MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis RGTB327 chromosome

Total Repeats: 77118

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_017026	CAT	2	6	108024	108029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383306032
2002	NC_017026	CCT	2	6	108073	108078	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383306032
2003	NC_017026	CGAA	2	8	108100	108107	50 %	0 %	25 %	25 %	383306032
2004	NC_017026	CGG	2	6	108157	108162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306032
2005	NC_017026	GGC	2	6	108163	108168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306032
2006	NC_017026	CGC	2	6	109859	109864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306033
2007	NC_017026	CGA	2	6	109886	109891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306033
2008	NC_017026	CGA	2	6	109910	109915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306033
2009	NC_017026	CTG	2	6	109959	109964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306033
2010	NC_017026	AGC	2	6	109969	109974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306033
2011	NC_017026	TG	3	6	110057	110062	0 %	50 %	50 %	0 %	383306033
2012	NC_017026	CCG	2	6	110161	110166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306034
2013	NC_017026	CACC	2	8	110422	110429	25 %	0 %	0 %	75 %	383306034
2014	NC_017026	CTG	2	6	110435	110440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306034
2015	NC_017026	CGG	2	6	110443	110448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306034
2016	NC_017026	ACC	2	6	110489	110494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383306034
2017	NC_017026	CGG	2	6	110499	110504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306034
2018	NC_017026	CCG	2	6	110554	110559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306034
2019	NC_017026	GAA	2	6	110579	110584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383306034
2020	NC_017026	CGA	2	6	110626	110631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306034
2021	NC_017026	CGG	2	6	110641	110646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306034
2022	NC_017026	TGG	2	6	110781	110786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383306034
2023	NC_017026	GCG	2	6	110789	110794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306034
2024	NC_017026	TCTGA	2	10	110873	110882	20 %	40 %	20 %	20 %	383306034
2025	NC_017026	GAG	2	6	111011	111016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383306034
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2027	NC_017026	CGGTC	2	10	111148	111157	0 %	20 %	40 %	40 %	383306034
2028	NC_017026	GAA	2	6	111188	111193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383306034
2029	NC_017026	AC	3	6	111248	111253	50 %	0 %	0 %	50 %	383306034
2030	NC_017026	GGC	2	6	111295	111300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306034
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2032	NC_017026	TGGT	2	8	111482	111489	0 %	50 %	50 %	0 %	383306034
2033	NC_017026	CGA	3	9	111529	111537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306034
2034	NC_017026	GCC	2	6	111683	111688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306034
2035	NC_017026	CA	3	6	111745	111750	50 %	0 %	0 %	50 %	383306034
2036	NC_017026	AC	3	6	111755	111760	50 %	0 %	0 %	50 %	383306034
2037	NC_017026	CTG	2	6	111767	111772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306034
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2039	NC_017026	CAT	2	6	111790	111795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383306034
2040	NC_017026	GCTC	2	8	111846	111853	0 %	25 %	25 %	50 %	383306034
2041	NC_017026	GAG	2	6	111947	111952	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383306034
2042	NC_017026	GC	3	6	111975	111980	0 %	0 %	50 %	50 %	383306034
2043	NC_017026	GGC	2	6	112018	112023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306034
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2050	NC_017026	GCT	2	6	112202	112207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306034
2051	NC_017026	GCT	2	6	112222	112227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306034
2052	NC_017026	GTC	2	6	112256	112261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306034
2053	NC_017026	CTT	2	6	112267	112272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383306034
2054	NC_017026	GACCA	2	10	112286	112295	40 %	0 %	20 %	40 %	383306034
2055	NC_017026	CGGC	2	8	112321	112328	0 %	0 %	50 %	50 %	383306034
2056	NC_017026	GTC	2	6	112367	112372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306034
2057	NC_017026	CGACGG	2	12	112411	112422	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	383306034
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2061	NC_017026	GCT	2	6	112829	112834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306034
2062	NC_017026	CCG	2	6	112845	112850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306034
2063	NC_017026	AGCG	2	8	112860	112867	25 %	0 %	50 %	25 %	383306034
2064	NC_017026	TCG	2	6	112922	112927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306034
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2108	NC_017026	GT	3	6	114691	114696	0 %	50 %	50 %	0 %	383306034
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2114	NC_017026	CGAT	2	8	114774	114781	25 %	25 %	25 %	25 %	383306034
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2117	NC_017026	GGCTG	2	10	114850	114859	0 %	20 %	60 %	20 %	383306034
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2120	NC_017026	GCCG	2	8	114943	114950	0 %	0 %	50 %	50 %	383306034
2121	NC_017026	CGG	2	6	115068	115073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306034
2122	NC_017026	GGT	2	6	115145	115150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383306034
2123	NC_017026	GGC	2	6	115180	115185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306034
2124	NC_017026	GCT	2	6	115207	115212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306034
2125	NC_017026	TGG	3	9	115296	115304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383306034
2126	NC_017026	TGG	2	6	115329	115334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383306034
2127	NC_017026	CGGG	2	8	115348	115355	0 %	0 %	75 %	25 %	383306034
2128	NC_017026	GCG	2	6	115397	115402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306034
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2132	NC_017026	CCGG	2	8	115502	115509	0 %	0 %	50 %	50 %	383306034
2133	NC_017026	CGGG	2	8	115565	115572	0 %	0 %	75 %	25 %	383306034
2134	NC_017026	CGG	2	6	115606	115611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306034
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2143	NC_017026	CGA	2	6	116089	116094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306034
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2190	NC_017026	TGC	2	6	122503	122508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306036
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2222	NC_017026	CG	3	6	124126	124131	0 %	0 %	50 %	50 %	383306037
2223	NC_017026	ACG	2	6	124132	124137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306037
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2226	NC_017026	AGT	2	6	124218	124223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383306037
2227	NC_017026	GGC	2	6	124244	124249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306037
2228	NC_017026	GCG	2	6	124264	124269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306037
2229	NC_017026	GCGG	2	8	124324	124331	0 %	0 %	75 %	25 %	383306037
2230	NC_017026	TGG	2	6	124464	124469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383306038
2231	NC_017026	CGA	2	6	124486	124491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306038
2232	NC_017026	TTG	2	6	124505	124510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383306038
2233	NC_017026	CCGGA	2	10	124513	124522	20 %	0 %	40 %	40 %	383306038
2234	NC_017026	GGT	2	6	124525	124530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383306038
2235	NC_017026	CAC	2	6	124600	124605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383306038
2236	NC_017026	GGA	2	6	124606	124611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383306038
2237	NC_017026	TG	3	6	124634	124639	0 %	50 %	50 %	0 %	383306038
2238	NC_017026	CGA	2	6	124654	124659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306038
2239	NC_017026	CTG	2	6	124661	124666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306038
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2241	NC_017026	TCG	2	6	124710	124715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306038
2242	NC_017026	CTG	2	6	124750	124755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306038
2243	NC_017026	GCC	2	6	124808	124813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306038
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2463	NC_017026	CGG	2	6	138638	138643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306045
2464	NC_017026	GAGAT	2	10	138745	138754	40 %	20 %	40 %	0 %	383306045
2465	NC_017026	TCGC	2	8	138761	138768	0 %	25 %	25 %	50 %	383306045
2466	NC_017026	TCGA	2	8	138795	138802	25 %	25 %	25 %	25 %	383306045
2467	NC_017026	TC	3	6	138813	138818	0 %	50 %	0 %	50 %	383306045
2468	NC_017026	GAA	2	6	138819	138824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383306045
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2481	NC_017026	CGG	2	6	139208	139213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306045
2482	NC_017026	GTC	2	6	139226	139231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306045
2483	NC_017026	CAA	2	6	139248	139253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383306045
2484	NC_017026	GTC	2	6	139260	139265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306045
2485	NC_017026	GACGCG	2	12	139272	139283	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	383306045
2486	NC_017026	CACT	2	8	139292	139299	25 %	25 %	0 %	50 %	383306045
2487	NC_017026	TCT	2	6	139331	139336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383306045
2488	NC_017026	GTG	2	6	139338	139343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383306045
2489	NC_017026	ATG	2	6	139509	139514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383306045
2490	NC_017026	CGCA	2	8	139544	139551	25 %	0 %	25 %	50 %	383306045
2491	NC_017026	GGA	2	6	139569	139574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383306045
2492	NC_017026	TG	3	6	139702	139707	0 %	50 %	50 %	0 %	383306045
2493	NC_017026	CGA	2	6	139723	139728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306045
2494	NC_017026	GAT	2	6	140048	140053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383306046
2495	NC_017026	TGT	2	6	140063	140068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383306046
2496	NC_017026	CGA	2	6	140089	140094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306046
2497	NC_017026	GGGC	2	8	140097	140104	0 %	0 %	75 %	25 %	383306046
2498	NC_017026	GCT	2	6	140111	140116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306046
2499	NC_017026	ACC	2	6	140358	140363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383306047
2500	NC_017026	GACC	2	8	140465	140472	25 %	0 %	25 %	50 %	383306047

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