MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Marinitoga piezophila KA3 plasmid pMARPI01

Total Repeats: 121

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016748	ATT	2	6	105	110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	373231419
2	NC_016748	CTT	2	6	148	153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	373231419
3	NC_016748	CTT	2	6	162	167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	373231419
4	NC_016748	TTA	2	6	217	222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	373231419
5	NC_016748	ATA	2	6	231	236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	373231419
6	NC_016748	CTA	2	6	323	328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	373231419
7	NC_016748	CTT	2	6	371	376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	373231419
8	NC_016748	TCA	2	6	472	477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	373231419
9	NC_016748	TAC	2	6	489	494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	373231419
10	NC_016748	ATA	2	6	537	542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	373231419
11	NC_016748	GTT	2	6	714	719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	373231420
12	NC_016748	TTC	2	6	730	735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	373231420
13	NC_016748	GAG	2	6	1406	1411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	373231421
14	NC_016748	CAA	2	6	1442	1447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	373231421
15	NC_016748	GAA	2	6	1660	1665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	373231421
16	NC_016748	TAT	2	6	1696	1701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	373231421
17	NC_016748	TAA	2	6	1926	1931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	373231421
18	NC_016748	GTA	2	6	2077	2082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	373231421
19	NC_016748	AGG	2	6	2097	2102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	373231421
20	NC_016748	GAA	2	6	2349	2354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	373231422
21	NC_016748	ATA	2	6	2406	2411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	373231422
22	NC_016748	TTG	2	6	2569	2574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	373231422
23	NC_016748	TAT	2	6	2620	2625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	373231422
24	NC_016748	ATT	2	6	2744	2749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	373231422
25	NC_016748	TGA	2	6	2783	2788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	373231422
26	NC_016748	ATC	2	6	2934	2939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	373231423
27	NC_016748	TTA	2	6	2983	2988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	373231423
28	NC_016748	AGT	2	6	3032	3037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	373231423
29	NC_016748	TGA	2	6	3038	3043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	373231423
30	NC_016748	ATT	2	6	3052	3057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	373231423
31	NC_016748	GAA	2	6	3087	3092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	373231423
32	NC_016748	ACG	2	6	3175	3180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	373231423
33	NC_016748	ATC	2	6	3183	3188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	373231423
34	NC_016748	TAT	2	6	3235	3240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	373231423
35	NC_016748	GAA	2	6	3243	3248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	373231423
36	NC_016748	ATG	2	6	3291	3296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	373231424
37	NC_016748	AAG	2	6	3527	3532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	373231424
38	NC_016748	AAC	2	6	3538	3543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	373231424
39	NC_016748	ATA	2	6	3694	3699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	373231425
40	NC_016748	TTA	2	6	3708	3713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	373231425
41	NC_016748	ATA	2	6	3772	3777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	373231425
42	NC_016748	ATG	2	6	3805	3810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	373231425
43	NC_016748	TTC	2	6	4026	4031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	373231425
44	NC_016748	ATG	2	6	4090	4095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	373231425
45	NC_016748	TAT	2	6	4134	4139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	373231425
46	NC_016748	AAC	2	6	4180	4185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	373231425
47	NC_016748	GAA	2	6	4197	4202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	373231425
48	NC_016748	TTC	2	6	4212	4217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	373231425
49	NC_016748	AGA	2	6	4346	4351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	373231425
50	NC_016748	AGA	2	6	4484	4489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	373231425
51	NC_016748	AAT	2	6	4662	4667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	373231425
52	NC_016748	AGA	2	6	4712	4717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	373231425
53	NC_016748	TAA	2	6	4838	4843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	373231425
54	NC_016748	ATT	2	6	4997	5002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	373231425
55	NC_016748	TAT	2	6	5037	5042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	373231425
56	NC_016748	GAA	2	6	5145	5150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	373231425
57	NC_016748	TAT	2	6	5163	5168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	373231425
58	NC_016748	TGA	2	6	5174	5179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	373231425
59	NC_016748	CTT	2	6	5187	5192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	373231425
60	NC_016748	GAA	2	6	5262	5267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	373231425
61	NC_016748	CAA	2	6	5695	5700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	373231425
62	NC_016748	TGA	2	6	5705	5710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	373231425
63	NC_016748	AAT	2	6	5717	5722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	373231425
64	NC_016748	TAA	2	6	6008	6013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	373231426
65	NC_016748	ATA	2	6	6058	6063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	373231426
66	NC_016748	ATT	2	6	6198	6203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	373231426
67	NC_016748	AGA	2	6	6242	6247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	373231426
68	NC_016748	AGA	2	6	6320	6325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	373231426
69	NC_016748	CTG	2	6	6334	6339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	373231426
70	NC_016748	TGA	2	6	6377	6382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	373231426
71	NC_016748	AAG	2	6	6511	6516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	373231426
72	NC_016748	TTA	2	6	6558	6563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	373231426
73	NC_016748	ATA	2	6	6684	6689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	373231426
74	NC_016748	AAT	3	9	6690	6698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	373231426
75	NC_016748	TAT	2	6	6735	6740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	373231426
76	NC_016748	AAG	2	6	6790	6795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	373231426
77	NC_016748	AAG	2	6	6799	6804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	373231426
78	NC_016748	ATT	2	6	6815	6820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	373231426
79	NC_016748	AGA	2	6	7046	7051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	373231426
80	NC_016748	AGA	2	6	7184	7189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	373231426
81	NC_016748	AAG	2	6	7259	7264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	373231426
82	NC_016748	AAT	2	6	7308	7313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	373231426
83	NC_016748	ATG	2	6	7327	7332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	373231426
84	NC_016748	TTA	2	6	7910	7915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	373231427
85	NC_016748	GAT	2	6	7971	7976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	373231427
86	NC_016748	TTA	2	6	7999	8004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	373231427
87	NC_016748	TAT	3	9	8487	8495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	373231428
88	NC_016748	ATT	2	6	8524	8529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	373231428
89	NC_016748	TAT	2	6	8586	8591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	373231428
90	NC_016748	AAT	2	6	8601	8606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	373231428
91	NC_016748	AAT	2	6	8619	8624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	373231428
92	NC_016748	AAT	2	6	8667	8672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	373231428
93	NC_016748	TAA	2	6	8677	8682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	373231428
94	NC_016748	ATA	2	6	8683	8688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	373231428
95	NC_016748	AGA	2	6	9083	9088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	373231429
96	NC_016748	GAT	2	6	9100	9105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	373231429
97	NC_016748	ATA	2	6	9161	9166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	373231429
98	NC_016748	AAG	2	6	9214	9219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	373231429
99	NC_016748	TGT	2	6	9330	9335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	373231429
100	NC_016748	ATA	2	6	9350	9355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	373231429
101	NC_016748	TAA	2	6	9374	9379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	373231429
102	NC_016748	GAT	2	6	9463	9468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	373231429
103	NC_016748	GAA	2	6	9529	9534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	373231429
104	NC_016748	TGA	2	6	9600	9605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	373231429
105	NC_016748	AAT	2	6	9618	9623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	373231429
106	NC_016748	GAA	2	6	9667	9672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	373231429
107	NC_016748	AAG	2	6	11925	11930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	373231430
108	NC_016748	ATT	2	6	11935	11940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	373231430
109	NC_016748	GAA	2	6	12074	12079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	373231430
110	NC_016748	GAA	2	6	12112	12117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	373231430
111	NC_016748	AAT	2	6	12335	12340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	373231430
112	NC_016748	AAG	2	6	12360	12365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	373231430
113	NC_016748	AAT	2	6	12374	12379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	373231430
114	NC_016748	AAT	2	6	12432	12437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	373231430
115	NC_016748	GAA	2	6	12827	12832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	373231431
116	NC_016748	TTA	2	6	12855	12860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	373231431
117	NC_016748	TTA	2	6	12958	12963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	373231431
118	NC_016748	ATA	2	6	13039	13044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	373231431
119	NC_016748	ATT	2	6	13149	13154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	373231431
120	NC_016748	TTA	2	6	13281	13286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	373231431
121	NC_016748	CAC	2	6	13366	13371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	373231431

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.