MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis CCDC5079 chromosome

Total Repeats: 2983

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017523	TCATC	2	10	901	910	20 %	40 %	0 %	40 %	385993127
2	NC_017523	CGTTT	2	10	2091	2100	0 %	60 %	20 %	20 %	385993128
3	NC_017523	CGGTT	2	10	3240	3249	0 %	40 %	40 %	20 %	385993128
4	NC_017523	GTCGG	2	10	4588	4597	0 %	20 %	60 %	20 %	385993130
5	NC_017523	GCAGC	2	10	7373	7382	20 %	0 %	40 %	40 %	385993132
6	NC_017523	CGGTG	2	10	9281	9290	0 %	20 %	60 %	20 %	385993132
7	NC_017523	CAGAC	2	10	9799	9808	40 %	0 %	20 %	40 %	385993132
8	NC_017523	CGCAA	2	10	11201	11210	40 %	0 %	20 %	40 %	385993133
9	NC_017523	CGGCG	2	10	11327	11336	0 %	0 %	60 %	40 %	385993133
10	NC_017523	GGCGT	2	10	15032	15041	0 %	20 %	60 %	20 %	385993137
11	NC_017523	GGGCC	2	10	15315	15324	0 %	0 %	60 %	40 %	385993137
12	NC_017523	GCGTT	2	10	16060	16069	0 %	40 %	40 %	20 %	385993138
13	NC_017523	CCAGC	2	10	16600	16609	20 %	0 %	20 %	60 %	385993139
14	NC_017523	ACCGA	2	10	17363	17372	40 %	0 %	20 %	40 %	385993139
15	NC_017523	ATCGG	2	10	17755	17764	20 %	20 %	40 %	20 %	385993139
16	NC_017523	CGGCC	2	10	18764	18773	0 %	0 %	40 %	60 %	385993140
17	NC_017523	TTAGC	2	10	19915	19924	20 %	40 %	20 %	20 %	385993141
18	NC_017523	GGTCC	2	10	19987	19996	0 %	20 %	40 %	40 %	385993141
19	NC_017523	GTCGT	2	10	22506	22515	0 %	40 %	40 %	20 %	385993143
20	NC_017523	ATCAC	2	10	24779	24788	40 %	20 %	0 %	40 %	385993145
21	NC_017523	GCCGG	2	10	25466	25475	0 %	0 %	60 %	40 %	385993145
22	NC_017523	GGCAA	2	10	30160	30169	40 %	0 %	40 %	20 %	385993149
23	NC_017523	CGATC	2	10	30986	30995	20 %	20 %	20 %	40 %	385993150
24	NC_017523	CGACG	2	10	33169	33178	20 %	0 %	40 %	40 %	385993153
25	NC_017523	GCGTC	2	10	33224	33233	0 %	20 %	40 %	40 %	385993153
26	NC_017523	GACAC	2	10	33321	33330	40 %	0 %	20 %	40 %	385993153
27	NC_017523	TCCTG	2	10	38326	38335	0 %	40 %	20 %	40 %	385993158
28	NC_017523	CTCGG	2	10	38419	38428	0 %	20 %	40 %	40 %	385993158
29	NC_017523	GGCGC	2	10	38962	38971	0 %	0 %	60 %	40 %	385993158
30	NC_017523	TGGCC	2	10	39110	39119	0 %	20 %	40 %	40 %	385993158
31	NC_017523	CGGCG	2	10	39642	39651	0 %	0 %	60 %	40 %	385993158
32	NC_017523	GTCCA	2	10	40422	40431	20 %	20 %	20 %	40 %	385993159
33	NC_017523	GCCAA	2	10	42556	42565	40 %	0 %	20 %	40 %	385993161
34	NC_017523	GGTAC	2	10	45888	45897	20 %	20 %	40 %	20 %	385993163
35	NC_017523	TCGAA	2	10	46120	46129	40 %	20 %	20 %	20 %	385993163
36	NC_017523	GCACC	2	10	47050	47059	20 %	0 %	20 %	60 %	385993163
37	NC_017523	CGGTG	2	10	48084	48093	0 %	20 %	60 %	20 %	385993164
38	NC_017523	GCAGC	2	10	49624	49633	20 %	0 %	40 %	40 %	385993166
39	NC_017523	CCCGA	2	10	49707	49716	20 %	0 %	20 %	60 %	385993166
40	NC_017523	CTCCC	2	10	57273	57282	0 %	20 %	0 %	80 %	385993173
41	NC_017523	CGGCG	2	10	57722	57731	0 %	0 %	60 %	40 %	385993173
42	NC_017523	CTTCG	2	10	59942	59951	0 %	40 %	20 %	40 %	385993175
43	NC_017523	TCAGG	2	10	63484	63493	20 %	20 %	40 %	20 %	385993177
44	NC_017523	GGCGA	2	10	67447	67456	20 %	0 %	60 %	20 %	385993180
45	NC_017523	GGTGT	2	10	70024	70033	0 %	40 %	60 %	0 %	385993182
46	NC_017523	ATCGG	2	10	70661	70670	20 %	20 %	40 %	20 %	385993182
47	NC_017523	CCGCG	2	10	71198	71207	0 %	0 %	40 %	60 %	385993182
48	NC_017523	GGCAA	2	10	71549	71558	40 %	0 %	40 %	20 %	385993182
49	NC_017523	CGACC	2	10	71838	71847	20 %	0 %	20 %	60 %	385993182
50	NC_017523	CGGGT	2	10	72292	72301	0 %	20 %	60 %	20 %	385993182
51	NC_017523	GGTCG	2	10	72352	72361	0 %	20 %	60 %	20 %	385993182
52	NC_017523	TGCCT	2	10	73093	73102	0 %	40 %	20 %	40 %	385993183
53	NC_017523	GTCCA	2	10	73964	73973	20 %	20 %	20 %	40 %	385993184
54	NC_017523	TGACC	2	10	76588	76597	20 %	20 %	20 %	40 %	385993186
55	NC_017523	GCCAA	2	10	76902	76911	40 %	0 %	20 %	40 %	385993186
56	NC_017523	GTCGC	2	10	76979	76988	0 %	20 %	40 %	40 %	385993186
57	NC_017523	GCGCG	2	10	78067	78076	0 %	0 %	60 %	40 %	385993187
58	NC_017523	ATCCG	2	10	80959	80968	20 %	20 %	20 %	40 %	385993189
59	NC_017523	CACCG	2	10	81739	81748	20 %	0 %	20 %	60 %	385993190
60	NC_017523	TGGTC	2	10	83874	83883	0 %	40 %	40 %	20 %	385993191
61	NC_017523	GCTGG	2	10	84511	84520	0 %	20 %	60 %	20 %	385993192
62	NC_017523	TGGGT	2	10	87549	87558	0 %	40 %	60 %	0 %	385993197
63	NC_017523	TCGCC	2	10	87756	87765	0 %	20 %	20 %	60 %	385993197
64	NC_017523	GGGCC	2	10	88729	88738	0 %	0 %	60 %	40 %	385993198
65	NC_017523	GGCCG	2	10	90048	90057	0 %	0 %	60 %	40 %	385993199
66	NC_017523	GCGCC	2	10	90700	90709	0 %	0 %	40 %	60 %	385993199
67	NC_017523	GCTTG	2	10	92732	92741	0 %	40 %	40 %	20 %	385993201
68	NC_017523	CGTGT	2	10	93164	93173	0 %	40 %	40 %	20 %	385993202
69	NC_017523	AGATC	2	10	93243	93252	40 %	20 %	20 %	20 %	385993202
70	NC_017523	CGGCG	2	10	96815	96824	0 %	0 %	60 %	40 %	385993205
71	NC_017523	GCGGT	2	10	97891	97900	0 %	20 %	60 %	20 %	385993206
72	NC_017523	GGTGG	2	10	101414	101423	0 %	20 %	80 %	0 %	385993208
73	NC_017523	CTGGC	2	10	103151	103160	0 %	20 %	40 %	40 %	385993209
74	NC_017523	GCACA	2	10	104272	104281	40 %	0 %	20 %	40 %	385993209
75	NC_017523	CTGAA	2	10	106602	106611	40 %	20 %	20 %	20 %	385993212
76	NC_017523	ATCGC	2	10	107097	107106	20 %	20 %	20 %	40 %	385993212
77	NC_017523	TCTGA	2	10	108431	108440	20 %	40 %	20 %	20 %	385993213
78	NC_017523	CGGTC	2	10	108706	108715	0 %	20 %	40 %	40 %	385993213
79	NC_017523	GACCA	2	10	109844	109853	40 %	0 %	20 %	40 %	385993213
80	NC_017523	GGCTG	2	10	112407	112416	0 %	20 %	60 %	20 %	385993214
81	NC_017523	CCGCG	2	10	116327	116336	0 %	0 %	40 %	60 %	385993215
82	NC_017523	TCGTG	2	10	120280	120289	0 %	40 %	40 %	20 %	385993217
83	NC_017523	CCGGA	2	10	122061	122070	20 %	0 %	40 %	40 %	385993218
84	NC_017523	TGCGC	2	10	124534	124543	0 %	20 %	40 %	40 %	385993219
85	NC_017523	GCGAG	2	10	125045	125054	20 %	0 %	60 %	20 %	385993219
86	NC_017523	GGGGT	2	10	126054	126063	0 %	20 %	80 %	0 %	385993219
87	NC_017523	CCCAC	2	10	126616	126625	20 %	0 %	0 %	80 %	385993219
88	NC_017523	CCGGC	2	10	127126	127135	0 %	0 %	40 %	60 %	385993219
89	NC_017523	TGCGG	2	10	127536	127545	0 %	20 %	60 %	20 %	385993219
90	NC_017523	ATCAC	2	10	129015	129024	40 %	20 %	0 %	40 %	385993220
91	NC_017523	ATCGG	2	10	129063	129072	20 %	20 %	40 %	20 %	385993220
92	NC_017523	CGGGC	2	10	130154	130163	0 %	0 %	60 %	40 %	385993220
93	NC_017523	GCGAT	2	10	131959	131968	20 %	20 %	40 %	20 %	385993222
94	NC_017523	GTTCG	2	10	132180	132189	0 %	40 %	40 %	20 %	385993222
95	NC_017523	CCTGG	2	10	132572	132581	0 %	20 %	40 %	40 %	385993222
96	NC_017523	GGCCC	2	10	132678	132687	0 %	0 %	40 %	60 %	385993222
97	NC_017523	CGTTG	2	10	133190	133199	0 %	40 %	40 %	20 %	385993222
98	NC_017523	CGACC	2	10	133262	133271	20 %	0 %	20 %	60 %	385993222
99	NC_017523	GAGAT	2	10	136282	136291	40 %	20 %	40 %	0 %	385993225
100	NC_017523	CGGCG	2	10	138436	138445	0 %	0 %	60 %	40 %	385993226
101	NC_017523	TGCGG	2	10	139069	139078	0 %	20 %	60 %	20 %	385993227
102	NC_017523	CGCTG	2	10	139776	139785	0 %	20 %	40 %	40 %	385993228
103	NC_017523	GTTGC	2	10	140322	140331	0 %	40 %	40 %	20 %	385993228
104	NC_017523	CCGAT	2	10	141070	141079	20 %	20 %	20 %	40 %	385993228
105	NC_017523	ATCGC	2	10	141761	141770	20 %	20 %	20 %	40 %	385993229
106	NC_017523	AACCG	2	10	142500	142509	40 %	0 %	20 %	40 %	385993229
107	NC_017523	CCGCC	2	10	143087	143096	0 %	0 %	20 %	80 %	385993229
108	NC_017523	CCGCC	2	10	143730	143739	0 %	0 %	20 %	80 %	385993230
109	NC_017523	ATCGG	2	10	147215	147224	20 %	20 %	40 %	20 %	385993234
110	NC_017523	TCGTC	2	10	152173	152182	0 %	40 %	20 %	40 %	385993238
111	NC_017523	CACGC	2	10	152637	152646	20 %	0 %	20 %	60 %	385993238
112	NC_017523	ATTCT	2	10	153481	153490	20 %	60 %	0 %	20 %	385993239
113	NC_017523	AGGCG	2	10	154009	154018	20 %	0 %	60 %	20 %	385993239
114	NC_017523	TGACC	2	10	157013	157022	20 %	20 %	20 %	40 %	385993242
115	NC_017523	CGGCG	2	10	157259	157268	0 %	0 %	60 %	40 %	385993242
116	NC_017523	CCGCA	2	10	158608	158617	20 %	0 %	20 %	60 %	385993244
117	NC_017523	CGCGG	2	10	158687	158696	0 %	0 %	60 %	40 %	385993244
118	NC_017523	CGGTT	2	10	159014	159023	0 %	40 %	40 %	20 %	385993244
119	NC_017523	CTGGG	2	10	161810	161819	0 %	20 %	60 %	20 %	385993247
120	NC_017523	GCCGG	2	10	162403	162412	0 %	0 %	60 %	40 %	385993248
121	NC_017523	GTTGG	2	10	164372	164381	0 %	40 %	60 %	0 %	385993250
122	NC_017523	GCGTG	2	10	165538	165547	0 %	20 %	60 %	20 %	385993253
123	NC_017523	GCCGC	2	10	166211	166220	0 %	0 %	40 %	60 %	385993253
124	NC_017523	CCGCC	2	10	167462	167471	0 %	0 %	20 %	80 %	385993254
125	NC_017523	CTACC	2	10	169428	169437	20 %	20 %	0 %	60 %	385993256
126	NC_017523	GCGCC	2	10	171587	171596	0 %	0 %	40 %	60 %	385993258
127	NC_017523	ACCAA	2	10	172294	172303	60 %	0 %	0 %	40 %	385993258
128	NC_017523	CCCGA	2	10	172304	172313	20 %	0 %	20 %	60 %	385993258
129	NC_017523	TGGTC	2	10	172962	172971	0 %	40 %	40 %	20 %	385993259
130	NC_017523	TCGCT	2	10	173861	173870	0 %	40 %	20 %	40 %	385993260
131	NC_017523	GGGCT	2	10	173901	173910	0 %	20 %	60 %	20 %	385993260
132	NC_017523	GTTCG	2	10	175715	175724	0 %	40 %	40 %	20 %	385993262
133	NC_017523	GGACA	2	10	175925	175934	40 %	0 %	40 %	20 %	385993262
134	NC_017523	GCCGA	2	10	176748	176757	20 %	0 %	40 %	40 %	385993262
135	NC_017523	TTCAT	2	10	177924	177933	20 %	60 %	0 %	20 %	385993263
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141	NC_017523	ACGGT	2	10	188733	188742	20 %	20 %	40 %	20 %	385993272
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149	NC_017523	CCACG	2	10	206324	206333	20 %	0 %	20 %	60 %	385993288
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252	NC_017523	ACCCC	2	10	383383	383392	20 %	0 %	0 %	80 %	385993420
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254	NC_017523	GCTCG	2	10	386459	386468	0 %	20 %	40 %	40 %	385993424
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260	NC_017523	GCGAT	2	10	392837	392846	20 %	20 %	40 %	20 %	385993431
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262	NC_017523	TCGAC	2	10	395273	395282	20 %	20 %	20 %	40 %	385993434
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