MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium rhodesiae NBB3 chromosome

Total Repeats: 148760

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_016604	GCA	2	6	182669	182674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375137389
4002	NC_016604	CCG	2	6	182749	182754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375137389
4003	NC_016604	CG	3	6	182753	182758	0 %	0 %	50 %	50 %	375137389
4004	NC_016604	GCC	2	6	182781	182786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375137389
4005	NC_016604	CGAG	2	8	182802	182809	25 %	0 %	50 %	25 %	375137389
4006	NC_016604	CAC	2	6	182847	182852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375137389
4007	NC_016604	CAC	2	6	182865	182870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375137389
4008	NC_016604	TGC	2	6	182929	182934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375137389
4009	NC_016604	GCCC	2	8	182953	182960	0 %	0 %	25 %	75 %	375137389
4010	NC_016604	CAC	2	6	182991	182996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375137389
4011	NC_016604	ATCGCC	2	12	183025	183036	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	375137389
4012	NC_016604	CAC	2	6	183045	183050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375137389
4013	NC_016604	CTG	2	6	183400	183405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375137390
4014	NC_016604	GAT	2	6	183499	183504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375137390
4015	NC_016604	TCC	2	6	183509	183514	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	375137390
4016	NC_016604	TGC	2	6	183524	183529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375137390
4017	NC_016604	GCA	2	6	183540	183545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375137390
4018	NC_016604	CAT	2	6	183643	183648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375137390
4019	NC_016604	G	6	6	183686	183691	0 %	0 %	100 %	0 %	375137390
4020	NC_016604	GCA	2	6	183828	183833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375137390
4021	NC_016604	GCA	2	6	183885	183890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375137390
4022	NC_016604	GCT	2	6	183972	183977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375137391
4023	NC_016604	CGG	2	6	183991	183996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375137391
4024	NC_016604	CCA	2	6	184021	184026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375137391
4025	NC_016604	GTG	2	6	184050	184055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375137391
4026	NC_016604	TCG	2	6	184057	184062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375137391
4027	NC_016604	GT	3	6	184120	184125	0 %	50 %	50 %	0 %	375137391
4028	NC_016604	TGC	2	6	184175	184180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375137391
4029	NC_016604	CGC	2	6	184181	184186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375137391
4030	NC_016604	CTC	2	6	184190	184195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	375137391
4031	NC_016604	GCC	2	6	184208	184213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375137391
4032	NC_016604	GCT	2	6	184216	184221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375137391
4033	NC_016604	GGT	2	6	184316	184321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375137391
4034	NC_016604	CAT	2	6	185620	185625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375137392
4035	NC_016604	GAA	2	6	185646	185651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375137392
4036	NC_016604	CAG	2	6	185688	185693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375137392
4037	NC_016604	TGG	2	6	185705	185710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375137392
4038	NC_016604	CGG	2	6	185717	185722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375137392
4039	NC_016604	CGC	2	6	185729	185734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375137392
4040	NC_016604	GCCA	2	8	185800	185807	25 %	0 %	25 %	50 %	375137392
4041	NC_016604	TTTG	2	8	185816	185823	0 %	75 %	25 %	0 %	375137392
4042	NC_016604	GAT	2	6	185892	185897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375137392
4043	NC_016604	CGA	2	6	185933	185938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375137392
4044	NC_016604	ACA	2	6	185942	185947	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375137392
4045	NC_016604	TCG	2	6	185998	186003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375137392
4046	NC_016604	TCG	2	6	186010	186015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375137392
4047	NC_016604	GGT	2	6	186024	186029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375137392
4048	NC_016604	GCG	3	9	186041	186049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375137392
4049	NC_016604	CG	3	6	186068	186073	0 %	0 %	50 %	50 %	375137392
4050	NC_016604	CG	3	6	186079	186084	0 %	0 %	50 %	50 %	375137392
4051	NC_016604	GT	3	6	186086	186091	0 %	50 %	50 %	0 %	375137392
4052	NC_016604	GCG	4	12	186139	186150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375137392
4053	NC_016604	CGG	2	6	186158	186163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375137392
4054	NC_016604	CCG	2	6	186347	186352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375137393
4055	NC_016604	CAG	3	9	186404	186412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375137393
4056	NC_016604	CGT	2	6	186433	186438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375137393
4057	NC_016604	CAG	2	6	186455	186460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375137393
4058	NC_016604	GAT	2	6	186467	186472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375137393
4059	NC_016604	GCG	2	6	186486	186491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375137393
4060	NC_016604	GGC	2	6	186500	186505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375137393
4061	NC_016604	CGA	2	6	186538	186543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375137393
4062	NC_016604	ACC	2	6	186558	186563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375137393
4063	NC_016604	GCA	2	6	186673	186678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375137393
4064	NC_016604	ATCCG	2	10	186685	186694	20 %	20 %	20 %	40 %	375137393
4065	NC_016604	CAG	3	9	186695	186703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375137393
4066	NC_016604	CGC	2	6	186707	186712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375137393
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4068	NC_016604	GGC	2	6	186761	186766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375137393
4069	NC_016604	GCG	2	6	186783	186788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375137393
4070	NC_016604	GCG	2	6	186951	186956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375137394
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4080	NC_016604	GCCG	2	8	187285	187292	0 %	0 %	50 %	50 %	375137394
4081	NC_016604	GC	3	6	187293	187298	0 %	0 %	50 %	50 %	375137394
4082	NC_016604	GCG	2	6	187301	187306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375137394
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4085	NC_016604	CG	4	8	187355	187362	0 %	0 %	50 %	50 %	375137394
4086	NC_016604	GAT	2	6	187366	187371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375137394
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4088	NC_016604	GT	3	6	187432	187437	0 %	50 %	50 %	0 %	375137394
4089	NC_016604	TCG	2	6	187454	187459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375137394
4090	NC_016604	CG	3	6	187489	187494	0 %	0 %	50 %	50 %	375137394
4091	NC_016604	GCT	2	6	187523	187528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375137394
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4093	NC_016604	C	7	7	187550	187556	0 %	0 %	0 %	100 %	375137394
4094	NC_016604	CGC	3	9	187571	187579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375137394
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4099	NC_016604	CGA	2	6	187821	187826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375137395
4100	NC_016604	TCGA	2	8	188003	188010	25 %	25 %	25 %	25 %	375137395
4101	NC_016604	GC	3	6	188027	188032	0 %	0 %	50 %	50 %	375137395
4102	NC_016604	CGC	2	6	188050	188055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375137395
4103	NC_016604	GCC	2	6	188057	188062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375137395
4104	NC_016604	CGCC	2	8	188080	188087	0 %	0 %	25 %	75 %	375137395
4105	NC_016604	CTG	2	6	188093	188098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375137395
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4107	NC_016604	TCT	2	6	188181	188186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375137395
4108	NC_016604	CCG	2	6	188244	188249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375137395
4109	NC_016604	TGG	2	6	188251	188256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375137395
4110	NC_016604	CGT	2	6	188283	188288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375137395
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4114	NC_016604	GCGA	2	8	188427	188434	25 %	0 %	50 %	25 %	375137395
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4117	NC_016604	GCC	2	6	188470	188475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375137395
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4119	NC_016604	CG	3	6	188608	188613	0 %	0 %	50 %	50 %	375137395
4120	NC_016604	ACG	2	6	188773	188778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375137395
4121	NC_016604	CA	3	6	188953	188958	50 %	0 %	0 %	50 %	375137396
4122	NC_016604	CA	3	6	188963	188968	50 %	0 %	0 %	50 %	375137396
4123	NC_016604	CGG	2	6	189041	189046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375137396
4124	NC_016604	GATGAG	2	12	189066	189077	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	375137396
4125	NC_016604	CAC	2	6	189122	189127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375137396
4126	NC_016604	CATC	2	8	189146	189153	25 %	25 %	0 %	50 %	375137396
4127	NC_016604	GA	3	6	189247	189252	50 %	0 %	50 %	0 %	375137396
4128	NC_016604	GCT	2	6	189269	189274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375137396
4129	NC_016604	CTGG	2	8	189324	189331	0 %	25 %	50 %	25 %	375137396
4130	NC_016604	GGC	2	6	189374	189379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375137396
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4133	NC_016604	ATC	2	6	189594	189599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375137396
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4138	NC_016604	TCG	3	9	189736	189744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375137396
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4140	NC_016604	GCT	2	6	189812	189817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375137396
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4144	NC_016604	CTT	2	6	189923	189928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375137396
4145	NC_016604	CGGAC	2	10	189971	189980	20 %	0 %	40 %	40 %	375137396
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4147	NC_016604	GTC	2	6	189993	189998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375137396
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4150	NC_016604	CGC	2	6	190178	190183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375137396
4151	NC_016604	GAC	2	6	190392	190397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375137397
4152	NC_016604	ACG	2	6	190400	190405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375137397
4153	NC_016604	CG	3	6	190438	190443	0 %	0 %	50 %	50 %	375137397
4154	NC_016604	ATC	2	6	190465	190470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375137397
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4156	NC_016604	CG	3	6	190513	190518	0 %	0 %	50 %	50 %	375137397
4157	NC_016604	GGCT	2	8	190636	190643	0 %	25 %	50 %	25 %	375137397
4158	NC_016604	CGT	2	6	190845	190850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375137398
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4160	NC_016604	GCCG	2	8	190937	190944	0 %	0 %	50 %	50 %	375137398
4161	NC_016604	GGA	2	6	190985	190990	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	375137398
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4242	NC_016604	CGA	2	6	194877	194882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375137403
4243	NC_016604	CGC	3	9	194913	194921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375137403
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4351	NC_016604	CG	3	6	200211	200216	0 %	0 %	50 %	50 %	375137409
4352	NC_016604	ACT	2	6	200221	200226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375137409
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4355	NC_016604	CAT	2	6	200550	200555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375137410
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4357	NC_016604	CA	3	6	201075	201080	50 %	0 %	0 %	50 %	375137411
4358	NC_016604	CGC	2	6	201085	201090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375137411
4359	NC_016604	TGG	2	6	201160	201165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375137411
4360	NC_016604	GTT	2	6	201201	201206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375137411
4361	NC_016604	GGC	2	6	201207	201212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375137411
4362	NC_016604	CAA	2	6	201327	201332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375137411
4363	NC_016604	AC	3	6	201341	201346	50 %	0 %	0 %	50 %	375137411
4364	NC_016604	C	6	6	201394	201399	0 %	0 %	0 %	100 %	375137411
4365	NC_016604	GCC	2	6	201412	201417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375137411
4366	NC_016604	GCG	2	6	201436	201441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375137411
4367	NC_016604	CGA	2	6	201450	201455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375137411
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4369	NC_016604	AAC	2	6	201470	201475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375137411
4370	NC_016604	GCGCA	2	10	201492	201501	20 %	0 %	40 %	40 %	375137411
4371	NC_016604	CAA	2	6	201511	201516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375137411
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4374	NC_016604	ATC	2	6	201976	201981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375137412
4375	NC_016604	CTTCCG	2	12	201983	201994	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	375137412
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4379	NC_016604	AGAAAA	2	12	202152	202163	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	375137412
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4386	NC_016604	CGG	2	6	202383	202388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375137413
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4392	NC_016604	GGAT	2	8	202522	202529	25 %	25 %	50 %	0 %	375137413
4393	NC_016604	TGC	2	6	202568	202573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375137413
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4395	NC_016604	CGC	2	6	202665	202670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375137413
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4454	NC_016604	CCAC	2	8	205801	205808	25 %	0 %	0 %	75 %	375137417
4455	NC_016604	ACG	2	6	205813	205818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375137417
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4459	NC_016604	CCGA	2	8	205933	205940	25 %	0 %	25 %	50 %	375137417
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4468	NC_016604	CGA	3	9	206806	206814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375137418
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4470	NC_016604	CTGG	2	8	206870	206877	0 %	25 %	50 %	25 %	375137418
4471	NC_016604	GGCA	2	8	206882	206889	25 %	0 %	50 %	25 %	375137418
4472	NC_016604	CGT	2	6	207044	207049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375137418
4473	NC_016604	TCA	2	6	207115	207120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375137418
4474	NC_016604	GCA	2	6	207190	207195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375137418
4475	NC_016604	TCGAC	2	10	207196	207205	20 %	20 %	20 %	40 %	375137418
4476	NC_016604	CGT	2	6	207226	207231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375137418
4477	NC_016604	CGC	2	6	207257	207262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375137418
4478	NC_016604	CCA	2	6	207289	207294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375137418
4479	NC_016604	TC	3	6	207306	207311	0 %	50 %	0 %	50 %	375137418
4480	NC_016604	CGG	2	6	207484	207489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375137419
4481	NC_016604	CCAC	2	8	207499	207506	25 %	0 %	0 %	75 %	375137419
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4483	NC_016604	CGC	2	6	207542	207547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375137419
4484	NC_016604	TGC	2	6	207561	207566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375137419
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