MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methylophaga sp. JAM1 chromosome

Total Repeats: 53702

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017857	ATGCAA	2	12	261450	261461	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387126148
4502	NC_017857	CTA	2	6	261463	261468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126148
4503	NC_017857	TGC	2	6	261497	261502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126148
4504	NC_017857	TAC	2	6	261504	261509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126148
4505	NC_017857	AAAT	2	8	261519	261526	75 %	25 %	0 %	0 %	387126148
4506	NC_017857	AT	3	6	261576	261581	50 %	50 %	0 %	0 %	387126149
4507	NC_017857	GCTC	2	8	261652	261659	0 %	25 %	25 %	50 %	387126149
4508	NC_017857	ATA	2	6	261660	261665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387126149
4509	NC_017857	ACG	2	6	261681	261686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126149
4510	NC_017857	GGC	2	6	261703	261708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387126149
4511	NC_017857	A	6	6	261726	261731	100 %	0 %	0 %	0 %	387126149
4512	NC_017857	GATT	2	8	261732	261739	25 %	50 %	25 %	0 %	387126149
4513	NC_017857	AGA	2	6	261754	261759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387126149
4514	NC_017857	AATT	2	8	261792	261799	50 %	50 %	0 %	0 %	387126149
4515	NC_017857	ATC	2	6	261969	261974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126149
4516	NC_017857	TGTT	2	8	261987	261994	0 %	75 %	25 %	0 %	387126149
4517	NC_017857	A	6	6	262028	262033	100 %	0 %	0 %	0 %	387126149
4518	NC_017857	CAGAAA	2	12	262049	262060	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	387126149
4519	NC_017857	GCA	2	6	262108	262113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126150
4520	NC_017857	GGC	2	6	262122	262127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387126150
4521	NC_017857	ACTG	2	8	262200	262207	25 %	25 %	25 %	25 %	387126150
4522	NC_017857	ACA	2	6	262233	262238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387126150
4523	NC_017857	AAC	2	6	262253	262258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387126150
4524	NC_017857	GTA	2	6	262324	262329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126150
4525	NC_017857	GTG	2	6	262418	262423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387126150
4526	NC_017857	CTGG	2	8	262447	262454	0 %	25 %	50 %	25 %	387126150
4527	NC_017857	AAAC	2	8	262459	262466	75 %	0 %	0 %	25 %	387126150
4528	NC_017857	TAT	2	6	262476	262481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387126150
4529	NC_017857	ACCGG	2	10	262504	262513	20 %	0 %	40 %	40 %	387126150
4530	NC_017857	AAC	2	6	262559	262564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387126150
4531	NC_017857	CTG	2	6	262600	262605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126150
4532	NC_017857	GAT	2	6	262654	262659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126150
4533	NC_017857	A	6	6	262690	262695	100 %	0 %	0 %	0 %	387126150
4534	NC_017857	CAGCA	2	10	262721	262730	40 %	0 %	20 %	40 %	387126150
4535	NC_017857	CG	3	6	262747	262752	0 %	0 %	50 %	50 %	387126150
4536	NC_017857	TGC	2	6	262796	262801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126150
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4538	NC_017857	TTA	2	6	262915	262920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387126150
4539	NC_017857	A	6	6	262939	262944	100 %	0 %	0 %	0 %	387126150
4540	NC_017857	CCAA	2	8	262951	262958	50 %	0 %	0 %	50 %	387126150
4541	NC_017857	AGGC	2	8	262985	262992	25 %	0 %	50 %	25 %	387126150
4542	NC_017857	TAT	2	6	263016	263021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387126151
4543	NC_017857	GCC	2	6	263033	263038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387126151
4544	NC_017857	CCA	2	6	263134	263139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387126151
4545	NC_017857	T	6	6	263165	263170	0 %	100 %	0 %	0 %	387126151
4546	NC_017857	CAGC	2	8	263185	263192	25 %	0 %	25 %	50 %	387126151
4547	NC_017857	TGC	2	6	263241	263246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126151
4548	NC_017857	TGG	2	6	263247	263252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387126151
4549	NC_017857	TA	3	6	263254	263259	50 %	50 %	0 %	0 %	387126151
4550	NC_017857	GCC	2	6	263291	263296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387126151
4551	NC_017857	AACA	2	8	263330	263337	75 %	0 %	0 %	25 %	387126151
4552	NC_017857	CAG	2	6	263384	263389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126151
4553	NC_017857	A	7	7	263400	263406	100 %	0 %	0 %	0 %	387126151
4554	NC_017857	CTGA	2	8	263408	263415	25 %	25 %	25 %	25 %	387126151
4555	NC_017857	CAA	2	6	263506	263511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387126151
4556	NC_017857	ACC	2	6	263518	263523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387126151
4557	NC_017857	GAT	2	6	263524	263529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126151
4558	NC_017857	ATT	2	6	263575	263580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387126151
4559	NC_017857	GCC	2	6	263588	263593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387126151
4560	NC_017857	TTTGC	2	10	263657	263666	0 %	60 %	20 %	20 %	387126151
4561	NC_017857	CAA	2	6	263711	263716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387126151
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4564	NC_017857	CCAA	2	8	263810	263817	50 %	0 %	0 %	50 %	387126151
4565	NC_017857	AATT	2	8	263820	263827	50 %	50 %	0 %	0 %	387126151
4566	NC_017857	TCAG	2	8	263838	263845	25 %	25 %	25 %	25 %	387126151
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4574	NC_017857	TCT	2	6	264311	264316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387126152
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4604	NC_017857	T	6	6	265588	265593	0 %	100 %	0 %	0 %	387126153
4605	NC_017857	CGA	2	6	265778	265783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126153
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4607	NC_017857	TCGGA	2	10	265940	265949	20 %	20 %	40 %	20 %	387126153
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4988	NC_017857	GCACCA	2	12	288755	288766	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	387126173
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4990	NC_017857	TCCA	2	8	288915	288922	25 %	25 %	0 %	50 %	387126173
4991	NC_017857	A	6	6	289003	289008	100 %	0 %	0 %	0 %	387126173
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