MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methylophaga sp. JAM7 chromosome

Total Repeats: 47292

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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46502	NC_017856	AGA	2	6	2652257	2652262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387131572
46503	NC_017856	ACC	2	6	2652291	2652296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387131572
46504	NC_017856	CGAG	2	8	2652389	2652396	25 %	0 %	50 %	25 %	387131572
46505	NC_017856	TGC	2	6	2652400	2652405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387131572
46506	NC_017856	GCA	2	6	2652420	2652425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387131572
46507	NC_017856	GCG	2	6	2652592	2652597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387131572
46508	NC_017856	TAC	2	6	2652686	2652691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387131573
46509	NC_017856	ATC	2	6	2652737	2652742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387131573
46510	NC_017856	CCATGC	2	12	2652760	2652771	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	387131573
46511	NC_017856	CAAG	2	8	2652946	2652953	50 %	0 %	25 %	25 %	387131573
46512	NC_017856	GGTGC	2	10	2652977	2652986	0 %	20 %	60 %	20 %	387131573
46513	NC_017856	GGC	2	6	2653106	2653111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387131573
46514	NC_017856	CCTGA	2	10	2653118	2653127	20 %	20 %	20 %	40 %	387131573
46515	NC_017856	GTGG	2	8	2653190	2653197	0 %	25 %	75 %	0 %	387131573
46516	NC_017856	ACC	2	6	2653220	2653225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387131573
46517	NC_017856	TGTGT	2	10	2653267	2653276	0 %	60 %	40 %	0 %	387131573
46518	NC_017856	GGT	2	6	2653277	2653282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387131573
46519	NC_017856	CTGA	2	8	2653316	2653323	25 %	25 %	25 %	25 %	387131573
46520	NC_017856	ACT	2	6	2653419	2653424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387131573
46521	NC_017856	GAA	2	6	2653481	2653486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387131573
46522	NC_017856	CGT	2	6	2653592	2653597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387131573
46523	NC_017856	ATG	2	6	2653646	2653651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387131573
46524	NC_017856	A	6	6	2653662	2653667	100 %	0 %	0 %	0 %	387131573
46525	NC_017856	ATAAAA	2	12	2653674	2653685	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387131573
46526	NC_017856	AGC	2	6	2653817	2653822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387131574
46527	NC_017856	TATT	2	8	2653833	2653840	25 %	75 %	0 %	0 %	387131574
46528	NC_017856	GTTT	2	8	2653868	2653875	0 %	75 %	25 %	0 %	387131574
46529	NC_017856	TTG	2	6	2653940	2653945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387131574
46530	NC_017856	GATG	2	8	2653953	2653960	25 %	25 %	50 %	0 %	387131574
46531	NC_017856	TGGA	2	8	2653964	2653971	25 %	25 %	50 %	0 %	387131574
46532	NC_017856	TTGGC	2	10	2654045	2654054	0 %	40 %	40 %	20 %	387131574
46533	NC_017856	TTGG	2	8	2654102	2654109	0 %	50 %	50 %	0 %	387131574
46534	NC_017856	T	6	6	2654191	2654196	0 %	100 %	0 %	0 %	387131574
46535	NC_017856	CGGCTG	2	12	2654213	2654224	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	387131574
46536	NC_017856	TTA	2	6	2654309	2654314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387131574
46537	NC_017856	GGTTT	2	10	2654401	2654410	0 %	60 %	40 %	0 %	387131574
46538	NC_017856	CCG	2	6	2654437	2654442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387131574
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46540	NC_017856	T	6	6	2654460	2654465	0 %	100 %	0 %	0 %	387131574
46541	NC_017856	TTGATT	2	12	2654497	2654508	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387131574
46542	NC_017856	GAC	2	6	2654638	2654643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387131575
46543	NC_017856	GCA	2	6	2654686	2654691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387131575
46544	NC_017856	GCT	2	6	2654702	2654707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387131575
46545	NC_017856	TTG	2	6	2654759	2654764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387131575
46546	NC_017856	TTG	2	6	2654795	2654800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387131575
46547	NC_017856	CGG	2	6	2654814	2654819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387131575
46548	NC_017856	ATCCG	2	10	2654875	2654884	20 %	20 %	20 %	40 %	387131575
46549	NC_017856	TCA	2	6	2654896	2654901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387131575
46550	NC_017856	TTG	2	6	2654936	2654941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387131575
46551	NC_017856	TTA	2	6	2655023	2655028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387131575
46552	NC_017856	CAAT	2	8	2655124	2655131	50 %	25 %	0 %	25 %	387131576
46553	NC_017856	GC	3	6	2655141	2655146	0 %	0 %	50 %	50 %	387131576
46554	NC_017856	GC	4	8	2655199	2655206	0 %	0 %	50 %	50 %	387131576
46555	NC_017856	TCT	2	6	2655307	2655312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387131576
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46559	NC_017856	ATT	2	6	2655441	2655446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387131576
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46562	NC_017856	GCCTT	2	10	2655629	2655638	0 %	40 %	20 %	40 %	387131577
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46571	NC_017856	A	6	6	2655991	2655996	100 %	0 %	0 %	0 %	387131577
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46589	NC_017856	GAAT	2	8	2657260	2657267	50 %	25 %	25 %	0 %	387131578
46590	NC_017856	GGC	2	6	2657375	2657380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387131578
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46595	NC_017856	A	8	8	2657616	2657623	100 %	0 %	0 %	0 %	387131579
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46604	NC_017856	TAAAT	2	10	2658063	2658072	60 %	40 %	0 %	0 %	387131579
46605	NC_017856	GCA	2	6	2658099	2658104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387131579
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46608	NC_017856	AGC	2	6	2658221	2658226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387131579
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46612	NC_017856	GAG	2	6	2658331	2658336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387131579
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