MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Mycoplasma hyorhinis GDL-1 chromosome

Total Repeats: 11142

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016829	GAA	2	6	3	8	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378835507
2	NC_016829	ATA	2	6	41	46	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378835507
3	NC_016829	ATT	2	6	71	76	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378835507
4	NC_016829	TGA	2	6	90	95	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378835507
5	NC_016829	AAT	2	6	99	104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378835507
6	NC_016829	AAT	2	6	156	161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378835507
7	NC_016829	AAT	2	6	175	180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378835507
8	NC_016829	TTA	2	6	217	222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378835507
9	NC_016829	ACT	2	6	271	276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378835507
10	NC_016829	TTC	2	6	339	344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378835507
11	NC_016829	AAC	2	6	391	396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378835507
12	NC_016829	TAA	2	6	444	449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378835507
13	NC_016829	TTC	2	6	522	527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378835507
14	NC_016829	GAA	2	6	582	587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378835507
15	NC_016829	ACA	2	6	619	624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378835507
16	NC_016829	TAT	2	6	704	709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378835507
17	NC_016829	TGA	2	6	711	716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378835507
18	NC_016829	TAA	2	6	732	737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378835507
19	NC_016829	CAA	2	6	743	748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378835507
20	NC_016829	ATC	2	6	799	804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378835507
21	NC_016829	GGT	2	6	835	840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378835507
22	NC_016829	GAA	2	6	844	849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378835507
23	NC_016829	TTA	2	6	854	859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378835507
24	NC_016829	AGA	2	6	906	911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378835507
25	NC_016829	ATA	2	6	1150	1155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378835507
26	NC_016829	GAA	2	6	1156	1161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378835507
27	NC_016829	ATT	2	6	1169	1174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378835507
28	NC_016829	AGA	2	6	1188	1193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378835507
29	NC_016829	ATT	2	6	1324	1329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378835507
30	NC_016829	CAA	2	6	1338	1343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378835507
31	NC_016829	AGG	2	6	1666	1671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378835508
32	NC_016829	ATT	3	9	1672	1680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378835508
33	NC_016829	AAG	2	6	1687	1692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378835508
34	NC_016829	ATG	2	6	1911	1916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378835508
35	NC_016829	TAA	2	6	1962	1967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378835508
36	NC_016829	ATT	2	6	2052	2057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378835508
37	NC_016829	TAT	2	6	2058	2063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378835508
38	NC_016829	AGA	2	6	2212	2217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378835508
39	NC_016829	AGA	2	6	2224	2229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378835508
40	NC_016829	TGA	2	6	2245	2250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378835508
41	NC_016829	ACA	2	6	2279	2284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378835508
42	NC_016829	GAT	2	6	2345	2350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378835508
43	NC_016829	ATT	2	6	2358	2363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378835508
44	NC_016829	CAA	2	6	2406	2411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378835508
45	NC_016829	TTC	2	6	2416	2421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378835508
46	NC_016829	AGA	2	6	2458	2463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378835508
47	NC_016829	AAT	2	6	2506	2511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378835508
48	NC_016829	TAA	2	6	2626	2631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378835508
49	NC_016829	AAC	2	6	2673	2678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378835508
50	NC_016829	AAT	2	6	2710	2715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378835509
51	NC_016829	AGA	2	6	2917	2922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378835509
52	NC_016829	TAG	3	9	2967	2975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378835510
53	NC_016829	TGG	2	6	3094	3099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378835510
54	NC_016829	TAA	2	6	3114	3119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378835510
55	NC_016829	TGG	2	6	3139	3144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378835510
56	NC_016829	CAG	2	6	3210	3215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378835510
57	NC_016829	AGA	2	6	3304	3309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378835510
58	NC_016829	ATT	2	6	3395	3400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378835510
59	NC_016829	ACA	2	6	3401	3406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378835510
60	NC_016829	GAA	2	6	3440	3445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378835510
61	NC_016829	TTC	2	6	3622	3627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378835510
62	NC_016829	GAA	2	6	3683	3688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378835510
63	NC_016829	ATT	2	6	3698	3703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378835510
64	NC_016829	AAG	2	6	4000	4005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378835510
65	NC_016829	GAA	2	6	4070	4075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378835510
66	NC_016829	GCA	2	6	4076	4081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378835510
67	NC_016829	TAG	2	6	4092	4097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378835510
68	NC_016829	TGA	2	6	4180	4185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378835510
69	NC_016829	ATG	2	6	4563	4568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378835510
70	NC_016829	TGA	2	6	4662	4667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378835510
71	NC_016829	CTG	2	6	4719	4724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378835510
72	NC_016829	ATT	2	6	4810	4815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378835511
73	NC_016829	TAA	2	6	4821	4826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378835511
74	NC_016829	TGA	2	6	4827	4832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378835511
75	NC_016829	AGA	2	6	4833	4838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378835511
76	NC_016829	GAA	2	6	4842	4847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378835511
77	NC_016829	TAG	2	6	4884	4889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378835511
78	NC_016829	ATT	2	6	4900	4905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378835511
79	NC_016829	AAG	2	6	4939	4944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378835511
80	NC_016829	ATT	2	6	4963	4968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378835511
81	NC_016829	TAA	2	6	5075	5080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378835511
82	NC_016829	TAA	2	6	5127	5132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378835511
83	NC_016829	ATT	2	6	5184	5189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378835511
84	NC_016829	TAT	2	6	5297	5302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378835512
85	NC_016829	TCA	2	6	5327	5332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378835512
86	NC_016829	TTC	2	6	5415	5420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378835512
87	NC_016829	GAA	3	9	5472	5480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378835512
88	NC_016829	GAA	2	6	5484	5489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378835512
89	NC_016829	CAT	2	6	5513	5518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378835512
90	NC_016829	CAG	2	6	5527	5532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378835512
91	NC_016829	TTA	2	6	5559	5564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378835512
92	NC_016829	ATC	3	9	5599	5607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378835512
93	NC_016829	TGT	2	6	5609	5614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378835512
94	NC_016829	TTC	2	6	5615	5620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378835512
95	NC_016829	TTC	2	6	5648	5653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378835512
96	NC_016829	GCT	2	6	5664	5669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378835512
97	NC_016829	TGA	2	6	5711	5716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378835512
98	NC_016829	ACA	2	6	5781	5786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378835512
99	NC_016829	AGA	2	6	5867	5872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378835512
100	NC_016829	ACA	2	6	6022	6027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378835512
101	NC_016829	GAA	2	6	6051	6056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378835512
102	NC_016829	TTA	2	6	6094	6099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378835512
103	NC_016829	AGC	2	6	6140	6145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378835512
104	NC_016829	AAG	2	6	6190	6195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378835512
105	NC_016829	TAA	2	6	6237	6242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378835512
106	NC_016829	AGA	2	6	6245	6250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378835513
107	NC_016829	CAA	2	6	6265	6270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378835513
108	NC_016829	TAA	2	6	6366	6371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378835513
109	NC_016829	TTC	2	6	6413	6418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378835513
110	NC_016829	AGA	2	6	6456	6461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378835513
111	NC_016829	GTT	2	6	6475	6480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378835513
112	NC_016829	GAT	3	9	6571	6579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378835513
113	NC_016829	TTC	2	6	6606	6611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378835513
114	NC_016829	AGC	2	6	6678	6683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378835513
115	NC_016829	ATT	2	6	6961	6966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378835513
116	NC_016829	AAG	2	6	7007	7012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378835513
117	NC_016829	AGT	2	6	7053	7058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378835513
118	NC_016829	GTG	2	6	7085	7090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378835513
119	NC_016829	TAT	2	6	7113	7118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378835513
120	NC_016829	AGT	2	6	7143	7148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378835513
121	NC_016829	TTA	2	6	7269	7274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378835514
122	NC_016829	TAA	2	6	7342	7347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378835514
123	NC_016829	CTT	2	6	7351	7356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378835514
124	NC_016829	TCT	2	6	7407	7412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378835514
125	NC_016829	ATT	2	6	7418	7423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378835514
126	NC_016829	AGT	2	6	7430	7435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378835514
127	NC_016829	CAA	2	6	7678	7683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378835514
128	NC_016829	AGA	2	6	7706	7711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378835514
129	NC_016829	AAC	2	6	7712	7717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378835514
130	NC_016829	CTT	2	6	7771	7776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378835514
131	NC_016829	TAG	2	6	7780	7785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378835514
132	NC_016829	TAT	2	6	7915	7920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378835515
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