MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Mycoplasma hyorhinis MCLD chromosome

Total Repeats: 783

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017519	AAAAC	2	10	734	743	80 %	0 %	0 %	20 %	385858115
2	NC_017519	TATTT	2	10	761	770	20 %	80 %	0 %	0 %	385858115
3	NC_017519	TTTTG	2	10	855	864	0 %	80 %	20 %	0 %	385858115
4	NC_017519	ATTTA	2	10	977	986	40 %	60 %	0 %	0 %	385858115
5	NC_017519	TTTTG	2	10	1276	1285	0 %	80 %	20 %	0 %	385858115
6	NC_017519	ATAAA	2	10	1397	1406	80 %	20 %	0 %	0 %	385858115
7	NC_017519	GATAA	2	10	2458	2467	60 %	20 %	20 %	0 %	385858118
8	NC_017519	AAATT	2	10	2676	2685	60 %	40 %	0 %	0 %	385858119
9	NC_017519	TGATT	2	10	6173	6182	20 %	60 %	20 %	0 %	385858120
10	NC_017519	ATCTA	2	10	6669	6678	40 %	40 %	0 %	20 %	385858120
11	NC_017519	TGCTT	2	10	7700	7709	0 %	60 %	20 %	20 %	385858122
12	NC_017519	AAATT	2	10	11038	11047	60 %	40 %	0 %	0 %	385858129
13	NC_017519	ATAAA	2	10	12481	12490	80 %	20 %	0 %	0 %	385858129
14	NC_017519	TTTTG	2	10	13421	13430	0 %	80 %	20 %	0 %	385858131
15	NC_017519	GATTT	2	10	13777	13786	20 %	60 %	20 %	0 %	385858132
16	NC_017519	TTCAA	2	10	14057	14066	40 %	40 %	0 %	20 %	385858132
17	NC_017519	GTTGA	2	10	14770	14779	20 %	40 %	40 %	0 %	385858132
18	NC_017519	CAATT	2	10	16802	16811	40 %	40 %	0 %	20 %	385858134
19	NC_017519	TTACT	2	10	17087	17096	20 %	60 %	0 %	20 %	385858134
20	NC_017519	AATTA	2	10	18319	18328	60 %	40 %	0 %	0 %	385858135
21	NC_017519	GGATA	2	10	20237	20246	40 %	20 %	40 %	0 %	385858136
22	NC_017519	AATTA	2	10	20593	20602	60 %	40 %	0 %	0 %	385858137
23	NC_017519	AGAAA	2	10	21077	21086	80 %	0 %	20 %	0 %	385858137
24	NC_017519	CAAAA	2	10	21375	21384	80 %	0 %	0 %	20 %	385858137
25	NC_017519	CAACA	2	10	21387	21396	60 %	0 %	0 %	40 %	385858137
26	NC_017519	CATTT	2	10	21544	21553	20 %	60 %	0 %	20 %	385858137
27	NC_017519	TTAAA	2	10	21594	21603	60 %	40 %	0 %	0 %	385858137
28	NC_017519	AGTTT	2	10	22457	22466	20 %	60 %	20 %	0 %	385858137
29	NC_017519	CAAAT	2	10	24004	24013	60 %	20 %	0 %	20 %	385858137
30	NC_017519	CAAAC	2	10	24170	24179	60 %	0 %	0 %	40 %	385858137
31	NC_017519	TTCAA	2	10	24522	24531	40 %	40 %	0 %	20 %	385858137
32	NC_017519	ATTTA	2	10	26839	26848	40 %	60 %	0 %	0 %	385858137
33	NC_017519	TCAAC	2	10	28064	28073	40 %	20 %	0 %	40 %	385858137
34	NC_017519	GAATT	2	10	29867	29876	40 %	40 %	20 %	0 %	385858138
35	NC_017519	AATTT	2	10	30293	30302	40 %	60 %	0 %	0 %	385858138
36	NC_017519	GTTTA	2	10	30947	30956	20 %	60 %	20 %	0 %	385858138
37	NC_017519	GTAAT	2	10	31184	31193	40 %	40 %	20 %	0 %	385858138
38	NC_017519	TGAAA	2	10	35509	35518	60 %	20 %	20 %	0 %	385858141
39	NC_017519	CTAAG	2	10	38392	38401	40 %	20 %	20 %	20 %	385858144
40	NC_017519	TGGAT	2	10	41588	41597	20 %	40 %	40 %	0 %	385858148
41	NC_017519	TGGAT	2	10	41627	41636	20 %	40 %	40 %	0 %	385858148
42	NC_017519	TGGAT	2	10	41666	41675	20 %	40 %	40 %	0 %	385858148
43	NC_017519	TGGAT	2	10	41705	41714	20 %	40 %	40 %	0 %	385858148
44	NC_017519	TATCT	2	10	45578	45587	20 %	60 %	0 %	20 %	385858152
45	NC_017519	CAAAA	2	10	45771	45780	80 %	0 %	0 %	20 %	385858152
46	NC_017519	GAAAA	2	10	46373	46382	80 %	0 %	20 %	0 %	385858153
47	NC_017519	AATTA	2	10	46785	46794	60 %	40 %	0 %	0 %	385858153
48	NC_017519	TTTAT	2	10	46887	46896	20 %	80 %	0 %	0 %	385858153
49	NC_017519	TAATT	2	10	46923	46932	40 %	60 %	0 %	0 %	385858153
50	NC_017519	ATTTT	2	10	48652	48661	20 %	80 %	0 %	0 %	385858154
51	NC_017519	ATTAT	2	10	49801	49810	40 %	60 %	0 %	0 %	385858155
52	NC_017519	AAATA	2	10	50301	50310	80 %	20 %	0 %	0 %	385858157
53	NC_017519	AATTT	2	10	51225	51234	40 %	60 %	0 %	0 %	385858158
54	NC_017519	TGATA	2	10	52466	52475	40 %	40 %	20 %	0 %	385858158
55	NC_017519	TCATA	2	10	53693	53702	40 %	40 %	0 %	20 %	385858159
56	NC_017519	AATTA	2	10	54669	54678	60 %	40 %	0 %	0 %	385858159
57	NC_017519	GAGCA	2	10	56124	56133	40 %	0 %	40 %	20 %	385858160
58	NC_017519	AATAA	2	10	57647	57656	80 %	20 %	0 %	0 %	385858162
59	NC_017519	GCTAA	2	10	57678	57687	40 %	20 %	20 %	20 %	385858162
60	NC_017519	AATTT	2	10	59550	59559	40 %	60 %	0 %	0 %	385858164
61	NC_017519	TTGTT	2	10	60633	60642	0 %	80 %	20 %	0 %	385858167
62	NC_017519	TTTGC	2	10	62121	62130	0 %	60 %	20 %	20 %	385858168
63	NC_017519	ATTTT	2	10	63760	63769	20 %	80 %	0 %	0 %	385858169
64	NC_017519	TTTTG	2	10	69518	69527	0 %	80 %	20 %	0 %	385858171
65	NC_017519	TAAAT	2	10	69721	69730	60 %	40 %	0 %	0 %	385858171
66	NC_017519	TTGTC	2	10	71705	71714	0 %	60 %	20 %	20 %	385858171
67	NC_017519	AAAAT	2	10	71999	72008	80 %	20 %	0 %	0 %	385858171
68	NC_017519	GTAGA	2	10	75048	75057	40 %	20 %	40 %	0 %	385858175
69	NC_017519	TCAAT	2	10	75058	75067	40 %	40 %	0 %	20 %	385858175
70	NC_017519	ATTTT	2	10	77125	77134	20 %	80 %	0 %	0 %	385858177
71	NC_017519	ATTAA	2	10	78237	78246	60 %	40 %	0 %	0 %	385858179
72	NC_017519	TTTTC	2	10	79037	79046	0 %	80 %	0 %	20 %	385858181
73	NC_017519	AATAC	2	10	79813	79822	60 %	20 %	0 %	20 %	385858181
74	NC_017519	AATAA	2	10	82114	82123	80 %	20 %	0 %	0 %	385858183
75	NC_017519	ATAAA	2	10	82409	82418	80 %	20 %	0 %	0 %	385858183
76	NC_017519	AATCT	2	10	82590	82599	40 %	40 %	0 %	20 %	385858184
77	NC_017519	AAAAT	2	10	83219	83228	80 %	20 %	0 %	0 %	385858185
78	NC_017519	TAATT	2	10	83919	83928	40 %	60 %	0 %	0 %	385858186
79	NC_017519	AATTA	2	10	85602	85611	60 %	40 %	0 %	0 %	385858188
80	NC_017519	TTTGA	2	10	88633	88642	20 %	60 %	20 %	0 %	385858191
81	NC_017519	AATTA	2	10	89521	89530	60 %	40 %	0 %	0 %	385858192
82	NC_017519	CAAAA	2	10	90608	90617	80 %	0 %	0 %	20 %	385858192
83	NC_017519	TAAAC	2	10	91658	91667	60 %	20 %	0 %	20 %	385858193
84	NC_017519	ATTCT	2	10	92222	92231	20 %	60 %	0 %	20 %	385858193
85	NC_017519	TCAAA	2	10	92613	92622	60 %	20 %	0 %	20 %	385858193
86	NC_017519	GAAAA	2	10	93173	93182	80 %	0 %	20 %	0 %	385858194
87	NC_017519	ATTTT	2	10	93537	93546	20 %	80 %	0 %	0 %	385858194
88	NC_017519	TATTT	2	10	95632	95641	20 %	80 %	0 %	0 %	385858197
89	NC_017519	TTGTT	2	10	97043	97052	0 %	80 %	20 %	0 %	385858198
90	NC_017519	AATTA	2	10	99856	99865	60 %	40 %	0 %	0 %	385858199
91	NC_017519	AAATT	2	10	99948	99957	60 %	40 %	0 %	0 %	385858199
92	NC_017519	CTAAA	2	10	100431	100440	60 %	20 %	0 %	20 %	385858199
93	NC_017519	TAAAT	2	10	101644	101653	60 %	40 %	0 %	0 %	385858199
94	NC_017519	TTTCA	2	10	102234	102243	20 %	60 %	0 %	20 %	385858199
95	NC_017519	GTTTT	2	10	102277	102286	0 %	80 %	20 %	0 %	385858199
96	NC_017519	TGTTT	2	10	104486	104495	0 %	80 %	20 %	0 %	385858200
97	NC_017519	TTCAA	2	10	110416	110425	40 %	40 %	0 %	20 %	385858207
98	NC_017519	TGATT	2	10	111478	111487	20 %	60 %	20 %	0 %	385858207
99	NC_017519	CTCAT	2	10	112376	112385	20 %	40 %	0 %	40 %	385858208
100	NC_017519	ATATT	2	10	113013	113022	40 %	60 %	0 %	0 %	385858209
101	NC_017519	CTTTT	2	10	113222	113231	0 %	80 %	0 %	20 %	385858210
102	NC_017519	ACTTA	2	10	113345	113354	40 %	40 %	0 %	20 %	385858210
103	NC_017519	AACTA	2	10	113444	113453	60 %	20 %	0 %	20 %	385858210
104	NC_017519	ATTAA	2	10	116215	116224	60 %	40 %	0 %	0 %	385858213
105	NC_017519	AGCTC	2	10	116519	116528	20 %	20 %	20 %	40 %	385858214
106	NC_017519	TTTTC	2	10	117688	117697	0 %	80 %	0 %	20 %	385858215
107	NC_017519	TATGA	2	10	118642	118651	40 %	40 %	20 %	0 %	385858215
108	NC_017519	AGAAA	2	10	120051	120060	80 %	0 %	20 %	0 %	385858216
109	NC_017519	AATTA	2	10	123545	123554	60 %	40 %	0 %	0 %	385858217
110	NC_017519	ACTAA	2	10	125414	125423	60 %	20 %	0 %	20 %	385858219
111	NC_017519	AATTG	2	10	125450	125459	40 %	40 %	20 %	0 %	385858219
112	NC_017519	TAATT	2	10	125575	125584	40 %	60 %	0 %	0 %	385858219
113	NC_017519	TTGGT	2	10	127612	127621	0 %	60 %	40 %	0 %	385858221
114	NC_017519	AGATT	2	10	127728	127737	40 %	40 %	20 %	0 %	385858221
115	NC_017519	TAATT	2	10	128304	128313	40 %	60 %	0 %	0 %	385858222
116	NC_017519	TCATC	2	10	129018	129027	20 %	40 %	0 %	40 %	385858223
117	NC_017519	AAATT	2	10	129759	129768	60 %	40 %	0 %	0 %	385858224
118	NC_017519	ATTAT	2	10	132344	132353	40 %	60 %	0 %	0 %	385858227
119	NC_017519	TATTT	2	10	132487	132496	20 %	80 %	0 %	0 %	385858227
120	NC_017519	GTTTT	2	10	132519	132528	0 %	80 %	20 %	0 %	385858227
121	NC_017519	ATTTA	2	10	132627	132636	40 %	60 %	0 %	0 %	385858227
122	NC_017519	TAATT	2	10	132998	133007	40 %	60 %	0 %	0 %	385858228
123	NC_017519	CAATA	2	10	133429	133438	60 %	20 %	0 %	20 %	385858228
124	NC_017519	TTAAT	2	10	133531	133540	40 %	60 %	0 %	0 %	385858228
125	NC_017519	TAATT	2	10	133565	133574	40 %	60 %	0 %	0 %	385858228
126	NC_017519	AAATT	2	10	133702	133711	60 %	40 %	0 %	0 %	385858228
127	NC_017519	TCATC	2	10	136908	136917	20 %	40 %	0 %	40 %	385858231
128	NC_017519	ATTTA	2	10	137698	137707	40 %	60 %	0 %	0 %	385858233
129	NC_017519	TATTT	2	10	137819	137828	20 %	80 %	0 %	0 %	385858233
130	NC_017519	GCAAA	2	10	137970	137979	60 %	0 %	20 %	20 %	385858233
131	NC_017519	AGAAA	2	10	138465	138474	80 %	0 %	20 %	0 %	385858234
132	NC_017519	GACTA	2	10	139163	139172	40 %	20 %	20 %	20 %	385858234
133	NC_017519	AAATA	2	10	140430	140439	80 %	20 %	0 %	0 %	385858236
134	NC_017519	TAATA	2	10	141272	141281	60 %	40 %	0 %	0 %	385858236
135	NC_017519	AAATC	2	10	142146	142155	60 %	20 %	0 %	20 %	385858237
136	NC_017519	TGCAA	2	10	142913	142922	40 %	20 %	20 %	20 %	385858237
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