MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methylophaga sp. JAM1 chromosome

Total Repeats: 53702

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017857	TGGA	2	8	29879	29886	25 %	25 %	50 %	0 %	387125932
502	NC_017857	CAG	2	6	29968	29973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387125932
503	NC_017857	GAC	2	6	30061	30066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387125932
504	NC_017857	AAT	2	6	30119	30124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387125932
505	NC_017857	GTT	2	6	30182	30187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387125933
506	NC_017857	AGC	2	6	30241	30246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387125933
507	NC_017857	CGGCG	2	10	30256	30265	0 %	0 %	60 %	40 %	387125933
508	NC_017857	AAG	2	6	30327	30332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387125933
509	NC_017857	ATT	2	6	30408	30413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387125933
510	NC_017857	GAA	2	6	30542	30547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387125933
511	NC_017857	AAG	2	6	30660	30665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387125933
512	NC_017857	ATTC	2	8	30686	30693	25 %	50 %	0 %	25 %	387125933
513	NC_017857	CTGAA	2	10	30804	30813	40 %	20 %	20 %	20 %	387125933
514	NC_017857	ATTC	2	8	30822	30829	25 %	50 %	0 %	25 %	387125933
515	NC_017857	GC	3	6	30841	30846	0 %	0 %	50 %	50 %	387125933
516	NC_017857	GGT	2	6	30890	30895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387125933
517	NC_017857	GAA	2	6	30962	30967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387125933
518	NC_017857	TTA	2	6	31001	31006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387125933
519	NC_017857	CAG	2	6	31132	31137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387125933
520	NC_017857	ATT	2	6	31152	31157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387125933
521	NC_017857	GGC	2	6	31171	31176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387125933
522	NC_017857	GC	3	6	31233	31238	0 %	0 %	50 %	50 %	387125933
523	NC_017857	AGC	2	6	31284	31289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387125933
524	NC_017857	ACA	2	6	31317	31322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387125933
525	NC_017857	CAAG	2	8	31342	31349	50 %	0 %	25 %	25 %	387125933
526	NC_017857	GAT	2	6	31447	31452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387125933
527	NC_017857	TGA	2	6	31453	31458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387125933
528	NC_017857	TGC	2	6	31465	31470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387125933
529	NC_017857	T	6	6	31523	31528	0 %	100 %	0 %	0 %	387125933
530	NC_017857	TGA	2	6	31539	31544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387125933
531	NC_017857	GGTCA	2	10	31571	31580	20 %	20 %	40 %	20 %	387125933
532	NC_017857	AAAC	2	8	31861	31868	75 %	0 %	0 %	25 %	387125934
533	NC_017857	GT	3	6	32172	32177	0 %	50 %	50 %	0 %	387125934
534	NC_017857	TTC	2	6	32238	32243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387125934
535	NC_017857	CGG	2	6	32260	32265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387125934
536	NC_017857	TGGC	2	8	32268	32275	0 %	25 %	50 %	25 %	387125934
537	NC_017857	GAT	2	6	32276	32281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387125934
538	NC_017857	AAT	2	6	32309	32314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387125934
539	NC_017857	ATCAA	2	10	32316	32325	60 %	20 %	0 %	20 %	387125934
540	NC_017857	GTG	2	6	32379	32384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387125934
541	NC_017857	CTT	2	6	32520	32525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387125934
542	NC_017857	CAT	2	6	32548	32553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387125934
543	NC_017857	GAT	2	6	32555	32560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387125934
544	NC_017857	TTG	2	6	32585	32590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387125934
545	NC_017857	TGG	2	6	32682	32687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387125934
546	NC_017857	GCC	2	6	32702	32707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387125934
547	NC_017857	GAA	2	6	32722	32727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387125934
548	NC_017857	TG	3	6	32759	32764	0 %	50 %	50 %	0 %	387125934
549	NC_017857	GAT	2	6	32894	32899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387125934
550	NC_017857	CAGC	2	8	33002	33009	25 %	0 %	25 %	50 %	387125935
551	NC_017857	CAT	2	6	33201	33206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387125935
552	NC_017857	TCA	2	6	33235	33240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387125935
553	NC_017857	CTT	2	6	33299	33304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387125935
554	NC_017857	AGA	2	6	33309	33314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387125935
555	NC_017857	GTT	2	6	33326	33331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387125935
556	NC_017857	CAT	2	6	33350	33355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387125935
557	NC_017857	CAT	2	6	33369	33374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387125935
558	NC_017857	CCATA	2	10	33380	33389	40 %	20 %	0 %	40 %	387125935
559	NC_017857	AAC	2	6	33411	33416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387125935
560	NC_017857	TCTA	2	8	33426	33433	25 %	50 %	0 %	25 %	387125935
561	NC_017857	CAC	2	6	33530	33535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387125935
562	NC_017857	ATCAAT	2	12	33567	33578	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387125935
563	NC_017857	ATGC	2	8	33590	33597	25 %	25 %	25 %	25 %	387125935
564	NC_017857	GGC	2	6	33661	33666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387125935
565	NC_017857	ATT	2	6	33720	33725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387125935
566	NC_017857	AAT	2	6	33951	33956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387125935
567	NC_017857	CCG	2	6	33963	33968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387125935
568	NC_017857	TGC	2	6	34002	34007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387125935
569	NC_017857	CA	4	8	34011	34018	50 %	0 %	0 %	50 %	387125935
570	NC_017857	AAAT	2	8	34059	34066	75 %	25 %	0 %	0 %	387125935
571	NC_017857	T	7	7	34339	34345	0 %	100 %	0 %	0 %	387125936
572	NC_017857	CAA	2	6	34348	34353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387125936
573	NC_017857	ATG	2	6	34361	34366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387125936
574	NC_017857	CAGCCC	2	12	34417	34428	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	387125936
575	NC_017857	ACT	2	6	34451	34456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387125936
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577	NC_017857	ATT	2	6	35049	35054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387125937
578	NC_017857	GCA	2	6	35060	35065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387125937
579	NC_017857	CAT	2	6	35087	35092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387125937
580	NC_017857	A	6	6	35132	35137	100 %	0 %	0 %	0 %	387125937
581	NC_017857	AGT	2	6	35162	35167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387125937
582	NC_017857	CAAG	2	8	35176	35183	50 %	0 %	25 %	25 %	387125937
583	NC_017857	GTT	2	6	35214	35219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387125937
584	NC_017857	GAT	2	6	35256	35261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387125937
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587	NC_017857	A	7	7	35384	35390	100 %	0 %	0 %	0 %	387125938
588	NC_017857	GCAG	2	8	35424	35431	25 %	0 %	50 %	25 %	387125938
589	NC_017857	AATT	2	8	35459	35466	50 %	50 %	0 %	0 %	387125938
590	NC_017857	GATG	2	8	35469	35476	25 %	25 %	50 %	0 %	387125938
591	NC_017857	TATCGT	2	12	35550	35561	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387125938
592	NC_017857	GAT	2	6	35644	35649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387125938
593	NC_017857	TGG	2	6	35672	35677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387125938
594	NC_017857	ACG	2	6	35741	35746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387125939
595	NC_017857	CAGC	2	8	35747	35754	25 %	0 %	25 %	50 %	387125939
596	NC_017857	CAA	2	6	35775	35780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387125939
597	NC_017857	GAC	2	6	35823	35828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387125939
598	NC_017857	GCG	2	6	35938	35943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387125939
599	NC_017857	TCT	2	6	35945	35950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387125939
600	NC_017857	AAACGC	2	12	36003	36014	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	387125939
601	NC_017857	ACC	2	6	36028	36033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387125939
602	NC_017857	CCA	2	6	36268	36273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387125940
603	NC_017857	T	7	7	36282	36288	0 %	100 %	0 %	0 %	387125940
604	NC_017857	GCT	2	6	36293	36298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387125940
605	NC_017857	GTT	2	6	36368	36373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387125940
606	NC_017857	AGA	2	6	36617	36622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387125940
607	NC_017857	TCAAC	2	10	36691	36700	40 %	20 %	0 %	40 %	387125940
608	NC_017857	TGCAT	2	10	36743	36752	20 %	40 %	20 %	20 %	387125940
609	NC_017857	GGC	2	6	36818	36823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387125940
610	NC_017857	GCCA	2	8	36849	36856	25 %	0 %	25 %	50 %	387125940
611	NC_017857	TCT	2	6	36858	36863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387125940
612	NC_017857	A	6	6	36915	36920	100 %	0 %	0 %	0 %	387125940
613	NC_017857	GCA	2	6	36998	37003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387125940
614	NC_017857	GCG	2	6	37068	37073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387125940
615	NC_017857	CGT	2	6	37115	37120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387125940
616	NC_017857	AGT	2	6	37247	37252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387125940
617	NC_017857	ACA	2	6	37358	37363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387125940
618	NC_017857	GCG	3	9	37449	37457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387125940
619	NC_017857	AGTC	2	8	37495	37502	25 %	25 %	25 %	25 %	387125940
620	NC_017857	AT	3	6	37548	37553	50 %	50 %	0 %	0 %	387125941
621	NC_017857	TGC	2	6	37617	37622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387125941
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623	NC_017857	CAA	2	6	37660	37665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387125941
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625	NC_017857	ATT	2	6	37929	37934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387125941
626	NC_017857	GA	3	6	37935	37940	50 %	0 %	50 %	0 %	387125941
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