MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methylophaga sp. JAM1 chromosome

Total Repeats: 53702

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_017857	GAA	2	6	233703	233708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387126121
4003	NC_017857	GTT	2	6	233728	233733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387126121
4004	NC_017857	GCC	2	6	233832	233837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387126121
4005	NC_017857	CCA	2	6	233872	233877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387126121
4006	NC_017857	TCA	2	6	234029	234034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126122
4007	NC_017857	AGT	2	6	234043	234048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126122
4008	NC_017857	TCAGC	2	10	234063	234072	20 %	20 %	20 %	40 %	387126122
4009	NC_017857	CAG	2	6	234094	234099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126122
4010	NC_017857	CAT	2	6	234135	234140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126122
4011	NC_017857	TGTTTC	2	12	234206	234217	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	387126122
4012	NC_017857	TCA	2	6	234266	234271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126122
4013	NC_017857	ACC	3	9	234334	234342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387126122
4014	NC_017857	TGA	2	6	234351	234356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126122
4015	NC_017857	CAC	2	6	234372	234377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387126122
4016	NC_017857	TGG	2	6	234480	234485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387126122
4017	NC_017857	GAT	2	6	234520	234525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126122
4018	NC_017857	TTCAC	2	10	234557	234566	20 %	40 %	0 %	40 %	387126122
4019	NC_017857	TGC	2	6	234604	234609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126122
4020	NC_017857	GTGA	2	8	234624	234631	25 %	25 %	50 %	0 %	387126122
4021	NC_017857	TGG	2	6	234667	234672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387126122
4022	NC_017857	ACG	2	6	234673	234678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126122
4023	NC_017857	TAA	2	6	234679	234684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387126122
4024	NC_017857	TCA	2	6	234725	234730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126122
4025	NC_017857	GAT	2	6	234733	234738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126122
4026	NC_017857	AGC	2	6	234811	234816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126122
4027	NC_017857	GAT	2	6	234841	234846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126122
4028	NC_017857	AGA	2	6	234898	234903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387126122
4029	NC_017857	TGAT	2	8	234953	234960	25 %	50 %	25 %	0 %	387126122
4030	NC_017857	CGAC	2	8	235028	235035	25 %	0 %	25 %	50 %	387126122
4031	NC_017857	ATC	2	6	235040	235045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126122
4032	NC_017857	GATT	2	8	235051	235058	25 %	50 %	25 %	0 %	387126122
4033	NC_017857	TGGT	2	8	235075	235082	0 %	50 %	50 %	0 %	387126122
4034	NC_017857	CAA	2	6	235185	235190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387126122
4035	NC_017857	GACAT	2	10	235364	235373	40 %	20 %	20 %	20 %	387126122
4036	NC_017857	CTG	2	6	235491	235496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126122
4037	NC_017857	GCTTA	2	10	235532	235541	20 %	40 %	20 %	20 %	387126123
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4040	NC_017857	T	6	6	235698	235703	0 %	100 %	0 %	0 %	387126123
4041	NC_017857	TTA	2	6	235728	235733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387126123
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4043	NC_017857	AGC	2	6	235829	235834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126123
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4045	NC_017857	TCA	2	6	235898	235903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126123
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4053	NC_017857	CGA	2	6	236493	236498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126124
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4055	NC_017857	GAA	2	6	236674	236679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387126125
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4060	NC_017857	ATG	2	6	236887	236892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126126
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4067	NC_017857	ATGCC	2	10	237252	237261	20 %	20 %	20 %	40 %	387126126
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4072	NC_017857	GAA	2	6	237562	237567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387126126
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4088	NC_017857	CCAGC	2	10	239025	239034	20 %	0 %	20 %	60 %	387126128
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4103	NC_017857	CGG	2	6	239833	239838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387126129
4104	NC_017857	TTGG	2	8	239853	239860	0 %	50 %	50 %	0 %	387126129
4105	NC_017857	ATG	2	6	239892	239897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126129
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4109	NC_017857	AT	3	6	240103	240108	50 %	50 %	0 %	0 %	387126129
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4121	NC_017857	T	6	6	240672	240677	0 %	100 %	0 %	0 %	387126130
4122	NC_017857	CCG	3	9	240800	240808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387126131
4123	NC_017857	ATG	2	6	240926	240931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126131
4124	NC_017857	AT	3	6	240979	240984	50 %	50 %	0 %	0 %	387126131
4125	NC_017857	CAT	2	6	241022	241027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126131
4126	NC_017857	TCA	2	6	241058	241063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126131
4127	NC_017857	GAC	2	6	241085	241090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126131
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4129	NC_017857	GTT	2	6	241151	241156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387126131
4130	NC_017857	T	6	6	241163	241168	0 %	100 %	0 %	0 %	387126131
4131	NC_017857	CG	3	6	241178	241183	0 %	0 %	50 %	50 %	387126131
4132	NC_017857	ATC	2	6	241251	241256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126131
4133	NC_017857	TCA	2	6	241384	241389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126131
4134	NC_017857	TCA	2	6	241411	241416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126131
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4142	NC_017857	GAT	2	6	241922	241927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126131
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4161	NC_017857	T	6	6	242917	242922	0 %	100 %	0 %	0 %	387126132
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4217	NC_017857	CTT	3	9	245659	245667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387126136
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4223	NC_017857	CGG	2	6	246049	246054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387126136
4224	NC_017857	TGC	2	6	246145	246150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126136
4225	NC_017857	CTGGT	2	10	246216	246225	0 %	40 %	40 %	20 %	387126136
4226	NC_017857	CTG	2	6	246234	246239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126136
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4228	NC_017857	TGG	2	6	246286	246291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387126136
4229	NC_017857	TGGT	2	8	246372	246379	0 %	50 %	50 %	0 %	387126136
4230	NC_017857	CTG	2	6	246389	246394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126136
4231	NC_017857	ATC	2	6	246437	246442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126136
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4233	NC_017857	TTTG	2	8	246458	246465	0 %	75 %	25 %	0 %	387126136
4234	NC_017857	TTG	2	6	246471	246476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387126136
4235	NC_017857	GTA	2	6	246494	246499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126136
4236	NC_017857	GAA	4	12	246530	246541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387126136
4237	NC_017857	CTAA	2	8	246600	246607	50 %	25 %	0 %	25 %	387126136
4238	NC_017857	TGA	2	6	246683	246688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126137
4239	NC_017857	TCG	2	6	246747	246752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126137
4240	NC_017857	GATG	2	8	246753	246760	25 %	25 %	50 %	0 %	387126137
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4242	NC_017857	CAT	2	6	247026	247031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126137
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4484	NC_017857	CAA	2	6	260594	260599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387126147
4485	NC_017857	CACC	2	8	260627	260634	25 %	0 %	0 %	75 %	387126147
4486	NC_017857	TGGTT	2	10	260640	260649	0 %	60 %	40 %	0 %	387126147
4487	NC_017857	GAT	2	6	260661	260666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126147
4488	NC_017857	ATGG	2	8	260682	260689	25 %	25 %	50 %	0 %	387126147
4489	NC_017857	GATA	2	8	260804	260811	50 %	25 %	25 %	0 %	387126147
4490	NC_017857	ACC	2	6	260914	260919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387126147
4491	NC_017857	GAT	2	6	260933	260938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126147
4492	NC_017857	ACA	2	6	260966	260971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387126147
4493	NC_017857	AAAC	2	8	261001	261008	75 %	0 %	0 %	25 %	387126147
4494	NC_017857	ATC	2	6	261016	261021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126147
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