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414024
3067	NC_018027	ATC	3	9	115749	115757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392414024
3068	NC_018027	TCT	2	6	115804	115809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392414024
3069	NC_018027	GC	3	6	115826	115831	0 %	0 %	50 %	50 %	392414024
3070	NC_018027	CGG	2	6	115895	115900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414024
3071	NC_018027	AAGGTC	2	12	115905	115916	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	392414024
3072	NC_018027	CGA	2	6	115949	115954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414024
3073	NC_018027	ACC	2	6	115956	115961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392414024
3074	NC_018027	ACCTGA	2	12	115975	115986	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	392414024
3075	NC_018027	CAA	2	6	116024	116029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392414024
3076	NC_018027	CGG	2	6	116042	116047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414024
3077	NC_018027	CA	3	6	116066	116071	50 %	0 %	0 %	50 %	392414024
3078	NC_018027	CGG	2	6	116099	116104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414024
3079	NC_018027	CCGG	2	8	116108	116115	0 %	0 %	50 %	50 %	392414024
3080	NC_018027	CAA	2	6	116144	116149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392414024
3081	NC_018027	CCAGGG	2	12	116177	116188	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	392414024
3082	NC_018027	CAG	3	9	116313	116321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414024
3083	NC_018027	CGA	2	6	116324	116329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414024
3084	NC_018027	GAA	2	6	116336	116341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392414024
3085	NC_018027	GAA	2	6	116366	116371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392414024
3086	NC_018027	GTCG	2	8	116393	116400	0 %	25 %	50 %	25 %	392414024
3087	NC_018027	CGG	2	6	116416	116421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414024
3088	NC_018027	CTG	2	6	116436	116441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414024
3089	NC_018027	CCGC	2	8	116450	116457	0 %	0 %	25 %	75 %	392414024
3090	NC_018027	TGC	2	6	116458	116463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414024
3091	NC_018027	CAG	2	6	116493	116498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414024
3092	NC_018027	TCT	2	6	116531	116536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392414024
3093	NC_018027	ATC	2	6	116562	116567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392414024
3094	NC_018027	CTT	2	6	116594	116599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392414024
3095	NC_018027	CGG	2	6	116648	116653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414024
3096	NC_018027	CAC	2	6	116797	116802	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392414025
3097	NC_018027	TAC	2	6	116831	116836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392414025
3098	NC_018027	GTC	2	6	116939	116944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414025
3099	NC_018027	GGC	2	6	116960	116965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414025
3100	NC_018027	GGC	2	6	116989	116994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414025
3101	NC_018027	GCC	2	6	117018	117023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414025
3102	NC_018027	GATC	2	8	117034	117041	25 %	25 %	25 %	25 %	392414025
3103	NC_018027	CGA	2	6	117049	117054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414025
3104	NC_018027	GC	3	6	117061	117066	0 %	0 %	50 %	50 %	392414025
3105	NC_018027	TTC	2	6	117075	117080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392414025
3106	NC_018027	ACG	2	6	117114	117119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414025
3107	NC_018027	GCG	2	6	117227	117232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414025
3108	NC_018027	CGA	2	6	117274	117279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414025
3109	NC_018027	CTG	2	6	117293	117298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414025
3110	NC_018027	GCCAAC	2	12	117299	117310	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	392414025
3111	NC_018027	CGC	2	6	117382	117387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414025
3112	NC_018027	CAGC	2	8	117412	117419	25 %	0 %	25 %	50 %	392414025
3113	NC_018027	CGA	2	6	117466	117471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414025
3114	NC_018027	AGC	2	6	117498	117503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414025
3115	NC_018027	CG	3	6	117529	117534	0 %	0 %	50 %	50 %	392414025
3116	NC_018027	TCG	2	6	117546	117551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414025
3117	NC_018027	GTCCG	2	10	117604	117613	0 %	20 %	40 %	40 %	392414025
3118	NC_018027	TCG	2	6	117666	117671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414025
3119	NC_018027	CGC	2	6	117673	117678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414025
3120	NC_018027	AAG	2	6	117683	117688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392414025
3121	NC_018027	GAG	2	6	117704	117709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392414025
3122	NC_018027	CCCGA	2	10	117746	117755	20 %	0 %	20 %	60 %	392414025
3123	NC_018027	CCG	2	6	117782	117787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414025
3124	NC_018027	CGG	2	6	117831	117836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414025
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3126	NC_018027	CCGG	2	8	117886	117893	0 %	0 %	50 %	50 %	392414025
3127	NC_018027	GTCG	2	8	117919	117926	0 %	25 %	50 %	25 %	392414025
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3132	NC_018027	GCC	2	6	118174	118179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414025
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3134	NC_018027	GCCGGG	2	12	118204	118215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414025
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3220	NC_018027	GCA	2	6	121810	121815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414028
3221	NC_018027	GGC	2	6	121816	121821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414028
3222	NC_018027	GTC	2	6	121898	121903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414028
3223	NC_018027	ACA	2	6	121923	121928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392414028
3224	NC_018027	CTG	2	6	122009	122014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414028
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3226	NC_018027	TCCTG	2	10	122292	122301	0 %	40 %	20 %	40 %	392414028
3227	NC_018027	CCGG	2	8	122340	122347	0 %	0 %	50 %	50 %	392414028
3228	NC_018027	CAA	2	6	122368	122373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392414028
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3230	NC_018027	C	6	6	122446	122451	0 %	0 %	0 %	100 %	392414028
3231	NC_018027	CAG	2	6	122480	122485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414028
3232	NC_018027	GCC	2	6	122518	122523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414028
3233	NC_018027	CAC	2	6	122527	122532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392414028
3234	NC_018027	AGC	2	6	122549	122554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414028
3235	NC_018027	GGT	2	6	122560	122565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392414028
3236	NC_018027	GAC	2	6	122615	122620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414028
3237	NC_018027	ACCG	2	8	122733	122740	25 %	0 %	25 %	50 %	392414029
3238	NC_018027	CGC	2	6	122808	122813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414029
3239	NC_018027	CG	3	6	122857	122862	0 %	0 %	50 %	50 %	392414029
3240	NC_018027	GCC	2	6	122863	122868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414029
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3352	NC_018027	ATC	2	6	126295	126300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392414033
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3355	NC_018027	CTCGG	2	10	126346	126355	0 %	20 %	40 %	40 %	392414033
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3357	NC_018027	GCC	2	6	126426	126431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414034
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3359	NC_018027	CGA	2	6	126491	126496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414034
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3481	NC_018027	CCG	2	6	131273	131278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414039
3482	NC_018027	CGGC	2	8	131302	131309	0 %	0 %	50 %	50 %	392414039
3483	NC_018027	CGC	2	6	131312	131317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414039
3484	NC_018027	CCG	2	6	131326	131331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414039
3485	NC_018027	GTG	2	6	131361	131366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392414039
3486	NC_018027	CGGCG	2	10	131441	131450	0 %	0 %	60 %	40 %	392414039
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3489	NC_018027	CG	3	6	131544	131549	0 %	0 %	50 %	50 %	392414040
3490	NC_018027	GCG	2	6	131610	131615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414040
3491	NC_018027	GTG	2	6	131634	131639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392414040
3492	NC_018027	CGG	2	6	131668	131673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414040
3493	NC_018027	TGA	2	6	131695	131700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392414040
3494	NC_018027	CGG	2	6	131732	131737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414040
3495	NC_018027	CGG	2	6	131755	131760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414040
3496	NC_018027	CGA	2	6	131770	131775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414040
3497	NC_018027	GCC	2	6	131829	131834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414040
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3499	NC_018027	CGTCGC	2	12	131857	131868	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	392414040
3500	NC_018027	TCG	2	6	131883	131888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414040

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