MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis CTRI-2 chromosome

Total Repeats: 100120

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_017524	CG	4	8	479302	479309	0 %	0 %	50 %	50 %	385997170
11002	NC_017524	CGC	2	6	479336	479341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385997170
11003	NC_017524	TCG	2	6	479400	479405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997170
11004	NC_017524	GTC	2	6	479435	479440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997170
11005	NC_017524	GTG	2	6	479455	479460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385997170
11006	NC_017524	TCA	2	6	479470	479475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385997170
11007	NC_017524	GC	4	8	479520	479527	0 %	0 %	50 %	50 %	385997171
11008	NC_017524	GCC	2	6	479539	479544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385997171
11009	NC_017524	CGT	2	6	479547	479552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997171
11010	NC_017524	GGC	2	6	479619	479624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997171
11011	NC_017524	GGC	3	9	479681	479689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997171
11012	NC_017524	CGG	2	6	479768	479773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997171
11013	NC_017524	TCG	2	6	479789	479794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997171
11014	NC_017524	TGC	3	9	479819	479827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997171
11015	NC_017524	GCC	2	6	479839	479844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385997171
11016	NC_017524	GCACC	2	10	479857	479866	20 %	0 %	20 %	60 %	385997171
11017	NC_017524	GCA	2	6	480080	480085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997172
11018	NC_017524	GTG	2	6	480112	480117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385997172
11019	NC_017524	CGA	2	6	480118	480123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997172
11020	NC_017524	CCA	2	6	480171	480176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385997172
11021	NC_017524	GTG	2	6	480262	480267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385997172
11022	NC_017524	CGA	2	6	480278	480283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997172
11023	NC_017524	CCA	2	6	480299	480304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385997172
11024	NC_017524	GGCC	2	8	480392	480399	0 %	0 %	50 %	50 %	385997172
11025	NC_017524	TCT	2	6	480406	480411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385997172
11026	NC_017524	ATG	2	6	480466	480471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385997172
11027	NC_017524	GCA	2	6	480479	480484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997172
11028	NC_017524	CAGTG	2	10	480490	480499	20 %	20 %	40 %	20 %	385997172
11029	NC_017524	TGC	2	6	480514	480519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997172
11030	NC_017524	CGA	2	6	480572	480577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997172
11031	NC_017524	CGG	2	6	480581	480586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997172
11032	NC_017524	ATG	3	9	480616	480624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385997172
11033	NC_017524	ACG	2	6	480646	480651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997172
11034	NC_017524	AGAT	2	8	480715	480722	50 %	25 %	25 %	0 %	385997172
11035	NC_017524	TCG	2	6	480757	480762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997172
11036	NC_017524	ATG	2	6	480772	480777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385997172
11037	NC_017524	TG	3	6	480785	480790	0 %	50 %	50 %	0 %	385997172
11038	NC_017524	TGA	2	6	480827	480832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385997172
11039	NC_017524	GTC	2	6	480927	480932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997172
11040	NC_017524	GTT	2	6	480933	480938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385997172
11041	NC_017524	GGC	2	6	480939	480944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997172
11042	NC_017524	TGG	2	6	481055	481060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385997172
11043	NC_017524	AGT	2	6	481084	481089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385997172
11044	NC_017524	TG	3	6	481096	481101	0 %	50 %	50 %	0 %	385997172
11045	NC_017524	GTC	2	6	481119	481124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997172
11046	NC_017524	CAA	2	6	481176	481181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385997172
11047	NC_017524	CAG	2	6	481195	481200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997172
11048	NC_017524	GTC	2	6	481260	481265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997172
11049	NC_017524	CGA	2	6	481500	481505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997172
11050	NC_017524	CG	3	6	481549	481554	0 %	0 %	50 %	50 %	385997172
11051	NC_017524	GTCG	2	8	481605	481612	0 %	25 %	50 %	25 %	385997172
11052	NC_017524	GTA	2	6	481728	481733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385997172
11053	NC_017524	CAG	2	6	481791	481796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997172
11054	NC_017524	GGC	2	6	481800	481805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997172
11055	NC_017524	GGGCC	2	10	481813	481822	0 %	0 %	60 %	40 %	385997172
11056	NC_017524	ACG	2	6	481828	481833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997172
11057	NC_017524	GAT	2	6	481911	481916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385997172
11058	NC_017524	CCA	2	6	482071	482076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385997172
11059	NC_017524	GTA	2	6	482085	482090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385997172
11060	NC_017524	CGA	2	6	482138	482143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997172
11061	NC_017524	GAT	2	6	482148	482153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385997172
11062	NC_017524	CCA	2	6	482183	482188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385997172
11063	NC_017524	GAT	2	6	482244	482249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385997172
11064	NC_017524	CAG	2	6	482262	482267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997172
11065	NC_017524	CAG	2	6	482283	482288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997172
11066	NC_017524	AGC	2	6	482298	482303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997172
11067	NC_017524	AGCG	2	8	482308	482315	25 %	0 %	50 %	25 %	385997172
11068	NC_017524	AAC	2	6	482326	482331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385997172
11069	NC_017524	CGG	3	9	482445	482453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997172
11070	NC_017524	CGG	2	6	482480	482485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997172
11071	NC_017524	GCC	2	6	482508	482513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385997172
11072	NC_017524	TGC	2	6	482544	482549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997172
11073	NC_017524	CGC	2	6	482574	482579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385997172
11074	NC_017524	GTGG	2	8	482619	482626	0 %	25 %	75 %	0 %	385997172
11075	NC_017524	TCA	2	6	482674	482679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385997172
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11078	NC_017524	CGAC	2	8	482816	482823	25 %	0 %	25 %	50 %	385997172
11079	NC_017524	GCG	2	6	482831	482836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997172
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11081	NC_017524	CAC	2	6	482847	482852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385997172
11082	NC_017524	CAGAA	2	10	482869	482878	60 %	0 %	20 %	20 %	385997172
11083	NC_017524	GCG	2	6	482911	482916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997172
11084	NC_017524	CTC	2	6	482944	482949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385997172
11085	NC_017524	CTC	2	6	483002	483007	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385997173
11086	NC_017524	CGG	2	6	483082	483087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997173
11087	NC_017524	GGT	2	6	483092	483097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385997173
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11089	NC_017524	GGCATC	2	12	483149	483160	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385997173
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11091	NC_017524	CGA	2	6	483744	483749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997174
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11094	NC_017524	CGA	2	6	483877	483882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997174
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11100	NC_017524	GCG	2	6	484307	484312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997174
11101	NC_017524	GTT	2	6	484392	484397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385997174
11102	NC_017524	GATG	2	8	484454	484461	25 %	25 %	50 %	0 %	385997174
11103	NC_017524	TGCT	2	8	484466	484473	0 %	50 %	25 %	25 %	385997174
11104	NC_017524	AAT	2	6	484581	484586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385997174
11105	NC_017524	TCC	2	6	484628	484633	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385997174
11106	NC_017524	CAT	2	6	484676	484681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385997174
11107	NC_017524	GGT	2	6	484698	484703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385997174
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11113	NC_017524	GAT	2	6	485131	485136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385997174
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11117	NC_017524	TCT	2	6	485340	485345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385997174
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11119	NC_017524	GGC	2	6	485394	485399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997174
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11122	NC_017524	GCA	2	6	485758	485763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997175
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11227	NC_017524	GAGC	2	8	490380	490387	25 %	0 %	50 %	25 %	385997176
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11234	NC_017524	GGC	2	6	490644	490649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997177
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11475	NC_017524	TGC	2	6	501493	501498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997185
11476	NC_017524	AG	3	6	501535	501540	50 %	0 %	50 %	0 %	385997185
11477	NC_017524	GAC	2	6	501562	501567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997185
11478	NC_017524	GTC	2	6	501600	501605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997185
11479	NC_017524	GGT	2	6	501644	501649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385997185
11480	NC_017524	TGC	2	6	501688	501693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997185
11481	NC_017524	GCC	2	6	501879	501884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385997185
11482	NC_017524	TCG	2	6	501891	501896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997186
11483	NC_017524	AGGTCG	2	12	501912	501923	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385997186
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11485	NC_017524	CGC	2	6	501940	501945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385997186
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11490	NC_017524	TCA	2	6	502135	502140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385997187
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11495	NC_017524	CGA	2	6	502487	502492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997187
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11500	NC_017524	GTT	2	6	502697	502702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385997187

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