MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis RGTB423 chromosome

Total Repeats: 2343

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017528	TCATC	2	10	903	912	20 %	40 %	0 %	40 %	386003091
2	NC_017528	GTCGG	2	10	4593	4602	0 %	20 %	60 %	20 %	386003094
3	NC_017528	CGCAA	2	10	10328	10337	40 %	0 %	20 %	40 %	386003096
4	NC_017528	CGGCG	2	10	10454	10463	0 %	0 %	60 %	40 %	386003096
5	NC_017528	ACCCG	2	10	11284	11293	20 %	0 %	20 %	60 %	386003097
6	NC_017528	GGCGT	2	10	14159	14168	0 %	20 %	60 %	20 %	386003104
7	NC_017528	GGGCC	2	10	14442	14451	0 %	0 %	60 %	40 %	386003104
8	NC_017528	GCGTT	2	10	15187	15196	0 %	40 %	40 %	20 %	386003105
9	NC_017528	CGGCC	2	10	17894	17903	0 %	0 %	40 %	60 %	386003106
10	NC_017528	TTAGC	2	10	19045	19054	20 %	40 %	20 %	20 %	386003107
11	NC_017528	GGTCC	2	10	19117	19126	0 %	20 %	40 %	40 %	386003107
12	NC_017528	GTCGT	2	10	21637	21646	0 %	40 %	40 %	20 %	386003108
13	NC_017528	ATCAC	2	10	23910	23919	40 %	20 %	0 %	40 %	386003110
14	NC_017528	GCCGG	2	10	24597	24606	0 %	0 %	60 %	40 %	386003110
15	NC_017528	GGCAA	2	10	29311	29320	40 %	0 %	40 %	20 %	386003114
16	NC_017528	CGATC	2	10	30137	30146	20 %	20 %	20 %	40 %	386003115
17	NC_017528	CGACG	2	10	32320	32329	20 %	0 %	40 %	40 %	386003119
18	NC_017528	GCGTC	2	10	32375	32384	0 %	20 %	40 %	40 %	386003119
19	NC_017528	GACAC	2	10	32472	32481	40 %	0 %	20 %	40 %	386003119
20	NC_017528	TCCTG	2	10	37484	37493	0 %	40 %	20 %	40 %	386003123
21	NC_017528	CTCGG	2	10	37577	37586	0 %	20 %	40 %	40 %	386003123
22	NC_017528	GGCGC	2	10	38120	38129	0 %	0 %	60 %	40 %	386003123
23	NC_017528	TGGCC	2	10	38268	38277	0 %	20 %	40 %	40 %	386003123
24	NC_017528	CGGCG	2	10	38800	38809	0 %	0 %	60 %	40 %	386003123
25	NC_017528	GTCCA	2	10	39412	39421	20 %	20 %	20 %	40 %	386003124
26	NC_017528	GCACA	2	10	42346	42355	40 %	0 %	20 %	40 %	386003126
27	NC_017528	GGTAC	2	10	44884	44893	20 %	20 %	40 %	20 %	386003128
28	NC_017528	TCGAA	2	10	45116	45125	40 %	20 %	20 %	20 %	386003128
29	NC_017528	GCACC	2	10	46046	46055	20 %	0 %	20 %	60 %	386003128
30	NC_017528	CGGTG	2	10	47080	47089	0 %	20 %	60 %	20 %	386003129
31	NC_017528	TCATG	2	10	47226	47235	20 %	40 %	20 %	20 %	386003129
32	NC_017528	GCAGC	2	10	48620	48629	20 %	0 %	40 %	40 %	386003131
33	NC_017528	CCCGA	2	10	48703	48712	20 %	0 %	20 %	60 %	386003131
34	NC_017528	CAGCG	2	10	49831	49840	20 %	0 %	40 %	40 %	386003132
35	NC_017528	CGACC	2	10	58252	58261	20 %	0 %	20 %	60 %	386003138
36	NC_017528	CTTCG	2	10	58940	58949	0 %	40 %	20 %	40 %	386003139
37	NC_017528	TGCCG	2	10	65517	65526	0 %	20 %	40 %	40 %	386003145
38	NC_017528	GGCGA	2	10	66449	66458	20 %	0 %	60 %	20 %	386003146
39	NC_017528	TGCCT	2	10	72068	72077	0 %	40 %	20 %	40 %	386003149
40	NC_017528	GTCCA	2	10	72939	72948	20 %	20 %	20 %	40 %	386003150
41	NC_017528	TGACC	2	10	75563	75572	20 %	20 %	20 %	40 %	386003152
42	NC_017528	GCCAA	2	10	75877	75886	40 %	0 %	20 %	40 %	386003152
43	NC_017528	GTCGC	2	10	75954	75963	0 %	20 %	40 %	40 %	386003152
44	NC_017528	GCGCG	2	10	77042	77051	0 %	0 %	60 %	40 %	386003153
45	NC_017528	CACGA	2	10	79903	79912	40 %	0 %	20 %	40 %	386003156
46	NC_017528	CCACC	2	10	80537	80546	20 %	0 %	0 %	80 %	386003157
47	NC_017528	GAGCA	2	10	82444	82453	40 %	0 %	40 %	20 %	386003159
48	NC_017528	GCCGG	2	10	82543	82552	0 %	0 %	60 %	40 %	386003159
49	NC_017528	GCGAC	2	10	82619	82628	20 %	0 %	40 %	40 %	386003159
50	NC_017528	CACCG	2	10	84172	84181	20 %	0 %	20 %	60 %	386003160
51	NC_017528	TGGTC	2	10	86307	86316	0 %	40 %	40 %	20 %	386003162
52	NC_017528	GCTGG	2	10	86944	86953	0 %	20 %	60 %	20 %	386003163
53	NC_017528	TGGGT	2	10	89983	89992	0 %	40 %	60 %	0 %	386003169
54	NC_017528	TCGCC	2	10	90190	90199	0 %	20 %	20 %	60 %	386003169
55	NC_017528	GGGCC	2	10	91163	91172	0 %	0 %	60 %	40 %	386003170
56	NC_017528	GGCCG	2	10	92482	92491	0 %	0 %	60 %	40 %	386003171
57	NC_017528	GCGCC	2	10	93134	93143	0 %	0 %	40 %	60 %	386003171
58	NC_017528	GCTTG	2	10	95166	95175	0 %	40 %	40 %	20 %	386003173
59	NC_017528	CGTGT	2	10	95598	95607	0 %	40 %	40 %	20 %	386003174
60	NC_017528	AGATC	2	10	95677	95686	40 %	20 %	20 %	20 %	386003174
61	NC_017528	GCGGT	2	10	100339	100348	0 %	20 %	60 %	20 %	386003177
62	NC_017528	GCGCC	2	10	103174	103183	0 %	0 %	40 %	60 %	386003179
63	NC_017528	GGTGG	2	10	103862	103871	0 %	20 %	80 %	0 %	386003180
64	NC_017528	CTGGC	2	10	105597	105606	0 %	20 %	40 %	40 %	386003182
65	NC_017528	GCACA	2	10	106718	106727	40 %	0 %	20 %	40 %	386003182
66	NC_017528	CTGAA	2	10	109048	109057	40 %	20 %	20 %	20 %	386003185
67	NC_017528	ATCGC	2	10	109543	109552	20 %	20 %	20 %	40 %	386003185
68	NC_017528	TCGTG	2	10	122734	122743	0 %	40 %	40 %	20 %	386003187
69	NC_017528	CCGGA	2	10	124514	124523	20 %	0 %	40 %	40 %	386003189
70	NC_017528	ATCAC	2	10	131473	131482	40 %	20 %	0 %	40 %	386003191
71	NC_017528	ATCGG	2	10	131521	131530	20 %	20 %	40 %	20 %	386003191
72	NC_017528	CGGGC	2	10	132612	132621	0 %	0 %	60 %	40 %	386003191
73	NC_017528	GAGAT	2	10	138748	138757	40 %	20 %	40 %	0 %	386003196
74	NC_017528	CGGCG	2	10	140906	140915	0 %	0 %	60 %	40 %	386003198
75	NC_017528	TGCGG	2	10	141539	141548	0 %	20 %	60 %	20 %	386003199
76	NC_017528	CGCTG	2	10	142247	142256	0 %	20 %	40 %	40 %	386003200
77	NC_017528	GTTGC	2	10	142793	142802	0 %	40 %	40 %	20 %	386003200
78	NC_017528	CCGAT	2	10	143541	143550	20 %	20 %	20 %	40 %	386003200
79	NC_017528	ATCGG	2	10	149690	149699	20 %	20 %	40 %	20 %	386003204
80	NC_017528	TCGTC	2	10	154651	154660	0 %	40 %	20 %	40 %	386003206
81	NC_017528	CACGC	2	10	155115	155124	20 %	0 %	20 %	60 %	386003206
82	NC_017528	ATTCT	2	10	155959	155968	20 %	60 %	0 %	20 %	386003207
83	NC_017528	AGGCG	2	10	156487	156496	20 %	0 %	60 %	20 %	386003207
84	NC_017528	TGACC	2	10	159491	159500	20 %	20 %	20 %	40 %	386003210
85	NC_017528	CGGCG	2	10	159737	159746	0 %	0 %	60 %	40 %	386003210
86	NC_017528	GCACC	2	10	159907	159916	20 %	0 %	20 %	60 %	386003211
87	NC_017528	CCGCA	2	10	161086	161095	20 %	0 %	20 %	60 %	386003212
88	NC_017528	CGCGG	2	10	161165	161174	0 %	0 %	60 %	40 %	386003212
89	NC_017528	CGGTT	2	10	161492	161501	0 %	40 %	40 %	20 %	386003212
90	NC_017528	CTGGG	2	10	164289	164298	0 %	20 %	60 %	20 %	386003214
91	NC_017528	GCCGG	2	10	164882	164891	0 %	0 %	60 %	40 %	386003215
92	NC_017528	GTTGG	2	10	166851	166860	0 %	40 %	60 %	0 %	386003217
93	NC_017528	GCGTG	2	10	168019	168028	0 %	20 %	60 %	20 %	386003220
94	NC_017528	GCCGC	2	10	168694	168703	0 %	0 %	40 %	60 %	386003221
95	NC_017528	CCGCC	2	10	169945	169954	0 %	0 %	20 %	80 %	386003222
96	NC_017528	CTACC	2	10	171911	171920	20 %	20 %	0 %	60 %	386003224
97	NC_017528	GCGCC	2	10	174070	174079	0 %	0 %	40 %	60 %	386003226
98	NC_017528	ACCAA	2	10	174777	174786	60 %	0 %	0 %	40 %	386003226
99	NC_017528	CCCGA	2	10	174787	174796	20 %	0 %	20 %	60 %	386003226
100	NC_017528	TGGTC	2	10	175444	175453	0 %	40 %	40 %	20 %	386003227
101	NC_017528	TCGCT	2	10	176344	176353	0 %	40 %	20 %	40 %	386003228
102	NC_017528	GGGCT	2	10	176384	176393	0 %	20 %	60 %	20 %	386003228
103	NC_017528	GTTCG	2	10	178198	178207	0 %	40 %	40 %	20 %	386003231
104	NC_017528	GGACA	2	10	178408	178417	40 %	0 %	40 %	20 %	386003231
105	NC_017528	GCCGA	2	10	179231	179240	20 %	0 %	40 %	40 %	386003231
106	NC_017528	GTCGC	2	10	183824	183833	0 %	20 %	40 %	40 %	386003236
107	NC_017528	ACGGC	2	10	187985	187994	20 %	0 %	40 %	40 %	386003241
108	NC_017528	CGGCT	2	10	190847	190856	0 %	20 %	40 %	40 %	386003244
109	NC_017528	GGCTG	2	10	191078	191087	0 %	20 %	60 %	20 %	386003244
110	NC_017528	ACGGT	2	10	191224	191233	20 %	20 %	40 %	20 %	386003244
111	NC_017528	CACCC	2	10	191346	191355	20 %	0 %	0 %	80 %	386003244
112	NC_017528	CGGCG	2	10	197251	197260	0 %	0 %	60 %	40 %	386003249
113	NC_017528	GCCGC	2	10	204563	204572	0 %	0 %	40 %	60 %	386003256
114	NC_017528	GACCT	2	10	205181	205190	20 %	20 %	20 %	40 %	386003256
115	NC_017528	TTGCG	2	10	207169	207178	0 %	40 %	40 %	20 %	386003258
116	NC_017528	TTGCG	2	10	207242	207251	0 %	40 %	40 %	20 %	386003258
117	NC_017528	CCACG	2	10	208830	208839	20 %	0 %	20 %	60 %	386003260
118	NC_017528	CAGCA	2	10	210912	210921	40 %	0 %	20 %	40 %	386003262
119	NC_017528	ACCGC	2	10	212508	212517	20 %	0 %	20 %	60 %	386003263
120	NC_017528	GCAGG	2	10	212593	212602	20 %	0 %	60 %	20 %	386003263
121	NC_017528	CCTCG	2	10	215500	215509	0 %	20 %	20 %	60 %	386003266
122	NC_017528	TCGGT	3	15	216000	216014	0 %	40 %	40 %	20 %	386003267
123	NC_017528	GTGCG	2	10	217154	217163	0 %	20 %	60 %	20 %	386003268
124	NC_017528	CAACC	2	10	218856	218865	40 %	0 %	0 %	60 %	386003270
125	NC_017528	CGGCG	2	10	219309	219318	0 %	0 %	60 %	40 %	386003270
126	NC_017528	CAGCG	2	10	220552	220561	20 %	0 %	40 %	40 %	386003272
127	NC_017528	GAATC	2	10	220604	220613	40 %	20 %	20 %	20 %	386003272
128	NC_017528	CCCGA	2	10	220904	220913	20 %	0 %	20 %	60 %	386003272
129	NC_017528	GCGTC	2	10	222060	222069	0 %	20 %	40 %	40 %	386003273
130	NC_017528	CCGTG	2	10	222213	222222	0 %	20 %	40 %	40 %	386003273
131	NC_017528	CGGCG	2	10	222974	222983	0 %	0 %	60 %	40 %	386003274
132	NC_017528	CTGGC	2	10	223197	223206	0 %	20 %	40 %	40 %	386003274
133	NC_017528	ACCCG	2	10	223950	223959	20 %	0 %	20 %	60 %	386003275
134	NC_017528	CGCAG	2	10	225020	225029	20 %	0 %	40 %	40 %	386003276
135	NC_017528	CCGGG	2	10	228090	228099	0 %	0 %	60 %	40 %	386003278
136	NC_017528	TGCGC	2	10	231655	231664	0 %	20 %	40 %	40 %	386003280
137	NC_017528	ATCCA	2	10	235528	235537	40 %	20 %	0 %	40 %	386003282
138	NC_017528	TGCGC	2	10	236423	236432	0 %	20 %	40 %	40 %	386003282
139	NC_017528	TCGAT	2	10	237351	237360	20 %	40 %	20 %	20 %	386003283
140	NC_017528	ACGCC	2	10	242605	242614	20 %	0 %	20 %	60 %	386003286
141	NC_017528	TCACC	2	10	244630	244639	20 %	20 %	0 %	60 %	386003287
142	NC_017528	CCAGC	2	10	245160	245169	20 %	0 %	20 %	60 %	386003288
143	NC_017528	CGACG	2	10	246595	246604	20 %	0 %	40 %	40 %	386003288
144	NC_017528	GCGGT	2	10	250151	250160	0 %	20 %	60 %	20 %	386003291
145	NC_017528	GGTGA	2	10	251476	251485	20 %	20 %	60 %	0 %	386003292
146	NC_017528	CGCGG	2	10	253929	253938	0 %	0 %	60 %	40 %	386003293
147	NC_017528	GTCCA	2	10	257179	257188	20 %	20 %	20 %	40 %	386003294
148	NC_017528	CCCGG	2	10	258441	258450	0 %	0 %	40 %	60 %	386003296
149	NC_017528	CGGTG	2	10	259713	259722	0 %	20 %	60 %	20 %	386003297
150	NC_017528	GGCTC	2	10	259764	259773	0 %	20 %	40 %	40 %	386003297
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152	NC_017528	GGCCA	2	10	261329	261338	20 %	0 %	40 %	40 %	386003299
153	NC_017528	GGCGA	2	10	262250	262259	20 %	0 %	60 %	20 %	386003299
154	NC_017528	CGATG	2	10	265817	265826	20 %	20 %	40 %	20 %	386003302
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156	NC_017528	TCGGC	2	10	269249	269258	0 %	20 %	40 %	40 %	386003303
157	NC_017528	GTCGA	2	10	269265	269274	20 %	20 %	40 %	20 %	386003303
158	NC_017528	CGAGT	2	10	272864	272873	20 %	20 %	40 %	20 %	386003305
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162	NC_017528	GATCC	2	10	278628	278637	20 %	20 %	20 %	40 %	386003310
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164	NC_017528	AACCG	2	10	280737	280746	40 %	0 %	20 %	40 %	386003312
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167	NC_017528	GCGGT	2	10	292560	292569	0 %	20 %	60 %	20 %	386003320
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169	NC_017528	TGCGC	2	10	302398	302407	0 %	20 %	40 %	40 %	386003329
170	NC_017528	TGGGG	2	10	308605	308614	0 %	20 %	80 %	0 %	386003332
171	NC_017528	TGCGG	2	10	309260	309269	0 %	20 %	60 %	20 %	386003332
172	NC_017528	TGCCA	2	10	311024	311033	20 %	20 %	20 %	40 %	386003334
173	NC_017528	CGGCC	2	10	313393	313402	0 %	0 %	40 %	60 %	386003335
174	NC_017528	CAGAT	2	10	314300	314309	40 %	20 %	20 %	20 %	386003335
175	NC_017528	GGCCG	2	10	315166	315175	0 %	0 %	60 %	40 %	386003336
176	NC_017528	GCCCG	2	10	315664	315673	0 %	0 %	40 %	60 %	386003336
177	NC_017528	CCTGG	2	10	317240	317249	0 %	20 %	40 %	40 %	386003338
178	NC_017528	GGCCG	2	10	320346	320355	0 %	0 %	60 %	40 %	386003339
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237	NC_017528	TGGCG	2	10	453974	453983	0 %	20 %	60 %	20 %	386003432
238	NC_017528	GCGCG	2	10	454088	454097	0 %	0 %	60 %	40 %	386003432
239	NC_017528	TCTCG	2	10	455055	455064	0 %	40 %	20 %	40 %	386003433
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243	NC_017528	CAGCC	2	10	463028	463037	20 %	0 %	20 %	60 %	386003440
244	NC_017528	GTCCG	2	10	463148	463157	0 %	20 %	40 %	40 %	386003440
245	NC_017528	GCCGG	2	10	467163	467172	0 %	0 %	60 %	40 %	386003441
246	NC_017528	GTTGA	2	10	472216	472225	20 %	40 %	40 %	0 %	386003444
247	NC_017528	GATCG	2	10	473419	473428	20 %	20 %	40 %	20 %	386003445
248	NC_017528	TGGAT	2	10	475261	475270	20 %	40 %	40 %	0 %	386003447
249	NC_017528	CGAAC	2	10	475966	475975	40 %	0 %	20 %	40 %	386003448
250	NC_017528	CGACC	2	10	476283	476292	20 %	0 %	20 %	60 %	386003449
251	NC_017528	TCGCG	2	10	479593	479602	0 %	20 %	40 %	40 %	386003451
252	NC_017528	CAGGC	2	10	479806	479815	20 %	0 %	40 %	40 %	386003451
253	NC_017528	GCACC	2	10	480458	480467	20 %	0 %	20 %	60 %	386003452
254	NC_017528	GGACT	2	10	484612	484621	20 %	20 %	40 %	20 %	386003454
255	NC_017528	GCGCA	2	10	490648	490657	20 %	0 %	40 %	40 %	386003455
256	NC_017528	GTGCT	2	10	490733	490742	0 %	40 %	40 %	20 %	386003455
257	NC_017528	CTGAA	2	10	491122	491131	40 %	20 %	20 %	20 %	386003456
258	NC_017528	TGCGC	2	10	492785	492794	0 %	20 %	40 %	40 %	386003457
259	NC_017528	ATGGC	2	10	492862	492871	20 %	20 %	40 %	20 %	386003457
260	NC_017528	CGCAA	2	10	493108	493117	40 %	0 %	20 %	40 %	386003457
261	NC_017528	ATCGA	2	10	494930	494939	40 %	20 %	20 %	20 %	386003458
262	NC_017528	GGGCG	2	10	497674	497683	0 %	0 %	80 %	20 %	386003459
263	NC_017528	CGGCT	2	10	499650	499659	0 %	20 %	40 %	40 %	386003460
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