MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium chubuense NBB4 chromosome

Total Repeats: 143386

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_018027	CGG	2	6	189682	189687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414098
5002	NC_018027	GCTGGC	2	12	189714	189725	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	392414098
5003	NC_018027	CTG	2	6	189739	189744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414098
5004	NC_018027	AC	3	6	189783	189788	50 %	0 %	0 %	50 %	392414098
5005	NC_018027	GTG	2	6	189871	189876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392414098
5006	NC_018027	CGCT	2	8	189883	189890	0 %	25 %	25 %	50 %	392414098
5007	NC_018027	CGC	3	9	189897	189905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414098
5008	NC_018027	GCT	2	6	189951	189956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414098
5009	NC_018027	CCGT	2	8	189987	189994	0 %	25 %	25 %	50 %	392414099
5010	NC_018027	CG	4	8	190022	190029	0 %	0 %	50 %	50 %	392414099
5011	NC_018027	ACC	2	6	190032	190037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392414099
5012	NC_018027	CGACGC	2	12	190061	190072	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	392414099
5013	NC_018027	GCT	2	6	190079	190084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414099
5014	NC_018027	CGG	3	9	190115	190123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414099
5015	NC_018027	CGGC	2	8	190132	190139	0 %	0 %	50 %	50 %	392414099
5016	NC_018027	CGA	2	6	190199	190204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414099
5017	NC_018027	TCG	2	6	190225	190230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414099
5018	NC_018027	CGA	2	6	190244	190249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414099
5019	NC_018027	CGT	2	6	190294	190299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414099
5020	NC_018027	CGC	2	6	190301	190306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414099
5021	NC_018027	GCT	2	6	190316	190321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414099
5022	NC_018027	GCG	2	6	190359	190364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414099
5023	NC_018027	CCG	2	6	190378	190383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414099
5024	NC_018027	TGG	2	6	190420	190425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392414099
5025	NC_018027	GCG	2	6	190459	190464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414099
5026	NC_018027	GCT	2	6	190466	190471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414099
5027	NC_018027	CGT	2	6	190490	190495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414099
5028	NC_018027	CGGCC	2	10	190510	190519	0 %	0 %	40 %	60 %	392414099
5029	NC_018027	CTT	2	6	190547	190552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392414099
5030	NC_018027	TCGATC	2	12	190588	190599	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	392414099
5031	NC_018027	GCT	2	6	190619	190624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414099
5032	NC_018027	GCC	3	9	190626	190634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414099
5033	NC_018027	TCC	2	6	190650	190655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392414099
5034	NC_018027	CGGC	2	8	190656	190663	0 %	0 %	50 %	50 %	392414099
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5037	NC_018027	GCCG	2	8	190710	190717	0 %	0 %	50 %	50 %	392414099
5038	NC_018027	GC	3	6	190757	190762	0 %	0 %	50 %	50 %	392414099
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5042	NC_018027	CGG	2	6	190879	190884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414099
5043	NC_018027	CGG	3	9	190910	190918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414099
5044	NC_018027	GTC	2	6	190923	190928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414099
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5047	NC_018027	CGA	2	6	190979	190984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414099
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5050	NC_018027	GCCG	2	8	191078	191085	0 %	0 %	50 %	50 %	392414099
5051	NC_018027	CGCC	2	8	191121	191128	0 %	0 %	25 %	75 %	392414100
5052	NC_018027	TCG	2	6	191151	191156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414100
5053	NC_018027	GGC	2	6	191161	191166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414100
5054	NC_018027	CGC	2	6	191175	191180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414100
5055	NC_018027	ACG	2	6	191199	191204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414100
5056	NC_018027	GGC	2	6	191210	191215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414100
5057	NC_018027	TGC	2	6	191220	191225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414100
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5060	NC_018027	AGGC	2	8	191312	191319	25 %	0 %	50 %	25 %	392414100
5061	NC_018027	GAC	3	9	191351	191359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414100
5062	NC_018027	CG	3	6	191369	191374	0 %	0 %	50 %	50 %	392414100
5063	NC_018027	CGA	2	6	191422	191427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414100
5064	NC_018027	GCACC	2	10	191458	191467	20 %	0 %	20 %	60 %	392414100
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5066	NC_018027	GGCTG	2	10	191491	191500	0 %	20 %	60 %	20 %	392414100
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5071	NC_018027	GAC	2	6	191700	191705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414100
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5091	NC_018027	GCCG	2	8	192304	192311	0 %	0 %	50 %	50 %	392414100
5092	NC_018027	CGC	2	6	192343	192348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414100
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5102	NC_018027	GC	3	6	192687	192692	0 %	0 %	50 %	50 %	392414101
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5364	NC_018027	TCG	2	6	202256	202261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414108
5365	NC_018027	CGA	2	6	202311	202316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414108
5366	NC_018027	TCT	2	6	202329	202334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392414108
5367	NC_018027	CCG	2	6	202338	202343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414108
5368	NC_018027	GCC	2	6	202388	202393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414108
5369	NC_018027	CTC	2	6	202417	202422	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392414108
5370	NC_018027	CGTC	2	8	202431	202438	0 %	25 %	25 %	50 %	392414108
5371	NC_018027	CGC	3	9	202447	202455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414108
5372	NC_018027	CGC	2	6	202473	202478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414108
5373	NC_018027	CGC	3	9	202527	202535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414108
5374	NC_018027	AGT	2	6	202587	202592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392414108
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5380	NC_018027	ACG	2	6	202748	202753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414108
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5382	NC_018027	GCG	3	9	202784	202792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414108
5383	NC_018027	C	6	6	202803	202808	0 %	0 %	0 %	100 %	392414108
5384	NC_018027	CGA	2	6	202812	202817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414108
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5389	NC_018027	AGC	2	6	203219	203224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414109
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5391	NC_018027	CGC	2	6	203314	203319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414109
5392	NC_018027	CGC	2	6	203356	203361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414109
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5400	NC_018027	GTC	2	6	203564	203569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414109
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5404	NC_018027	CCGG	2	8	203644	203651	0 %	0 %	50 %	50 %	392414109
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5407	NC_018027	CGC	2	6	203763	203768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414109
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5430	NC_018027	CGA	2	6	204446	204451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414110
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5434	NC_018027	GAC	2	6	204580	204585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414110
5435	NC_018027	TGC	2	6	204762	204767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414111
5436	NC_018027	GGC	2	6	204772	204777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414111
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5438	NC_018027	CACC	2	8	204827	204834	25 %	0 %	0 %	75 %	392414111
5439	NC_018027	CGC	2	6	204847	204852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414111
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5443	NC_018027	CGG	2	6	204943	204948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414111
5444	NC_018027	TGG	2	6	204966	204971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392414111
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5446	NC_018027	CGG	2	6	205026	205031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414111
5447	NC_018027	AGC	3	9	205071	205079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414111
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5449	NC_018027	CGA	2	6	205119	205124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414111
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5451	NC_018027	TCA	2	6	205227	205232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392414111
5452	NC_018027	GAC	2	6	205247	205252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414111
5453	NC_018027	TGGCCC	2	12	205275	205286	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	392414111
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5455	NC_018027	GGCT	2	8	205478	205485	0 %	25 %	50 %	25 %	392414111
5456	NC_018027	CG	3	6	205537	205542	0 %	0 %	50 %	50 %	392414111
5457	NC_018027	ATG	2	6	205544	205549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392414111
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5462	NC_018027	CTG	3	9	205832	205840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414111
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5464	NC_018027	CGG	2	6	205906	205911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414111
5465	NC_018027	CAC	2	6	205984	205989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392414111
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5468	NC_018027	GCT	2	6	206047	206052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414111
5469	NC_018027	CGT	2	6	206056	206061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414111
5470	NC_018027	CGA	2	6	206083	206088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414111
5471	NC_018027	GGA	2	6	206110	206115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392414111
5472	NC_018027	TGGCCG	2	12	206130	206141	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	392414111
5473	NC_018027	CGA	2	6	206166	206171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414111
5474	NC_018027	GCA	2	6	206194	206199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414111
5475	NC_018027	CG	3	6	206205	206210	0 %	0 %	50 %	50 %	392414111
5476	NC_018027	GTTCC	2	10	206237	206246	0 %	40 %	20 %	40 %	392414111
5477	NC_018027	CGGT	2	8	206253	206260	0 %	25 %	50 %	25 %	392414111
5478	NC_018027	CTG	3	9	206264	206272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414111
5479	NC_018027	GCT	3	9	206278	206286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414111
5480	NC_018027	GTC	2	6	206363	206368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414111
5481	NC_018027	TTC	2	6	206378	206383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392414111
5482	NC_018027	TGC	2	6	206394	206399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414111
5483	NC_018027	TGC	2	6	206424	206429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414111
5484	NC_018027	CGA	2	6	206458	206463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414111
5485	NC_018027	GCC	2	6	206465	206470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414111
5486	NC_018027	CGA	2	6	206530	206535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414112
5487	NC_018027	CCG	2	6	206604	206609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414112
5488	NC_018027	CCG	2	6	206754	206759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414112
5489	NC_018027	CG	4	8	206776	206783	0 %	0 %	50 %	50 %	392414112
5490	NC_018027	GGA	2	6	206806	206811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392414112
5491	NC_018027	CGC	2	6	206815	206820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414112
5492	NC_018027	CGG	2	6	206866	206871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392414112
5493	NC_018027	GCA	2	6	207025	207030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392414113
5494	NC_018027	CCG	2	6	207105	207110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392414113
5495	NC_018027	TTGTCG	2	12	207189	207200	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	392414113
5496	NC_018027	GTG	2	6	207201	207206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392414113
5497	NC_018027	CGT	2	6	207256	207261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392414113
5498	NC_018027	CCTCGT	2	12	207262	207273	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	392414113
5499	NC_018027	TCC	2	6	207306	207311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392414113
5500	NC_018027	CAC	2	6	207394	207399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392414113

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