MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis RGTB423 chromosome

Total Repeats: 73422

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017528	AGC	2	6	199	204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003091
2	NC_017528	GCC	2	6	261	266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386003091
3	NC_017528	CCG	2	6	305	310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386003091
4	NC_017528	CGAC	2	8	312	319	25 %	0 %	25 %	50 %	386003091
5	NC_017528	CGA	2	6	325	330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003091
6	NC_017528	GCC	2	6	340	345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386003091
7	NC_017528	ACG	2	6	390	395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003091
8	NC_017528	TGA	2	6	400	405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386003091
9	NC_017528	CGTT	2	8	528	535	0 %	50 %	25 %	25 %	386003091
10	NC_017528	CGC	3	9	562	570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386003091
11	NC_017528	CCCG	2	8	590	597	0 %	0 %	25 %	75 %	386003091
12	NC_017528	AC	3	6	644	649	50 %	0 %	0 %	50 %	386003091
13	NC_017528	GGCA	2	8	661	668	25 %	0 %	50 %	25 %	386003091
14	NC_017528	GTT	2	6	682	687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386003091
15	NC_017528	CGA	2	6	811	816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003091
16	NC_017528	TTC	2	6	857	862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386003091
17	NC_017528	CAA	2	6	889	894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386003091
18	NC_017528	TCATC	2	10	903	912	20 %	40 %	0 %	40 %	386003091
19	NC_017528	CCCA	2	8	919	926	25 %	0 %	0 %	75 %	386003091
20	NC_017528	AGC	2	6	927	932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003091
21	NC_017528	ACC	2	6	994	999	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386003091
22	NC_017528	CGA	2	6	1063	1068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003091
23	NC_017528	CAG	2	6	1087	1092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003091
24	NC_017528	GC	3	6	1122	1127	0 %	0 %	50 %	50 %	386003091
25	NC_017528	GCG	2	6	1238	1243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386003091
26	NC_017528	CCG	2	6	1260	1265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386003091
27	NC_017528	CA	3	6	1409	1414	50 %	0 %	0 %	50 %	386003091
28	NC_017528	CAC	2	6	1492	1497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386003091
29	NC_017528	GGTA	2	8	3468	3475	25 %	25 %	50 %	0 %	386003092
30	NC_017528	GTG	2	6	3502	3507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386003092
31	NC_017528	ACG	2	6	3509	3514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003092
32	NC_017528	CAA	2	6	3558	3563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386003092
33	NC_017528	ATC	2	6	3579	3584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386003092
34	NC_017528	TGT	2	6	3626	3631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386003092
35	NC_017528	GGTT	2	8	3650	3657	0 %	50 %	50 %	0 %	386003092
36	NC_017528	CGG	2	6	3676	3681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386003092
37	NC_017528	GAT	2	6	3691	3696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386003092
38	NC_017528	GT	3	6	3815	3820	0 %	50 %	50 %	0 %	386003092
39	NC_017528	TGG	2	6	3872	3877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386003092
40	NC_017528	CCGC	2	8	3878	3885	0 %	0 %	25 %	75 %	386003092
41	NC_017528	GAA	2	6	3918	3923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386003092
42	NC_017528	AGC	2	6	4032	4037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003092
43	NC_017528	GGC	2	6	4047	4052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386003092
44	NC_017528	GGC	2	6	4056	4061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386003092
45	NC_017528	GAC	2	6	4114	4119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003092
46	NC_017528	GGC	2	6	4204	4209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386003093
47	NC_017528	TGG	2	6	4231	4236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386003093
48	NC_017528	GTT	2	6	4246	4251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386003093
49	NC_017528	CGA	2	6	4255	4260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003093
50	NC_017528	CGG	2	6	4305	4310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386003093
51	NC_017528	CCG	2	6	4317	4322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386003093
52	NC_017528	CCG	2	6	4362	4367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386003093
53	NC_017528	GGT	2	6	4426	4431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386003093
54	NC_017528	TGC	3	9	4536	4544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386003094
55	NC_017528	CG	5	10	4546	4555	0 %	0 %	50 %	50 %	386003094
56	NC_017528	GTCGG	2	10	4593	4602	0 %	20 %	60 %	20 %	386003094
57	NC_017528	CGA	2	6	4615	4620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003094
58	NC_017528	GGT	2	6	4749	4754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386003094
59	NC_017528	CCA	2	6	4758	4763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386003094
60	NC_017528	ACG	2	6	4796	4801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003094
61	NC_017528	CGC	2	6	4881	4886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386003094
62	NC_017528	CGG	2	6	4931	4936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386003094
63	NC_017528	CG	3	6	4982	4987	0 %	0 %	50 %	50 %	386003094
64	NC_017528	AAG	2	6	5259	5264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386003095
65	NC_017528	GGT	2	6	5387	5392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386003095
66	NC_017528	CGA	2	6	5405	5410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003095
67	NC_017528	TGC	2	6	5446	5451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386003095
68	NC_017528	CGA	2	6	5477	5482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003095
69	NC_017528	CCAC	2	8	5503	5510	25 %	0 %	0 %	75 %	386003095
70	NC_017528	ACCG	2	8	5522	5529	25 %	0 %	25 %	50 %	386003095
71	NC_017528	GTG	2	6	5535	5540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386003095
72	NC_017528	CGG	2	6	5558	5563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386003095
73	NC_017528	TGG	2	6	5594	5599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386003095
74	NC_017528	CGGCGT	2	12	5606	5617	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386003095
75	NC_017528	GGT	2	6	5621	5626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386003095
76	NC_017528	CAAG	2	8	5717	5724	50 %	0 %	25 %	25 %	386003095
77	NC_017528	AAG	2	6	5736	5741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386003095
78	NC_017528	CGCC	2	8	5813	5820	0 %	0 %	25 %	75 %	386003095
79	NC_017528	CAA	2	6	5843	5848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386003095
80	NC_017528	CGA	2	6	5870	5875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003095
81	NC_017528	GTC	2	6	5895	5900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386003095
82	NC_017528	TGG	2	6	6013	6018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386003095
83	NC_017528	AGC	2	6	6060	6065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003095
84	NC_017528	GGC	2	6	6180	6185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386003095
85	NC_017528	GC	3	6	6208	6213	0 %	0 %	50 %	50 %	386003095
86	NC_017528	GGT	2	6	6221	6226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386003095
87	NC_017528	AAGGAC	2	12	6258	6269	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	386003095
88	NC_017528	AGACCA	2	12	6352	6363	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386003095
89	NC_017528	GCG	2	6	6524	6529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386003095
90	NC_017528	CGGC	2	8	6628	6635	0 %	0 %	50 %	50 %	386003095
91	NC_017528	ATC	2	6	6696	6701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386003095
92	NC_017528	GC	3	6	6714	6719	0 %	0 %	50 %	50 %	386003095
93	NC_017528	ATC	2	6	6756	6761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386003095
94	NC_017528	ACG	2	6	6784	6789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003095
95	NC_017528	TGT	2	6	6871	6876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386003095
96	NC_017528	GTT	3	9	6881	6889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386003095
97	NC_017528	CCG	2	6	6939	6944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386003095
98	NC_017528	CTG	2	6	7011	7016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386003095
99	NC_017528	GAA	2	6	7037	7042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386003095
100	NC_017528	CAA	2	6	7046	7051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386003095
101	NC_017528	ACC	2	6	7113	7118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386003095
102	NC_017528	GT	3	6	7135	7140	0 %	50 %	50 %	0 %	386003095
103	NC_017528	GAC	2	6	7158	7163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003095
104	NC_017528	GCC	4	12	7164	7175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386003095
105	NC_017528	GTT	2	6	7181	7186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386003095
106	NC_017528	CG	3	6	7214	7219	0 %	0 %	50 %	50 %	386003095
107	NC_017528	CGC	2	6	10046	10051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386003096
108	NC_017528	TGC	2	6	10062	10067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386003096
109	NC_017528	GCC	3	9	10098	10106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386003096
110	NC_017528	CCCG	2	8	10137	10144	0 %	0 %	25 %	75 %	386003096
111	NC_017528	CCG	4	12	10142	10153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386003096
112	NC_017528	GCC	2	6	10207	10212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386003096
113	NC_017528	CCG	2	6	10271	10276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386003096
114	NC_017528	CGCAA	2	10	10328	10337	40 %	0 %	20 %	40 %	386003096
115	NC_017528	GCC	2	6	10390	10395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386003096
116	NC_017528	GCG	2	6	10403	10408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386003096
117	NC_017528	CGGCG	2	10	10454	10463	0 %	0 %	60 %	40 %	386003096
118	NC_017528	TGT	3	9	10535	10543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386003096
119	NC_017528	TTC	2	6	10555	10560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386003096
120	NC_017528	GAT	2	6	10566	10571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386003096
121	NC_017528	CGG	2	6	10599	10604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386003096
122	NC_017528	AAC	2	6	10651	10656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386003096
123	NC_017528	GCA	2	6	10664	10669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003096
124	NC_017528	CGG	2	6	10701	10706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386003096
125	NC_017528	TGA	2	6	10739	10744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386003096
126	NC_017528	CCA	2	6	10754	10759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386003096
127	NC_017528	CGG	2	6	10797	10802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386003096
128	NC_017528	ACCCG	2	10	11284	11293	20 %	0 %	20 %	60 %	386003097
129	NC_017528	CGG	2	6	11325	11330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386003097
130	NC_017528	ACG	2	6	11387	11392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003097
131	NC_017528	GCAC	2	8	11613	11620	25 %	0 %	25 %	50 %	386003098
132	NC_017528	CCG	2	6	11642	11647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386003098
133	NC_017528	GGT	2	6	11907	11912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386003099
134	NC_017528	CGA	2	6	11933	11938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003099
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136	NC_017528	GCC	2	6	11982	11987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386003099
137	NC_017528	GGT	2	6	12010	12015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386003099
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156	NC_017528	CCCG	2	8	13452	13459	0 %	0 %	25 %	75 %	386003101
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164	NC_017528	GA	3	6	14131	14136	50 %	0 %	50 %	0 %	386003104
165	NC_017528	TGAT	2	8	14140	14147	25 %	50 %	25 %	0 %	386003104
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256	NC_017528	CGG	2	6	19887	19892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386003107
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258	NC_017528	CAG	2	6	20057	20062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003107
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260	NC_017528	TCG	2	6	20103	20108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386003107
261	NC_017528	CGG	2	6	20149	20154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386003107
262	NC_017528	AG	3	6	20229	20234	50 %	0 %	50 %	0 %	386003107
263	NC_017528	GTCGT	2	10	21637	21646	0 %	40 %	40 %	20 %	386003108
264	NC_017528	GCC	3	9	21650	21658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386003108
265	NC_017528	TCG	2	6	21705	21710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386003108
266	NC_017528	CGG	2	6	21736	21741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386003108
267	NC_017528	AGT	2	6	21784	21789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386003108
268	NC_017528	GGT	2	6	21811	21816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386003108
269	NC_017528	GAG	2	6	21836	21841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386003108
270	NC_017528	TGG	3	9	21867	21875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386003108
271	NC_017528	CGGG	2	8	21891	21898	0 %	0 %	75 %	25 %	386003108
272	NC_017528	GGC	2	6	21923	21928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386003108
273	NC_017528	GCC	2	6	21941	21946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386003108
274	NC_017528	GCCG	2	8	21982	21989	0 %	0 %	50 %	50 %	386003108
275	NC_017528	GC	3	6	22010	22015	0 %	0 %	50 %	50 %	386003108
276	NC_017528	CGG	2	6	22018	22023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386003108
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278	NC_017528	TCA	2	6	22041	22046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386003108
279	NC_017528	ATG	2	6	22175	22180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386003108
280	NC_017528	GTA	2	6	22207	22212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386003108
281	NC_017528	TGC	2	6	22215	22220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386003108
282	NC_017528	GAT	2	6	22222	22227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386003108
283	NC_017528	CG	3	6	22228	22233	0 %	0 %	50 %	50 %	386003108
284	NC_017528	TCA	2	6	22254	22259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386003108
285	NC_017528	ACC	2	6	22302	22307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386003108
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287	NC_017528	CGGC	2	8	22382	22389	0 %	0 %	50 %	50 %	386003108
288	NC_017528	GTC	3	9	22414	22422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386003108
289	NC_017528	CGTAGT	2	12	22461	22472	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386003108
290	NC_017528	CGA	2	6	22473	22478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003108
291	NC_017528	CGA	3	9	22485	22493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003108
292	NC_017528	GCC	3	9	22510	22518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386003108
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294	NC_017528	CCT	2	6	22734	22739	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386003108
295	NC_017528	TCG	2	6	22757	22762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386003108
296	NC_017528	GTC	2	6	22783	22788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386003108
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299	NC_017528	GC	3	6	22955	22960	0 %	0 %	50 %	50 %	386003108
300	NC_017528	CAGC	2	8	22968	22975	25 %	0 %	25 %	50 %	386003108
301	NC_017528	CAG	2	6	22981	22986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003108
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331	NC_017528	CGGG	2	8	24427	24434	0 %	0 %	75 %	25 %	386003110
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343	NC_017528	CCA	2	6	24888	24893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386003110
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370	NC_017528	CGA	2	6	27987	27992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003112
371	NC_017528	TC	3	6	28018	28023	0 %	50 %	0 %	50 %	386003112
372	NC_017528	GCC	2	6	28058	28063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386003112
373	NC_017528	CCGG	2	8	28104	28111	0 %	0 %	50 %	50 %	386003112
374	NC_017528	CG	3	6	28143	28148	0 %	0 %	50 %	50 %	386003112
375	NC_017528	GC	3	6	28149	28154	0 %	0 %	50 %	50 %	386003112
376	NC_017528	GTC	2	6	28210	28215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386003112
377	NC_017528	TCGGCG	2	12	28245	28256	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386003112
378	NC_017528	CGA	2	6	28258	28263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003112
379	NC_017528	GC	3	6	28302	28307	0 %	0 %	50 %	50 %	386003112
380	NC_017528	TCG	2	6	28326	28331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386003112
381	NC_017528	ACG	2	6	28350	28355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003112
382	NC_017528	GCA	2	6	28366	28371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003112
383	NC_017528	TCA	2	6	28407	28412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386003113
384	NC_017528	CAC	2	6	28455	28460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386003113
385	NC_017528	CTG	2	6	28474	28479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386003113
386	NC_017528	GGC	2	6	28548	28553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386003113
387	NC_017528	CTG	2	6	28562	28567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386003113
388	NC_017528	TCA	2	6	28595	28600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386003113
389	NC_017528	CGG	2	6	28630	28635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386003113
390	NC_017528	CGA	2	6	28653	28658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003113
391	NC_017528	GCTC	2	8	28660	28667	0 %	25 %	25 %	50 %	386003113
392	NC_017528	ACC	2	6	28672	28677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386003113
393	NC_017528	CGT	2	6	28720	28725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386003113
394	NC_017528	GC	4	8	28737	28744	0 %	0 %	50 %	50 %	386003113
395	NC_017528	CGA	2	6	28768	28773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003113
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399	NC_017528	CGC	2	6	28896	28901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386003113
400	NC_017528	CAC	2	6	29013	29018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386003113
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402	NC_017528	CAA	2	6	29118	29123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386003113
403	NC_017528	GTC	2	6	29128	29133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386003113
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409	NC_017528	CG	3	6	29432	29437	0 %	0 %	50 %	50 %	386003114
410	NC_017528	GGATCA	2	12	29443	29454	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386003114
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421	NC_017528	CCGG	2	8	30155	30162	0 %	0 %	50 %	50 %	386003115
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492	NC_017528	CGA	2	6	33515	33520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003120
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494	NC_017528	CCA	2	6	34453	34458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386003121
495	NC_017528	GGT	2	6	34501	34506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386003121
496	NC_017528	GGCC	2	8	34616	34623	0 %	0 %	50 %	50 %	386003121
497	NC_017528	GAC	2	6	34644	34649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003121
498	NC_017528	TGA	2	6	34663	34668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386003121
499	NC_017528	TCGAGG	2	12	34864	34875	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386003121
500	NC_017528	CGA	2	6	34880	34885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003121

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