MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Methylophaga sp. JAM7 chromosome

Total Repeats: 32359

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017856	ATG	2	6	174	179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387128983
2	NC_017856	GGC	2	6	313	318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387128983
3	NC_017856	TCA	2	6	322	327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387128983
4	NC_017856	GAA	2	6	428	433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387128983
5	NC_017856	TTG	2	6	471	476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387128983
6	NC_017856	GAT	2	6	485	490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387128983
7	NC_017856	GGC	2	6	626	631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387128984
8	NC_017856	CAT	3	9	708	716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387128984
9	NC_017856	TGC	2	6	747	752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387128985
10	NC_017856	TGC	2	6	1003	1008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387128985
11	NC_017856	CAT	2	6	1084	1089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387128985
12	NC_017856	TTA	2	6	1100	1105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387128985
13	NC_017856	CCA	2	6	1377	1382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387128986
14	NC_017856	CAG	2	6	1391	1396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387128986
15	NC_017856	CTG	2	6	1503	1508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387128986
16	NC_017856	ATA	2	6	1648	1653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387128986
17	NC_017856	CCG	2	6	1665	1670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387128986
18	NC_017856	TGA	2	6	1678	1683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387128986
19	NC_017856	TGC	2	6	1767	1772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387128986
20	NC_017856	TGT	2	6	1827	1832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387128986
21	NC_017856	TCA	2	6	1899	1904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387128986
22	NC_017856	TGA	2	6	2052	2057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387128986
23	NC_017856	GCG	2	6	2080	2085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387128986
24	NC_017856	TTC	2	6	2099	2104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387128986
25	NC_017856	CAG	2	6	2138	2143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387128986
26	NC_017856	TTG	2	6	2147	2152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387128986
27	NC_017856	GAC	2	6	2182	2187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387128986
28	NC_017856	TGA	2	6	2325	2330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387128986
29	NC_017856	TCA	2	6	2385	2390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387128986
30	NC_017856	ATA	2	6	2391	2396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387128986
31	NC_017856	CCT	2	6	2491	2496	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387128986
32	NC_017856	CAA	2	6	2518	2523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387128986
33	NC_017856	TAA	2	6	2609	2614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387128986
34	NC_017856	TGC	2	6	2743	2748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387128986
35	NC_017856	TCA	2	6	2767	2772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387128986
36	NC_017856	CTG	2	6	2981	2986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387128986
37	NC_017856	TTG	2	6	3014	3019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387128986
38	NC_017856	GCA	2	6	3112	3117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387128987
39	NC_017856	GCG	2	6	3157	3162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387128987
40	NC_017856	GCA	3	9	3281	3289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387128987
41	NC_017856	AAT	2	6	3350	3355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387128987
42	NC_017856	CAT	2	6	3409	3414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387128987
43	NC_017856	AGC	2	6	3421	3426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387128987
44	NC_017856	GCT	2	6	3459	3464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387128987
45	NC_017856	ATT	2	6	3542	3547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387128987
46	NC_017856	CGA	2	6	3564	3569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387128987
47	NC_017856	ACA	2	6	3728	3733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387128987
48	NC_017856	TGA	2	6	3782	3787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387128987
49	NC_017856	ATA	2	6	3853	3858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387128987
50	NC_017856	CAG	2	6	3886	3891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387128987
51	NC_017856	GTT	2	6	4160	4165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387128988
52	NC_017856	GCT	2	6	4306	4311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387128988
53	NC_017856	TGT	2	6	4339	4344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387128988
54	NC_017856	CCA	2	6	4373	4378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387128988
55	NC_017856	ATG	3	9	4474	4482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387128988
56	NC_017856	ACC	3	9	4495	4503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387128988
57	NC_017856	GGT	2	6	4612	4617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387128989
58	NC_017856	AAT	2	6	4633	4638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387128989
59	NC_017856	CCG	2	6	4661	4666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387128989
60	NC_017856	ATA	2	6	4723	4728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387128989
61	NC_017856	ATC	2	6	4750	4755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387128989
62	NC_017856	TGT	2	6	4787	4792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387128989
63	NC_017856	TGA	2	6	4883	4888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387128989
64	NC_017856	ATC	2	6	4915	4920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387128989
65	NC_017856	GGT	2	6	4993	4998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387128989
66	NC_017856	GTA	2	6	5240	5245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387128990
67	NC_017856	AGA	2	6	5274	5279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387128990
68	NC_017856	ACG	2	6	5321	5326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387128990
69	NC_017856	CCG	2	6	5712	5717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387128990
70	NC_017856	ATG	2	6	5742	5747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387128990
71	NC_017856	GAA	2	6	5929	5934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387128991
72	NC_017856	CGC	2	6	5981	5986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387128991
73	NC_017856	ATT	2	6	6042	6047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387128991
74	NC_017856	GGC	2	6	6070	6075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387128991
75	NC_017856	ATT	2	6	6300	6305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387128992
76	NC_017856	GAT	2	6	6411	6416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387128992
77	NC_017856	GCA	2	6	6433	6438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387128992
78	NC_017856	TGG	2	6	6479	6484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387128992
79	NC_017856	GAT	2	6	6501	6506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387128992
80	NC_017856	AAT	2	6	6666	6671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387128992
81	NC_017856	ATC	2	6	6801	6806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387128992
82	NC_017856	TGT	2	6	6835	6840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387128992
83	NC_017856	GTG	2	6	6934	6939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387128992
84	NC_017856	GCC	2	6	7077	7082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387128993
85	NC_017856	GAC	2	6	7160	7165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387128993
86	NC_017856	AGC	2	6	7260	7265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387128993
87	NC_017856	TAA	2	6	7268	7273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387128993
88	NC_017856	ACC	2	6	7337	7342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387128993
89	NC_017856	ATG	2	6	7361	7366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387128993
90	NC_017856	CAA	2	6	7391	7396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387128993
91	NC_017856	CTT	2	6	7471	7476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387128993
92	NC_017856	AAT	2	6	7781	7786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387128993
93	NC_017856	TGT	2	6	7854	7859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387128993
94	NC_017856	TCT	2	6	8142	8147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387128995
95	NC_017856	AAT	2	6	8200	8205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387128995
96	NC_017856	CCT	2	6	8258	8263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387128995
97	NC_017856	GAT	2	6	8319	8324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387128995
98	NC_017856	AGC	2	6	8521	8526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387128995
99	NC_017856	ATT	2	6	8574	8579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387128995
100	NC_017856	CTG	2	6	8587	8592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387128995
101	NC_017856	TTG	2	6	8614	8619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387128995
102	NC_017856	GTT	2	6	8623	8628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387128995
103	NC_017856	GGC	2	6	8776	8781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387128995
104	NC_017856	TGA	2	6	8934	8939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387128995
105	NC_017856	AGC	2	6	9014	9019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387128995
106	NC_017856	TCG	2	6	9065	9070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387128995
107	NC_017856	GCA	2	6	9095	9100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387128995
108	NC_017856	ACA	2	6	9123	9128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387128995
109	NC_017856	GCA	2	6	9147	9152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387128995
110	NC_017856	TTA	2	6	9220	9225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387128995
111	NC_017856	AGA	2	6	9402	9407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387128995
112	NC_017856	ATG	2	6	9421	9426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387128995
113	NC_017856	TCT	2	6	9482	9487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387128995
114	NC_017856	GAC	2	6	9549	9554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387128995
115	NC_017856	CAG	2	6	9565	9570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387128995
116	NC_017856	TGC	2	6	9702	9707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387128995
117	NC_017856	TAG	2	6	9879	9884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387128995
118	NC_017856	AGG	2	6	9911	9916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387128995
119	NC_017856	TGG	2	6	9944	9949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387128995
120	NC_017856	GCA	2	6	10031	10036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387128996
121	NC_017856	TGT	2	6	10082	10087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387128996
122	NC_017856	GAA	2	6	10141	10146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387128996
123	NC_017856	TGA	2	6	10275	10280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387128996
124	NC_017856	ATT	2	6	10304	10309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387128996
125	NC_017856	TGA	2	6	10401	10406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387128996
126	NC_017856	ATG	2	6	10693	10698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387128997
127	NC_017856	CAA	2	6	10787	10792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387128997
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129	NC_017856	TAA	2	6	10929	10934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387128997
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253	NC_017856	GTT	2	6	18871	18876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387129004
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