MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium chubuense NBB4 plasmid pMYCCH.02

Total Repeats: 40

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018023	CTCAGC	2	12	8491	8502	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	392406276
2	NC_018023	AACGCC	2	12	14626	14637	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	392406281
3	NC_018023	CTGCGG	2	12	16152	16163	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	392406282
4	NC_018023	CTCACG	2	12	17068	17079	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	392406282
5	NC_018023	GTCGGC	2	12	22735	22746	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	392406287
6	NC_018023	CCGGCG	2	12	23781	23792	0 %	0 %	50 %	50 %	392406289
7	NC_018023	GAGACG	2	12	30117	30128	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	392406295
8	NC_018023	CGATGT	2	12	31022	31033	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	392406295
9	NC_018023	CGAGAT	2	12	34436	34447	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	392406298
10	NC_018023	TCAACC	2	12	35825	35836	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	392406299
11	NC_018023	GTTGTC	2	12	41076	41087	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	392406303
12	NC_018023	CGTCTT	2	12	50346	50357	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	392406309
13	NC_018023	TCGACC	2	12	52013	52024	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	392406310
14	NC_018023	CGCCTG	2	12	62223	62234	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	392406322
15	NC_018023	TACCTG	2	12	68049	68060	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	392406329
16	NC_018023	CACCGA	2	12	69581	69592	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	392406329
17	NC_018023	CGCCCG	2	12	70493	70504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392406329
18	NC_018023	GGGCCA	2	12	77344	77355	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	392406331
19	NC_018023	TCGCCG	2	12	82485	82496	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	392406334
20	NC_018023	TGGTGA	2	12	87592	87603	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	392406339
21	NC_018023	CCGTCG	2	12	89861	89872	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	392406341
22	NC_018023	GCGACC	2	12	90312	90323	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	392406342
23	NC_018023	CCCGCG	2	12	91278	91289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392406343
24	NC_018023	CATCAC	2	12	91746	91757	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	392406344
25	NC_018023	CATCGA	2	12	92991	93002	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	392406345
26	NC_018023	GCGGTG	2	12	93694	93705	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	392406346
27	NC_018023	GCGTCG	2	12	100278	100289	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	392406352
28	NC_018023	CCCCCA	2	12	109434	109445	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	392406358
29	NC_018023	CCGCCC	2	12	112998	113009	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	392406363
30	NC_018023	CGCCCC	2	12	117549	117560	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	392406367
31	NC_018023	CGACGC	2	12	119114	119125	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	392406368
32	NC_018023	TGCCGG	2	12	126885	126896	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	392406376
33	NC_018023	GAAGTC	2	12	126991	127002	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	392406376
34	NC_018023	CCTCGG	2	12	128462	128473	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	392406377
35	NC_018023	GCGTCC	2	12	129036	129047	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	392406378
36	NC_018023	CGTCAC	2	12	131196	131207	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	392406380
37	NC_018023	GGCCGG	2	12	136275	136286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392406386
38	NC_018023	GCCCGC	2	12	138376	138387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392406390
39	NC_018023	CGGCCT	2	12	139416	139427	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	392406390
40	NC_018023	GGCACC	2	12	142366	142377	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	392406390

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.