MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium chubuense NBB4 plasmid pMYCCH.02

Total Repeats: 239

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018023	CG	3	6	1352	1357	0 %	0 %	50 %	50 %	392406270
2	NC_018023	TC	3	6	1526	1531	0 %	50 %	0 %	50 %	392406270
3	NC_018023	CG	3	6	2241	2246	0 %	0 %	50 %	50 %	392406270
4	NC_018023	CG	3	6	2743	2748	0 %	0 %	50 %	50 %	392406271
5	NC_018023	CG	3	6	3428	3433	0 %	0 %	50 %	50 %	392406271
6	NC_018023	CG	3	6	4593	4598	0 %	0 %	50 %	50 %	392406272
7	NC_018023	AG	3	6	8079	8084	50 %	0 %	50 %	0 %	392406276
8	NC_018023	CA	3	6	8387	8392	50 %	0 %	0 %	50 %	392406276
9	NC_018023	GC	4	8	8930	8937	0 %	0 %	50 %	50 %	392406277
10	NC_018023	TC	3	6	9261	9266	0 %	50 %	0 %	50 %	392406277
11	NC_018023	CG	4	8	9319	9326	0 %	0 %	50 %	50 %	392406277
12	NC_018023	AC	3	6	9585	9590	50 %	0 %	0 %	50 %	392406277
13	NC_018023	GC	3	6	11286	11291	0 %	0 %	50 %	50 %	392406278
14	NC_018023	AC	3	6	11588	11593	50 %	0 %	0 %	50 %	392406279
15	NC_018023	GC	3	6	11812	11817	0 %	0 %	50 %	50 %	392406279
16	NC_018023	AC	3	6	11963	11968	50 %	0 %	0 %	50 %	392406279
17	NC_018023	GC	3	6	12241	12246	0 %	0 %	50 %	50 %	392406280
18	NC_018023	AT	3	6	12660	12665	50 %	50 %	0 %	0 %	392406280
19	NC_018023	AT	3	6	13588	13593	50 %	50 %	0 %	0 %	392406281
20	NC_018023	GC	3	6	14068	14073	0 %	0 %	50 %	50 %	392406281
21	NC_018023	CG	3	6	16262	16267	0 %	0 %	50 %	50 %	392406282
22	NC_018023	CG	3	6	16394	16399	0 %	0 %	50 %	50 %	392406282
23	NC_018023	GT	3	6	16707	16712	0 %	50 %	50 %	0 %	392406282
24	NC_018023	GC	3	6	17730	17735	0 %	0 %	50 %	50 %	392406283
25	NC_018023	GC	3	6	18264	18269	0 %	0 %	50 %	50 %	392406283
26	NC_018023	CG	3	6	19068	19073	0 %	0 %	50 %	50 %	392406284
27	NC_018023	GC	3	6	19077	19082	0 %	0 %	50 %	50 %	392406284
28	NC_018023	CG	3	6	19420	19425	0 %	0 %	50 %	50 %	392406284
29	NC_018023	GC	3	6	22516	22521	0 %	0 %	50 %	50 %	392406287
30	NC_018023	CG	3	6	22651	22656	0 %	0 %	50 %	50 %	392406287
31	NC_018023	GC	3	6	23342	23347	0 %	0 %	50 %	50 %	392406288
32	NC_018023	GC	4	8	23546	23553	0 %	0 %	50 %	50 %	392406288
33	NC_018023	GC	3	6	23765	23770	0 %	0 %	50 %	50 %	392406289
34	NC_018023	CA	3	6	24580	24585	50 %	0 %	0 %	50 %	392406290
35	NC_018023	GC	3	6	24615	24620	0 %	0 %	50 %	50 %	392406290
36	NC_018023	AC	3	6	25060	25065	50 %	0 %	0 %	50 %	392406290
37	NC_018023	GT	3	6	26261	26266	0 %	50 %	50 %	0 %	392406292
38	NC_018023	CG	3	6	26396	26401	0 %	0 %	50 %	50 %	392406292
39	NC_018023	GC	4	8	26952	26959	0 %	0 %	50 %	50 %	392406292
40	NC_018023	CA	3	6	27987	27992	50 %	0 %	0 %	50 %	392406293
41	NC_018023	AG	3	6	28042	28047	50 %	0 %	50 %	0 %	392406293
42	NC_018023	GC	3	6	28159	28164	0 %	0 %	50 %	50 %	392406293
43	NC_018023	GC	3	6	28506	28511	0 %	0 %	50 %	50 %	392406293
44	NC_018023	CG	3	6	28854	28859	0 %	0 %	50 %	50 %	392406294
45	NC_018023	TC	3	6	29409	29414	0 %	50 %	0 %	50 %	392406294
46	NC_018023	CA	3	6	30300	30305	50 %	0 %	0 %	50 %	392406295
47	NC_018023	GC	3	6	30870	30875	0 %	0 %	50 %	50 %	392406295
48	NC_018023	CG	4	8	31373	31380	0 %	0 %	50 %	50 %	392406295
49	NC_018023	GC	3	6	32031	32036	0 %	0 %	50 %	50 %	392406296
50	NC_018023	GC	3	6	34597	34602	0 %	0 %	50 %	50 %	392406299
51	NC_018023	GA	3	6	36207	36212	50 %	0 %	50 %	0 %	392406300
52	NC_018023	GC	4	8	36894	36901	0 %	0 %	50 %	50 %	392406300
53	NC_018023	TG	3	6	37080	37085	0 %	50 %	50 %	0 %	392406300
54	NC_018023	TC	3	6	37346	37351	0 %	50 %	0 %	50 %	392406301
55	NC_018023	CG	3	6	37452	37457	0 %	0 %	50 %	50 %	392406301
56	NC_018023	CG	3	6	37729	37734	0 %	0 %	50 %	50 %	392406301
57	NC_018023	GT	4	8	37857	37864	0 %	50 %	50 %	0 %	392406301
58	NC_018023	GC	3	6	38535	38540	0 %	0 %	50 %	50 %	392406302
59	NC_018023	CG	3	6	38893	38898	0 %	0 %	50 %	50 %	392406303
60	NC_018023	CG	3	6	39087	39092	0 %	0 %	50 %	50 %	392406303
61	NC_018023	GT	3	6	39968	39973	0 %	50 %	50 %	0 %	392406303
62	NC_018023	CG	3	6	40383	40388	0 %	0 %	50 %	50 %	392406303
63	NC_018023	TC	3	6	40731	40736	0 %	50 %	0 %	50 %	392406303
64	NC_018023	GC	3	6	40845	40850	0 %	0 %	50 %	50 %	392406303
65	NC_018023	GC	4	8	43010	43017	0 %	0 %	50 %	50 %	392406304
66	NC_018023	GC	3	6	43095	43100	0 %	0 %	50 %	50 %	392406304
67	NC_018023	CG	3	6	43881	43886	0 %	0 %	50 %	50 %	392406304
68	NC_018023	TC	3	6	44386	44391	0 %	50 %	0 %	50 %	392406305
69	NC_018023	TG	3	6	45354	45359	0 %	50 %	50 %	0 %	392406305
70	NC_018023	GT	3	6	45387	45392	0 %	50 %	50 %	0 %	392406305
71	NC_018023	AT	3	6	47307	47312	50 %	50 %	0 %	0 %	392406306
72	NC_018023	GT	3	6	48975	48980	0 %	50 %	50 %	0 %	392406307
73	NC_018023	AG	4	8	49718	49725	50 %	0 %	50 %	0 %	392406308
74	NC_018023	AC	3	6	50609	50614	50 %	0 %	0 %	50 %	392406309
75	NC_018023	CT	3	6	50713	50718	0 %	50 %	0 %	50 %	392406309
76	NC_018023	CA	3	6	51075	51080	50 %	0 %	0 %	50 %	392406309
77	NC_018023	GC	3	6	51440	51445	0 %	0 %	50 %	50 %	392406310
78	NC_018023	CG	3	6	52247	52252	0 %	0 %	50 %	50 %	392406310
79	NC_018023	TG	3	6	54036	54041	0 %	50 %	50 %	0 %	392406312
80	NC_018023	GC	3	6	54387	54392	0 %	0 %	50 %	50 %	392406313
81	NC_018023	GC	3	6	54398	54403	0 %	0 %	50 %	50 %	392406313
82	NC_018023	GC	3	6	54905	54910	0 %	0 %	50 %	50 %	392406313
83	NC_018023	CG	4	8	56304	56311	0 %	0 %	50 %	50 %	392406317
84	NC_018023	GC	3	6	56361	56366	0 %	0 %	50 %	50 %	392406317
85	NC_018023	GC	3	6	56795	56800	0 %	0 %	50 %	50 %	392406317
86	NC_018023	CG	5	10	56838	56847	0 %	0 %	50 %	50 %	392406318
87	NC_018023	CG	3	6	57418	57423	0 %	0 %	50 %	50 %	392406318
88	NC_018023	CA	3	6	58140	58145	50 %	0 %	0 %	50 %	392406318
89	NC_018023	CG	4	8	58150	58157	0 %	0 %	50 %	50 %	392406318
90	NC_018023	AC	3	6	58219	58224	50 %	0 %	0 %	50 %	392406318
91	NC_018023	GT	3	6	59383	59388	0 %	50 %	50 %	0 %	392406320
92	NC_018023	CG	3	6	60617	60622	0 %	0 %	50 %	50 %	392406321
93	NC_018023	GC	3	6	62457	62462	0 %	0 %	50 %	50 %	392406322
94	NC_018023	AC	3	6	62912	62917	50 %	0 %	0 %	50 %	392406323
95	NC_018023	CG	3	6	63135	63140	0 %	0 %	50 %	50 %	392406324
96	NC_018023	GC	3	6	64067	64072	0 %	0 %	50 %	50 %	392406325
97	NC_018023	GC	3	6	64350	64355	0 %	0 %	50 %	50 %	392406325
98	NC_018023	CA	3	6	64530	64535	50 %	0 %	0 %	50 %	392406325
99	NC_018023	TG	3	6	64542	64547	0 %	50 %	50 %	0 %	392406325
100	NC_018023	GC	3	6	64857	64862	0 %	0 %	50 %	50 %	392406325
101	NC_018023	CA	3	6	66938	66943	50 %	0 %	0 %	50 %	392406327
102	NC_018023	CG	3	6	67600	67605	0 %	0 %	50 %	50 %	392406328
103	NC_018023	GC	3	6	67623	67628	0 %	0 %	50 %	50 %	392406328
104	NC_018023	CT	3	6	68272	68277	0 %	50 %	0 %	50 %	392406329
105	NC_018023	CG	3	6	68405	68410	0 %	0 %	50 %	50 %	392406329
106	NC_018023	CG	3	6	68487	68492	0 %	0 %	50 %	50 %	392406329
107	NC_018023	CG	3	6	68836	68841	0 %	0 %	50 %	50 %	392406329
108	NC_018023	CG	3	6	69400	69405	0 %	0 %	50 %	50 %	392406329
109	NC_018023	GC	3	6	69464	69469	0 %	0 %	50 %	50 %	392406329
110	NC_018023	CG	3	6	69485	69490	0 %	0 %	50 %	50 %	392406329
111	NC_018023	GC	3	6	69504	69509	0 %	0 %	50 %	50 %	392406329
112	NC_018023	CG	3	6	70891	70896	0 %	0 %	50 %	50 %	392406329
113	NC_018023	CG	3	6	71260	71265	0 %	0 %	50 %	50 %	392406329
114	NC_018023	GC	3	6	72560	72565	0 %	0 %	50 %	50 %	392406329
115	NC_018023	CG	3	6	72701	72706	0 %	0 %	50 %	50 %	392406329
116	NC_018023	AC	3	6	72718	72723	50 %	0 %	0 %	50 %	392406329
117	NC_018023	GC	3	6	72725	72730	0 %	0 %	50 %	50 %	392406329
118	NC_018023	AC	3	6	72881	72886	50 %	0 %	0 %	50 %	392406329
119	NC_018023	CG	3	6	72951	72956	0 %	0 %	50 %	50 %	392406329
120	NC_018023	CG	3	6	73079	73084	0 %	0 %	50 %	50 %	392406329
121	NC_018023	GC	4	8	73350	73357	0 %	0 %	50 %	50 %	392406329
122	NC_018023	GC	3	6	73521	73526	0 %	0 %	50 %	50 %	392406329
123	NC_018023	GC	4	8	74997	75004	0 %	0 %	50 %	50 %	392406330
124	NC_018023	GC	3	6	75082	75087	0 %	0 %	50 %	50 %	392406330
125	NC_018023	CG	3	6	75868	75873	0 %	0 %	50 %	50 %	392406330
126	NC_018023	CG	3	6	77224	77229	0 %	0 %	50 %	50 %	392406331
127	NC_018023	GC	3	6	78467	78472	0 %	0 %	50 %	50 %	392406332
128	NC_018023	GC	3	6	78870	78875	0 %	0 %	50 %	50 %	392406332
129	NC_018023	CG	3	6	79092	79097	0 %	0 %	50 %	50 %	392406332
130	NC_018023	AC	3	6	79601	79606	50 %	0 %	0 %	50 %	392406332
131	NC_018023	CG	3	6	80460	80465	0 %	0 %	50 %	50 %	392406333
132	NC_018023	CG	3	6	80870	80875	0 %	0 %	50 %	50 %	392406333
133	NC_018023	GC	3	6	81080	81085	0 %	0 %	50 %	50 %	392406333
134	NC_018023	CA	3	6	81546	81551	50 %	0 %	0 %	50 %	392406333
135	NC_018023	CG	3	6	81571	81576	0 %	0 %	50 %	50 %	392406333
136	NC_018023	TC	3	6	81687	81692	0 %	50 %	0 %	50 %	392406334
137	NC_018023	CG	3	6	81786	81791	0 %	0 %	50 %	50 %	392406334
138	NC_018023	CG	3	6	81878	81883	0 %	0 %	50 %	50 %	392406334
139	NC_018023	GC	3	6	81898	81903	0 %	0 %	50 %	50 %	392406334
140	NC_018023	CG	3	6	82357	82362	0 %	0 %	50 %	50 %	392406334
141	NC_018023	GC	3	6	83637	83642	0 %	0 %	50 %	50 %	392406334
142	NC_018023	GC	4	8	83823	83830	0 %	0 %	50 %	50 %	392406335
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.