MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methylophaga sp. JAM7 chromosome

Total Repeats: 47292

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017856	TG	3	6	168396	168401	0 %	50 %	50 %	0 %	387129142
3002	NC_017856	CGC	2	6	168417	168422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387129142
3003	NC_017856	GGCA	2	8	168502	168509	25 %	0 %	50 %	25 %	387129142
3004	NC_017856	TGGT	2	8	168582	168589	0 %	50 %	50 %	0 %	387129143
3005	NC_017856	TCAAA	2	10	168591	168600	60 %	20 %	0 %	20 %	387129143
3006	NC_017856	ATC	2	6	168712	168717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387129143
3007	NC_017856	CCT	2	6	168765	168770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387129143
3008	NC_017856	TGT	2	6	168776	168781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387129143
3009	NC_017856	TTTTG	2	10	168782	168791	0 %	80 %	20 %	0 %	387129143
3010	NC_017856	AGCC	2	8	168818	168825	25 %	0 %	25 %	50 %	387129143
3011	NC_017856	TTC	2	6	168826	168831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387129143
3012	NC_017856	CAC	2	6	168855	168860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387129143
3013	NC_017856	T	7	7	168897	168903	0 %	100 %	0 %	0 %	387129143
3014	NC_017856	AACA	2	8	168916	168923	75 %	0 %	0 %	25 %	387129143
3015	NC_017856	CA	3	6	168922	168927	50 %	0 %	0 %	50 %	387129143
3016	NC_017856	GCC	2	6	168968	168973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387129143
3017	NC_017856	TTG	2	6	168988	168993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387129143
3018	NC_017856	T	7	7	169258	169264	0 %	100 %	0 %	0 %	387129143
3019	NC_017856	ACA	2	6	169320	169325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387129143
3020	NC_017856	T	6	6	169598	169603	0 %	100 %	0 %	0 %	387129143
3021	NC_017856	CCT	2	6	169677	169682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387129143
3022	NC_017856	A	6	6	169732	169737	100 %	0 %	0 %	0 %	387129143
3023	NC_017856	GTT	2	6	169743	169748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387129143
3024	NC_017856	TCA	2	6	169883	169888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387129143
3025	NC_017856	CAA	2	6	170034	170039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387129143
3026	NC_017856	T	6	6	170053	170058	0 %	100 %	0 %	0 %	387129143
3027	NC_017856	GATTG	2	10	170123	170132	20 %	40 %	40 %	0 %	387129143
3028	NC_017856	CA	3	6	170284	170289	50 %	0 %	0 %	50 %	387129144
3029	NC_017856	GCG	2	6	170301	170306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387129144
3030	NC_017856	TGC	2	6	170362	170367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387129144
3031	NC_017856	CTGG	2	8	170455	170462	0 %	25 %	50 %	25 %	387129144
3032	NC_017856	ATTG	2	8	170482	170489	25 %	50 %	25 %	0 %	387129144
3033	NC_017856	TTG	2	6	170492	170497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387129144
3034	NC_017856	AT	3	6	170524	170529	50 %	50 %	0 %	0 %	387129144
3035	NC_017856	TGG	2	6	170534	170539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387129144
3036	NC_017856	GTC	2	6	170543	170548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387129144
3037	NC_017856	GCTT	2	8	170551	170558	0 %	50 %	25 %	25 %	387129144
3038	NC_017856	CA	3	6	170599	170604	50 %	0 %	0 %	50 %	387129144
3039	NC_017856	CGG	2	6	170638	170643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387129144
3040	NC_017856	AT	3	6	170666	170671	50 %	50 %	0 %	0 %	387129144
3041	NC_017856	TGC	3	9	170676	170684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387129144
3042	NC_017856	GGT	2	6	170687	170692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387129144
3043	NC_017856	TATTT	2	10	170701	170710	20 %	80 %	0 %	0 %	387129144
3044	NC_017856	T	6	6	170708	170713	0 %	100 %	0 %	0 %	387129144
3045	NC_017856	CAT	2	6	170737	170742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387129144
3046	NC_017856	CAG	2	6	170810	170815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387129144
3047	NC_017856	CAA	2	6	170831	170836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387129144
3048	NC_017856	TGC	2	6	170869	170874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387129144
3049	NC_017856	ATT	2	6	170922	170927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387129144
3050	NC_017856	TTCG	2	8	170937	170944	0 %	50 %	25 %	25 %	387129144
3051	NC_017856	T	6	6	171131	171136	0 %	100 %	0 %	0 %	387129144
3052	NC_017856	CGAAA	2	10	171150	171159	60 %	0 %	20 %	20 %	387129144
3053	NC_017856	CG	3	6	171295	171300	0 %	0 %	50 %	50 %	387129144
3054	NC_017856	GAC	2	6	171338	171343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387129145
3055	NC_017856	TGC	2	6	171357	171362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387129145
3056	NC_017856	CGC	3	9	171383	171391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387129145
3057	NC_017856	CAT	2	6	171605	171610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387129145
3058	NC_017856	TCG	2	6	171615	171620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387129145
3059	NC_017856	TC	3	6	171693	171698	0 %	50 %	0 %	50 %	387129145
3060	NC_017856	CG	3	6	171756	171761	0 %	0 %	50 %	50 %	387129145
3061	NC_017856	GCG	2	6	171775	171780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387129145
3062	NC_017856	TGC	2	6	171868	171873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387129145
3063	NC_017856	TTG	2	6	171888	171893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387129145
3064	NC_017856	CGG	2	6	171937	171942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387129145
3065	NC_017856	TTG	2	6	172032	172037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387129146
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3067	NC_017856	CAT	2	6	172295	172300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387129146
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3069	NC_017856	TTA	2	6	172330	172335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387129146
3070	NC_017856	AAG	2	6	172341	172346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387129146
3071	NC_017856	ACC	2	6	172369	172374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387129146
3072	NC_017856	GCA	2	6	172414	172419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387129146
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3081	NC_017856	CCAG	2	8	172736	172743	25 %	0 %	25 %	50 %	387129146
3082	NC_017856	A	6	6	172762	172767	100 %	0 %	0 %	0 %	387129146
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3090	NC_017856	GCC	2	6	173171	173176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387129147
3091	NC_017856	ATA	2	6	173183	173188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387129147
3092	NC_017856	CGC	2	6	173196	173201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387129147
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3095	NC_017856	GTT	2	6	173411	173416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387129147
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3104	NC_017856	GTT	2	6	173731	173736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387129148
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3106	NC_017856	ACA	2	6	173784	173789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387129148
3107	NC_017856	GAT	2	6	173818	173823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387129148
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3109	NC_017856	CAG	2	6	173840	173845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387129148
3110	NC_017856	TGT	2	6	173940	173945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387129148
3111	NC_017856	CGC	2	6	173972	173977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387129148
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3114	NC_017856	GTT	2	6	174232	174237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387129149
3115	NC_017856	T	6	6	174236	174241	0 %	100 %	0 %	0 %	387129149
3116	NC_017856	AGCGC	2	10	174322	174331	20 %	0 %	40 %	40 %	387129149
3117	NC_017856	T	6	6	174398	174403	0 %	100 %	0 %	0 %	387129149
3118	NC_017856	GAT	2	6	174446	174451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387129149
3119	NC_017856	TATT	2	8	174516	174523	25 %	75 %	0 %	0 %	387129149
3120	NC_017856	T	6	6	174566	174571	0 %	100 %	0 %	0 %	387129149
3121	NC_017856	GCG	2	6	174594	174599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387129149
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3123	NC_017856	CAT	2	6	174643	174648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387129149
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