MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium chubuense NBB4 plasmid pMYCCH.01

Total Repeats: 12263

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018022	TCG	2	6	28786	28791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405755
502	NC_018022	CGG	3	9	28871	28879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405755
503	NC_018022	TCA	2	6	28963	28968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392405755
504	NC_018022	CCG	2	6	28978	28983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405755
505	NC_018022	TC	3	6	29010	29015	0 %	50 %	0 %	50 %	392405755
506	NC_018022	GCT	2	6	29030	29035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405755
507	NC_018022	CTT	2	6	29085	29090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392405755
508	NC_018022	CAG	2	6	29099	29104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405755
509	NC_018022	GCC	2	6	29116	29121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405755
510	NC_018022	TAA	2	6	29129	29134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392405755
511	NC_018022	GGC	2	6	29142	29147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405755
512	NC_018022	ACA	2	6	29188	29193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392405755
513	NC_018022	TGC	2	6	29197	29202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405755
514	NC_018022	GTA	2	6	29386	29391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392405756
515	NC_018022	CGG	2	6	29402	29407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405756
516	NC_018022	GGC	2	6	29409	29414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405756
517	NC_018022	GCG	2	6	29439	29444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405756
518	NC_018022	TGG	2	6	29467	29472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392405756
519	NC_018022	TCG	2	6	29481	29486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405756
520	NC_018022	AGT	2	6	29496	29501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392405756
521	NC_018022	TGG	2	6	29509	29514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392405756
522	NC_018022	TCG	3	9	29531	29539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405756
523	NC_018022	GCT	2	6	29575	29580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405756
524	NC_018022	CTGG	2	8	29588	29595	0 %	25 %	50 %	25 %	392405756
525	NC_018022	G	7	7	29608	29614	0 %	0 %	100 %	0 %	392405756
526	NC_018022	GGT	2	6	29624	29629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392405756
527	NC_018022	GAT	2	6	29690	29695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392405756
528	NC_018022	CTCG	2	8	29701	29708	0 %	25 %	25 %	50 %	392405756
529	NC_018022	GGTC	2	8	29740	29747	0 %	25 %	50 %	25 %	392405756
530	NC_018022	GCT	2	6	29775	29780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405756
531	NC_018022	GGCC	2	8	29785	29792	0 %	0 %	50 %	50 %	392405756
532	NC_018022	CAC	2	6	29819	29824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392405756
533	NC_018022	CGC	2	6	29863	29868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405756
534	NC_018022	TTC	2	6	30219	30224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392405757
535	NC_018022	TC	3	6	30256	30261	0 %	50 %	0 %	50 %	392405757
536	NC_018022	CGA	2	6	30394	30399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405757
537	NC_018022	CG	3	6	30419	30424	0 %	0 %	50 %	50 %	392405757
538	NC_018022	GGC	2	6	30467	30472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405758
539	NC_018022	CG	3	6	30504	30509	0 %	0 %	50 %	50 %	392405758
540	NC_018022	TTC	2	6	30510	30515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392405758
541	NC_018022	TCG	2	6	30523	30528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405758
542	NC_018022	GGT	2	6	30535	30540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392405758
543	NC_018022	CGCTCG	2	12	30661	30672	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	392405758
544	NC_018022	TCG	2	6	30736	30741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405758
545	NC_018022	GAG	2	6	30813	30818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392405758
546	NC_018022	CG	3	6	30871	30876	0 %	0 %	50 %	50 %	392405758
547	NC_018022	GCG	3	9	30874	30882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405758
548	NC_018022	CGA	2	6	30917	30922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405758
549	NC_018022	GGT	2	6	30941	30946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392405758
550	NC_018022	TGC	2	6	31024	31029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405758
551	NC_018022	CG	3	6	31065	31070	0 %	0 %	50 %	50 %	392405758
552	NC_018022	CAG	2	6	31143	31148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405758
553	NC_018022	TCG	2	6	31203	31208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405758
554	NC_018022	GCA	2	6	31244	31249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405758
555	NC_018022	AGCC	2	8	31314	31321	25 %	0 %	25 %	50 %	392405758
556	NC_018022	TTC	2	6	31333	31338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392405758
557	NC_018022	C	6	6	31363	31368	0 %	0 %	0 %	100 %	392405758
558	NC_018022	GT	3	6	31370	31375	0 %	50 %	50 %	0 %	392405758
559	NC_018022	ACG	2	6	31411	31416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405758
560	NC_018022	GTCGC	2	10	31449	31458	0 %	20 %	40 %	40 %	392405758
561	NC_018022	GGT	3	9	31475	31483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392405758
562	NC_018022	GGC	2	6	31494	31499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405758
563	NC_018022	CGT	2	6	31508	31513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405758
564	NC_018022	AGG	2	6	31543	31548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392405758
565	NC_018022	GAC	3	9	31581	31589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405758
566	NC_018022	GC	3	6	31596	31601	0 %	0 %	50 %	50 %	392405758
567	NC_018022	CGGC	2	8	31623	31630	0 %	0 %	50 %	50 %	392405758
568	NC_018022	CGG	2	6	31690	31695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405758
569	NC_018022	TCG	2	6	31717	31722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405758
570	NC_018022	CGG	2	6	31754	31759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405758
571	NC_018022	AGC	2	6	31813	31818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405758
572	NC_018022	CGA	2	6	31845	31850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405758
573	NC_018022	GGT	2	6	31854	31859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392405758
574	NC_018022	CGG	2	6	31897	31902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405758
575	NC_018022	GCCGC	2	10	31988	31997	0 %	0 %	40 %	60 %	392405758
576	NC_018022	AGC	2	6	31999	32004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405758
577	NC_018022	TCG	2	6	32023	32028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405758
578	NC_018022	GCC	2	6	32073	32078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405758
579	NC_018022	TGG	2	6	32081	32086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392405758
580	NC_018022	CGC	2	6	32105	32110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405758
581	NC_018022	GCGG	2	8	32127	32134	0 %	0 %	75 %	25 %	392405758
582	NC_018022	GCA	2	6	32161	32166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405758
583	NC_018022	CAG	2	6	32196	32201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405758
584	NC_018022	GGCA	2	8	32248	32255	25 %	0 %	50 %	25 %	392405758
585	NC_018022	GC	3	6	32265	32270	0 %	0 %	50 %	50 %	392405758
586	NC_018022	GC	3	6	32340	32345	0 %	0 %	50 %	50 %	392405758
587	NC_018022	GCGCC	2	10	32372	32381	0 %	0 %	40 %	60 %	392405758
588	NC_018022	GCTG	3	12	32386	32397	0 %	25 %	50 %	25 %	392405758
589	NC_018022	GGGT	2	8	32435	32442	0 %	25 %	75 %	0 %	392405759
590	NC_018022	GCG	2	6	32469	32474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405759
591	NC_018022	CCG	2	6	32482	32487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405759
592	NC_018022	GC	3	6	32499	32504	0 %	0 %	50 %	50 %	392405759
593	NC_018022	CGA	2	6	32985	32990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405760
594	NC_018022	TGA	2	6	32993	32998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392405760
595	NC_018022	GAC	2	6	33010	33015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405760
596	NC_018022	CGC	2	6	33183	33188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405760
597	NC_018022	GC	3	6	33202	33207	0 %	0 %	50 %	50 %	392405760
598	NC_018022	GGCT	2	8	33226	33233	0 %	25 %	50 %	25 %	392405760
599	NC_018022	TCG	2	6	33254	33259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405760
600	NC_018022	CGA	2	6	33278	33283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405760
601	NC_018022	CGG	2	6	33299	33304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405760
602	NC_018022	ACAG	2	8	33326	33333	50 %	0 %	25 %	25 %	392405760
603	NC_018022	TTC	2	6	33334	33339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392405760
604	NC_018022	TGCAC	2	10	33384	33393	20 %	20 %	20 %	40 %	392405760
605	NC_018022	GCGT	2	8	33445	33452	0 %	25 %	50 %	25 %	392405760
606	NC_018022	CCGG	2	8	33457	33464	0 %	0 %	50 %	50 %	392405760
607	NC_018022	CGG	2	6	33521	33526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405760
608	NC_018022	GCTG	2	8	33590	33597	0 %	25 %	50 %	25 %	392405760
609	NC_018022	CAG	2	6	33618	33623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405760
610	NC_018022	ACCA	2	8	33634	33641	50 %	0 %	0 %	50 %	392405760
611	NC_018022	GAG	2	6	33718	33723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392405760
612	NC_018022	GTCGGC	2	12	33724	33735	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	392405760
613	NC_018022	GGT	2	6	33777	33782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392405760
614	NC_018022	ATC	2	6	33999	34004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392405761
615	NC_018022	TGG	2	6	34054	34059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392405761
616	NC_018022	CCCG	2	8	34060	34067	0 %	0 %	25 %	75 %	392405761
617	NC_018022	GGCG	2	8	34105	34112	0 %	0 %	75 %	25 %	392405761
618	NC_018022	ACA	2	6	34149	34154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392405761
619	NC_018022	TGA	2	6	34180	34185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392405761
620	NC_018022	CAG	2	6	34226	34231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405761
621	NC_018022	ATGG	2	8	34337	34344	25 %	25 %	50 %	0 %	392405761
622	NC_018022	GCC	2	6	34403	34408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405761
623	NC_018022	GCGG	2	8	34487	34494	0 %	0 %	75 %	25 %	392405761
624	NC_018022	CTC	2	6	34507	34512	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392405761
625	NC_018022	GGC	2	6	34520	34525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405761
626	NC_018022	GTG	2	6	34527	34532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392405761
627	NC_018022	CCG	2	6	34541	34546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405761
628	NC_018022	CCGC	2	8	34565	34572	0 %	0 %	25 %	75 %	392405761
629	NC_018022	ATGGGC	2	12	34631	34642	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	392405761
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631	NC_018022	GGGCT	2	10	34679	34688	0 %	20 %	60 %	20 %	392405761
632	NC_018022	CGG	2	6	34708	34713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405761
633	NC_018022	CGG	2	6	34723	34728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405761
634	NC_018022	GGT	2	6	34748	34753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392405761
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636	NC_018022	CGA	2	6	34824	34829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405761
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645	NC_018022	CGG	2	6	35028	35033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405761
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650	NC_018022	CAG	2	6	35353	35358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405761
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652	NC_018022	CGA	2	6	35424	35429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405762
653	NC_018022	CGC	2	6	35434	35439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405762
654	NC_018022	CAG	2	6	35464	35469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405762
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659	NC_018022	GCC	2	6	35675	35680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405762
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742	NC_018022	TGGG	2	8	41112	41119	0 %	25 %	75 %	0 %	392405768
743	NC_018022	TCG	2	6	41170	41175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405768
744	NC_018022	CGA	2	6	41219	41224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405768
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746	NC_018022	GCA	2	6	41246	41251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405768
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749	NC_018022	CGC	2	6	41342	41347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405768
750	NC_018022	GGC	2	6	41355	41360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405768
751	NC_018022	TGGGT	2	10	41424	41433	0 %	40 %	60 %	0 %	392405768
752	NC_018022	GACGGC	2	12	41496	41507	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	392405768
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879	NC_018022	CCCT	2	8	47955	47962	0 %	25 %	0 %	75 %	392405775
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