MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methylomicrobium alcaliphilum chromosome

Total Repeats: 73443

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_016112	GTCCT	2	10	227764	227773	0 %	40 %	20 %	40 %	357403591
3502	NC_016112	AAT	2	6	227775	227780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357403591
3503	NC_016112	TGC	2	6	227904	227909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403591
3504	NC_016112	TTG	2	6	227990	227995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403591
3505	NC_016112	GAT	2	6	228360	228365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403591
3506	NC_016112	CAA	2	6	228405	228410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403592
3507	NC_016112	TGC	2	6	228418	228423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403592
3508	NC_016112	GTCG	2	8	228531	228538	0 %	25 %	50 %	25 %	357403592
3509	NC_016112	GAC	2	6	228582	228587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403592
3510	NC_016112	CCCA	2	8	228652	228659	25 %	0 %	0 %	75 %	357403592
3511	NC_016112	GAT	2	6	228669	228674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403592
3512	NC_016112	TCC	2	6	228682	228687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357403592
3513	NC_016112	TTCGG	2	10	228738	228747	0 %	40 %	40 %	20 %	357403592
3514	NC_016112	GC	3	6	228755	228760	0 %	0 %	50 %	50 %	357403592
3515	NC_016112	GTC	2	6	228790	228795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403592
3516	NC_016112	CGT	2	6	228816	228821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403592
3517	NC_016112	TTC	2	6	228825	228830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357403592
3518	NC_016112	GCAT	2	8	228892	228899	25 %	25 %	25 %	25 %	357403592
3519	NC_016112	TTC	2	6	228921	228926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357403592
3520	NC_016112	TGC	2	6	228944	228949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403592
3521	NC_016112	CGAT	2	8	228955	228962	25 %	25 %	25 %	25 %	357403592
3522	NC_016112	T	6	6	228962	228967	0 %	100 %	0 %	0 %	357403592
3523	NC_016112	CGT	2	6	229135	229140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403592
3524	NC_016112	ACG	2	6	229175	229180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403592
3525	NC_016112	ATG	2	6	229266	229271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403592
3526	NC_016112	CAGGC	2	10	229374	229383	20 %	0 %	40 %	40 %	357403592
3527	NC_016112	GTT	2	6	229503	229508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403592
3528	NC_016112	GACGCC	2	12	229527	229538	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	357403592
3529	NC_016112	GTC	2	6	229591	229596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403592
3530	NC_016112	GCC	2	6	229647	229652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403592
3531	NC_016112	GC	3	6	229665	229670	0 %	0 %	50 %	50 %	357403592
3532	NC_016112	CGG	2	6	229685	229690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403592
3533	NC_016112	CGG	2	6	229769	229774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403592
3534	NC_016112	CGTT	2	8	229856	229863	0 %	50 %	25 %	25 %	357403592
3535	NC_016112	GCG	2	6	229901	229906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403592
3536	NC_016112	GATC	2	8	229919	229926	25 %	25 %	25 %	25 %	357403592
3537	NC_016112	CGA	3	9	229937	229945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403592
3538	NC_016112	T	6	6	229971	229976	0 %	100 %	0 %	0 %	357403592
3539	NC_016112	CGAAC	2	10	229983	229992	40 %	0 %	20 %	40 %	357403592
3540	NC_016112	GTCG	2	8	230004	230011	0 %	25 %	50 %	25 %	357403593
3541	NC_016112	AGTCG	2	10	230081	230090	20 %	20 %	40 %	20 %	357403593
3542	NC_016112	GCC	2	6	230174	230179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403593
3543	NC_016112	GAA	2	6	230232	230237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403593
3544	NC_016112	CGGG	2	8	230264	230271	0 %	0 %	75 %	25 %	357403593
3545	NC_016112	CTG	2	6	230516	230521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403594
3546	NC_016112	TTTA	2	8	230584	230591	25 %	75 %	0 %	0 %	357403594
3547	NC_016112	TGT	2	6	230683	230688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403595
3548	NC_016112	TTG	2	6	230797	230802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403596
3549	NC_016112	CCG	2	6	230867	230872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403596
3550	NC_016112	TG	3	6	230917	230922	0 %	50 %	50 %	0 %	357403596
3551	NC_016112	CAAA	2	8	230998	231005	75 %	0 %	0 %	25 %	357403596
3552	NC_016112	TTG	2	6	231016	231021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403596
3553	NC_016112	GAT	2	6	231028	231033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403596
3554	NC_016112	GCAA	2	8	231059	231066	50 %	0 %	25 %	25 %	357403596
3555	NC_016112	GCA	2	6	231085	231090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403596
3556	NC_016112	CAGA	2	8	231153	231160	50 %	0 %	25 %	25 %	357403596
3557	NC_016112	GAA	2	6	231198	231203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403596
3558	NC_016112	TCGCGG	2	12	232043	232054	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	357403597
3559	NC_016112	GC	3	6	232061	232066	0 %	0 %	50 %	50 %	357403597
3560	NC_016112	GCA	2	6	232149	232154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403597
3561	NC_016112	AAT	2	6	232206	232211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357403597
3562	NC_016112	CGTT	2	8	232260	232267	0 %	50 %	25 %	25 %	357403597
3563	NC_016112	GCC	2	6	232296	232301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403597
3564	NC_016112	GCA	2	6	232302	232307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403597
3565	NC_016112	CGGT	2	8	232412	232419	0 %	25 %	50 %	25 %	357403597
3566	NC_016112	CAACT	2	10	232469	232478	40 %	20 %	0 %	40 %	357403597
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3568	NC_016112	CGAT	2	8	232501	232508	25 %	25 %	25 %	25 %	357403597
3569	NC_016112	GAAC	2	8	232520	232527	50 %	0 %	25 %	25 %	357403597
3570	NC_016112	ACA	2	6	232537	232542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403597
3571	NC_016112	CG	3	6	232603	232608	0 %	0 %	50 %	50 %	357403597
3572	NC_016112	CGAATC	2	12	232712	232723	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	357403597
3573	NC_016112	CGGT	2	8	232773	232780	0 %	25 %	50 %	25 %	357403597
3574	NC_016112	CGG	2	6	232800	232805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403597
3575	NC_016112	GCG	2	6	232854	232859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403597
3576	NC_016112	GT	3	6	232956	232961	0 %	50 %	50 %	0 %	357403597
3577	NC_016112	CAA	2	6	233024	233029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403597
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3580	NC_016112	GAA	2	6	233258	233263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403597
3581	NC_016112	TGAT	2	8	233313	233320	25 %	50 %	25 %	0 %	357403597
3582	NC_016112	AGT	2	6	234146	234151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403598
3583	NC_016112	GCG	2	6	234159	234164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403598
3584	NC_016112	CGG	2	6	234216	234221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403598
3585	NC_016112	ATGG	2	8	234234	234241	25 %	25 %	50 %	0 %	357403598
3586	NC_016112	CTGCC	2	10	234272	234281	0 %	20 %	20 %	60 %	357403598
3587	NC_016112	TCAT	2	8	234388	234395	25 %	50 %	0 %	25 %	357403598
3588	NC_016112	TC	3	6	234406	234411	0 %	50 %	0 %	50 %	357403598
3589	NC_016112	TAT	2	6	234418	234423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403598
3590	NC_016112	ACT	2	6	234457	234462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403598
3591	NC_016112	ATT	2	6	234705	234710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403598
3592	NC_016112	GCG	2	6	234794	234799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403598
3593	NC_016112	GC	3	6	234826	234831	0 %	0 %	50 %	50 %	357403598
3594	NC_016112	CGG	2	6	235036	235041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403598
3595	NC_016112	AAT	2	6	235043	235048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357403598
3596	NC_016112	G	6	6	235051	235056	0 %	0 %	100 %	0 %	357403598
3597	NC_016112	GAT	2	6	235061	235066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403598
3598	NC_016112	TTG	2	6	235096	235101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403598
3599	NC_016112	TCA	2	6	235138	235143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403598
3600	NC_016112	CG	3	6	235165	235170	0 %	0 %	50 %	50 %	357403598
3601	NC_016112	AGC	2	6	235194	235199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403598
3602	NC_016112	AATC	2	8	235600	235607	50 %	25 %	0 %	25 %	357403599
3603	NC_016112	CTTC	2	8	235698	235705	0 %	50 %	0 %	50 %	357403599
3604	NC_016112	CTT	2	6	235764	235769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357403599
3605	NC_016112	CGT	2	6	235788	235793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403599
3606	NC_016112	ACG	2	6	235811	235816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403599
3607	NC_016112	GAT	2	6	235831	235836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403599
3608	NC_016112	CAT	2	6	235869	235874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403599
3609	NC_016112	AT	3	6	235873	235878	50 %	50 %	0 %	0 %	357403599
3610	NC_016112	CG	3	6	235908	235913	0 %	0 %	50 %	50 %	357403599
3611	NC_016112	TGC	2	6	235934	235939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403599
3612	NC_016112	GC	3	6	235943	235948	0 %	0 %	50 %	50 %	357403599
3613	NC_016112	ACCG	2	8	235999	236006	25 %	0 %	25 %	50 %	357403599
3614	NC_016112	GTC	2	6	236011	236016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403599
3615	NC_016112	C	7	7	236046	236052	0 %	0 %	0 %	100 %	357403599
3616	NC_016112	AATTCC	2	12	236162	236173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403599
3617	NC_016112	TCGAAA	2	12	236222	236233	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	357403599
3618	NC_016112	AAT	2	6	236312	236317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357403599
3619	NC_016112	CGA	2	6	236349	236354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403599
3620	NC_016112	CGG	2	6	236409	236414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403599
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3622	NC_016112	TTG	2	6	236473	236478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403599
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3740	NC_016112	CGAAC	2	10	243932	243941	40 %	0 %	20 %	40 %	357403603
3741	NC_016112	CAT	2	6	243977	243982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403603
3742	NC_016112	CGG	2	6	244030	244035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403603
3743	NC_016112	AG	3	6	244052	244057	50 %	0 %	50 %	0 %	357403603
3744	NC_016112	AAC	2	6	244194	244199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403603
3745	NC_016112	TGC	2	6	244270	244275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403603
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3747	NC_016112	CAA	2	6	244529	244534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403603
3748	NC_016112	CGGC	2	8	244583	244590	0 %	0 %	50 %	50 %	357403603
3749	NC_016112	GAC	2	6	244598	244603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403603
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3754	NC_016112	CGT	2	6	244826	244831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403603
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3756	NC_016112	GGC	2	6	244884	244889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403603
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3758	NC_016112	GAC	3	9	245081	245089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403603
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3764	NC_016112	TGAG	2	8	246192	246199	25 %	25 %	50 %	0 %	357403604
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3776	NC_016112	TAAC	2	8	248690	248697	50 %	25 %	0 %	25 %	357403606
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3849	NC_016112	GTA	2	6	252504	252509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403611
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3853	NC_016112	CAT	2	6	253238	253243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403612
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3855	NC_016112	GAAACC	2	12	253290	253301	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	357403612
3856	NC_016112	A	7	7	253313	253319	100 %	0 %	0 %	0 %	357403612
3857	NC_016112	A	6	6	253326	253331	100 %	0 %	0 %	0 %	357403612
3858	NC_016112	GCT	3	9	253335	253343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403612
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3860	NC_016112	A	6	6	253419	253424	100 %	0 %	0 %	0 %	357403612
3861	NC_016112	GCC	2	6	253425	253430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403612
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3863	NC_016112	CGGC	2	8	253513	253520	0 %	0 %	50 %	50 %	357403612
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3987	NC_016112	GA	3	6	262799	262804	50 %	0 %	50 %	0 %	357403622
3988	NC_016112	ATG	2	6	262813	262818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403622
3989	NC_016112	CGG	2	6	262879	262884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403622
3990	NC_016112	CTG	2	6	262998	263003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403622
3991	NC_016112	GTC	2	6	263033	263038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403622
3992	NC_016112	TCG	2	6	263042	263047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403622
3993	NC_016112	G	6	6	263074	263079	0 %	0 %	100 %	0 %	357403622
3994	NC_016112	GGAA	2	8	263125	263132	50 %	0 %	50 %	0 %	357403622
3995	NC_016112	CCT	2	6	263212	263217	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357403622
3996	NC_016112	AC	3	6	263303	263308	50 %	0 %	0 %	50 %	357403622
3997	NC_016112	GGC	2	6	263333	263338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403622
3998	NC_016112	ATGT	2	8	263466	263473	25 %	50 %	25 %	0 %	357403622
3999	NC_016112	CCTT	2	8	263474	263481	0 %	50 %	0 %	50 %	357403622
4000	NC_016112	GCC	2	6	263518	263523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403622

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