MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis KZN 4207 chromosome

Total Repeats: 10342

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016768	CGAC	2	8	412	419	25 %	0 %	25 %	50 %	375294202
2	NC_016768	CGTT	2	8	628	635	0 %	50 %	25 %	25 %	375294202
3	NC_016768	CCCG	2	8	690	697	0 %	0 %	25 %	75 %	375294202
4	NC_016768	GGCA	2	8	761	768	25 %	0 %	50 %	25 %	375294202
5	NC_016768	CCCA	2	8	1019	1026	25 %	0 %	0 %	75 %	375294202
6	NC_016768	GTGG	2	8	2233	2240	0 %	25 %	75 %	0 %	375294203
7	NC_016768	GCCA	2	8	2251	2258	25 %	0 %	25 %	50 %	375294203
8	NC_016768	TCAG	2	8	2595	2602	25 %	25 %	25 %	25 %	375294203
9	NC_016768	CGTT	2	8	2821	2828	0 %	50 %	25 %	25 %	375294203
10	NC_016768	ACGG	2	8	3173	3180	25 %	0 %	50 %	25 %	375294203
11	NC_016768	GCCT	2	8	3235	3242	0 %	25 %	25 %	50 %	375294203
12	NC_016768	CGTC	2	8	3386	3393	0 %	25 %	25 %	50 %	375294204
13	NC_016768	GGTA	2	8	3566	3573	25 %	25 %	50 %	0 %	375294204
14	NC_016768	GGTT	2	8	3748	3755	0 %	50 %	50 %	0 %	375294204
15	NC_016768	CCGC	2	8	3976	3983	0 %	0 %	25 %	75 %	375294204
16	NC_016768	CCAC	2	8	5600	5607	25 %	0 %	0 %	75 %	375294206
17	NC_016768	ACCG	2	8	5619	5626	25 %	0 %	25 %	50 %	375294206
18	NC_016768	CAAG	2	8	5814	5821	50 %	0 %	25 %	25 %	375294206
19	NC_016768	CGCC	2	8	5910	5917	0 %	0 %	25 %	75 %	375294206
20	NC_016768	CGGC	2	8	6725	6732	0 %	0 %	50 %	50 %	375294206
21	NC_016768	GACA	2	8	7405	7412	50 %	0 %	25 %	25 %	375294207
22	NC_016768	CGGT	2	8	7625	7632	0 %	25 %	50 %	25 %	375294207
23	NC_016768	CGAG	2	8	8557	8564	25 %	0 %	50 %	25 %	375294207
24	NC_016768	CCAC	2	8	9087	9094	25 %	0 %	0 %	75 %	375294207
25	NC_016768	CGAC	2	8	9456	9463	25 %	0 %	25 %	50 %	375294207
26	NC_016768	GGTT	2	8	9684	9691	0 %	50 %	50 %	0 %	375294207
27	NC_016768	CCCG	2	8	10233	10240	0 %	0 %	25 %	75 %	375294208
28	NC_016768	GAGC	2	8	12193	12200	25 %	0 %	50 %	25 %	375294209
29	NC_016768	CTCA	2	8	12404	12411	25 %	25 %	0 %	50 %	375294209
30	NC_016768	AACC	2	8	13439	13446	50 %	0 %	0 %	50 %	375294211
31	NC_016768	CCCG	2	8	13548	13555	0 %	0 %	25 %	75 %	375294211
32	NC_016768	ACCC	2	8	14199	14206	25 %	0 %	0 %	75 %	375294213
33	NC_016768	TGAT	2	8	14236	14243	25 %	50 %	25 %	0 %	375294213
34	NC_016768	TGCT	2	8	14283	14290	0 %	50 %	25 %	25 %	375294213
35	NC_016768	GCCC	2	8	14770	14777	0 %	0 %	25 %	75 %	375294213
36	NC_016768	GGGC	2	8	15551	15558	0 %	0 %	75 %	25 %	375294214
37	NC_016768	CTGA	2	8	16006	16013	25 %	25 %	25 %	25 %	375294215
38	NC_016768	GCTT	2	8	16208	16215	0 %	50 %	25 %	25 %	375294215
39	NC_016768	CAGT	2	8	16236	16243	25 %	25 %	25 %	25 %	375294215
40	NC_016768	CGGT	2	8	16607	16614	0 %	25 %	50 %	25 %	375294215
41	NC_016768	GCCG	2	8	16666	16673	0 %	0 %	50 %	50 %	375294215
42	NC_016768	CGGG	2	8	17901	17908	0 %	0 %	75 %	25 %	375294216
43	NC_016768	CTGG	2	8	18009	18016	0 %	25 %	50 %	25 %	375294216
44	NC_016768	GTGC	2	8	18509	18516	0 %	25 %	50 %	25 %	375294216
45	NC_016768	GCCG	2	8	18527	18534	0 %	0 %	50 %	50 %	375294216
46	NC_016768	CCGC	2	8	18892	18899	0 %	0 %	25 %	75 %	375294217
47	NC_016768	GCCG	2	8	20356	20363	0 %	0 %	50 %	50 %	375294218
48	NC_016768	CCAG	2	8	20844	20851	25 %	0 %	25 %	50 %	375294218
49	NC_016768	CACC	2	8	21027	21034	25 %	0 %	0 %	75 %	375294218
50	NC_016768	CGGG	2	8	21983	21990	0 %	0 %	75 %	25 %	375294219
51	NC_016768	GCCG	2	8	22074	22081	0 %	0 %	50 %	50 %	375294219
52	NC_016768	GCTG	2	8	22454	22461	0 %	25 %	50 %	25 %	375294219
53	NC_016768	CGGC	2	8	22474	22481	0 %	0 %	50 %	50 %	375294219
54	NC_016768	GCCG	2	8	23145	23152	0 %	0 %	50 %	50 %	375294219
55	NC_016768	CCCA	2	8	23157	23164	25 %	0 %	0 %	75 %	375294219
56	NC_016768	GCTG	2	8	24296	24303	0 %	25 %	50 %	25 %	375294221
57	NC_016768	CGGC	2	8	24344	24351	0 %	0 %	50 %	50 %	375294221
58	NC_016768	GCCG	2	8	24444	24451	0 %	0 %	50 %	50 %	375294221
59	NC_016768	CGGG	2	8	24519	24526	0 %	0 %	75 %	25 %	375294221
60	NC_016768	GCTC	2	8	26606	26613	0 %	25 %	25 %	50 %	375294222
61	NC_016768	CCAA	2	8	26823	26830	50 %	0 %	0 %	50 %	375294222
62	NC_016768	CAGC	2	8	26889	26896	25 %	0 %	25 %	50 %	375294222
63	NC_016768	CGGC	2	8	27709	27716	0 %	0 %	50 %	50 %	375294224
64	NC_016768	CCGG	2	8	28195	28202	0 %	0 %	50 %	50 %	375294224
65	NC_016768	GCTC	2	8	28751	28758	0 %	25 %	25 %	50 %	375294225
66	NC_016768	TGCG	2	8	28890	28897	0 %	25 %	50 %	25 %	375294225
67	NC_016768	CCGG	2	8	29155	29162	0 %	0 %	50 %	50 %	375294225
68	NC_016768	CGTC	2	8	29486	29493	0 %	25 %	25 %	50 %	375294226
69	NC_016768	CACG	2	8	29846	29853	25 %	0 %	25 %	50 %	375294227
70	NC_016768	ACCG	2	8	29927	29934	25 %	0 %	25 %	50 %	375294227
71	NC_016768	CCGG	2	8	30246	30253	0 %	0 %	50 %	50 %	375294227
72	NC_016768	GTCG	2	8	30422	30429	0 %	25 %	50 %	25 %	375294227
73	NC_016768	CCCG	2	8	31044	31051	0 %	0 %	25 %	75 %	375294227
74	NC_016768	CGAG	2	8	31556	31563	25 %	0 %	50 %	25 %	375294228
75	NC_016768	CGAC	2	8	31853	31860	25 %	0 %	25 %	50 %	375294229
76	NC_016768	GCCG	2	8	32580	32587	0 %	0 %	50 %	50 %	375294230
77	NC_016768	CCGA	2	8	33569	33576	25 %	0 %	25 %	50 %	375294231
78	NC_016768	GGCC	2	8	34704	34711	0 %	0 %	50 %	50 %	375294232
79	NC_016768	ATCG	2	8	35197	35204	25 %	25 %	25 %	25 %	375294232
80	NC_016768	GATC	2	8	35535	35542	25 %	25 %	25 %	25 %	375294232
81	NC_016768	CCAC	2	8	36356	36363	25 %	0 %	0 %	75 %	375294232
82	NC_016768	ACCG	2	8	36751	36758	25 %	0 %	25 %	50 %	375294233
83	NC_016768	CTGG	2	8	37095	37102	0 %	25 %	50 %	25 %	375294234
84	NC_016768	GCAT	2	8	37490	37497	25 %	25 %	25 %	25 %	375294235
85	NC_016768	GCTG	2	8	38004	38011	0 %	25 %	50 %	25 %	375294235
86	NC_016768	AACG	2	8	38759	38766	50 %	0 %	25 %	25 %	375294235
87	NC_016768	CCGA	2	8	38820	38827	25 %	0 %	25 %	50 %	375294235
88	NC_016768	CCAC	2	8	38976	38983	25 %	0 %	0 %	75 %	375294235
89	NC_016768	CAGC	2	8	39203	39210	25 %	0 %	25 %	50 %	375294236
90	NC_016768	CCGG	2	8	39699	39706	0 %	0 %	50 %	50 %	375294236
91	NC_016768	GGCC	2	8	40230	40237	0 %	0 %	50 %	50 %	375294237
92	NC_016768	CGAT	2	8	40680	40687	25 %	25 %	25 %	25 %	375294237
93	NC_016768	GCCG	2	8	40980	40987	0 %	0 %	50 %	50 %	375294237
94	NC_016768	CACC	2	8	41005	41012	25 %	0 %	0 %	75 %	375294237
95	NC_016768	ACCG	2	8	41228	41235	25 %	0 %	25 %	50 %	375294237
96	NC_016768	GCGT	2	8	41254	41261	0 %	25 %	50 %	25 %	375294237
97	NC_016768	CCAC	2	8	41983	41990	25 %	0 %	0 %	75 %	375294238
98	NC_016768	CGAT	2	8	41992	41999	25 %	25 %	25 %	25 %	375294238
99	NC_016768	GGCC	2	8	42688	42695	0 %	0 %	50 %	50 %	375294240
100	NC_016768	CCCG	2	8	43279	43286	0 %	0 %	25 %	75 %	375294240
101	NC_016768	CGGG	2	8	43308	43315	0 %	0 %	75 %	25 %	375294240
102	NC_016768	CGAC	2	8	43947	43954	25 %	0 %	25 %	50 %	375294241
103	NC_016768	GAGC	2	8	44327	44334	25 %	0 %	50 %	25 %	375294241
104	NC_016768	GGGC	2	8	45486	45493	0 %	0 %	75 %	25 %	375294241
105	NC_016768	CGGC	2	8	45581	45588	0 %	0 %	50 %	50 %	375294241
106	NC_016768	GCCG	2	8	46544	46551	0 %	0 %	50 %	50 %	375294241
107	NC_016768	TTGC	2	8	46708	46715	0 %	50 %	25 %	25 %	375294242
108	NC_016768	CCGC	2	8	46856	46863	0 %	0 %	25 %	75 %	375294242
109	NC_016768	CCGC	2	8	46889	46896	0 %	0 %	25 %	75 %	375294242
110	NC_016768	GGTC	2	8	46997	47004	0 %	25 %	50 %	25 %	375294242
111	NC_016768	CGGG	2	8	47548	47555	0 %	0 %	75 %	25 %	375294243
112	NC_016768	GCAG	2	8	47621	47628	25 %	0 %	50 %	25 %	375294243
113	NC_016768	GTGC	2	8	48521	48528	0 %	25 %	50 %	25 %	375294244
114	NC_016768	GCCG	2	8	48805	48812	0 %	0 %	50 %	50 %	375294244
115	NC_016768	CAGC	2	8	49990	49997	25 %	0 %	25 %	50 %	375294245
116	NC_016768	CGGG	2	8	50179	50186	0 %	0 %	75 %	25 %	375294246
117	NC_016768	GCCG	2	8	50279	50286	0 %	0 %	50 %	50 %	375294246
118	NC_016768	GGTG	2	8	50602	50609	0 %	25 %	75 %	0 %	375294246
119	NC_016768	CTCA	2	8	51218	51225	25 %	25 %	0 %	50 %	375294246
120	NC_016768	CGCT	2	8	51357	51364	0 %	25 %	25 %	50 %	375294247
121	NC_016768	GGTA	2	8	52223	52230	25 %	25 %	50 %	0 %	375294248
122	NC_016768	GCCG	2	8	53672	53679	0 %	0 %	50 %	50 %	375294250
123	NC_016768	ACCA	2	8	53843	53850	50 %	0 %	0 %	50 %	375294250
124	NC_016768	GTGC	2	8	54728	54735	0 %	25 %	50 %	25 %	375294250
125	NC_016768	ACCG	2	8	55606	55613	25 %	0 %	25 %	50 %	375294250
126	NC_016768	CCCG	2	8	55768	55775	0 %	0 %	25 %	75 %	375294250
127	NC_016768	GGCC	2	8	56442	56449	0 %	0 %	50 %	50 %	375294251
128	NC_016768	CGCT	2	8	57169	57176	0 %	25 %	25 %	50 %	375294251
129	NC_016768	GCGG	2	8	58926	58933	0 %	0 %	75 %	25 %	375294254
130	NC_016768	GTTC	2	8	59145	59152	0 %	50 %	25 %	25 %	375294254
131	NC_016768	AGCG	2	8	59350	59357	25 %	0 %	50 %	25 %	375294255
132	NC_016768	CGGC	2	8	60092	60099	0 %	0 %	50 %	50 %	375294257
133	NC_016768	GCGG	2	8	60104	60111	0 %	0 %	75 %	25 %	375294257
134	NC_016768	CAGC	2	8	61622	61629	25 %	0 %	25 %	50 %	375294258
135	NC_016768	TGGC	3	12	62250	62261	0 %	25 %	50 %	25 %	375294258
136	NC_016768	AAGG	2	8	63993	64000	50 %	0 %	50 %	0 %	375294259
137	NC_016768	AACC	2	8	64770	64777	50 %	0 %	0 %	50 %	375294260
138	NC_016768	CGGA	2	8	65134	65141	25 %	0 %	50 %	25 %	375294261
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